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Heatmap: Cluster_132 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.09 0.0 -0.57 -0.32 -0.1 0.48 0.36 0.24 -0.71 -0.27 0.13 0.33
0.73 -1.31 -1.64 -1.69 -1.07 0.08 0.44 0.86 0.21 0.13 0.16 0.28
0.61 -1.04 -0.81 -0.49 -0.28 0.08 0.06 0.21 -0.23 0.15 0.37 0.46
0.31 -0.11 -0.47 -0.21 -0.05 0.34 -0.06 -0.1 -0.38 -0.01 0.26 0.23
1.32 -1.05 -2.07 -0.83 -0.19 0.16 0.49 0.42 -0.01 -0.12 -0.3 -0.41
1.11 -0.71 -1.93 -0.79 -0.33 0.48 0.07 -0.51 -0.45 0.11 -0.29 0.87
0.12 -0.96 -1.02 -0.17 0.08 0.55 0.02 0.33 -0.31 -0.0 0.28 0.26
0.66 -1.9 -2.61 -1.12 -0.09 0.59 0.64 1.19 -0.3 -0.34 -0.37 -0.18
0.53 -1.54 -0.9 -0.19 -0.17 0.32 0.33 0.54 -0.42 -0.22 0.17 0.28
-0.11 -0.55 -0.66 0.01 -0.28 0.3 -0.03 0.23 -0.09 0.19 0.27 0.34
0.14 -0.02 -0.55 -0.25 -0.04 0.43 0.03 0.35 -0.65 -0.27 0.05 0.35
0.26 -0.11 -0.35 -0.12 0.06 0.49 0.06 -0.44 -0.4 -0.14 0.12 0.26
0.12 0.0 -0.56 -0.03 0.04 0.42 0.13 -0.27 -0.63 -0.19 0.16 0.41
0.88 -0.56 -0.61 -0.47 -0.22 0.24 -0.0 -0.28 -0.16 -0.12 -0.05 0.55
0.57 -1.38 -2.4 -0.39 0.44 0.62 0.3 0.07 -0.13 -0.3 0.15 0.23
0.16 -0.25 -0.46 -0.13 0.0 0.24 0.0 -0.06 -0.45 -0.07 0.18 0.53
1.71 -1.09 -1.6 -2.46 -1.75 -0.64 -0.03 -0.56 -0.35 -0.46 0.56 1.11
0.52 -0.2 -0.27 -0.04 -0.03 0.49 0.1 -0.1 -0.72 -0.46 0.04 0.19
0.13 -0.44 -0.79 -0.28 -0.08 0.59 0.24 -0.27 -0.21 -0.03 0.21 0.39
0.86 -1.1 -1.37 -1.1 -0.57 0.19 0.58 0.81 -0.24 -0.16 -0.22 0.26
0.01 -0.86 -0.68 -0.13 0.0 0.44 0.23 0.45 -0.33 -0.08 0.3 0.04
1.06 -0.45 -1.29 -0.63 -0.19 0.32 0.04 -0.1 -0.95 -0.52 0.2 0.74
0.38 -0.19 -0.99 -0.27 0.24 0.58 0.26 0.13 -0.68 -0.34 0.07 0.09
-0.1 -0.32 -0.7 -0.27 0.04 0.38 0.39 0.71 -0.14 -0.3 -0.14 -0.12
0.4 -0.91 -1.21 -0.27 -0.17 0.47 0.3 0.63 -0.35 -0.24 -0.3 0.48
0.09 -0.15 -0.48 -0.07 -0.01 0.36 -0.02 -0.05 -0.38 -0.15 0.23 0.37
0.27 -0.37 -0.4 -0.56 -0.54 0.17 0.1 0.4 0.21 0.23 0.06 0.01
-0.49 -0.96 -1.0 -0.08 0.25 0.4 0.5 0.21 -0.33 0.09 0.38 0.11
-0.17 -0.47 -0.73 0.16 0.14 0.53 0.39 0.42 -0.42 -0.41 -0.07 0.03
0.62 -1.0 -1.36 -0.58 -0.2 0.65 0.6 0.42 -0.33 -0.33 -0.04 0.07
0.35 -1.33 -1.15 -0.12 0.01 0.54 0.26 0.71 -0.24 -0.26 -0.07 0.05
0.11 -0.17 -0.8 0.04 0.09 0.45 0.04 0.11 -0.29 -0.13 0.27 -0.06
-0.05 -0.41 -1.29 -0.38 -0.1 0.56 0.22 -0.15 -0.4 -0.02 0.34 0.69
0.37 -0.71 -0.73 -0.07 -0.0 0.44 0.31 0.16 -0.44 -0.21 0.03 0.26
0.9 -1.04 -1.35 -0.62 -0.33 0.37 0.38 0.05 -0.06 0.05 0.01 0.24
0.27 -0.7 -0.77 -0.14 0.03 0.21 0.16 0.0 -0.07 -0.04 0.08 0.49
0.61 -0.53 - -1.7 -0.11 0.85 0.67 0.29 -1.35 -0.54 0.2 0.77
0.93 -1.42 -2.18 -0.77 -0.07 0.53 0.13 0.44 -0.57 -0.01 0.17 0.35
0.37 -0.83 -1.78 -0.45 -0.24 0.25 0.27 0.51 -0.15 0.02 0.28 0.39
0.38 -1.19 -1.87 -0.65 0.01 0.69 0.42 -0.13 -0.78 -0.38 0.14 1.02
0.05 -0.31 -0.49 -0.09 -0.11 0.26 0.12 0.39 -0.25 -0.08 0.16 0.13
0.53 -1.47 -2.31 -1.1 -0.24 0.26 0.38 0.28 0.02 0.18 0.29 0.67
0.18 -1.06 -0.94 -0.27 -0.23 0.24 0.3 0.3 -0.06 0.08 0.31 0.36
0.7 -2.05 -2.21 -1.12 -0.41 0.34 0.48 0.57 0.03 0.14 0.21 0.36
0.55 -1.09 -0.93 -0.16 0.11 0.36 0.17 0.25 -0.09 0.05 -0.02 0.03
0.19 -0.28 -0.42 0.12 0.27 0.48 0.15 -0.19 -1.08 -0.65 0.05 0.55
0.01 -1.07 -0.56 -0.11 -0.16 0.28 0.01 0.35 -0.19 0.18 0.36 0.29
0.59 -0.5 -0.93 -0.02 0.05 0.33 0.11 0.13 -0.37 -0.18 0.0 0.22
1.07 -1.25 -1.63 -0.67 -0.07 0.43 0.52 0.83 -0.32 -0.56 -0.51 -0.27
0.07 0.23 -0.49 -0.23 -0.04 0.53 0.17 0.42 -0.69 -0.62 -0.11 0.19
0.06 -0.47 -1.19 -0.22 0.27 0.56 0.33 0.87 -0.2 -0.25 -0.4 -0.51
0.16 -0.53 -0.67 -0.25 0.02 0.43 0.19 -0.05 -0.44 -0.1 0.2 0.54
-0.14 -0.16 -0.63 -0.29 -0.06 0.53 0.35 0.44 -0.58 -0.29 0.05 0.24
0.36 -0.46 -1.78 -0.4 0.38 0.79 0.2 -0.44 -0.96 -0.52 0.06 0.82
0.25 -0.09 -0.39 0.24 0.16 0.49 0.04 -0.41 -0.71 -0.31 0.06 0.23
1.14 -0.44 -0.87 -0.75 -0.4 0.24 0.21 -0.57 -0.18 -0.12 0.01 0.43
0.33 -0.05 -0.39 -0.26 -0.18 0.28 -0.06 -0.17 -0.81 -0.16 0.41 0.53
0.67 -1.15 -1.31 -0.48 -0.21 0.35 0.47 0.31 0.08 -0.07 -0.24 0.27
0.83 -0.19 -0.51 -0.46 -0.46 0.2 0.16 -0.03 -0.66 -0.45 0.15 0.55
0.17 -0.88 -0.56 -0.47 -0.05 0.43 0.64 0.35 -0.05 -0.08 -0.01 -0.17
0.53 -0.77 -1.57 -0.62 -0.56 0.04 0.48 0.52 0.02 0.18 0.16 0.23
0.51 -0.86 -0.86 -0.5 -0.82 0.05 0.47 0.67 -0.22 0.26 -0.19 0.32
-0.2 -0.69 -0.57 0.02 0.09 0.36 0.2 0.59 -0.78 -0.44 0.1 0.52
0.33 -1.1 -0.92 0.13 0.11 0.55 0.14 0.05 -0.41 -0.17 0.06 0.37
0.18 -0.37 -0.63 -0.16 0.04 0.16 -0.01 0.09 -0.26 -0.13 0.31 0.43
1.29 -1.96 -4.58 -2.02 -0.61 0.14 0.94 0.43 0.58 -0.31 -0.25 -0.23
0.66 -1.07 -1.88 -0.44 -0.08 0.35 0.45 0.2 -0.27 -0.19 0.28 0.34
0.61 -0.45 -0.91 -0.43 -0.29 0.29 0.28 -0.16 0.02 0.05 0.02 0.33
0.78 -1.32 -2.76 -1.55 -0.6 0.3 0.41 0.49 -0.21 -0.11 0.3 0.81
0.11 -0.58 -1.13 -0.47 -0.03 0.48 0.18 0.06 -0.25 -0.06 0.21 0.65
-0.04 -0.23 -0.43 0.08 0.15 0.47 0.16 -0.12 -0.62 -0.43 0.0 0.54
0.79 -1.08 -1.02 -0.29 -0.0 0.36 0.1 -0.29 -0.35 0.04 0.2 0.44
0.13 -0.67 -0.76 0.04 0.11 0.36 0.08 0.22 -0.66 -0.29 0.2 0.56
-0.12 -0.49 -1.08 -0.47 -0.1 0.61 0.24 -0.08 -0.01 0.03 0.17 0.52
0.27 -0.25 -0.25 0.05 -0.11 0.49 0.19 -0.52 -0.32 -0.11 0.1 0.16
-0.04 -0.44 -0.96 -0.36 -0.15 0.34 0.07 0.53 -0.26 0.06 0.18 0.42
0.74 -0.58 -1.25 -0.77 -0.48 0.35 0.29 0.19 -0.32 -0.25 0.02 0.72
0.42 -1.01 -1.0 -0.06 0.03 0.55 0.44 0.61 -0.36 -0.36 -0.3 -0.03
0.48 -1.19 -1.08 -0.43 -0.4 0.51 0.43 1.1 -0.34 -0.29 -0.31 -0.22
-0.4 -0.36 -0.74 -0.06 -0.03 0.49 -0.11 0.51 -0.7 -0.26 0.28 0.59
0.59 -0.79 -1.19 -0.56 -0.19 0.54 0.25 0.04 0.01 0.1 0.15 0.09
0.6 -0.42 -0.9 -0.16 0.11 0.59 0.17 -0.22 -0.94 -0.53 0.17 0.49

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.