Heatmap: Cluster_22 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
Kfl00012_0010 (kfl00012_0010_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.03
Kfl00029_0350 (kfl00029_0350_v1.1)
0.0 0.04 0.05 0.08 0.0 0.12 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
Kfl00031_g12 (kfl00031_g12_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
Kfl00034_g20 (kfl00034_g20_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00038_0375 (kfl00038_0375_v1.1)
0.15 0.42 0.08 0.13 0.22 0.06 0.32 0.28 0.31 0.33 0.15 0.32
Kfl00042_0010 (kfl00042_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00048_0020 (kfl00048_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00053_0185 (kfl00053_0185_v1.1)
0.04 0.53 0.0 0.02 0.1 0.15 0.47 0.14 0.15 0.23 0.17 0.32
Kfl00060_0150 (kfl00060_0150_v1.1)
0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05
Kfl00073_0270 (kfl00073_0270_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00074_0030 (kfl00074_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00076_0070 (kfl00076_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00086_0040 (kfl00086_0040_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00105_0310 (kfl00105_0310_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00115_0020 (kfl00115_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
Kfl00131_g24 (kfl00131_g24_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00134_0140 (kfl00134_0140_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00136_g15 (kfl00136_g15_v1.1)
0.0 0.18 0.22 0.68 0.0 0.11 0.06 0.19 0.47 0.31 0.38 0.16
Kfl00151_0060 (kfl00151_0060_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.03
Kfl00164_0040 (kfl00164_0040_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00208_0160 (kfl00208_0160_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.2 0.02 0.05 0.0 0.05 0.0 0.13 0.02 0.0
Kfl00213_0220 (kfl00213_0220_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00227_0140 (kfl00227_0140_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
Kfl00228_0220 (kfl00228_0220_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00266_g15 (kfl00266_g15_v1.1)
0.27 0.71 0.31 1.22 0.26 0.75 0.46 0.12 0.28 0.08 0.23 0.29
Kfl00268_g10 (kfl00268_g10_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00287_0060 (kfl00287_0060_v1.1)
0.32 0.0 0.0 0.43 0.0 0.03 0.15 0.07 0.05 0.06 0.08 0.0
Kfl00327_0130 (kfl00327_0130_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00351_0020 (kfl00351_0020_v1.1)
0.11 0.18 0.16 0.41 0.27 0.17 0.34 0.1 0.1 0.05 0.09 0.37
Kfl00353_0060 (kfl00353_0060_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00410_0085 (kfl00410_0085_v1.1)
0.0 0.07 0.03 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
Kfl00428_0020 (kfl00428_0020_v1.1)
33.85 32.58 26.37 29.52 28.05 29.12 32.94 31.74 33.81 31.03 33.59 36.24
Kfl00460_0130 (kfl00460_0130_v1.1)
0.43 0.0 0.0 0.22 0.0 0.11 0.0 0.0 0.11 0.08 0.1 0.0
Kfl00471_0060 (kfl00471_0060_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 4.66 0.0 0.0 4.56 2.58 1.37 0.0 4.93 0.0
Kfl00496_0090 (kfl00496_0090_v1.1)
0.0 0.13 0.04 0.22 0.0 0.07 0.18 0.0 0.16 0.12 0.1 0.0
Kfl00510_0020 (kfl00510_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00517_0020 (kfl00517_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00519_0030 (kfl00519_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00526_0060 (kfl00526_0060_v1.1)
0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.05 0.02 0.03 0.03
Kfl00613_0010 (kfl00613_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00643_0050 (kfl00643_0050_v1.1)
0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00657_0030 (kfl00657_0030_v1.1)
0.0 0.13 0.02 0.22 0.02 0.09 0.17 0.16 0.1 0.03 0.07 0.08
Kfl00739_0040 (kfl00739_0040_v1.1)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00749_0010 (kfl00749_0010_v1.1)
1.31 2.76 1.66 3.46 0.98 1.94 2.03 2.35 2.12 1.88 1.92 1.83
Kfl00752_0010 (kfl00752_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00823_0020 (kfl00823_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00856_0020 (kfl00856_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00862_0060 (kfl00862_0060_v1.1)
0.11 0.33 0.17 0.53 0.19 0.37 0.2 0.16 0.18 0.17 0.12 0.29
Kfl01081_0030 (kfl01081_0030_v1.1)
0.15 0.35 0.15 0.26 0.06 0.21 0.19 0.23 0.16 0.19 0.1 0.13
Kfl01308_0030 (kfl01308_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01339_0010 (kfl01339_0010_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0
Kfl01363_g2 (kfl01363_g2_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01604_0010 (kfl01604_0010_v1.1)
0.04 0.02 0.0 0.17 0.06 0.05 0.0 0.05 0.02 0.05 0.02 0.05
Kfl01777_0010 (kfl01777_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01805_g1 (kfl01805_g1_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)