Heatmap: Cluster_121 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
Kfl00003_0060 (kfl00003_0060_v1.1)	-0.93	-0.14	-0.16	0.12	0.15	0.02	0.34	0.0	0.03	0.07	-0.0	0.17
Kfl00003_0095 (kfl00003_0095_v1.1)	-0.41	-0.89	-0.66	0.15	0.08	0.28	0.36	0.11	-0.01	-0.04	0.33	0.15
Kfl00013_0160 (kfl00013_0160_v1.1)	-0.59	-0.6	-0.3	0.17	-0.03	0.06	0.26	0.15	0.23	0.17	0.13	0.04
Kfl00013_0185 (kfl00013_0185_v1.1)	-0.83	-1.32	-0.53	0.19	0.17	0.46	0.34	0.2	0.15	0.08	-0.11	0.25
Kfl00014_0190 (kfl00014_0190_v1.1)	-0.43	0.09	0.16	-0.06	-0.18	-0.27	-0.01	-0.21	-0.11	0.23	0.2	0.38
Kfl00014_0440 (kfl00014_0440_v1.1)	-1.35	-0.18	0.01	0.26	0.03	-0.11	0.36	0.22	0.02	0.02	0.09	0.06
Kfl00014_g34 (kfl00014_g34_v1.1)	-0.7	-0.73	-0.35	-0.06	-0.29	0.01	0.23	0.28	0.52	0.39	0.11	0.01
Kfl00022_0040 (kfl00022_0040_v1.1)	-1.46	-1.17	-0.14	0.21	0.12	0.29	0.3	0.39	0.1	0.04	0.07	0.17
Kfl00023_0110 (kfl00023_0110_v1.1)	-0.19	-0.25	-0.17	0.23	0.26	0.28	0.22	-0.22	-0.14	-0.04	-0.2	0.06
Kfl00024_0190 (kfl00024_0190_v1.1)	-0.72	-0.78	-0.64	0.18	0.33	0.18	0.31	0.13	0.22	0.18	0.14	-0.11
Kfl00024_0200 (kfl00024_0200_v1.1)	-0.43	-0.28	0.1	-0.09	0.05	0.07	0.07	0.06	0.04	0.09	0.09	0.13
Kfl00024_0390 (kfl00024_0390_v1.1)	-1.14	-0.36	-0.03	-0.06	-0.06	-0.03	0.5	0.22	0.09	0.09	0.19	0.07
Kfl00024_0400 (kfl00024_0400_v1.1)	-0.32	-0.29	-0.16	0.06	-0.16	0.15	0.14	-0.03	0.12	0.15	0.12	0.1
Kfl00029_0430 (kfl00029_0430_v1.1)	-0.49	-0.15	-0.0	0.15	0.05	0.01	0.27	-0.03	0.08	0.01	0.0	-0.02
Kfl00033_0190 (kfl00033_0190_v1.1)	-1.05	-0.8	-0.02	0.02	-0.04	0.09	0.44	0.04	-0.09	0.39	0.09	0.27
Kfl00035_0250 (kfl00035_0250_v1.1)	-0.2	-0.08	-0.09	0.13	-0.02	-0.05	0.1	0.07	-0.05	0.02	0.04	0.11
Kfl00036_0360 (kfl00036_0360_v1.1)	-0.54	-0.21	-0.05	0.03	0.02	0.11	0.09	0.11	0.09	0.08	0.03	0.11
Kfl00039_0450 (kfl00039_0450_v1.1)	-0.44	-0.26	0.02	0.07	0.01	0.17	0.17	0.08	0.0	-0.05	-0.04	0.16
Kfl00045_0020 (kfl00045_0020_v1.1)	-0.2	-0.15	-0.02	0.03	-0.05	0.08	-0.06	0.08	0.03	0.05	0.06	0.12
Kfl00048_0440 (kfl00048_0440_v1.1)	-0.57	0.01	0.15	-0.0	-0.16	0.17	0.21	-0.05	-0.11	-0.03	0.07	0.15
Kfl00054_0270 (kfl00054_0270_v1.1)	-0.55	-0.39	-0.09	0.01	-0.14	0.02	0.26	0.28	0.28	0.22	-0.01	-0.17
Kfl00057_0490 (kfl00057_0490_v1.1)	-0.37	-0.0	-0.06	0.04	-0.03	-0.04	0.43	0.07	-0.03	-0.12	-0.16	0.13
Kfl00061_0180 (kfl00061_0180_v1.1)	-0.32	-0.14	0.14	-0.05	-0.18	0.03	0.11	0.23	0.02	-0.03	0.02	0.08
Kfl00067_0090 (kfl00067_0090_v1.1)	-1.04	-0.37	0.07	0.12	0.0	0.08	0.09	0.23	0.09	0.11	0.1	0.13
Kfl00067_0380 (kfl00067_0380_v1.1)	-0.98	-0.9	-0.98	0.52	0.26	0.07	0.33	0.21	-0.21	-0.02	0.23	0.41
Kfl00067_0390 (kfl00067_0390_v1.1)	-1.4	-0.72	-1.29	-0.13	0.04	0.24	0.41	0.44	0.18	0.18	0.31	0.36
Kfl00067_0410 (kfl00067_0410_v1.1)	-0.69	-0.44	-0.27	0.27	0.09	0.04	0.21	0.06	0.21	-0.02	0.11	0.13
Kfl00069_0410 (kfl00069_0410_v1.1)	-0.37	-0.3	-0.17	0.07	0.03	0.09	0.18	0.11	0.13	0.12	-0.02	-0.0
Kfl00071_0200 (kfl00071_0200_v1.1)	-1.71	-0.64	-0.31	0.03	0.12	0.08	0.44	0.27	0.29	0.16	0.18	0.06
Kfl00075_0080 (kfl00075_0080_v1.1)	-0.75	-0.36	-0.12	0.13	-0.08	0.03	0.18	0.21	0.13	0.12	0.13	0.12
Kfl00077_0290 (kfl00077_0290_v1.1)	-0.86	-0.72	-0.2	0.23	0.02	0.24	0.36	0.25	0.22	-0.03	0.02	-0.03
Kfl00078_0180 (kfl00078_0180_v1.1)	-0.63	-0.06	0.05	-0.17	-0.32	0.09	0.2	0.17	-0.05	0.01	0.11	0.36
Kfl00081_0210 (kfl00081_0210_v1.1)	-0.62	-0.59	-0.34	-0.01	-0.28	0.25	0.51	0.07	0.02	0.09	0.23	0.21
Kfl00086_0260 (kfl00086_0260_v1.1)	-0.87	-0.39	-0.49	0.08	-0.09	0.05	0.34	0.15	0.32	0.31	0.15	-0.04
Kfl00088_0140 (kfl00088_0140_v1.1)	-1.03	-0.41	0.09	0.03	0.01	0.07	0.16	0.17	0.09	0.06	0.11	0.25
Kfl00113_0020 (kfl00113_0020_v1.1)	-0.56	-0.28	-0.11	0.03	0.01	0.17	0.25	0.09	-0.02	0.13	0.06	0.06
Kfl00115_0080 (kfl00115_0080_v1.1)	-1.14	-0.39	0.07	-0.04	0.0	0.0	0.2	0.22	-0.09	0.06	0.19	0.4
Kfl00116_0100 (kfl00116_0100_v1.1)	-0.52	-0.16	0.1	0.22	-0.07	-0.01	0.21	-0.02	-0.0	-0.02	0.02	0.1
Kfl00116_0140 (kfl00116_0140_v1.1)	-0.86	-0.71	-0.02	-0.1	-0.09	0.21	0.15	0.32	0.07	0.11	0.18	0.26
Kfl00121_0220 (kfl00121_0220_v1.1)	-0.58	-0.29	-0.04	0.21	-0.07	0.11	0.23	0.15	0.08	0.04	0.01	-0.03
Kfl00122_0110 (kfl00122_0110_v1.1)	-0.94	-0.24	-0.02	0.13	0.04	0.08	0.27	0.11	-0.05	0.04	0.1	0.15
Kfl00127_0155 (kfl00127_0155_v1.1)	-0.13	-0.04	0.02	-0.02	0.01	0.05	0.05	0.07	0.05	-0.07	-0.05	0.04
Kfl00129_0050 (kfl00129_0050_v1.1)	-0.75	-0.53	-0.09	0.1	0.05	0.06	0.26	0.4	0.02	-0.04	0.02	0.16
Kfl00135_0250 (kfl00135_0250_v1.1)	-0.45	-0.14	0.13	-0.09	-0.27	-0.06	0.08	0.01	-0.12	0.05	0.18	0.47
Kfl00159_0080 (kfl00159_0080_v1.1)	-1.86	-2.23	-1.62	-0.21	0.08	0.38	-0.08	0.58	0.5	0.41	0.42	0.53
Kfl00159_0150 (kfl00159_0150_v1.1)	-0.65	-0.13	-0.01	0.07	-0.04	-0.19	0.28	0.08	0.12	0.11	0.09	0.08
Kfl00160_0010 (kfl00160_0010_v1.1)	-0.84	-0.49	-0.3	0.03	-0.18	-0.0	0.29	0.23	0.08	0.14	0.16	0.43
Kfl00164_0050 (kfl00164_0050_v1.1)	-0.56	-0.35	-0.23	0.14	-0.12	-0.14	0.13	0.15	0.18	0.27	0.17	0.11
Kfl00181_0230 (kfl00181_0230_v1.1)	-0.36	-0.4	-0.35	0.14	0.27	0.22	0.25	0.31	0.06	-0.0	-0.14	-0.27
Kfl00182_0210 (kfl00182_0210_v1.1)	-1.11	-0.67	-0.54	0.44	-0.15	0.23	0.18	0.15	0.52	0.08	0.11	-0.03
Kfl00186_0130 (kfl00186_0130_v1.1)	-0.34	-0.23	0.01	0.17	-0.09	-0.11	0.52	0.04	-0.36	-0.02	0.04	0.15
Kfl00193_0120 (kfl00193_0120_v1.1)	-0.17	-0.31	-0.02	0.03	0.04	0.14	0.11	0.09	0.04	-0.03	-0.03	0.05
Kfl00196_0010 (kfl00196_0010_v1.1)	-1.6	-0.85	-0.26	-0.07	0.13	0.25	0.29	0.5	0.09	0.09	0.18	0.18
Kfl00200_0130 (kfl00200_0130_v1.1)	-0.82	-0.51	0.08	-0.04	0.05	0.12	0.11	0.24	-0.06	0.29	0.14	0.04
Kfl00212_0100 (kfl00212_0100_v1.1)	-0.66	-0.17	-0.44	0.1	-0.01	0.02	0.52	0.08	0.3	0.18	-0.12	-0.16
Kfl00212_0110 (kfl00212_0110_v1.1)	-0.68	-0.27	-0.4	0.05	-0.07	-0.06	0.23	0.1	0.31	0.33	0.14	-0.0
Kfl00230_0070 (kfl00230_0070_v1.1)	-0.36	-0.13	0.08	0.05	-0.07	0.01	0.16	0.09	0.01	-0.0	0.01	0.08
Kfl00230_0120 (kfl00230_0120_v1.1)	-0.95	-0.39	0.14	0.29	-0.07	0.25	0.35	0.12	-0.11	-0.15	-0.03	0.13
Kfl00231_0060 (kfl00231_0060_v1.1)	-1.22	-0.42	-0.35	0.11	0.64	0.2	0.56	0.09	-0.25	-0.05	-0.23	0.06
Kfl00239_0110 (kfl00239_0110_v1.1)	-0.2	-0.02	-0.19	0.03	-0.14	0.05	0.21	0.07	0.01	0.01	0.05	0.07
Kfl00242_0160 (kfl00242_0160_v1.1)	-1.03	-0.96	-0.57	0.06	0.52	0.16	0.65	0.39	-0.04	0.13	-0.08	-0.26
Kfl00243_0100 (kfl00243_0100_v1.1)	-1.45	-0.13	0.1	-0.01	-0.42	-0.09	0.23	0.46	-0.19	-0.06	0.26	0.47
Kfl00248_0080 (kfl00248_0080_v1.1)	-0.56	-0.32	-0.66	-0.14	-0.12	0.17	0.68	0.28	0.06	0.05	0.04	0.02
Kfl00248_0100 (kfl00248_0100_v1.1)	-2.32	-1.12	-0.5	-0.18	0.78	0.18	0.23	0.4	0.17	-0.06	0.21	0.22
Kfl00262_0100 (kfl00262_0100_v1.1)	-1.06	-0.15	0.01	0.1	-0.14	0.0	0.36	0.22	0.08	0.04	0.03	0.11
Kfl00264_0220 (kfl00264_0220_v1.1)	-0.15	-0.02	-0.14	0.14	-0.12	0.02	0.16	0.1	-0.09	-0.03	0.02	0.07
Kfl00266_0160 (kfl00266_0160_v1.1)	-0.4	-0.19	0.07	0.06	-0.01	0.19	-0.21	-0.0	0.12	0.0	0.11	0.14
Kfl00283_0100 (kfl00283_0100_v1.1)	-0.51	-0.15	-0.12	0.13	-0.01	-0.11	0.21	0.2	0.07	0.04	0.09	0.04
Kfl00283_0110 (kfl00283_0110_v1.1)	-0.48	-0.43	0.18	0.14	0.01	-0.11	0.27	0.07	-0.18	0.02	0.05	0.24
Kfl00302_0190 (kfl00302_0190_v1.1)	-0.49	-0.35	-0.02	0.05	-0.02	0.07	0.22	0.09	0.05	0.05	0.08	0.12
Kfl00306_0050 (kfl00306_0050_v1.1)	-1.37	-0.4	-0.38	0.12	0.18	0.16	0.17	0.16	0.15	0.27	0.07	0.2
Kfl00308_0100 (kfl00308_0100_v1.1)	-0.6	-0.24	-0.01	0.04	-0.04	0.11	0.07	0.02	0.05	0.13	0.17	0.15
Kfl00324_0160 (kfl00324_0160_v1.1)	-0.16	-0.12	0.07	-0.11	0.01	0.02	-0.04	0.03	0.01	-0.01	0.1	0.17
Kfl00342_0090 (kfl00342_0090_v1.1)	-2.46	-1.17	-1.1	0.53	0.61	0.74	0.54	0.19	-0.56	0.47	-0.07	-0.59
Kfl00344_0020 (kfl00344_0020_v1.1)	-1.58	-1.43	-0.19	0.17	-0.04	0.19	0.48	0.27	-0.08	0.3	0.14	0.38
Kfl00352_0100 (kfl00352_0100_v1.1)	-0.52	-0.32	-0.06	-0.09	-0.16	0.07	0.08	0.14	0.11	0.2	0.15	0.21
Kfl00388_g4 (kfl00388_g4_v1.1)	-0.25	-0.16	-0.22	0.04	-0.18	0.18	0.13	0.04	0.04	0.12	0.15	0.03
Kfl00395_0040 (kfl00395_0040_v1.1)	-1.69	-0.69	0.01	0.13	0.17	0.02	0.26	0.18	0.08	0.1	0.16	0.32
Kfl00433_0030 (kfl00433_0030_v1.1)	-0.31	-0.16	-0.12	0.11	-0.0	0.11	0.21	-0.03	0.14	0.03	-0.02	-0.03
Kfl00451_0050 (kfl00451_0050_v1.1)	-0.85	-0.67	-0.22	-0.03	-0.19	0.15	0.25	0.21	0.34	0.25	0.22	0.02
Kfl00481_0040 (kfl00481_0040_v1.1)	-1.18	-0.97	-0.6	0.04	0.51	0.25	0.42	0.36	-0.12	0.08	-0.04	0.25
Kfl00496_0050 (kfl00496_0050_v1.1)	-0.78	-0.7	-0.47	0.06	0.02	0.26	0.41	0.17	0.12	0.16	0.08	0.16
Kfl00511_0060 (kfl00511_0060_v1.1)	-0.71	-0.58	-0.23	0.09	0.05	0.2	0.31	0.25	0.2	0.15	-0.05	-0.05
Kfl00528_0020 (kfl00528_0020_v1.1)	-0.25	-0.17	0.09	-0.09	-0.07	0.08	0.08	0.06	0.02	0.05	0.06	0.1
Kfl00585_0010 (kfl00585_0010_v1.1)	-0.68	-0.45	-0.14	0.07	0.01	0.01	0.08	0.17	0.16	0.14	0.21	0.18
Kfl00623_0040 (kfl00623_0040_v1.1)	-1.26	-1.4	-0.51	0.42	0.53	0.28	0.54	0.05	-0.15	0.15	-0.17	0.16
Kfl00690_0110 (kfl00690_0110_v1.1)	-0.33	-0.13	-0.05	0.02	-0.01	-0.09	0.14	0.09	0.04	0.14	0.07	0.06
Kfl00694_0020 (kfl00694_0020_v1.1)	-0.74	-0.46	0.04	0.13	0.12	0.13	0.25	0.13	0.02	-0.0	0.01	0.1
Kfl00716_0010 (kfl00716_0010_v1.1)	-0.22	-0.16	-0.05	-0.05	-0.13	0.09	0.1	0.05	0.06	0.09	0.04	0.12
Kfl00755_0015 (kfl00755_0015_v1.1)	-0.96	-0.36	0.13	-0.02	-0.1	0.07	0.23	0.23	0.09	0.16	0.07	0.11
Kfl00768_0040 (kfl00768_0040_v1.1)	-0.89	-0.46	-0.69	0.14	0.27	0.26	0.38	0.26	0.23	0.12	-0.07	-0.18
Kfl00840_0050 (kfl00840_0050_v1.1)	-1.01	-0.55	-0.44	0.06	0.12	-0.04	0.38	0.21	0.21	0.32	0.13	0.03
Kfl00958_0030 (kfl00958_0030_v1.1)	-0.71	-0.23	-0.11	0.07	-0.23	0.16	0.47	0.09	-0.05	0.07	0.01	0.15
Kfl01004_0010 (kfl01004_0010_v1.1)	-0.45	-0.32	-0.15	0.12	0.05	0.06	0.16	-0.02	0.15	0.13	0.08	0.07
Kfl01022_0020 (kfl01022_0020_v1.1)	-0.35	-0.25	-0.18	0.05	-0.27	0.07	0.3	0.02	0.07	0.07	0.11	0.21
Kfl01060_0040 (kfl01060_0040_v1.1)	-0.53	-0.14	0.02	0.19	0.06	0.13	0.19	0.0	-0.02	-0.05	-0.01	0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.