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Heatmap: Cluster_59 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.59 -0.05 -0.87 -0.8 -1.0 -0.51 -1.25 0.93 -0.48 -0.27 0.67 0.8
0.38 -0.04 -0.29 -0.52 -0.35 0.18 -0.05 0.08 -0.33 -0.13 0.24 0.48
-0.88 -0.05 -0.64 -1.53 -0.75 -0.13 0.18 0.38 -0.43 -0.17 0.43 1.37
0.33 -0.13 -0.95 -0.33 -0.28 0.15 -0.11 0.16 -0.38 -0.07 0.24 0.71
0.08 -0.41 -0.8 -0.37 -0.38 -0.02 0.03 0.01 -0.04 0.16 0.32 0.78
0.0 0.1 -0.88 -0.57 -0.31 -0.04 -0.12 0.39 -0.52 -0.25 0.51 0.8
-0.09 0.22 -0.46 -0.57 -0.42 -0.02 -0.14 0.13 -0.48 -0.03 0.41 0.79
-1.17 -0.2 -0.99 -0.82 -0.47 0.06 -0.0 0.19 0.04 0.03 0.57 1.12
0.25 -0.07 -0.7 -0.7 -0.58 0.18 0.1 0.3 -0.25 0.03 0.24 0.56
0.24 0.02 -0.71 -0.59 -0.31 0.32 0.1 0.04 -0.26 -0.02 0.18 0.5
-0.28 0.1 -0.67 -0.49 -0.47 0.17 0.21 0.44 -0.23 -0.07 0.2 0.54
0.11 -0.11 -0.43 -0.29 -0.44 0.08 0.03 0.19 -0.19 0.03 0.32 0.41
0.21 0.11 -0.76 -0.38 -0.42 0.03 -0.06 -0.02 -0.55 -0.05 0.39 0.79
-0.03 -0.07 -0.49 -0.3 -0.53 -0.32 -0.34 0.6 -0.74 -0.11 0.44 0.9
-0.27 -0.15 -0.4 -0.4 -0.41 0.07 -0.21 0.15 -0.52 -0.0 0.58 0.84
0.16 -0.15 -0.61 -0.26 -0.21 0.11 -0.07 0.14 -0.59 -0.16 0.37 0.72
-0.23 0.14 -0.2 -0.4 -0.33 -0.03 -0.24 0.16 -0.43 0.15 0.36 0.63
0.13 0.13 -0.48 -0.45 -0.36 -0.06 -0.19 0.37 -0.6 -0.17 0.42 0.66
-0.1 -0.03 -0.65 -0.5 -0.46 0.07 -0.08 -0.24 -0.32 0.02 0.52 0.94
0.39 -0.08 -1.35 -0.78 -0.71 -0.54 -0.42 0.5 -0.52 -0.04 0.6 1.09
-0.15 -0.21 -0.86 -0.6 -0.3 -0.0 -0.3 -0.46 -0.5 -0.15 0.88 1.16
-1.42 -0.84 -2.08 -1.16 -0.77 -0.18 0.34 0.67 0.29 0.24 0.63 1.08
0.16 -0.09 -0.68 -0.54 -0.47 0.06 0.01 0.27 -0.41 -0.02 0.43 0.64
-0.13 -0.17 -0.78 -0.55 -0.31 0.19 0.07 0.03 -0.11 0.11 0.48 0.6
0.13 0.21 -0.73 -1.16 -0.72 0.09 0.13 0.15 -0.07 0.15 0.34 0.58
0.09 -0.09 -0.81 -0.42 -0.28 0.13 -0.08 0.04 -0.24 -0.11 0.42 0.74
0.14 -0.28 -2.13 -1.38 -0.47 0.44 0.18 0.39 -0.27 -0.01 0.39 0.86
-0.09 0.16 -0.58 -0.14 -0.56 -0.14 -0.0 0.3 -0.6 -0.24 0.41 0.78
-0.11 0.07 -0.64 -0.2 -0.3 -0.02 -0.07 -0.04 -0.77 -0.07 0.46 0.9
-0.09 -0.03 -0.69 -0.22 -0.39 -0.1 -0.11 -0.18 -0.56 0.04 0.59 0.91
-0.2 -0.37 -0.17 -0.16 -0.4 -0.63 0.0 0.54 -0.22 -0.15 0.36 0.73
0.35 0.61 -0.9 -1.69 -0.89 0.11 0.07 0.3 -0.57 -0.17 0.58 0.48
0.18 0.15 -0.54 -0.55 -0.42 0.25 0.29 0.0 -0.34 -0.2 0.19 0.52
-0.36 -0.28 -0.97 -0.39 -0.27 0.18 0.05 -0.06 -0.2 0.14 0.49 0.83
-0.01 0.11 -0.75 -0.84 -0.78 -0.08 -0.05 0.15 -0.36 -0.09 0.59 0.96
-0.49 -0.28 -0.94 -0.59 -0.52 -0.22 -0.25 0.66 -0.23 0.15 0.6 0.86
-0.23 -0.23 -0.62 -0.12 -0.37 0.06 0.2 0.3 0.02 -0.24 0.22 0.59
-0.81 -0.29 -0.95 -0.92 -0.61 0.1 0.12 0.04 -0.2 0.29 0.48 1.16
-0.62 -0.32 -1.35 -0.46 -0.32 0.24 0.06 0.02 -0.16 0.02 0.49 1.05
0.1 -0.16 -2.27 -1.45 -0.68 -0.3 0.06 -0.32 -0.66 0.1 0.72 1.5
0.23 -0.06 -1.11 -1.21 -1.06 -0.43 -0.46 0.74 -0.66 -0.39 0.52 1.34
-0.6 -0.45 -0.92 -1.13 -0.66 -0.0 0.24 0.34 -0.19 0.12 0.7 0.97
-0.06 0.11 -0.77 -0.44 -0.36 0.23 0.1 0.22 -0.64 -0.29 0.35 0.78
0.05 0.05 -0.78 -0.57 -0.39 0.09 0.12 0.08 -0.34 -0.12 0.44 0.7
0.29 0.19 -1.13 -1.18 -0.48 0.13 0.13 0.34 -0.37 -0.16 0.44 0.61
-0.28 -0.3 -0.73 -0.56 -0.29 0.01 -0.01 0.63 0.0 -0.04 0.36 0.54
-0.07 -0.08 -0.77 -0.63 -0.54 0.18 0.14 0.47 -0.58 -0.26 0.18 0.95
0.06 -0.1 -0.3 -0.35 -0.33 0.26 -0.09 -0.03 -0.35 -0.04 0.25 0.64
-0.11 -0.68 -0.75 -0.67 -0.53 0.0 0.08 0.24 -0.17 0.2 0.56 0.83
0.01 0.2 -0.64 -0.69 -0.52 0.29 0.3 0.24 -0.45 -0.16 0.26 0.51
-0.03 -0.26 -1.22 -1.16 -0.91 -0.14 -0.01 0.1 -0.29 0.06 0.63 1.26
-0.02 -0.49 -1.52 -1.07 -0.45 0.18 0.21 0.51 -0.24 0.05 0.37 0.89
-0.12 0.36 -0.54 -0.69 -0.6 0.33 0.33 -0.02 -0.23 -0.19 0.32 0.43
-0.25 -0.25 -1.66 -0.92 -0.48 0.07 0.03 0.44 -0.13 0.06 0.6 0.89
-1.13 -0.29 -1.59 -1.27 -0.71 -0.06 0.06 0.67 -0.45 -0.02 0.8 1.21
-0.35 -0.42 -1.25 -1.29 -0.69 -0.02 0.16 0.36 -0.16 0.22 0.68 0.98
-0.11 -0.03 -1.15 -0.91 -0.66 0.14 -0.11 -0.18 -0.32 0.05 0.63 1.13
0.04 -0.07 -0.79 -0.5 -0.23 0.27 0.08 0.1 -0.13 0.04 0.27 0.49
0.07 0.3 -0.79 -0.62 -0.35 0.27 0.23 -0.1 -0.16 -0.03 0.03 0.58
0.57 0.33 -0.8 -0.84 -1.09 -0.64 -0.44 0.59 -0.44 -0.21 0.43 0.87
0.12 -0.66 -1.53 -1.17 -0.59 0.21 0.12 0.35 -0.33 0.1 0.53 1.0
-0.22 0.12 -0.88 -0.62 -0.24 0.34 0.19 -0.01 -0.22 -0.12 0.39 0.61
-0.22 0.23 -0.55 -0.47 -0.38 0.28 0.09 0.34 -0.63 -0.13 0.27 0.58
-0.27 -0.14 -0.64 -0.46 -0.45 0.09 0.12 0.38 -0.04 -0.01 0.33 0.57
-0.21 -0.45 -1.14 -0.72 -0.38 0.11 0.09 0.47 -0.26 -0.04 0.44 0.91
-0.14 -0.09 -1.45 -1.0 -0.5 0.29 0.15 0.11 -0.51 0.0 0.49 1.05
-1.01 -0.88 -2.17 -2.24 -0.95 -0.04 0.25 0.45 0.05 0.47 0.92 1.12
0.3 -0.15 -0.88 -0.52 -0.36 0.03 -0.17 0.13 -0.62 -0.17 0.53 0.9
-0.23 -0.19 -0.66 -0.25 -0.4 0.13 -0.16 -0.0 -0.48 0.12 0.48 0.9
0.47 0.12 -0.54 -0.37 -0.44 -0.03 -0.17 0.24 -0.63 -0.24 0.16 0.73
0.0 -0.2 -0.32 -0.05 -0.3 0.06 -0.16 -0.09 -0.41 0.05 0.4 0.65
-0.1 0.22 -0.76 -0.58 -0.46 0.24 0.23 -0.01 -0.16 0.04 0.24 0.56
0.24 0.3 -0.6 -0.47 -0.41 0.2 0.13 0.2 -0.54 -0.28 0.25 0.44
-0.1 -0.41 -1.71 -1.4 -0.86 0.04 0.27 0.12 -0.14 -0.05 0.55 1.28
0.15 -0.04 -0.47 -0.39 -0.3 0.24 0.09 0.17 -0.51 -0.18 0.22 0.58

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.