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Heatmap: Cluster_17 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.83 -0.79 -0.95 -0.55 -0.48 -0.15 -0.42 -0.21 -0.24 0.43 0.87 1.27
-0.49 -0.72 -1.02 -0.65 -0.41 -0.09 -0.06 -0.13 0.19 0.51 0.68 0.86
-0.03 -0.09 -0.52 -0.11 -0.32 -0.02 -0.41 -0.12 -0.72 -0.06 0.56 0.97
-0.8 -1.02 -1.16 -0.62 -0.41 -0.19 -0.37 -0.24 -0.39 0.21 0.92 1.47
-0.37 -0.33 -0.79 -0.39 -0.36 0.14 -0.0 -0.07 0.06 0.24 0.58 0.62
-0.46 -0.32 -0.49 0.0 -0.41 -0.27 -0.3 -0.35 -0.21 0.1 0.72 1.0
-0.66 -0.39 -0.48 -0.64 -0.81 -0.04 -0.32 -0.09 -0.13 0.36 0.9 0.92
-1.84 -1.4 -1.54 -1.22 -0.42 -0.11 -0.14 0.13 -0.08 0.72 1.05 1.16
-0.54 -0.87 -1.79 -1.08 -0.89 -0.36 -0.26 -0.27 -0.05 0.44 1.06 1.38
-1.09 -1.32 -1.4 -1.01 -0.53 -0.46 -0.59 -0.35 0.25 0.74 0.9 1.41
-0.55 0.01 -0.31 -0.33 -0.5 -0.55 -0.7 -0.34 -0.25 0.3 0.73 1.13
-3.12 -1.6 -0.88 -0.64 -0.48 -0.65 -0.73 -0.72 -0.3 0.68 1.21 1.63
-3.12 -1.47 -1.08 -0.48 -0.65 -0.74 -1.12 -0.74 0.1 0.69 1.28 1.55
-0.27 -0.23 -0.49 -0.3 -0.47 -0.07 -0.23 -0.03 0.16 0.23 0.49 0.67
-0.92 -1.46 -1.08 -1.11 -0.96 -0.42 -0.16 -0.92 -0.33 0.47 1.28 1.53
-0.61 -0.57 -0.63 -0.29 -0.37 -0.17 -0.35 -0.18 -0.21 0.35 0.72 1.06
-0.47 -0.63 -0.98 -0.62 -0.67 -0.27 -0.22 0.03 -0.01 0.35 0.8 1.09
-0.43 -0.29 -1.11 -0.7 -0.55 -0.14 -0.03 0.25 0.13 0.38 0.49 0.85
-1.16 -0.47 -1.06 -0.96 -0.65 -0.29 -0.16 0.2 -0.12 0.39 1.0 1.08
-0.4 -0.47 -0.77 -0.26 -0.36 0.01 -0.24 -0.21 -0.14 0.24 0.67 0.94
-0.24 -0.8 -0.76 -0.58 -0.33 -0.13 -0.06 -0.11 0.07 0.55 0.57 0.78
-0.02 -0.3 -1.32 -0.74 -0.72 -0.25 -0.26 -0.31 -0.37 0.27 0.88 1.2
-0.18 -0.18 -0.94 -0.26 -0.18 -0.02 -0.35 -0.28 -0.55 -0.08 0.81 1.01
-0.5 -0.58 -0.87 -0.32 -0.22 0.01 -0.57 -0.75 -0.43 0.39 0.84 1.21
-1.0 -0.8 -0.63 -0.32 -0.27 -0.26 -0.35 -0.39 -0.25 0.36 0.82 1.25
-0.35 -0.29 -1.03 -0.82 -0.75 0.12 -0.12 0.6 0.15 0.27 0.44 0.64
-1.38 -0.61 -1.13 -0.76 -0.72 -0.33 -0.61 -0.69 -0.34 0.58 1.08 1.5
-0.39 -1.04 -2.25 -0.95 -0.34 -0.07 -0.04 0.22 0.27 0.56 0.72 0.86
- -4.49 -2.36 -0.63 -1.73 -0.53 -0.59 -0.07 -0.33 0.94 1.2 1.81
-0.79 -1.14 -1.87 -0.79 -0.6 -0.44 -0.48 -0.24 -0.13 0.55 1.04 1.44
-0.74 -1.14 -1.02 -0.27 -0.22 -0.34 -0.54 0.1 -0.23 0.36 0.79 1.23
-0.47 -0.34 -0.56 -0.2 -0.15 0.09 -0.12 -0.07 -0.03 0.23 0.51 0.6
-3.44 -4.43 -2.85 -1.41 -1.04 -0.55 -0.68 -0.13 -0.22 0.7 1.35 1.85
0.49 -0.0 -0.87 -0.63 -0.79 -0.41 -0.64 -0.68 -0.52 0.26 0.82 1.1
-0.3 -0.77 -1.02 -0.47 -0.29 0.08 -0.13 -0.19 -0.38 0.22 0.73 1.1
-0.07 -0.16 -0.71 -0.21 -0.39 -0.28 -0.58 -0.5 -0.42 0.06 0.66 1.22
0.16 -0.09 -0.71 -0.42 -0.39 -0.21 -0.52 -0.45 -0.46 0.16 0.77 0.98
-1.18 -1.03 -1.64 -0.95 -0.66 -0.46 -0.89 -0.38 -0.24 0.55 1.17 1.59
-0.58 -0.5 -0.55 -0.32 -0.28 -0.06 -0.24 -0.29 -0.06 0.32 0.67 0.93
-1.47 -0.95 -1.12 -0.72 -0.43 -0.21 -0.29 -0.25 0.01 0.43 0.9 1.35
-0.21 -0.35 -0.72 -0.23 -0.27 -0.17 -0.29 -0.02 -0.48 0.02 0.71 1.0
-0.59 -0.63 -0.57 -0.41 -0.34 -0.35 -0.32 -0.23 -0.25 0.39 0.72 1.16
-0.28 -0.53 -0.63 -0.44 -0.36 -0.16 -0.19 -0.02 0.14 0.28 0.71 0.69
-0.47 -0.62 -0.6 -0.63 -0.33 -0.23 -0.27 -0.14 -0.07 0.23 0.82 1.03
-1.22 -1.18 -1.37 -1.34 -0.79 -0.28 -0.39 0.17 0.07 0.83 1.01 1.15
-0.44 -0.78 -1.15 -0.45 -0.72 -0.53 -0.26 0.26 0.06 0.51 0.87 0.9
-0.3 -0.42 -0.7 -0.34 -0.2 -0.07 -0.46 -0.33 -0.39 -0.01 0.66 1.24
-1.1 -0.99 -1.05 -0.44 -0.3 -0.08 -0.36 -0.43 -0.13 0.43 0.84 1.31
-0.49 -0.71 -0.85 -0.29 -0.4 -0.2 -0.23 -0.35 -0.11 0.3 0.75 1.13
-1.42 -2.18 -3.36 -1.66 -1.43 -0.42 -0.36 -0.12 -0.05 0.7 1.22 1.7
-0.4 -0.55 -0.8 -0.67 -0.6 -0.09 -0.27 -0.04 -0.09 0.34 0.79 1.01
-1.13 -1.32 -1.12 -0.69 -0.6 -0.37 -0.43 -0.6 -0.38 0.45 1.09 1.57
-1.38 -0.65 -0.89 -0.35 -0.05 0.16 -0.25 -0.18 0.03 0.29 0.76 0.93
-0.91 -0.57 -1.26 -1.47 -1.06 -0.11 -0.02 0.3 0.19 0.48 0.88 1.01
-0.55 -1.15 -1.65 -1.44 -0.88 -0.09 -0.08 -0.39 -0.04 0.56 1.02 1.33
-0.25 -0.35 -0.8 -0.45 -0.38 -0.05 -0.37 -0.48 -0.57 0.1 0.71 1.3
-1.74 -0.81 -0.48 -0.38 -0.34 -0.24 -0.3 0.05 -0.11 0.4 0.78 1.15
-0.14 -1.64 -1.54 -0.69 -1.19 -0.53 -0.43 0.04 -0.05 0.63 0.98 1.27
-0.23 -0.81 -0.96 -0.76 -0.64 -0.12 -0.24 0.05 -0.02 0.39 0.74 1.04
-0.41 -1.12 -1.23 -0.66 -0.64 -0.47 -0.33 0.08 -0.03 0.5 0.96 1.12
-0.19 -0.8 -1.2 -0.71 -0.39 0.0 -0.24 -0.14 -0.04 0.27 0.76 1.08
-0.56 -1.12 -1.03 -0.51 -0.27 0.11 -0.25 -0.28 -0.01 0.36 0.64 1.19
-0.27 -0.3 -0.75 -0.25 -0.39 -0.18 -0.51 -0.09 -0.57 0.11 0.78 1.11
-4.58 -2.63 -1.83 -1.41 -0.91 -0.39 -0.27 -0.66 -0.18 0.66 1.26 1.82
-0.65 -1.02 -3.1 -2.26 -1.02 -0.12 0.06 0.65 0.24 0.7 0.74 1.03
-0.21 -0.06 -1.04 -0.98 -0.84 -0.42 -0.45 -0.43 -0.5 0.15 0.98 1.39
-0.52 -0.89 -0.97 -0.26 -0.26 -0.16 -0.37 0.04 -0.28 0.28 0.74 1.12
-0.25 -0.16 -0.23 -0.1 -0.36 -0.2 -0.46 -0.26 -0.17 0.07 0.58 0.88
-0.62 -0.5 -0.81 -0.41 -0.19 -0.04 -0.24 -0.19 0.08 0.47 0.56 0.88
-0.36 -0.73 -0.86 -0.57 -0.55 -0.1 -0.28 0.02 0.1 0.62 0.73 0.74
-0.56 -1.17 -1.47 -0.63 -0.45 -0.29 -0.33 -0.21 -0.09 0.47 0.83 1.35
-0.33 -2.05 -2.2 -0.73 -0.85 -0.92 -0.35 0.32 -0.27 0.47 1.05 1.45
-0.26 -0.24 -0.91 -0.42 -0.32 -0.09 -0.3 -0.3 -0.34 0.29 0.66 1.06
-0.3 -0.34 -0.47 -0.41 -0.51 -0.07 -0.27 0.02 -0.38 0.3 0.6 0.94
-2.56 -1.49 -2.2 -0.88 -1.21 -1.42 -1.58 -0.68 -0.06 0.85 1.3 1.9
-1.29 -0.69 -0.78 -0.54 -0.41 -0.02 -0.25 -0.08 -0.07 0.47 0.78 1.09
-0.31 -0.12 -0.44 -0.36 -0.41 -0.46 -0.64 -0.77 -0.28 0.38 0.76 1.15
-0.1 -0.31 -0.92 -0.23 -0.3 -0.18 -0.37 -0.25 -0.61 0.01 0.68 1.21
-0.6 -0.79 -1.46 -0.52 -0.52 -0.21 -0.71 -0.07 -0.32 0.37 0.87 1.41
-0.29 -0.07 -0.6 -0.56 -0.5 -0.27 -0.21 -0.05 -0.04 0.28 0.63 0.84
-0.58 -0.54 -1.22 -1.36 -0.87 -0.07 -0.16 -0.13 0.15 0.51 0.89 1.09
-0.16 -0.52 -0.69 -0.49 -0.3 0.07 0.01 0.04 -0.21 0.37 0.56 0.63
-1.18 -1.17 -1.76 -0.85 -0.4 -0.08 -0.29 -0.23 -0.27 0.55 1.06 1.33
-0.28 -0.61 -0.87 -0.23 -0.33 -0.07 -0.52 -0.66 -0.43 0.23 0.8 1.26
-0.42 -0.58 -1.12 -0.46 -0.45 -0.13 -0.48 -0.52 -0.37 0.36 0.96 1.22
-1.47 -1.56 -1.93 -1.17 -0.65 0.13 0.13 -0.03 0.26 0.56 0.88 1.19
-0.69 -0.23 -0.8 -0.89 -0.65 -0.1 -0.08 0.24 -0.02 0.26 0.69 0.95
-0.84 -0.35 -0.65 -0.3 -0.47 -0.35 -0.6 -0.69 -0.36 0.37 0.85 1.36
-0.13 -0.28 -0.63 -0.22 -0.23 0.09 -0.19 -0.41 -0.18 0.07 0.47 0.92
-0.64 -0.52 -1.08 -0.95 -0.72 0.07 -0.01 -0.04 0.31 0.45 0.65 0.91
-1.77 -1.41 -1.63 -0.83 -0.87 -0.46 -0.28 0.08 0.18 0.62 0.85 1.49
-2.17 -1.43 -1.01 -0.5 -0.55 -0.69 -0.13 -0.22 -0.01 0.37 1.01 1.5
-2.05 -1.98 -1.88 -1.06 -0.83 -0.62 -0.22 0.16 -0.19 0.51 1.14 1.61
-1.53 -0.43 -0.48 -0.26 -0.16 0.17 -0.19 -0.24 -0.06 0.33 0.7 0.82
-0.12 -0.35 -1.12 -0.49 -0.44 -0.04 -0.5 -0.71 -0.68 0.21 0.95 1.25
-0.76 -1.51 -1.69 -2.37 -0.71 -0.35 -0.76 -0.53 0.36 0.61 1.13 1.52
-0.78 -0.58 -1.41 -1.21 -1.02 -0.21 -0.35 0.19 0.03 0.43 0.98 1.21
-0.21 -0.11 -0.49 -0.58 -0.26 -0.15 -0.38 -0.2 -0.64 -0.02 0.75 1.1
-0.71 -1.11 -0.95 -0.44 -0.32 0.19 -0.32 0.02 -0.13 0.52 0.7 0.96

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.