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Heatmap: Cluster_121 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.18 -0.3 -0.53 0.06 -0.08 0.01 -0.17 0.07 -0.63 -0.13 0.34 0.69
0.19 -0.18 -0.49 0.03 -0.04 0.06 -0.08 -0.09 -0.55 -0.21 0.22 0.71
0.19 0.01 -0.2 -0.29 -0.36 -0.27 -0.77 -0.79 -0.68 -0.07 0.57 1.23
0.25 0.12 -0.19 0.24 -0.02 -0.25 -1.19 -1.63 -1.21 -0.24 0.2 1.4
-0.66 -0.04 -0.49 0.05 0.07 -0.05 -0.31 -0.12 -0.64 -0.18 0.47 0.99
0.44 0.16 -0.37 0.08 0.12 -0.03 -0.81 -1.15 -0.86 -0.47 0.21 1.12
0.28 0.11 -0.36 0.01 -0.24 -0.34 -0.73 -0.77 -0.61 -0.05 0.58 0.99
0.47 0.16 -0.09 -0.06 -0.62 -0.77 -0.87 -1.24 -0.78 -0.48 0.31 1.52
-0.21 -0.15 -0.54 -0.37 -0.84 -1.61 -1.07 0.25 -1.05 -0.33 0.4 1.86
-0.05 -0.06 -0.63 -0.31 -0.41 -0.23 -0.27 -0.06 -0.66 -0.31 0.33 1.34
0.26 -0.09 -0.68 -0.05 0.01 0.15 -0.22 -0.42 -0.68 -0.28 0.22 0.95
-0.61 -0.31 -0.25 0.34 -0.35 -0.95 -0.43 -0.52 -1.4 -0.14 0.52 1.57
0.64 0.13 -0.7 -0.4 -0.59 -0.86 -1.56 -1.74 -1.15 0.05 0.83 1.52
0.77 0.15 -0.34 -0.57 -1.11 -1.61 -1.16 -0.63 -0.68 -0.01 0.58 1.45
0.32 -0.06 -1.8 -1.05 -1.78 -1.36 -1.39 -1.39 -0.53 0.46 0.85 1.89
0.37 -0.2 -0.13 0.04 -0.18 -0.16 -0.28 -0.51 -0.88 -0.56 -0.27 1.35
0.22 0.23 -0.43 -0.36 -0.53 -0.5 -0.38 -0.34 -0.35 -0.08 0.32 1.14
0.01 0.0 -0.42 0.1 -0.07 -0.19 -0.43 -1.0 -0.82 -0.0 0.76 0.87
0.34 0.05 -0.61 -0.06 0.09 0.02 -0.39 -1.4 -0.65 -0.01 0.61 0.78
-0.75 -0.05 0.43 0.77 -0.0 -1.13 -3.85 -3.86 -1.95 -0.48 0.34 1.83
0.42 0.24 -0.66 -0.53 -1.02 -0.87 -1.02 -0.89 -0.39 0.11 0.58 1.46
0.16 -0.07 -0.13 -0.21 -0.48 -0.31 -0.66 -0.32 -0.76 -0.15 0.64 1.1
0.05 -0.52 -0.98 -0.79 -0.63 -0.16 -0.32 -0.6 -0.16 0.28 0.72 1.27
0.82 0.47 -0.56 -0.29 -0.95 -1.23 -1.75 -1.57 -0.94 -0.28 0.57 1.56
0.53 -0.27 -1.14 -0.84 -0.81 -0.45 -0.37 -0.06 -0.74 -0.39 0.43 1.57
-2.28 -1.39 -0.2 0.22 0.11 0.38 -0.13 -0.97 -0.74 -0.21 0.43 1.47
0.43 -1.12 -0.99 -0.23 -0.71 -1.18 -1.0 -0.5 -0.68 0.1 0.45 1.81
0.36 0.3 -0.45 -0.48 -0.67 -0.37 -0.74 -0.67 -0.81 -0.35 0.49 1.4
0.56 0.31 -0.67 -0.62 -1.3 -1.99 -2.92 -2.14 -0.93 0.19 0.78 1.85
0.7 0.36 -0.12 -0.19 -0.53 -0.67 -1.0 -0.58 -0.99 -0.67 0.21 1.33
0.09 -0.69 -1.14 -0.7 -0.62 -0.29 -0.69 -0.64 -0.3 0.51 0.84 1.31
0.74 -0.07 -0.58 -0.51 -0.8 -0.98 -1.31 -1.02 -0.23 0.39 0.34 1.38
-1.18 -1.12 -0.95 0.06 0.2 0.25 -0.76 -1.86 -1.02 0.06 0.84 1.59
-0.46 0.36 -0.58 -0.31 -0.57 -1.11 -0.96 -0.89 -0.49 0.38 0.86 1.33
-0.04 0.32 -0.36 -0.28 -0.48 -0.55 -0.93 -1.15 -0.96 0.17 0.64 1.38
0.31 -0.16 -0.93 -0.36 -0.39 -0.31 -0.71 -0.5 0.08 0.24 0.41 1.08
0.49 0.04 -0.61 -0.24 -0.42 -0.32 -0.75 -0.56 -0.43 0.2 0.54 0.92
0.26 0.42 -0.04 -0.24 -1.56 -2.93 -3.48 -2.44 -1.2 0.04 0.94 1.82
-1.47 -0.39 -0.48 0.44 0.23 0.06 -0.68 -0.59 -0.12 0.36 0.24 0.94
-0.3 0.18 0.0 -0.25 -0.77 -0.9 -1.0 -0.75 -0.22 0.3 0.66 1.22
0.01 0.24 -0.43 0.02 -0.26 -0.31 -0.63 -0.69 -0.65 -0.06 0.5 1.1
-1.86 -1.74 0.21 -0.11 0.12 -0.5 0.36 -0.76 -0.85 0.29 0.58 1.27
0.46 -0.26 -3.7 - -3.69 -3.13 -3.91 -1.06 0.13 0.84 0.51 2.23
-1.8 -0.64 -0.2 0.35 0.35 0.19 -0.41 -0.51 -1.11 -0.1 0.28 1.29
0.49 0.37 -0.45 -0.22 -0.26 -0.28 -0.69 -0.54 -0.97 -0.68 0.2 1.3
0.38 -0.24 -0.76 0.12 -0.08 -0.27 -0.48 -0.57 -0.74 -0.13 0.25 1.2
0.68 -0.06 -0.59 -0.42 -0.61 -0.43 -0.19 -0.2 -0.57 -0.26 0.16 1.18
- -3.23 -1.72 0.92 0.18 -1.09 -0.72 -1.53 -2.25 - 1.24 2.19
0.27 -0.2 -0.93 -0.38 -0.49 -0.15 -0.45 -0.54 -0.31 0.35 0.87 0.76
0.43 -0.06 -0.22 -0.01 -0.3 -0.47 -0.57 -0.54 -0.81 -0.19 0.4 1.12
0.48 -0.24 -0.86 -0.63 -0.79 -0.71 -0.84 -0.17 -0.94 -0.24 0.52 1.65
0.15 0.09 -0.64 -0.36 -0.3 -0.04 -0.49 -1.03 -0.76 0.1 0.78 1.03
0.47 0.5 -0.34 -0.17 -0.51 -0.64 -0.85 -1.09 -1.24 -0.49 0.1 1.56
-0.0 -0.28 -0.76 -0.76 -0.54 -0.31 -0.57 -0.87 -0.0 0.56 0.67 1.15
-0.01 -0.2 -1.11 -0.24 -0.18 0.02 -0.42 -0.54 -0.56 0.02 0.62 1.19
0.04 -0.3 -0.87 -0.0 0.01 0.15 -0.35 -1.19 -0.61 0.01 0.62 1.05
0.04 -0.22 -0.56 0.14 0.09 0.01 -0.55 -0.57 -1.2 -0.28 0.51 1.16
0.51 0.17 -0.45 -0.22 -0.59 -0.43 -0.42 -0.59 -0.98 -0.47 0.23 1.4
0.5 0.15 -0.41 -0.43 -0.45 -0.56 -0.8 -0.82 -0.89 -0.24 0.49 1.4
0.4 0.08 -0.76 -0.58 -0.8 -0.67 -0.61 -0.46 -0.55 0.07 0.56 1.36
0.26 0.51 -0.55 -0.43 -0.45 0.08 -0.29 -0.94 -1.0 -0.45 0.09 1.33
0.95 0.2 -0.61 -2.4 -2.41 -1.76 -1.47 -0.87 -2.29 -0.63 -0.6 2.37
0.05 0.06 -0.97 -0.06 -0.5 -0.4 -0.81 -1.24 -0.55 0.37 0.71 1.25
-0.05 -0.14 -0.4 -0.04 -0.22 -0.09 -0.53 -0.29 -0.29 0.25 0.58 0.67
0.43 0.2 -0.36 0.07 -0.35 -0.57 -1.14 -0.8 -0.69 -0.03 0.56 1.09
0.67 -0.09 -0.84 -0.61 -0.86 -0.81 -1.1 -1.58 -0.87 -0.01 0.71 1.66
-0.39 -0.18 -0.37 -0.21 -0.26 -0.31 -0.86 -0.69 0.07 0.36 0.49 1.12
0.06 0.18 -0.2 -0.17 -0.55 -0.45 -0.64 -0.1 -0.72 -0.2 0.61 1.05
-0.09 -0.54 -0.83 -0.44 -0.49 -0.5 -1.01 -0.82 0.13 0.42 0.77 1.29
0.9 -0.53 -0.79 -0.52 -0.95 -1.02 -0.81 -0.72 -0.13 -0.09 0.63 1.37
0.12 -0.05 -0.29 0.13 -0.16 -0.34 -0.84 -1.32 -0.58 0.37 0.7 0.85
0.16 -0.15 -1.09 -0.79 -0.95 -0.59 -0.63 -0.27 -0.59 0.06 0.57 1.62
0.09 -0.24 -0.36 -0.03 -0.09 -0.06 -0.88 -1.49 -0.85 0.06 0.67 1.23
0.66 -0.07 -0.08 0.09 -0.01 -0.87 -0.49 -0.58 -1.88 -1.03 -0.52 1.62
0.13 0.14 -0.27 0.12 -0.13 -0.12 -0.31 -0.37 -0.68 -0.38 0.11 1.01
0.26 -0.2 -0.98 -0.57 -0.44 -0.46 -0.39 -0.13 -0.87 -0.32 0.43 1.55
0.21 -0.5 -1.51 -0.36 -0.3 -0.32 -1.08 -0.25 -0.52 0.27 0.59 1.41
0.54 0.05 -0.44 -0.27 -0.38 -0.4 -0.52 -0.62 -0.42 -0.03 0.42 1.0
-1.29 -0.25 0.06 0.33 0.24 -0.03 -0.49 -0.55 -0.64 -0.17 0.26 1.12
0.61 -0.08 -0.77 -0.21 -0.2 -0.39 -0.85 -1.49 -1.27 -0.2 0.04 1.69
-1.64 -0.38 -0.0 0.54 0.28 -0.16 -0.62 -0.87 -0.82 0.02 0.4 1.17
0.19 -0.14 -0.72 -0.08 -0.14 -0.16 -0.6 -0.4 -1.03 -0.08 0.5 1.22
-2.15 -0.36 0.21 0.14 0.23 0.26 -0.31 -1.47 -0.99 -0.18 0.53 1.24
0.63 0.14 -0.68 -0.5 -0.82 -0.75 -0.8 -0.96 -0.56 0.09 0.54 1.36
-0.01 0.13 -0.34 -0.21 -0.39 0.12 -0.09 0.09 -0.45 -0.21 0.12 0.78
-0.09 0.34 -0.61 0.02 -0.24 -0.04 -0.29 -0.17 -0.37 -0.27 0.27 0.84
0.67 0.07 -0.38 -0.11 -0.38 -0.45 -0.21 -0.3 -0.85 -0.49 -0.3 1.27
0.32 0.17 -0.54 -0.17 -0.41 -0.16 -0.39 -0.51 -0.68 -0.09 0.49 0.98
0.28 -0.04 -0.01 -0.25 -0.72 -1.04 -1.62 -1.24 -0.68 0.15 0.81 1.41
-1.04 -0.38 -0.08 0.47 0.08 -0.22 -1.52 -2.11 -0.89 -0.3 0.55 1.63
0.43 0.24 -0.16 0.07 -0.32 -0.52 -1.1 -1.45 -0.95 -0.12 0.44 1.27
0.5 0.12 -0.53 -0.45 -0.78 -1.09 -1.18 -0.86 -0.7 0.02 0.71 1.47
-0.09 -0.07 -0.49 0.01 -0.12 0.03 -0.43 -0.91 -0.58 0.11 0.57 0.96
-0.58 0.14 0.02 0.22 0.19 -0.12 -0.73 -0.54 -0.89 -0.26 0.48 0.96
-1.61 -1.23 -0.14 0.24 0.11 0.43 0.25 -0.65 -0.47 -0.34 0.24 1.15
-0.0 -0.16 -0.5 0.04 -0.03 0.03 -0.53 -1.11 -0.67 0.19 0.57 0.98

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.