Heatmap: Cluster_16 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.08 0.24 0.14 0.1 0.02 0.0 4.33 7.51 6.67 4.45 4.36 2.75
0.36 0.32 0.0 0.03 0.02 0.5 0.53 1.01 3.17 2.69 1.37 0.65
3.63 2.58 1.59 2.12 3.25 2.29 2.02 2.57 3.83 3.6 3.66 3.43
0.47 0.33 0.29 0.05 0.0 0.03 6.74 16.05 15.77 10.48 10.1 15.0
0.45 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.15 0.56 0.65 0.7 0.5 0.19
0.61 0.1 0.05 0.03 0.0 0.0 1.5 2.2 2.76 1.91 1.54 2.03
0.0 0.23 0.0 0.28 0.26 0.28 0.49 0.95 1.32 0.85 0.91 0.84
0.05 0.09 0.05 0.02 0.01 0.01 4.12 6.94 7.42 4.97 3.44 3.31
0.38 0.91 1.41 1.0 0.91 1.3 1.7 2.42 3.52 3.3 2.7 3.97
0.0 0.03 0.0 0.05 0.05 0.13 0.12 0.25 0.27 0.17 0.28 0.36
0.13 0.07 0.0 0.0 0.02 0.07 0.09 0.26 0.2 0.2 0.27 0.32
10.84 8.05 9.93 7.97 8.67 11.25 11.05 15.48 22.32 14.91 14.22 9.38
0.06 0.16 0.0 0.0 0.09 0.41 1.3 1.76 2.15 2.02 1.71 2.27
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.63 1.13 1.22 0.72 0.32
0.34 0.78 0.87 1.18 1.72 0.79 1.41 2.18 3.08 3.1 2.5 1.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.08 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.3 0.41 0.3 0.28 0.0
0.0 0.04 0.11 0.1 0.07 0.23 0.26 0.56 1.1 0.59 0.7 1.33
0.14 0.16 0.62 0.86 0.44 0.43 0.44 0.72 1.3 1.43 1.47 1.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.23 0.11 0.1 0.1
0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.54 0.64 0.63 0.33 0.42 0.47
0.14 0.02 0.0 0.09 0.03 0.06 0.16 0.17 0.39 0.25 0.17 0.22
0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.03 0.04 0.23 0.34 0.33 0.07
0.0 0.09 0.0 0.15 0.16 0.14 0.65 0.52 0.84 0.94 0.3 0.23
0.08 0.03 0.02 0.0 0.02 0.04 0.36 0.29 0.35 0.25 0.24 0.44
1.22 0.41 0.11 0.18 0.11 0.42 1.47 1.67 3.76 2.47 2.77 2.94
1.18 0.1 0.11 0.15 0.0 0.16 1.55 2.32 3.72 2.82 2.56 3.01
0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.08 0.94 0.53 0.89 0.72 1.04 0.9
0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.1 0.17 0.37 0.19 0.19 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.4 0.75 0.39 0.39 0.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.12 0.32 0.39 0.28 0.18
0.68 0.8 0.51 0.36 0.19 0.11 3.84 8.22 7.55 4.48 4.47 6.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.4 0.33 0.58 0.84 0.57 0.7
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.13 0.04 0.04 0.05
0.74 1.21 0.84 0.13 0.39 0.33 10.26 14.54 16.36 10.55 9.24 12.73
1.88 0.72 0.17 0.86 0.56 0.26 0.27 1.03 1.15 1.87 1.85 1.36
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.51 0.61 0.57 0.73 0.91
0.11 0.08 0.05 0.03 0.01 0.02 0.06 0.08 0.33 0.35 0.4 0.41
0.32 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.21 0.92 0.8 0.67 0.34
0.26 0.28 0.17 0.11 0.1 0.01 3.57 4.69 8.84 6.05 5.04 6.66
0.53 0.48 0.4 0.22 0.17 0.23 4.07 5.34 7.78 5.57 3.98 6.15
47.33 28.07 23.05 15.84 9.71 7.6 86.65 109.48 137.37 95.61 102.37 151.46
5.39 9.62 4.43 0.59 0.18 0.4 124.33 148.13 197.82 126.45 111.88 140.77
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
4.32 5.17 2.39 1.8 1.62 2.65 46.76 70.57 84.87 55.11 43.66 55.86
0.0 0.01 0.03 0.07 0.09 0.15 0.67 0.84 1.7 1.09 0.67 0.45
0.0 0.03 0.0 0.05 0.1 0.05 0.57 0.43 1.19 0.56 0.44 0.69
0.06 0.06 0.06 0.01 0.01 0.02 1.48 2.94 3.37 1.89 1.4 2.2
0.75 0.85 0.7 0.52 0.31 0.36 2.56 4.95 4.25 3.41 2.77 2.48
2.41 2.31 1.83 1.76 2.16 2.26 1.43 3.04 4.43 5.95 4.36 1.39
2.12 2.8 5.73 9.83 6.38 4.89 19.73 32.51 27.79 23.67 18.79 12.4
31.51 15.25 5.63 2.05 0.39 0.36 59.09 113.36 118.42 82.19 100.29 145.85
1.37 1.91 1.27 0.0 0.19 0.23 33.24 36.0 45.17 26.45 18.89 26.85
1.34 2.94 2.27 0.26 0.07 0.35 77.27 92.51 114.43 71.85 44.8 60.41
0.18 0.44 0.21 0.02 0.01 0.03 2.15 3.35 3.87 2.48 1.62 2.12
4.3 1.84 0.76 0.33 0.09 0.03 6.28 12.54 14.8 10.04 12.0 14.44
4.0 6.18 3.61 0.65 0.32 0.41 90.08 120.05 162.04 91.74 68.27 107.7
1.33 1.25 0.37 1.05 0.99 0.88 1.28 1.73 2.07 2.96 3.11 2.53
0.45 0.75 0.67 0.14 0.13 0.16 14.26 18.69 20.95 12.82 12.13 18.2
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.35 0.33 0.0 0.24
0.92 0.86 0.69 0.73 0.82 1.06 5.45 7.5 8.88 6.46 3.61 6.02
0.0 0.28 0.0 0.0 0.18 0.0 0.19 0.42 0.99 0.71 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)