Heatmap: Cluster_80 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
Kfl00004_0630 (kfl00004_0630_v1.1)	-0.34	-0.25	0.05	0.12	0.27	0.22	-0.11	0.1	0.06	0.0	-0.08	-0.17
Kfl00006_0210 (kfl00006_0210_v1.1)	-0.4	-0.32	0.09	-0.06	0.09	0.25	-0.28	0.11	0.11	0.11	0.04	0.1
Kfl00009_0660 (kfl00009_0660_v1.1)	-0.51	-0.36	0.13	-0.03	0.27	0.05	-0.15	0.15	0.03	0.19	0.05	0.0
Kfl00010_0380 (kfl00010_0380_v1.1)	-0.58	-0.56	-0.06	0.17	0.23	0.32	-0.16	0.15	-0.01	0.02	0.08	0.11
Kfl00012_0510 (kfl00012_0510_v1.1)	-0.54	-0.36	0.12	0.02	0.2	0.25	-0.13	0.1	0.09	0.01	0.06	0.01
Kfl00018_0120 (kfl00018_0120_v1.1)	-0.46	-0.48	0.09	-0.01	0.08	0.19	0.02	0.08	0.08	0.09	0.06	0.1
Kfl00024_0420 (kfl00024_0420_v1.1)	-0.64	-0.26	0.17	0.05	0.21	0.29	-0.12	0.12	0.0	0.01	-0.03	-0.02
Kfl00026_0200 (kfl00026_0200_v1.1)	-0.64	-0.23	0.03	0.18	0.17	0.31	-0.09	0.04	0.05	0.03	-0.02	-0.03
Kfl00030_0310 (kfl00030_0310_v1.1)	-0.13	-0.26	0.1	-0.1	0.03	0.17	-0.11	0.12	0.02	0.0	0.06	0.03
Kfl00038_0010 (kfl00038_0010_v1.1)	-0.53	-0.25	-0.03	0.13	0.25	0.23	-0.1	0.11	0.08	-0.01	-0.02	-0.04
Kfl00040_0150 (kfl00040_0150_v1.1)	-0.33	-0.13	0.0	0.14	0.24	0.22	-0.15	0.03	-0.02	0.03	-0.07	-0.08
Kfl00046_0270 (kfl00046_0270_v1.1)	-0.9	-0.58	0.16	0.23	0.22	0.24	-0.06	0.11	0.01	0.05	-0.03	0.11
Kfl00050_0410 (kfl00050_0410_v1.1)	-0.62	-0.19	0.13	0.09	0.14	0.31	-0.2	0.02	0.04	0.03	-0.0	0.06
Kfl00058_0340 (kfl00058_0340_v1.1)	-0.57	-0.04	0.06	0.2	0.29	0.15	-0.22	-0.0	0.11	0.06	-0.1	-0.13
Kfl00060_0310 (kfl00060_0310_v1.1)	-0.57	-0.32	0.03	-0.01	0.17	0.24	-0.16	0.23	0.07	0.06	0.03	0.05
Kfl00082_0160 (kfl00082_0160_v1.1)	-0.88	-0.31	0.21	0.16	0.31	0.46	-0.46	0.07	0.02	0.01	-0.0	-0.06
Kfl00084_0070 (kfl00084_0070_v1.1)	-0.52	-0.22	0.17	0.24	0.14	0.21	-0.25	0.05	0.04	-0.01	-0.0	-0.02
Kfl00102_g7 (kfl00102_g7_v1.1)	-0.8	-0.27	0.24	-0.28	0.32	0.23	-0.28	0.1	0.04	0.09	0.12	0.13
Kfl00112_g11 (kfl00112_g11_v1.1)	-2.27	-0.81	-0.29	0.06	0.19	0.33	0.1	-0.01	0.39	0.04	0.43	0.29
Kfl00113_0070 (kfl00113_0070_v1.1)	-0.66	-0.33	0.22	0.03	0.15	0.25	-0.13	0.14	0.08	0.02	-0.01	0.01
Kfl00115_0260 (kfl00115_0260_v1.1)	-0.9	-0.42	0.08	0.16	0.14	0.25	-0.24	0.18	0.16	0.1	0.07	0.04
Kfl00128_0010 (kfl00128_0010_v1.1)	-0.41	-0.3	0.06	0.04	-0.01	0.07	-0.07	0.17	0.16	0.1	0.05	0.04
Kfl00132_0150 (kfl00132_0150_v1.1)	-0.56	-0.09	-0.01	0.12	0.26	0.19	-0.12	0.12	0.1	0.07	-0.09	-0.15
Kfl00147_0170 (kfl00147_0170_v1.1)	-0.71	-0.63	0.14	0.1	0.17	0.31	-0.18	0.15	0.02	0.07	0.1	0.11
Kfl00148_0050 (kfl00148_0050_v1.1)	-0.39	-0.35	0.05	0.02	0.12	0.19	-0.02	0.08	0.03	0.05	0.04	0.07
Kfl00151_0290 (kfl00151_0290_v1.1)	-0.3	-0.21	0.16	-0.03	0.1	0.23	-0.18	0.04	0.03	0.04	-0.03	0.05
Kfl00166_0220 (kfl00166_0220_v1.1)	-0.24	-0.12	0.04	0.02	0.12	0.26	-0.09	0.08	-0.01	-0.02	-0.04	-0.04
Kfl00174_0200 (kfl00174_0200_v1.1)	-0.43	-0.17	0.01	0.01	0.09	0.1	-0.13	0.14	0.05	0.09	0.08	0.07
Kfl00182_0140 (kfl00182_0140_v1.1)	-0.6	-0.5	0.0	0.06	0.18	0.07	-0.11	0.19	0.19	0.09	0.01	0.17
Kfl00182_0250 (kfl00182_0250_v1.1)	-0.53	-0.22	-0.01	-0.02	0.06	0.17	-0.12	0.02	0.17	0.05	0.16	0.11
Kfl00190_0160 (kfl00190_0160_v1.1)	-0.99	-0.55	0.19	-0.01	0.21	0.26	-0.21	0.12	0.12	0.09	0.12	0.17
Kfl00197_0080 (kfl00197_0080_v1.1)	-0.83	-0.37	-0.01	0.02	0.02	0.22	0.07	0.22	0.11	0.04	0.07	0.15
Kfl00208_0110 (kfl00208_0110_v1.1)	-0.39	-0.38	0.09	0.13	0.21	0.31	-0.49	0.08	0.03	0.09	0.04	0.04
Kfl00211_0180 (kfl00211_0180_v1.1)	-0.46	-0.15	0.11	0.09	0.21	0.22	-0.14	0.01	0.04	0.01	-0.02	-0.05
Kfl00217_0010 (kfl00217_0010_v1.1)	-1.18	-0.49	0.24	0.15	0.17	0.37	-0.24	0.12	0.09	0.11	0.09	-0.01
Kfl00223_0030 (kfl00223_0030_v1.1)	-0.6	-0.09	0.1	0.27	0.25	0.43	-0.34	-0.17	0.01	-0.04	-0.12	0.0
Kfl00232_0110 (kfl00232_0110_v1.1)	-0.37	-0.34	0.08	-0.0	-0.0	0.07	-0.15	0.19	0.1	0.1	0.08	0.14
Kfl00242_0030 (kfl00242_0030_v1.1)	-0.56	-0.32	0.03	0.25	0.22	0.24	-0.23	0.06	-0.01	0.03	0.04	0.03
Kfl00245_0060 (kfl00245_0060_v1.1)	-0.33	-0.17	0.13	0.02	0.11	0.2	-0.17	0.11	0.05	-0.0	0.0	-0.02
Kfl00252_0150 (kfl00252_0150_v1.1)	-1.94	-1.22	-0.61	0.07	-0.2	0.34	-0.03	0.62	0.14	0.14	0.53	0.38
Kfl00310_0060 (kfl00310_0060_v1.1)	-1.11	-0.38	0.14	0.07	0.31	0.35	-0.21	0.13	0.11	0.04	0.1	-0.06
Kfl00326_0020 (kfl00326_0020_v1.1)	-1.21	-0.7	0.12	0.14	0.02	0.02	0.15	0.3	0.19	0.1	0.12	0.12
Kfl00342_0070 (kfl00342_0070_v1.1)	-0.46	-0.28	0.02	0.09	0.19	0.21	-0.08	0.05	0.12	0.06	0.07	-0.12
Kfl00351_0050 (kfl00351_0050_v1.1)	-0.52	-0.17	0.14	0.02	0.2	0.18	0.08	0.07	0.04	0.03	-0.14	-0.06
Kfl00366_0160 (kfl00366_0160_v1.1)	-0.21	-0.33	-0.03	-0.02	0.04	0.12	-0.09	0.11	0.1	0.09	0.09	0.05
Kfl00379_0120 (kfl00379_0120_v1.1)	-0.71	-0.44	0.01	0.03	0.13	0.19	-0.22	0.06	0.14	0.13	0.18	0.22
Kfl00418_0120 (kfl00418_0120_v1.1)	-1.45	-0.3	0.3	-0.09	0.37	0.5	-0.26	0.09	-0.01	0.07	0.07	-0.06
Kfl00448_0090 (kfl00448_0090_v1.1)	-0.35	-0.36	0.1	-0.11	0.11	0.25	-0.27	0.18	0.16	0.08	0.04	-0.0
Kfl00475_0060 (kfl00475_0060_v1.1)	-1.11	-0.49	0.11	0.18	0.27	0.24	-0.22	0.23	0.21	0.07	0.02	-0.03
Kfl00478_0020 (kfl00478_0020_v1.1)	-0.89	-0.26	0.16	0.17	0.17	0.31	-0.13	0.11	-0.02	-0.0	-0.03	0.08
Kfl00487_0050 (kfl00487_0050_v1.1)	-1.08	-0.45	0.12	0.09	0.19	0.23	0.05	0.15	0.07	0.18	0.09	-0.11
Kfl00497_0030 (kfl00497_0030_v1.1)	-0.48	-0.25	0.22	-0.02	0.04	0.24	0.02	0.06	0.01	-0.01	0.02	0.01
Kfl00664_0050 (kfl00664_0050_v1.1)	-0.28	-0.28	0.05	-0.1	0.02	0.09	-0.01	0.15	0.07	0.08	0.04	0.09
Kfl00744_0030 (kfl00744_0030_v1.1)	-0.32	-0.28	0.05	-0.02	0.08	0.26	-0.21	0.09	0.02	0.08	0.02	0.11
Kfl00823_0040 (kfl00823_0040_v1.1)	-0.71	-0.49	0.01	0.05	0.14	0.18	-0.12	0.15	0.12	0.16	0.15	0.09
Kfl00962_0020 (kfl00962_0020_v1.1)	-0.88	-0.42	0.18	0.07	0.12	0.3	-0.14	0.04	0.09	0.08	0.07	0.14
Kfl01142_0020 (kfl01142_0020_v1.1)	-0.62	-0.4	-0.12	-0.03	0.04	0.15	-0.16	0.35	0.16	0.16	0.12	0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.