Heatmap: Cluster_96 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
Kfl00003_0550 (kfl00003_0550_v1.1)	-0.56	-0.26	-0.09	0.05	0.15	0.11	0.09	0.07	0.1	0.06	0.09	0.04
Kfl00008_0030 (kfl00008_0030_v1.1)	-0.67	-0.34	0.04	-0.15	-0.03	-0.1	0.11	0.3	0.22	0.23	0.03	0.1
Kfl00014_0370 (kfl00014_0370_v1.1)	-1.44	-0.68	-0.06	-0.1	0.1	0.2	0.14	0.31	0.28	0.25	0.09	0.11
Kfl00014_0570 (kfl00014_0570_v1.1)	-1.41	-0.44	-0.17	0.12	0.13	0.2	0.13	0.17	0.23	0.17	0.18	0.04
Kfl00014_0660 (kfl00014_0660_v1.1)	-0.83	-0.35	-0.02	0.05	-0.01	0.04	0.22	0.22	0.06	0.15	0.11	0.08
Kfl00024_0180 (kfl00024_0180_v1.1)	-0.37	-0.33	-0.13	-0.06	-0.14	0.12	0.08	0.25	0.2	0.07	0.16	0.0
Kfl00027_0360 (kfl00027_0360_v1.1)	-0.81	-0.52	-0.25	0.02	0.19	0.24	0.28	0.09	0.21	0.05	0.11	-0.0
Kfl00028_0150 (kfl00028_0150_v1.1)	-2.06	-0.46	-0.01	0.11	0.11	0.18	0.18	0.13	0.3	0.12	0.19	0.09
Kfl00044_0250 (kfl00044_0250_v1.1)	-0.96	-0.28	-0.12	-0.11	0.01	0.05	0.14	0.22	0.18	0.21	0.18	0.12
Kfl00045_0350 (kfl00045_0350_v1.1)	-1.9	-0.58	-0.06	0.12	0.29	0.24	0.21	0.27	0.24	0.07	0.11	-0.1
Kfl00053_0120 (kfl00053_0120_v1.1)	-1.01	-0.34	-0.15	-0.01	0.05	0.06	0.19	0.17	0.2	0.25	0.17	0.03
Kfl00065_0100 (kfl00065_0100_v1.1)	-0.52	-0.33	-0.32	-0.05	-0.09	0.13	0.12	0.25	0.14	0.16	0.18	0.11
Kfl00068_0170 (kfl00068_0170_v1.1)	-0.81	-0.36	-0.14	-0.12	0.13	0.02	0.09	0.21	0.24	0.18	0.13	0.12
Kfl00073_0190 (kfl00073_0190_v1.1)	-0.63	-0.31	-0.17	-0.09	-0.15	0.02	-0.02	0.14	0.26	0.28	0.21	0.22
Kfl00077_0010 (kfl00077_0010_v1.1)	-0.56	-0.35	-0.08	0.07	0.13	-0.03	0.03	0.07	0.1	0.19	0.1	0.16
Kfl00081_0330 (kfl00081_0330_v1.1)	-0.78	-0.51	0.06	-0.15	0.03	-0.0	-0.12	0.14	0.1	0.26	0.29	0.3
Kfl00091_0220 (kfl00091_0220_v1.1)	-0.81	-0.39	0.02	-0.17	-0.17	-0.09	0.08	0.08	0.3	0.21	0.25	0.31
Kfl00094_0250 (kfl00094_0250_v1.1)	-0.44	-0.41	0.02	0.05	0.03	0.02	0.12	0.06	0.16	0.08	0.13	0.03
Kfl00106_0120 (kfl00106_0120_v1.1)	-0.89	-0.4	-0.1	-0.03	-0.03	0.08	0.09	0.15	0.23	0.18	0.17	0.2
Kfl00110_0350 (kfl00110_0350_v1.1)	-1.05	-0.49	-0.18	-0.05	0.04	0.01	0.07	0.25	0.32	0.32	0.12	0.13
Kfl00115_0100 (kfl00115_0100_v1.1)	-0.41	-0.52	-0.13	-0.16	-0.21	-0.0	-0.09	0.22	0.22	0.18	0.3	0.32
Kfl00120_0120 (kfl00120_0120_v1.1)	-0.82	-0.73	0.03	-0.26	-0.05	0.06	-0.26	0.15	0.3	0.3	0.3	0.4
Kfl00124_0180 (kfl00124_0180_v1.1)	-0.74	-0.32	-0.07	0.03	-0.02	0.2	0.07	0.0	0.23	0.13	0.13	0.12
Kfl00147_0130 (kfl00147_0130_v1.1)	-1.68	-0.71	-0.26	0.22	0.06	0.21	0.22	0.15	0.3	0.1	0.22	0.18
Kfl00156_0020 (kfl00156_0020_v1.1)	-0.98	-0.51	0.1	-0.11	-0.13	0.08	-0.06	0.17	0.27	0.27	0.18	0.26
Kfl00158_0260 (kfl00158_0260_v1.1)	-0.92	-0.5	0.04	-0.01	-0.07	-0.05	-0.11	0.23	0.29	0.28	0.23	0.15
Kfl00208_0260 (kfl00208_0260_v1.1)	-0.7	-0.55	-0.04	-0.12	0.03	-0.02	0.16	0.19	0.24	0.14	0.25	0.09
Kfl00226_0060 (kfl00226_0060_v1.1)	-1.47	-0.64	-0.13	0.05	0.25	0.19	0.15	0.15	0.28	0.23	0.14	0.02
Kfl00238_0040 (kfl00238_0040_v1.1)	-0.88	-0.27	-0.0	-0.11	0.02	0.04	0.05	0.15	0.08	0.25	0.18	0.17
Kfl00247_0210 (kfl00247_0210_v1.1)	-0.9	-0.28	0.01	-0.06	0.12	0.15	0.12	0.22	0.14	0.15	0.03	-0.01
Kfl00260_0210 (kfl00260_0210_v1.1)	-0.95	-0.38	-0.05	0.13	0.08	0.09	0.15	0.13	0.1	0.22	0.04	0.1
Kfl00272_0110 (kfl00272_0110_v1.1)	-1.61	-0.72	-0.21	0.02	0.19	0.33	0.18	0.46	0.32	0.13	-0.01	-0.07
Kfl00294_0090 (kfl00294_0090_v1.1)	-1.75	-0.69	-0.26	0.17	0.2	0.14	0.07	0.19	0.32	0.18	0.26	0.13
Kfl00302_0090 (kfl00302_0090_v1.1)	-0.97	-0.44	0.01	0.14	0.03	0.02	0.15	0.17	0.28	0.04	0.11	0.06
Kfl00307_0140 (kfl00307_0140_v1.1)	-1.29	-0.33	0.03	-0.07	-0.02	0.06	0.26	0.3	0.21	0.1	0.13	0.06
Kfl00316_0070 (kfl00316_0070_v1.1)	-0.9	-0.6	-0.01	-0.26	-0.48	-0.16	0.28	0.47	0.27	0.18	0.26	0.29
Kfl00370_0130 (kfl00370_0130_v1.1)	-0.69	-0.29	0.01	0.01	0.0	0.19	-0.25	0.06	0.19	0.14	0.17	0.2
Kfl00394_0010 (kfl00394_0010_v1.1)	-1.69	-0.82	0.04	-0.24	-0.24	-0.1	0.11	0.21	0.46	0.39	0.23	0.47
Kfl00395_0010 (kfl00395_0010_v1.1)	-1.43	-0.65	-0.21	-0.18	-0.02	0.08	0.21	0.45	0.34	0.29	0.24	0.02
Kfl00418_0020 (kfl00418_0020_v1.1)	-1.34	-0.62	-0.31	-0.16	-0.01	0.2	0.15	0.38	0.34	0.23	0.26	0.09
Kfl00419_0050 (kfl00419_0050_v1.1)	-0.75	-0.34	0.09	-0.02	-0.06	0.04	-0.08	0.17	0.22	0.15	0.17	0.16
Kfl00441_0070 (kfl00441_0070_v1.1)	-0.53	-0.36	-0.01	-0.15	-0.13	-0.0	-0.24	0.03	0.18	0.22	0.26	0.44
Kfl00457_0060 (kfl00457_0060_v1.1)	-0.88	-0.44	-0.3	-0.22	-0.14	0.12	-0.19	0.26	0.32	0.27	0.49	0.18
Kfl00462_0050 (kfl00462_0050_v1.1)	-1.05	-0.42	0.14	-0.09	0.05	0.11	0.08	0.18	0.16	0.2	0.09	0.14
Kfl00508_0120 (kfl00508_0120_v1.1)	-1.3	-0.31	-0.02	0.07	-0.01	0.14	0.04	0.25	0.24	0.17	0.16	0.02
Kfl00510_0050 (kfl00510_0050_v1.1)	-0.76	-0.58	0.07	-0.09	0.09	-0.1	0.23	0.3	0.25	0.18	0.08	-0.04
Kfl00515_0020 (kfl00515_0020_v1.1)	-1.23	-0.43	0.14	-0.08	-0.02	-0.06	0.26	0.34	0.19	0.13	0.11	0.09
Kfl00542_0030 (kfl00542_0030_v1.1)	-1.09	-0.55	0.18	-0.17	-0.07	0.11	-0.03	0.21	0.3	0.23	0.14	0.19
Kfl00636_0055 (kfl00636_0055_v1.1)	-0.64	-0.26	0.07	0.02	0.1	0.05	0.15	0.19	0.11	0.05	0.02	-0.03
Kfl00638_0010 (kfl00638_0010_v1.1)	-0.51	-0.34	-0.1	-0.15	0.13	0.05	0.13	0.15	0.11	0.12	0.11	0.13
Kfl00663_0060 (kfl00663_0060_v1.1)	-1.1	-0.67	0.01	-0.09	-0.2	0.21	-0.06	0.21	0.23	0.32	0.21	0.29
Kfl00771_0010 (kfl00771_0010_v1.1)	-0.77	-0.32	0.1	0.03	-0.01	-0.13	-0.16	0.08	0.24	0.28	0.18	0.17
Kfl00925_g2 (kfl00925_g2_v1.1)	-1.04	-0.64	-0.01	-0.22	-0.01	-0.29	-0.09	0.09	0.49	0.39	0.37	0.27
Kfl00990_g2 (kfl00990_g2_v1.1)	-2.21	-1.54	-0.6	0.12	0.21	0.14	0.36	0.25	0.29	0.28	0.29	0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.