Heatmap: Cluster_4 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
Kfl00003_0020 (kfl00003_0020_v1.1)
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00003_0450 (kfl00003_0450_v1.1)
0.43 0.13 0.0 0.68 0.34 0.53 1.13 1.03 0.43 0.28 0.33 0.05
Kfl00006_0880 (kfl00006_0880_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00010_0370 (kfl00010_0370_v1.1)
1.87 1.0 2.88 4.48 1.74 3.3 3.67 3.91 2.26 3.24 4.04 4.14
Kfl00010_0580 (kfl00010_0580_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00022_0070 (kfl00022_0070_v1.1)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.26 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
Kfl00025_0560 (kfl00025_0560_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00047_0185 (kfl00047_0185_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.03 0.08 0.02 0.0
Kfl00052_0310 (kfl00052_0310_v1.1)
0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
Kfl00057_0250 (kfl00057_0250_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
Kfl00072_0130 (kfl00072_0130_v1.1)
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00083_0380 (kfl00083_0380_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00083_g23 (kfl00083_g23_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Kfl00094_0220 (kfl00094_0220_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00106_0160 (kfl00106_0160_v1.1)
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.28 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00110_0100 (kfl00110_0100_v1.1)
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00132_0020 (kfl00132_0020_v1.1)
0.04 0.0 0.05 0.03 0.03 0.03 0.27 0.05 0.0 0.05 0.0 0.03
Kfl00136_0060 (kfl00136_0060_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00150_0260 (kfl00150_0260_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00151_0250 (kfl00151_0250_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00161_0160 (kfl00161_0160_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00166_0020 (kfl00166_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00172_0105 (kfl00172_0105_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
Kfl00185_0220 (kfl00185_0220_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00199_0110 (kfl00199_0110_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.05 0.12 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
Kfl00252_0050 (kfl00252_0050_v1.1)
0.0 0.0 0.11 0.13 0.15 0.14 0.06 0.12 0.08 0.11 0.11 0.19
Kfl00276_0190 (kfl00276_0190_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00290_0110 (kfl00290_0110_v1.1)
0.0 0.02 0.04 0.11 0.07 0.03 0.08 0.14 0.08 0.04 0.12 0.08
Kfl00317_0030 (kfl00317_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00362_0100 (kfl00362_0100_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00363_0070 (kfl00363_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
Kfl00363_0130 (kfl00363_0130_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00372_0070 (kfl00372_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00422_0125 (kfl00422_0125_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.09 0.24 0.05 0.0 0.14 0.0 0.03
Kfl00631_0020 (kfl00631_0020_v1.1)
0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00662_0010 (kfl00662_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00678_g3 (kfl00678_g3_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00699_0070 (kfl00699_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
Kfl00740_g2 (kfl00740_g2_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.14 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
Kfl00808_0060 (kfl00808_0060_v1.1)
0.08 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.04 0.0 0.03
Kfl00857_0050 (kfl00857_0050_v1.1)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
12.41 0.0 6.75 0.0 3.48 0.0 4.94 2.02 0.0 3.69 5.63 0.0
Kfl00872_0060 (kfl00872_0060_v1.1)
2.19 2.26 2.52 3.28 2.48 1.89 2.47 2.68 3.16 2.44 2.91 2.42
Kfl00915_0020 (kfl00915_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01029_0010 (kfl01029_0010_v1.1)
0.34 0.0 0.0 0.31 0.0 0.26 0.59 0.3 0.11 0.31 0.39 0.21
Kfl01040_0010 (kfl01040_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01122_0030 (kfl01122_0030_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.04 0.0 0.08
Kfl01193_0010 (kfl01193_0010_v1.1)
0.14 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01205_0030 (kfl01205_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)