Heatmap: Cluster_46 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
Kfl00001_0100 (kfl00001_0100_v1.1)
0.11 0.0 0.16 0.08 0.15 0.05 0.14 0.02 0.08 0.02 0.0 0.0
Kfl00009_0250 (kfl00009_0250_v1.1)
0.08 0.43 0.22 0.88 0.6 0.54 0.51 0.19 0.26 0.33 0.52 0.57
Kfl00017_0580 (kfl00017_0580_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03
Kfl00023_0160 (kfl00023_0160_v1.1)
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00027_g13 (kfl00027_g13_v1.1)
2.41 1.34 1.18 1.73 1.92 2.14 1.57 1.71 2.0 0.38 1.04 0.74
Kfl00029_0310 (kfl00029_0310_v1.1)
1.37 0.29 0.46 0.17 0.1 0.09 0.27 0.09 0.08 0.22 0.13 0.33
Kfl00038_0020 (kfl00038_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.2 0.1 0.05 0.05 0.12 0.1 0.13 0.05 0.05 0.0
Kfl00044_0280 (kfl00044_0280_v1.1)
0.04 0.0 0.25 0.08 0.06 0.0 0.14 0.02 0.08 0.06 0.05 0.06
Kfl00055_0210 (kfl00055_0210_v1.1)
0.17 0.07 0.25 0.4 0.14 0.45 0.11 0.12 0.21 0.06 0.25 0.2
Kfl00057_g26 (kfl00057_g26_v1.1)
0.11 0.0 0.96 0.48 0.3 0.52 0.7 0.07 0.0 0.08 0.31 0.26
36.65 4.43 15.9 0.0 0.0 25.15 11.91 4.86 5.0 0.0 9.27 0.0
Kfl00085_0030 (kfl00085_0030_v1.1)
0.11 0.09 0.16 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03
Kfl00089_0220 (kfl00089_0220_v1.1)
0.03 0.0 0.12 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0
Kfl00098_0030 (kfl00098_0030_v1.1)
79.54 87.47 79.04 77.36 79.16 99.34 89.14 87.32 96.86 90.08 95.11 85.31
Kfl00099_0090 (kfl00099_0090_v1.1)
38.65 36.51 36.8 36.97 36.32 31.49 31.71 34.51 36.26 33.01 33.27 33.07
Kfl00106_0020 (kfl00106_0020_v1.1)
0.38 0.68 1.84 1.79 0.68 1.58 1.53 0.66 0.98 0.5 0.79 0.48
Kfl00111_0110 (kfl00111_0110_v1.1)
8.97 6.73 10.72 8.05 7.58 7.49 7.24 8.61 9.21 8.78 7.86 8.9
Kfl00123_0130 (kfl00123_0130_v1.1)
0.24 0.2 0.2 0.03 0.04 0.05 0.06 0.05 0.05 0.22 0.12 0.05
Kfl00133_0280 (kfl00133_0280_v1.1)
0.0 0.0 0.13 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.05 0.0
Kfl00134_0230 (kfl00134_0230_v1.1)
0.08 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03
Kfl00138_0200 (kfl00138_0200_v1.1)
39.09 36.62 39.53 40.43 40.31 39.51 35.95 38.14 39.91 39.43 39.66 39.83
Kfl00153_g9 (kfl00153_g9_v1.1)
0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00159_0160 (kfl00159_0160_v1.1)
11.65 12.44 13.3 16.11 13.47 14.81 10.65 10.38 11.23 11.42 11.08 12.34
Kfl00165_g7 (kfl00165_g7_v1.1)
0.0 0.0 0.32 0.14 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
Kfl00173_0220 (kfl00173_0220_v1.1)
18.3 18.53 20.33 19.6 20.1 22.9 17.71 19.71 22.63 22.54 22.55 20.93
Kfl00233_0030 (kfl00233_0030_v1.1)
0.61 0.16 0.47 0.0 0.0 0.08 0.14 0.0 0.16 0.1 0.02 0.18
Kfl00234_0140 (kfl00234_0140_v1.1)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00239_g2 (kfl00239_g2_v1.1)
0.23 0.8 1.37 1.14 0.77 0.51 1.2 1.15 1.88 1.45 1.28 1.17
Kfl00253_0040 (kfl00253_0040_v1.1)
0.07 0.0 0.08 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
Kfl00256_0070 (kfl00256_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00258_0070 (kfl00258_0070_v1.1)
1.19 1.25 1.38 1.66 0.76 1.03 1.79 0.48 1.07 0.94 0.81 0.64
Kfl00269_g5 (kfl00269_g5_v1.1)
0.32 0.22 0.52 0.98 0.79 0.1 0.18 0.6 0.41 0.4 0.35 0.16
Kfl00271_0140 (kfl00271_0140_v1.1)
30.36 27.2 30.22 30.75 30.22 32.43 26.15 31.67 30.97 32.01 31.52 30.22
Kfl00292_0040 (kfl00292_0040_v1.1)
19.48 20.54 22.03 20.54 22.93 23.86 22.58 22.92 22.47 23.56 21.74 21.79
Kfl00296_0130 (kfl00296_0130_v1.1)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00300_0100 (kfl00300_0100_v1.1)
0.21 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00305_0030 (kfl00305_0030_v1.1)
7.83 5.95 6.22 2.8 3.69 3.09 2.72 3.6 3.99 2.84 5.54 3.65
Kfl00309_0090 (kfl00309_0090_v1.1)
0.03 0.09 0.14 0.31 0.38 0.21 0.2 0.48 0.33 0.3 0.39 0.28
Kfl00333_0070 (kfl00333_0070_v1.1)
12.76 12.83 13.82 14.55 15.43 17.78 13.75 15.25 17.27 16.46 15.81 14.65
Kfl00340_0140 (kfl00340_0140_v1.1)
0.0 0.0 0.15 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl00347_0060 (kfl00347_0060_v1.1)
0.15 0.14 0.33 0.1 0.02 0.1 0.05 0.12 0.11 0.25 0.15 0.06
Kfl00353_g14 (kfl00353_g14_v1.1)
0.0 0.2 0.64 0.45 0.5 0.26 0.16 0.14 0.08 0.06 0.3 0.08
Kfl00355_0020 (kfl00355_0020_v1.1)
0.0 0.04 0.04 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.08 0.0 0.03 0.03
Kfl00369_0060 (kfl00369_0060_v1.1)
0.1 0.22 0.41 0.26 0.22 0.22 0.2 0.31 0.18 0.22 0.14 0.17
Kfl00369_0080 (kfl00369_0080_v1.1)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00376_0120 (kfl00376_0120_v1.1)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00387_0050 (kfl00387_0050_v1.1)
4.03 4.29 7.79 5.22 6.8 4.64 8.38 5.92 6.02 5.74 6.38 6.48
Kfl00390_0140 (kfl00390_0140_v1.1)
0.25 0.21 0.2 0.66 0.79 1.05 0.49 0.7 0.72 0.81 0.85 0.59
Kfl00469_0070 (kfl00469_0070_v1.1)
0.04 0.02 0.36 0.09 0.07 0.06 0.13 0.09 0.13 0.04 0.07 0.05
Kfl00492_0080 (kfl00492_0080_v1.1)
0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00526_0065 (kfl00526_0065_v1.1)
0.0 0.07 0.12 0.0 0.0 0.13 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0
Kfl00533_0050 (kfl00533_0050_v1.1)
11.8 8.7 12.19 12.88 15.41 14.56 8.26 10.83 13.35 13.32 13.98 16.17
Kfl00536_g4 (kfl00536_g4_v1.1)
0.38 0.43 0.83 0.35 0.38 0.27 0.97 0.22 0.34 0.4 0.35 0.36
Kfl00561_0050 (kfl00561_0050_v1.1)
0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00587_0020 (kfl00587_0020_v1.1)
108.38 82.24 112.31 89.95 96.64 103.9 88.79 99.25 105.14 102.84 100.07 107.67
Kfl00644_0040 (kfl00644_0040_v1.1)
35.75 23.66 30.67 25.29 23.84 25.0 25.83 25.39 28.38 29.06 27.6 31.63
Kfl00646_g1 (kfl00646_g1_v1.1)
97.11 118.56 105.64 93.23 80.74 70.22 88.3 80.54 79.47 76.45 80.17 88.21
0.0 0.0 8.83 1.54 0.0 0.0 1.33 6.35 0.0 1.09 0.0 2.95
Kfl00735_g3 (kfl00735_g3_v1.1)
0.08 0.0 0.56 0.12 0.08 0.19 0.12 0.14 0.16 0.0 0.14 0.05
Kfl00807_0030 (kfl00807_0030_v1.1)
21.16 21.15 21.56 20.95 22.46 26.01 20.98 23.32 22.54 24.11 24.09 22.81
Kfl00811_0010 (kfl00811_0010_v1.1)
0.0 0.02 0.04 0.05 0.06 0.03 0.06 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0
Kfl00899_0020 (kfl00899_0020_v1.1)
0.0 0.26 0.28 0.57 0.56 0.43 0.06 0.24 0.36 0.32 0.1 0.53
Kfl00938_0020 (kfl00938_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00955_g2 (kfl00955_g2_v1.1)
68.7 69.34 105.99 93.33 87.05 105.75 75.91 79.16 90.3 98.42 96.43 110.27
Kfl00991_0010 (kfl00991_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01047_0010 (kfl01047_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl01167_0010 (kfl01167_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01288_0010 (kfl01288_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01498_g2 (kfl01498_g2_v1.1)
0.0 0.02 0.16 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01526_g1 (kfl01526_g1_v1.1)
12.26 8.71 17.88 8.75 12.85 12.95 8.56 8.98 7.54 9.63 9.07 9.91
Kfl01536_0020 (kfl01536_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)