Heatmap: Cluster_6 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.01 0.04 0.06 0.07 0.02 0.09 0.4 1.0 0.62 0.53 0.44 0.44
0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.3 0.65 0.93 0.95 1.0 0.91 0.45
0.51 0.44 0.41 0.42 0.42 0.6 0.83 0.99 0.95 1.0 0.88 0.8
0.0 0.02 0.06 0.13 0.12 0.16 0.26 0.88 0.33 0.45 0.7 1.0
0.11 0.17 0.24 0.28 0.24 0.32 0.56 1.0 0.88 0.82 0.91 0.95
0.23 0.3 0.25 0.28 0.21 0.34 0.59 1.0 0.75 0.77 0.85 0.77
0.14 0.1 0.18 0.23 0.26 0.36 0.57 1.0 0.7 0.77 0.76 0.78
0.01 0.04 0.07 0.15 0.1 0.15 0.36 1.0 0.55 0.43 0.32 0.29
0.01 0.06 0.11 0.21 0.22 0.24 0.36 0.9 0.39 0.51 0.77 1.0
0.01 0.05 0.13 0.15 0.16 0.23 0.55 1.0 0.84 0.79 0.68 0.49
0.12 0.2 0.26 0.31 0.25 0.28 0.55 0.91 0.85 0.88 1.0 0.92
0.06 0.09 0.12 0.17 0.29 0.32 0.52 1.0 0.55 0.89 0.63 0.5
0.03 0.1 0.17 0.2 0.17 0.23 0.43 0.83 0.69 0.8 0.94 1.0
0.05 0.05 0.01 0.06 0.09 0.2 0.37 0.8 0.8 0.73 0.91 1.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.22 0.4 1.0 0.41 0.34 0.13 0.06
0.09 0.1 0.16 0.17 0.18 0.36 0.72 1.0 0.79 0.9 0.79 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.45 1.0 0.49 0.35 0.11 0.07
0.38 0.25 0.19 0.31 0.26 0.39 0.55 1.0 0.55 0.58 0.64 0.84
0.02 0.06 0.26 0.29 0.28 0.27 0.56 1.0 0.83 0.9 0.99 0.78
0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.03 0.29 0.87 0.69 0.79 1.0 0.96
0.21 0.34 0.35 0.43 0.37 0.42 0.67 1.0 0.81 0.66 0.68 0.71
0.0 0.0 0.0 0.07 0.15 0.32 0.65 1.0 0.66 0.56 0.5 0.44
0.13 0.26 0.18 0.24 0.23 0.4 0.66 1.0 0.7 0.66 0.78 0.63
0.36 0.12 0.11 0.12 0.11 0.19 0.44 0.84 0.65 0.69 0.75 1.0
0.1 0.18 0.19 0.23 0.17 0.19 0.62 1.0 0.77 0.69 0.56 0.57
0.01 0.02 0.04 0.07 0.11 0.18 0.31 0.91 0.41 0.54 0.76 1.0
0.0 0.05 0.03 0.12 0.19 0.39 0.5 0.65 0.67 0.66 0.67 1.0
0.19 0.19 0.11 0.15 0.17 0.39 0.67 1.0 0.79 0.82 0.82 0.83
0.01 0.03 0.05 0.09 0.09 0.23 0.49 0.94 0.53 0.68 0.82 1.0
0.39 0.47 0.42 0.54 0.45 0.54 0.7 1.0 0.73 0.85 0.89 0.89
0.04 0.06 0.06 0.05 0.12 0.22 0.57 1.0 0.67 0.64 0.43 0.49
0.54 0.48 0.3 0.32 0.31 0.51 0.77 0.68 0.96 0.98 1.0 0.97
0.03 0.05 0.11 0.2 0.17 0.17 0.33 0.89 0.55 0.64 0.9 1.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.33 1.0 0.6 0.59 0.55 0.61
0.16 0.09 0.12 0.0 0.02 0.33 0.45 1.0 0.67 0.78 0.73 0.72
0.04 0.13 0.19 0.25 0.2 0.25 0.5 1.0 0.73 0.79 0.89 0.9
0.43 0.15 0.14 0.29 0.36 0.55 0.88 0.96 1.0 0.96 0.75 0.38
0.02 0.05 0.07 0.1 0.08 0.08 0.42 0.8 0.69 0.64 0.64 1.0
0.02 0.06 0.05 0.05 0.06 0.28 0.56 1.0 0.72 0.73 0.67 0.48
0.02 0.04 0.09 0.12 0.06 0.02 0.48 1.0 0.7 0.5 0.47 0.62
0.03 0.06 0.14 0.18 0.18 0.2 0.29 0.77 0.45 0.55 0.77 1.0
0.17 0.41 0.35 0.29 0.27 0.44 0.68 1.0 0.8 0.84 0.95 0.89
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.37 0.61 1.0 0.7 0.86 0.79 0.35
0.01 0.14 0.14 0.2 0.17 0.21 0.42 0.97 0.81 0.9 1.0 0.97
0.07 0.23 0.32 0.23 0.12 0.16 0.53 1.0 0.73 0.71 0.67 0.66
0.0 0.05 0.07 0.04 0.03 0.18 0.67 1.0 0.64 0.79 0.82 0.69
0.0 0.01 0.06 0.06 0.09 0.11 0.44 1.0 0.79 0.88 0.92 0.85
0.47 0.48 0.41 0.42 0.46 0.52 0.75 1.0 0.9 0.92 0.95 0.86
0.68 0.55 0.58 0.55 0.47 0.61 0.76 1.0 0.83 0.9 0.97 0.92
0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.26 0.8 0.83 0.52 1.0 0.97
0.32 0.34 0.24 0.29 0.25 0.33 0.7 1.0 1.0 0.69 0.76 0.68
0.02 0.08 0.09 0.14 0.11 0.21 0.4 0.96 0.55 0.6 0.68 1.0
0.03 0.06 0.12 0.19 0.2 0.24 0.47 1.0 0.65 0.74 0.81 0.78
0.03 0.02 0.03 0.02 0.09 0.38 0.67 1.0 0.73 0.58 0.46 0.49
0.01 0.01 0.05 0.1 0.14 0.15 0.4 1.0 0.79 0.81 0.77 0.84
0.16 0.12 0.11 0.2 0.23 0.31 0.45 0.9 0.57 0.59 0.8 1.0
0.06 0.09 0.11 0.14 0.11 0.22 0.41 1.0 0.59 0.6 0.67 0.76
0.03 0.09 0.2 0.26 0.27 0.26 0.47 1.0 0.66 0.65 0.74 0.71
0.1 0.16 0.11 0.12 0.1 0.09 0.61 1.0 0.78 0.61 0.52 0.61
0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.13 0.6 1.0 0.56 0.49 0.53 0.56
0.0 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.31 0.9 0.81 0.71 0.79 1.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.39 1.0 0.7 0.62 0.58 0.67
0.0 0.0 0.01 0.08 0.2 0.39 0.73 1.0 0.71 0.58 0.61 0.52
0.0 0.0 0.01 0.05 0.19 0.36 0.5 0.98 0.76 1.0 0.81 0.47
0.1 0.17 0.19 0.22 0.23 0.44 0.75 1.0 0.74 0.66 0.64 0.57
0.37 0.3 0.2 0.26 0.26 0.55 0.67 0.81 0.73 0.68 0.87 1.0
0.04 0.11 0.16 0.22 0.2 0.32 0.66 1.0 0.73 0.66 0.71 0.84
0.09 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.27 0.71 0.7 0.61 0.78 1.0
0.07 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.78 0.65 0.67 0.71
0.02 0.02 0.05 0.1 0.14 0.26 0.57 1.0 0.58 0.64 0.68 0.73
0.02 0.04 0.05 0.06 0.06 0.19 0.5 1.0 0.63 0.6 0.5 0.38
0.01 0.04 0.09 0.13 0.14 0.28 0.48 0.84 0.63 0.68 0.83 1.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.36 1.0 0.74 0.73 0.82 0.79
0.07 0.04 0.02 0.0 0.08 0.13 0.4 1.0 0.53 0.66 0.72 0.69
0.01 0.05 0.08 0.17 0.12 0.25 0.56 1.0 0.78 0.84 0.94 0.8
0.48 0.48 0.4 0.39 0.35 0.52 0.78 0.72 0.92 0.86 0.94 1.0
0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.44 1.0 0.65 0.49 0.35 0.38
0.17 0.22 0.22 0.32 0.29 0.4 0.54 1.0 0.61 0.69 0.77 0.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.25 0.99 0.48 0.67 0.66 1.0
0.0 0.0 0.09 0.05 0.03 0.1 0.57 1.0 0.78 0.98 0.86 0.5
0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.18 0.36 1.0 0.56 0.47 0.17 0.12
0.02 0.09 0.21 0.18 0.24 0.41 0.56 1.0 0.7 0.79 0.78 0.73
0.04 0.13 0.25 0.28 0.3 0.33 0.48 0.98 0.6 0.62 0.89 1.0
0.09 0.13 0.15 0.27 0.25 0.26 0.37 0.75 0.49 0.53 0.71 1.0
0.61 0.07 0.03 0.12 0.16 0.23 0.41 1.0 0.71 0.77 0.85 0.91
0.03 0.08 0.15 0.23 0.24 0.3 0.48 0.98 0.68 0.8 0.93 1.0
0.0 0.0 0.01 0.05 0.11 0.22 0.59 1.0 0.58 0.56 0.57 0.57
0.47 0.14 0.09 0.14 0.15 0.25 0.57 1.0 0.73 0.75 0.62 0.86
0.02 0.08 0.14 0.2 0.19 0.25 0.58 0.89 0.85 0.94 0.97 1.0
0.45 0.33 0.15 0.11 0.13 0.34 0.63 0.77 0.76 0.69 0.95 1.0
0.2 0.07 0.11 0.22 0.19 0.3 0.41 0.92 0.54 0.61 0.79 1.0
0.07 0.22 0.25 0.18 0.1 0.16 0.48 0.86 0.78 0.76 0.97 1.0
0.01 0.08 0.17 0.19 0.12 0.1 0.38 0.76 0.59 0.77 0.83 1.0
0.07 0.13 0.04 0.04 0.04 0.03 0.21 0.6 0.53 0.55 0.62 1.0
0.04 0.03 0.07 0.06 0.02 0.01 0.49 1.0 0.65 0.46 0.26 0.37
0.02 0.04 0.1 0.17 0.16 0.22 0.42 0.84 0.6 0.68 0.9 1.0
0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.4 1.0 0.65 0.44 0.39 0.35
0.03 0.04 0.09 0.21 0.18 0.28 0.62 0.88 0.79 0.81 1.0 0.88
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.23 0.96 0.71 0.57 0.74 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.58 1.0 0.79 0.73 0.76 0.96
0.01 0.01 0.03 0.04 0.04 0.03 0.34 1.0 0.67 0.52 0.53 0.5
0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.16 0.48 1.0 0.71 0.62 0.52 0.6
0.01 0.02 0.03 0.07 0.09 0.06 0.32 1.0 0.77 0.8 0.85 0.93
0.12 0.14 0.19 0.24 0.25 0.36 0.54 1.0 0.51 0.61 0.73 0.75
0.4 0.32 0.23 0.17 0.16 0.31 0.64 1.0 0.85 0.76 0.73 0.67
0.07 0.21 0.1 0.26 0.27 0.43 0.68 1.0 0.85 0.69 0.66 0.63
0.02 0.03 0.11 0.12 0.1 0.18 0.42 1.0 0.66 0.81 0.83 0.86
0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.18 0.54 1.0 0.75 0.53 0.46 0.48
0.02 0.15 0.23 0.37 0.35 0.42 0.75 1.0 0.86 0.7 0.67 0.84
0.03 0.11 0.17 0.21 0.19 0.19 0.34 0.95 0.54 0.66 0.77 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.47 1.0 0.59 0.62 0.69 0.76
0.04 0.01 0.0 0.03 0.09 0.24 0.56 0.76 0.76 0.82 1.0 0.59
0.08 0.12 0.21 0.21 0.17 0.18 0.47 0.89 0.77 0.76 1.0 0.98
0.01 0.03 0.09 0.17 0.18 0.27 0.42 0.86 0.4 0.55 0.8 1.0
0.16 0.31 0.21 0.07 0.05 0.27 0.56 1.0 0.65 0.73 0.84 0.87
0.07 0.03 0.09 0.02 0.04 0.02 0.38 0.55 0.69 0.59 0.6 1.0
0.02 0.05 0.12 0.19 0.19 0.25 0.44 1.0 0.56 0.61 0.8 0.91
0.01 0.02 0.03 0.05 0.04 0.08 0.31 0.83 0.53 0.74 0.78 1.0
0.03 0.11 0.19 0.28 0.23 0.28 0.5 0.82 0.83 0.87 1.0 0.95
0.05 0.11 0.17 0.21 0.16 0.32 0.62 1.0 0.83 0.83 0.85 0.84
0.26 0.29 0.28 0.31 0.22 0.4 0.56 1.0 0.63 0.7 0.7 0.73
0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 0.09 0.54 0.94 0.73 0.74 0.79 1.0
0.0 0.02 0.09 0.1 0.14 0.17 0.45 0.89 0.47 0.56 0.74 1.0
0.01 0.03 0.06 0.07 0.04 0.08 0.44 1.0 0.64 0.53 0.43 0.47
0.05 0.09 0.0 0.0 0.01 0.15 0.4 0.94 0.41 0.56 0.58 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.12 0.34 1.0 0.45 0.32 0.16 0.08
0.03 0.03 0.0 0.01 0.0 0.26 0.53 1.0 0.69 0.42 0.17 0.1
0.02 0.07 0.12 0.17 0.14 0.23 0.37 0.86 0.44 0.48 0.74 1.0
0.03 0.1 0.2 0.22 0.22 0.29 0.54 0.76 0.8 0.89 0.98 1.0
0.1 0.07 0.12 0.2 0.24 0.28 0.65 1.0 0.77 0.75 0.78 0.86
0.03 0.1 0.07 0.12 0.14 0.27 0.42 1.0 0.53 0.43 0.36 0.31
0.19 0.12 0.05 0.06 0.05 0.29 0.57 1.0 0.7 0.62 0.51 0.47
0.01 0.01 0.04 0.01 0.03 0.03 0.36 0.98 0.79 0.83 0.97 1.0
0.06 0.15 0.11 0.04 0.02 0.22 0.45 1.0 0.59 0.61 0.68 0.63
0.37 0.42 0.26 0.24 0.2 0.41 0.67 0.79 0.81 0.88 1.0 0.95
0.1 0.19 0.23 0.18 0.22 0.48 0.65 1.0 0.72 0.84 0.98 0.98
0.02 0.09 0.17 0.26 0.22 0.23 0.39 0.84 0.51 0.64 0.81 1.0
0.03 0.07 0.12 0.17 0.19 0.22 0.42 0.82 0.56 0.67 0.78 1.0
0.07 0.02 0.02 0.05 0.07 0.1 0.4 1.0 0.61 0.39 0.39 0.37
0.04 0.1 0.17 0.27 0.24 0.32 0.62 0.92 0.84 0.87 1.0 1.0
0.05 0.12 0.18 0.24 0.29 0.29 0.5 1.0 0.68 0.71 0.82 0.93
0.16 0.13 0.14 0.37 0.32 0.3 0.62 1.0 0.82 0.58 0.42 0.44
0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.07 0.51 1.0 0.62 0.55 0.46 0.68
0.39 0.43 0.27 0.21 0.29 0.52 0.7 1.0 0.7 0.64 0.59 0.65
0.02 0.02 0.03 0.04 0.1 0.24 0.66 1.0 0.64 0.66 0.74 0.78
0.2 0.27 0.21 0.3 0.33 0.43 0.6 1.0 0.68 0.73 0.79 0.72
0.04 0.09 0.16 0.22 0.22 0.27 0.58 0.85 0.82 0.85 0.99 1.0
0.01 0.07 0.13 0.12 0.03 0.17 0.53 1.0 0.62 0.53 0.54 0.61
0.16 0.12 0.15 0.2 0.15 0.21 0.39 0.98 0.64 0.71 0.92 1.0
0.01 0.03 0.03 0.05 0.04 0.07 0.47 1.0 0.68 0.75 0.65 0.72
0.0 0.03 0.03 0.04 0.06 0.18 0.47 1.0 0.77 0.92 0.78 0.89
0.03 0.32 0.3 0.24 0.18 0.4 0.73 1.0 0.91 0.81 0.73 0.73
0.09 0.19 0.2 0.24 0.24 0.32 0.4 1.0 0.5 0.58 0.69 0.77
0.0 0.0 0.06 0.01 0.06 0.34 0.73 1.0 0.64 0.59 0.54 0.35
0.04 0.04 0.03 0.04 0.04 0.15 0.49 1.0 0.78 0.58 0.58 0.68
0.03 0.13 0.23 0.36 0.34 0.34 0.54 1.0 0.77 0.77 0.78 0.96
0.15 0.17 0.17 0.17 0.15 0.17 0.4 0.96 0.61 0.65 0.7 1.0
0.03 0.06 0.12 0.18 0.19 0.28 0.55 0.89 0.68 0.76 0.9 1.0
0.02 0.08 0.22 0.27 0.28 0.27 0.54 0.97 0.81 0.92 0.96 1.0
0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.24 0.5 1.0 0.77 0.82 0.9 0.67
0.15 0.14 0.12 0.09 0.07 0.12 0.6 1.0 0.89 0.87 0.79 0.74
0.01 0.05 0.1 0.09 0.1 0.14 0.49 1.0 0.64 0.59 0.57 0.42
0.19 0.1 0.01 0.02 0.08 0.23 0.4 0.86 0.74 0.88 1.0 0.59
0.04 0.07 0.14 0.28 0.25 0.27 0.46 0.8 0.61 0.74 0.86 1.0
0.33 0.54 0.35 0.31 0.36 0.57 0.76 0.93 0.84 0.89 1.0 0.89
0.03 0.07 0.14 0.18 0.17 0.26 0.63 1.0 0.72 0.71 0.7 0.64
0.03 0.02 0.06 0.11 0.15 0.19 0.43 0.79 0.59 0.6 0.74 1.0
0.35 0.52 0.35 0.38 0.34 0.47 0.64 0.89 0.79 0.84 1.0 0.88
0.0 0.07 0.12 0.13 0.15 0.13 0.57 1.0 0.68 0.63 0.58 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.54 1.0 0.97 0.86 0.91 0.77
0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.28 0.74 1.0 0.72 0.65 0.73 0.89
0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.13 0.36 1.0 0.54 0.47 0.34 0.3
0.14 0.16 0.12 0.11 0.19 0.26 0.49 0.93 0.72 1.0 0.84 0.67
0.06 0.03 0.09 0.17 0.24 0.26 0.57 0.99 0.76 0.94 0.94 1.0
0.27 0.31 0.25 0.34 0.21 0.27 0.5 1.0 0.76 0.73 0.81 0.9
0.19 0.22 0.2 0.27 0.28 0.35 0.43 1.0 0.48 0.64 0.76 0.79
0.18 0.21 0.14 0.14 0.09 0.14 0.31 0.99 0.53 0.65 0.81 1.0
0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.3 0.63 1.0 0.71 0.83 0.9 0.61
0.52 0.46 0.49 0.45 0.41 0.52 0.74 1.0 0.86 0.83 0.85 0.85
0.69 0.61 0.51 0.53 0.47 0.64 0.81 1.0 0.87 0.78 0.76 0.69
0.16 0.19 0.11 0.1 0.09 0.15 0.55 0.98 1.0 0.86 0.75 0.68
0.19 0.15 0.11 0.13 0.08 0.05 0.38 0.71 0.72 0.62 0.76 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.39 1.0 0.95 0.49 0.71 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.57 1.0 0.77 0.71 0.69 0.8
0.13 0.12 0.22 0.19 0.25 0.45 0.73 0.93 1.0 0.76 0.7 0.36
0.3 0.19 0.17 0.26 0.26 0.32 0.41 1.0 0.78 0.74 0.86 0.9
0.01 0.06 0.12 0.19 0.21 0.21 0.41 1.0 0.77 0.87 0.9 0.77
0.04 0.1 0.25 0.3 0.31 0.35 0.54 0.94 0.76 0.8 0.98 1.0
0.24 0.04 0.03 0.07 0.07 0.08 0.41 0.83 0.64 0.56 0.56 1.0
0.02 0.06 0.16 0.22 0.22 0.24 0.42 0.95 0.62 0.72 0.92 1.0
0.03 0.07 0.14 0.19 0.18 0.18 0.47 0.82 0.81 0.89 1.0 0.91
0.2 0.17 0.1 0.13 0.1 0.09 0.44 0.82 0.72 0.63 0.77 1.0
0.03 0.11 0.18 0.16 0.17 0.2 0.67 1.0 0.76 0.7 0.79 0.74
0.23 0.37 0.31 0.23 0.27 0.37 0.56 1.0 0.85 0.72 0.79 0.81
0.1 0.11 0.15 0.14 0.14 0.35 0.67 1.0 0.89 0.82 0.78 0.92
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.19 0.78 1.0 0.55 0.59 0.64 0.58
0.02 0.07 0.13 0.18 0.22 0.16 0.4 1.0 0.62 0.59 0.61 0.58
0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.16 0.35 1.0 0.62 0.53 0.25 0.22
0.12 0.18 0.2 0.32 0.24 0.17 0.64 1.0 0.74 0.74 0.63 0.78
0.03 0.04 0.04 0.13 0.12 0.3 0.52 1.0 0.7 0.54 0.4 0.35
0.28 0.36 0.31 0.29 0.17 0.45 0.67 0.95 0.67 0.82 0.9 1.0
0.03 0.08 0.14 0.21 0.17 0.18 0.39 1.0 0.71 0.85 1.0 0.95
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.09 0.42 1.0 0.51 0.42 0.36 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)