Heatmap: Cluster_134 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.05 0.03
0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.04 0.05 0.06 0.23 0.04 0.12 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.14 0.09 0.08 0.0 0.0 0.16 0.12
0.0 0.05 0.1 0.16 0.09 0.08 0.11 0.16 0.08 0.08 0.19 0.42
0.0 0.0 0.0 0.12 0.08 0.0 0.13 0.1 0.28 0.18 0.12 0.42
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.23 0.8 0.44 0.74 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.1 0.02 0.0 0.06 0.04
0.0 0.0 0.16 0.22 0.0 0.12 0.14 0.34 0.76 0.32 0.67 0.96
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.22
0.0 0.05 0.0 0.09 0.15 0.0 0.34 0.07 0.0 0.0 0.09 0.09
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.18 0.15
4.13 3.68 3.16 3.75 3.41 4.18 3.16 3.51 3.17 3.54 5.02 4.74
0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.07 0.0 0.02 0.01 0.02 0.07 0.07
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.0 0.12 0.06
0.04 0.03 0.01 0.05 0.05 0.05 0.01 0.03 0.07 0.06 0.05 0.11
0.22 0.25 0.19 0.09 0.0 0.0 0.15 0.32 0.24 0.32 0.65 0.29
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.22 0.25 0.0 0.86 0.54
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.03 0.19 0.06 0.0 0.28 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.09 0.0 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.08 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.23 0.35 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.12 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.1 0.0 0.29 0.05
0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.14 0.08 0.05 0.18 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.09 0.17 0.25
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.03 0.21 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.21 0.28 0.98 0.0 0.74 0.49
0.0 0.04 0.15 0.23 0.18 0.11 0.0 0.05 0.07 0.25 0.26 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.09 0.13 0.12 0.23 0.18
0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.08 0.23 0.18 0.11 0.24 0.33 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.19 0.0 0.09 0.26 0.24
0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.16 0.08 0.0 0.42 0.19
0.0 0.09 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.14 0.07 0.06 0.11 0.08
0.15 0.0 0.02 0.03 0.06 0.12 0.12 0.14 0.16 0.06 0.23 0.33
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.12 0.34 0.67 0.0 0.48 0.84
1.34 1.49 1.21 1.48 2.13 1.69 1.67 1.46 2.05 1.9 2.1 2.39
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.08 0.07 0.14 0.08
0.0 0.21 0.0 0.0 0.08 0.23 0.83 0.16 0.29 0.0 0.37 0.53
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.22 0.07 0.06 0.13 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.81 0.86
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.55 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.09 0.14
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.31 0.0 0.14 0.24
0.0 0.0 0.18 0.0 0.09 0.26 0.18 0.19 0.16 0.5 0.6 0.39
0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.0 0.27 0.0 0.37 0.0 0.16 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.03 0.0 0.0 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.07 0.19 0.0 0.17 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.16 0.0 0.08 0.24 0.12
0.03 0.03 0.04 0.04 0.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.08 0.1 0.11
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.12 0.07
0.0 0.0 0.19 0.0 0.09 0.0 0.1 0.97 0.53 0.53 0.18 0.09
3.18 2.61 1.15 0.88 0.52 1.55 0.92 1.34 1.87 1.82 5.6 5.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03
0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.08 0.1 0.03 0.09 0.17
0.0 0.0 0.0 0.16 0.11 0.28 0.13 0.29 0.21 0.34 0.41 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.1 0.06 0.19 0.23 0.68 0.56
0.05 0.05 0.01 0.03 0.06 0.04 0.06 0.08 0.08 0.12 0.15 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.09 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)