Heatmap: Cluster_25 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
Kfl00001_0530 (kfl00001_0530_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
Kfl00011_0480 (kfl00011_0480_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00013_0450 (kfl00013_0450_v1.1)
0.0 0.07 0.0 0.26 0.48 1.54 0.34 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00014_0380 (kfl00014_0380_v1.1)
151.4 119.48 120.8 129.92 131.15 142.43 106.75 120.29 118.58 110.79 122.09 105.59
Kfl00029_0330 (kfl00029_0330_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00040_0190 (kfl00040_0190_v1.1)
1.42 0.39 0.48 1.18 1.2 1.53 2.05 1.65 0.92 1.23 0.83 0.75
Kfl00046_0280 (kfl00046_0280_v1.1)
5.04 4.52 3.47 4.94 3.97 5.05 4.37 3.89 3.81 3.86 3.86 4.32
Kfl00053_0260 (kfl00053_0260_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00055_0260 (kfl00055_0260_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03
Kfl00080_g17 (kfl00080_g17_v1.1)
0.07 0.09 0.0 0.0 0.04 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl00084_0080 (kfl00084_0080_v1.1)
23.24 20.61 19.36 18.95 19.27 20.43 16.21 16.44 18.38 17.47 19.08 17.21
Kfl00086_0220 (kfl00086_0220_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00099_0070 (kfl00099_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03
Kfl00101_g9 (kfl00101_g9_v1.1)
0.15 0.1 0.32 0.0 0.0 0.67 0.12 0.0 0.0 0.2 0.19 0.11
Kfl00110_0280 (kfl00110_0280_v1.1)
0.04 0.2 0.04 0.2 0.06 0.54 0.09 0.14 0.33 0.08 0.02 0.11
Kfl00111_0270 (kfl00111_0270_v1.1)
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.03 0.05 0.03 0.08 0.05 0.08
Kfl00117_0230 (kfl00117_0230_v1.1)
47.98 51.51 31.3 29.82 31.98 30.97 33.38 21.9 26.6 27.95 28.98 35.8
Kfl00126_0120 (kfl00126_0120_v1.1)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
Kfl00136_0140 (kfl00136_0140_v1.1)
0.84 1.0 1.16 1.81 1.34 1.49 1.78 1.27 1.38 1.69 1.86 1.95
Kfl00142_g14 (kfl00142_g14_v1.1)
3.66 3.05 1.44 2.32 1.69 2.68 1.6 2.04 1.71 1.29 2.08 2.24
Kfl00144_0240 (kfl00144_0240_v1.1)
57.64 39.98 32.92 30.25 34.92 38.53 33.1 35.58 31.6 31.79 30.4 34.02
Kfl00145_0190 (kfl00145_0190_v1.1)
0.18 0.04 0.07 0.12 0.02 0.22 0.06 0.07 0.08 0.09 0.12 0.13
Kfl00172_0100 (kfl00172_0100_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00190_0150 (kfl00190_0150_v1.1)
0.0 0.02 0.03 0.0 0.05 0.33 0.0 0.1 0.11 0.08 0.1 0.06
Kfl00202_0020 (kfl00202_0020_v1.1)
0.86 1.0 1.37 1.9 1.9 2.98 1.84 1.55 1.97 1.83 2.47 2.74
Kfl00205_0150 (kfl00205_0150_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00208_0240 (kfl00208_0240_v1.1)
27.22 16.18 19.4 18.94 18.49 21.1 13.3 11.61 12.44 14.23 15.19 14.9
Kfl00220_0070 (kfl00220_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00231_g1 (kfl00231_g1_v1.1)
3.02 0.62 1.38 0.0 3.56 5.53 4.72 0.7 1.47 0.55 1.3 0.74
Kfl00236_0010 (kfl00236_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.02 0.03 0.02 0.03 0.0
Kfl00266_0080 (kfl00266_0080_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00304_0060 (kfl00304_0060_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00334_0120 (kfl00334_0120_v1.1)
51.18 40.9 41.39 41.08 44.31 46.77 35.54 35.53 38.25 39.03 38.82 36.81
Kfl00361_0020 (kfl00361_0020_v1.1)
0.08 0.0 0.05 0.02 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00403_0070 (kfl00403_0070_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00429_0030 (kfl00429_0030_v1.1)
0.21 0.42 0.32 0.79 0.26 0.37 0.55 0.14 0.26 0.14 0.17 0.24
Kfl00457_0080 (kfl00457_0080_v1.1)
0.72 0.71 0.77 1.1 0.97 0.88 0.36 0.69 0.57 0.71 0.61 0.75
Kfl00471_0020 (kfl00471_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0
Kfl00525_0060 (kfl00525_0060_v1.1)
0.03 0.0 0.09 0.0 0.08 0.1 0.08 0.02 0.03 0.05 0.07 0.0
Kfl00554_0010 (kfl00554_0010_v1.1)
25.98 20.31 16.45 15.77 17.43 18.4 16.88 15.86 14.83 16.81 17.29 17.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00594_g2 (kfl00594_g2_v1.1)
0.49 0.31 0.0 0.51 0.0 0.45 0.09 0.07 0.0 0.21 0.07 0.26
Kfl00645_0040 (kfl00645_0040_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.05
Kfl00649_0040 (kfl00649_0040_v1.1)
36.26 31.48 29.04 26.86 28.5 28.85 25.38 24.62 26.09 26.37 26.39 27.61
Kfl00651_0030 (kfl00651_0030_v1.1)
0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.1 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00657_0020 (kfl00657_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
Kfl00660_0020 (kfl00660_0020_v1.1)
65.71 51.82 43.3 50.01 50.74 53.2 35.11 43.13 44.8 43.81 50.88 39.23
Kfl00701_0060 (kfl00701_0060_v1.1)
462.06 464.13 441.07 371.11 351.27 347.74 383.39 334.54 371.3 371.92 406.98 404.28
Kfl00732_0070 (kfl00732_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00737_0050 (kfl00737_0050_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00747_0050 (kfl00747_0050_v1.1)
0.17 0.18 0.0 0.18 0.17 0.09 0.15 0.02 0.11 0.0 0.05 0.16
Kfl00747_0065 (kfl00747_0065_v1.1)
0.24 0.24 0.09 0.08 0.21 0.08 0.09 0.05 0.05 0.02 0.05 0.18
Kfl00758_0040 (kfl00758_0040_v1.1)
0.17 0.02 0.0 0.08 0.08 0.19 0.03 0.15 0.13 0.1 0.05 0.03
Kfl00759_0020 (kfl00759_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.11 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00854_0060 (kfl00854_0060_v1.1)
191.81 139.45 116.29 115.37 105.59 126.86 126.04 116.29 113.84 119.19 118.6 126.69
Kfl00923_0020 (kfl00923_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05
Kfl00941_0030 (kfl00941_0030_v1.1)
0.19 0.09 0.0 0.4 0.2 0.65 0.15 0.19 0.08 0.06 0.11 0.16
Kfl00980_0010 (kfl00980_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03
Kfl00981_g4 (kfl00981_g4_v1.1)
0.0 0.09 0.2 0.0 0.61 1.8 0.33 1.02 0.25 0.73 0.2 0.72
Kfl01005_0020 (kfl01005_0020_v1.1)
64.83 50.12 45.1 48.26 45.33 44.53 42.29 41.94 45.81 46.51 48.66 44.4
Kfl01009_0020 (kfl01009_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01171_0010 (kfl01171_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01463_0010 (kfl01463_0010_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01485_0010 (kfl01485_0010_v1.1)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01566_0010 (kfl01566_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0
Kfl01586_0010 (kfl01586_0010_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)