Heatmap: Cluster_23 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
Kfl00002_g40 (kfl00002_g40_v1.1)
0.0 0.0 0.09 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.32 0.0
Kfl00004_0610 (kfl00004_0610_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00006_0960 (kfl00006_0960_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
Kfl00007_0290 (kfl00007_0290_v1.1)
1.75 0.67 0.04 0.65 0.47 0.42 0.56 0.22 0.62 0.32 0.43 0.3
Kfl00012_0215 (kfl00012_0215_v1.1)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00016_0260 (kfl00016_0260_v1.1)
0.0 0.07 0.2 0.24 0.06 0.22 0.21 0.17 0.13 0.19 0.31 0.35
Kfl00017_0090 (kfl00017_0090_v1.1)
0.08 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00045_0300 (kfl00045_0300_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00045_0370 (kfl00045_0370_v1.1)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
Kfl00046_0035 (kfl00046_0035_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00047_0290 (kfl00047_0290_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.1 0.03
Kfl00054_g11 (kfl00054_g11_v1.1)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00055_0350 (kfl00055_0350_v1.1)
0.21 0.0 0.08 0.0 0.17 0.09 0.09 0.0 0.08 0.07 0.29 0.0
Kfl00056_0230 (kfl00056_0230_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00060_0120 (kfl00060_0120_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00062_0290 (kfl00062_0290_v1.1)
0.11 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00064_0170 (kfl00064_0170_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00068_g1 (kfl00068_g1_v1.1)
0.46 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
Kfl00071_0350 (kfl00071_0350_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00077_0090 (kfl00077_0090_v1.1)
0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00078_0160 (kfl00078_0160_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00109_0110 (kfl00109_0110_v1.1)
0.61 0.3 0.58 0.47 0.61 0.19 0.47 0.92 0.58 0.47 0.77 0.47
Kfl00110_0230 (kfl00110_0230_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00132_0030 (kfl00132_0030_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
Kfl00135_g23 (kfl00135_g23_v1.1)
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00171_0120 (kfl00171_0120_v1.1)
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
Kfl00182_0060 (kfl00182_0060_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00191_0060 (kfl00191_0060_v1.1)
0.0 0.07 0.14 0.04 0.09 0.03 0.06 0.0 0.1 0.04 0.1 0.08
Kfl00194_0200 (kfl00194_0200_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00196_0040 (kfl00196_0040_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00196_0070 (kfl00196_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl00218_0090 (kfl00218_0090_v1.1)
0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.11 0.07 0.03
Kfl00227_0120 (kfl00227_0120_v1.1)
3.76 1.44 1.07 2.01 1.34 0.83 1.19 1.32 1.07 1.65 1.31 1.18
Kfl00244_0040 (kfl00244_0040_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.15 0.11
Kfl00249_0160 (kfl00249_0160_v1.1)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00252_0010 (kfl00252_0010_v1.1)
1.68 0.6 0.0 0.2 0.13 0.0 0.55 0.19 0.73 0.76 0.15 0.21
Kfl00273_0170 (kfl00273_0170_v1.1)
0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.02 0.08 0.07 0.1 0.11
Kfl00274_0120 (kfl00274_0120_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00334_0070 (kfl00334_0070_v1.1)
16.8 2.9 0.5 6.99 1.91 3.26 6.71 1.76 5.97 4.57 0.99 0.83
Kfl00340_0060 (kfl00340_0060_v1.1)
0.77 0.16 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.14 0.29 0.51 0.14 0.08
Kfl00363_0150 (kfl00363_0150_v1.1)
0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00372_0100 (kfl00372_0100_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.03 0.0 0.07 0.0
Kfl00404_0150 (kfl00404_0150_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl00412_0020 (kfl00412_0020_v1.1)
0.38 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
Kfl00421_0080 (kfl00421_0080_v1.1)
1.3 0.38 0.06 0.45 0.18 0.14 0.3 0.07 0.37 0.23 0.09 0.05
Kfl00452_0030 (kfl00452_0030_v1.1)
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00452_0130 (kfl00452_0130_v1.1)
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.14 0.17 0.05
3.64 0.0 0.0 1.15 0.0 0.0 1.14 1.06 0.0 1.88 1.01 0.0
Kfl00512_0020 (kfl00512_0020_v1.1)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl00516_0030 (kfl00516_0030_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl00607_0010 (kfl00607_0010_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00653_0030 (kfl00653_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03
Kfl00755_0010 (kfl00755_0010_v1.1)
0.15 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
Kfl00789_0060 (kfl00789_0060_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00824_0070 (kfl00824_0070_v1.1)
0.38 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.17
Kfl00833_g3 (kfl00833_g3_v1.1)
0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl00908_0020 (kfl00908_0020_v1.1)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00918_g5 (kfl00918_g5_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00980_0020 (kfl00980_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl01024_0010 (kfl01024_0010_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01359_0010 (kfl01359_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
17.01 5.05 0.0 3.12 0.0 2.96 0.0 5.2 0.0 13.73 5.14 11.76
Kfl01458_g1 (kfl01458_g1_v1.1)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.22 0.05
2.43 1.69 1.59 0.0 0.0 2.13 0.0 0.0 9.32 1.75 5.32 0.0
Kfl01737_0010 (kfl01737_0010_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Kfl01760_0010 (kfl01760_0010_v1.1)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)