Heatmap: Cluster_85 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.07 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01
0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.06 0.07 0.09 0.0 0.07 0.16 0.19
0.0 0.02 0.05 0.09 0.08 0.13 0.05 0.1 0.1 0.1 0.17 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.29 0.28
0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.63 0.32 0.22 0.41 0.19 0.63 0.22
18.69 6.01 11.38 10.98 12.92 16.11 17.37 10.53 11.69 12.76 18.66 30.01
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.06 0.02 0.08 0.09
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.03 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.69 0.38 0.0 0.59 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.11 0.11 0.04 0.05 0.0 0.22 0.12
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.28 0.0 0.13 0.25 0.0 0.0 0.12 0.0 0.46 0.45 0.28
0.38 0.05 0.04 0.03 0.08 0.14 0.11 0.07 0.1 0.13 0.1 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.04 0.01 0.03 0.03 0.04 0.07 0.09
0.08 0.05 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.03 0.04 0.1 0.1 0.05
0.24 0.09 0.07 0.18 0.14 0.19 0.36 0.19 0.19 0.25 0.44 0.57
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.05 0.0 0.07 0.01
0.75 0.47 0.75 0.28 0.0 0.0 0.5 1.08 0.39 0.76 0.98 0.94
0.8 0.61 0.22 0.66 1.26 0.94 1.22 0.58 0.2 0.74 1.44 1.21
0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.04 0.03 0.0 0.02 0.03 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.07 0.03 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.46 0.15 0.0 0.47 0.0
0.0 0.2 0.11 0.26 0.1 0.16 0.15 0.31 0.31 0.09 0.55 0.51
0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.07 0.05 0.05 0.02 0.07 0.09 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01
0.0 0.12 0.12 0.07 0.09 0.13 0.09 0.0 0.0 0.0 0.18 0.04
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.07 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.21 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.27 0.19 0.0 0.1 0.05
0.0 0.04 0.02 0.05 0.01 0.06 0.02 0.03 0.04 0.04 0.2 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03
0.07 0.33 0.86 0.57 0.62 0.65 0.6 0.63 0.47 0.55 0.99 0.93
0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.39 0.57 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
1.35 0.17 0.19 0.26 0.0 0.38 0.19 0.06 0.17 0.0 0.67 0.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.05 0.07 0.03 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.06 0.04 0.07 0.07 0.05 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.19 0.07 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.07 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.02 0.1 0.12 0.13 0.18 0.04 0.16 0.18 0.17 0.26 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.1 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.0 0.0 0.31 0.28
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.22 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.05 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01
0.0 0.07 0.0 0.0 0.24 0.24 0.55 1.16 0.6 0.46 0.63 0.68
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.14 0.29
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
1.35 0.6 0.48 0.0 0.31 1.13 0.42 0.8 0.53 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.05 0.02
1.71 0.49 0.63 0.13 0.29 0.44 0.3 0.17 0.87 0.58 1.16 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.05 0.0 0.03 0.04 0.04
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.03 0.08 0.0 0.07 0.25
0.16 0.0 0.0 0.07 0.14 0.1 0.23 0.27 0.04 0.25 0.17 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.14 0.0 0.08 0.07 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.94 0.56 0.16 0.0 0.58 0.75 1.02
0.0 0.03 0.0 0.14 0.03 0.0 0.12 0.26 0.0 0.07 0.17 0.08
2.36 3.01 1.74 1.55 1.92 2.63 2.1 1.71 1.96 2.82 3.15 2.23
0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.12 0.0 0.06 0.0 0.0 0.31 0.0
0.16 0.3 0.48 0.39 0.52 0.53 0.02 0.08 0.13 0.24 0.62 0.47
0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.27 0.2
0.6 0.08 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.12 0.31 0.28 0.79 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.14 0.17
2.15 3.07 3.43 3.41 3.57 3.4 3.57 3.7 3.93 3.51 6.08 5.32
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.15 0.1 0.07 0.07 0.0 0.06 0.09
0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.19 0.07 0.0 0.38 0.22 0.28
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.13 0.31 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.13 0.07 0.06 0.0 0.07 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.03
0.38 0.19 0.1 0.12 0.12 0.27 0.12 0.08 0.18 0.15 0.29 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.06 1.31 0.07 0.24 0.25 0.55 0.22 0.21 0.12 1.44 1.38
0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.42 0.0 0.21 0.21 0.0 0.21 0.3
0.0 0.03 0.09 0.16 0.06 0.15 0.08 0.17 0.07 0.0 0.13 0.26
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.03 0.01 0.04 0.01
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.16 0.08 0.11 0.1 0.23 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.05 0.06 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.04 0.03 0.08 0.04
0.72 0.9 0.44 0.32 0.41 0.37 0.34 0.22 0.11 0.27 0.71 1.35
1.54 3.34 20.33 10.15 11.29 10.58 15.78 10.48 11.93 10.27 46.09 17.67
3.29 2.48 27.86 12.2 12.92 14.58 19.92 16.45 17.01 14.77 62.09 22.88
0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.05 0.1 0.04 0.02 0.08 0.08 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05
0.0 0.49 0.14 0.11 0.07 0.0 0.31 0.18 0.38 0.16 0.51 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.23 0.18
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.34 0.05
0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.24 0.09 0.36 0.24 0.18 0.5 0.21 0.84 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.06 0.0 0.0 0.29 0.23
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.3 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.0 0.11 0.0 0.0 0.18 0.21 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)