Heatmap: Cluster_28 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
Kfl00004_0460 (kfl00004_0460_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.03 0.17 0.1 0.02 0.07 0.05 0.03
Kfl00017_g47 (kfl00017_g47_v1.1)
1.07 0.41 1.14 0.1 1.95 0.36 0.69 0.55 0.96 0.77 0.54 1.14
Kfl00036_0270 (kfl00036_0270_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00052_0200 (kfl00052_0200_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00066_0050 (kfl00066_0050_v1.1)
0.0 0.09 0.22 1.66 3.63 0.89 0.54 0.1 0.18 0.18 0.03 0.21
Kfl00084_0145 (kfl00084_0145_v1.1)
0.15 0.18 0.16 0.05 0.17 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Kfl00094_0040 (kfl00094_0040_v1.1)
0.03 0.0 0.08 0.0 0.36 0.0 0.12 0.14 0.21 0.0 0.02 0.0
Kfl00096_0230 (kfl00096_0230_v1.1)
0.0 0.05 0.0 0.03 0.08 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00102_0170 (kfl00102_0170_v1.1)
0.15 0.04 0.08 0.18 0.19 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
Kfl00115_0255 (kfl00115_0255_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.31 0.4 0.07 0.05 0.23 0.1 0.05 0.24 0.38
Kfl00127_0130 (kfl00127_0130_v1.1)
0.03 0.04 0.0 0.1 0.25 0.03 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0
Kfl00129_0230 (kfl00129_0230_v1.1)
7.41 6.44 2.55 5.43 18.59 5.5 6.49 4.43 2.74 2.71 3.86 5.21
Kfl00138_0150 (kfl00138_0150_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03
Kfl00152_0120 (kfl00152_0120_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00177_g11 (kfl00177_g11_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.05 0.32 0.24 0.1 0.0 0.0 0.0
Kfl00182_0200 (kfl00182_0200_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00185_0020 (kfl00185_0020_v1.1)
0.81 1.1 1.07 1.1 1.67 0.55 0.74 0.73 0.36 0.59 0.55 0.72
Kfl00195_0110 (kfl00195_0110_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00197_0050 (kfl00197_0050_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
Kfl00203_0110 (kfl00203_0110_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.09 0.02 0.05 0.07 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 4.58 0.0 0.0 0.0 2.28 4.23 0.0 2.4
Kfl00243_0030 (kfl00243_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00244_0150 (kfl00244_0150_v1.1)
0.19 0.0 0.0 0.54 1.05 0.33 0.41 0.28 0.37 0.53 0.34 0.2
Kfl00252_0110 (kfl00252_0110_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00289_0110 (kfl00289_0110_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.17 3.99 15.74 4.26 0.0 0.0 11.1 0.0 0.0 3.77
Kfl00337_0070 (kfl00337_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00386_0010 (kfl00386_0010_v1.1)
0.04 0.16 0.18 0.0 0.22 0.06 0.0 0.0 0.1 0.02 0.25 0.51
Kfl00402_0030 (kfl00402_0030_v1.1)
0.0 0.02 0.0 0.03 0.24 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02 0.05 0.0
Kfl00420_0030 (kfl00420_0030_v1.1)
6.07 5.23 6.6 4.42 6.25 4.45 5.28 3.1 4.31 4.24 4.04 5.73
Kfl00423_0060 (kfl00423_0060_v1.1)
4.14 4.32 3.77 4.22 3.58 3.74 2.98 3.42 3.19 3.62 3.19 2.87
Kfl00460_0100 (kfl00460_0100_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.15 0.1 0.0 0.0
Kfl00534_0060 (kfl00534_0060_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
Kfl00554_0070 (kfl00554_0070_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.03 0.13 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0
Kfl00569_0100 (kfl00569_0100_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Kfl00590_0100 (kfl00590_0100_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00633_g1 (kfl00633_g1_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.76 0.74 0.0 0.0 0.29 0.0 0.92 0.28 0.0
Kfl00641_0030 (kfl00641_0030_v1.1)
0.66 1.34 0.1 0.9 1.09 1.14 1.07 0.52 0.56 1.33 0.85 1.04
Kfl00688_0040 (kfl00688_0040_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00689_0090 (kfl00689_0090_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.03 0.03 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0
Kfl00834_0020 (kfl00834_0020_v1.1)
0.0 0.18 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
Kfl00847_0030 (kfl00847_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl00958_0020 (kfl00958_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01065_0020 (kfl01065_0020_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01162_0030 (kfl01162_0030_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Kfl01520_g1 (kfl01520_g1_v1.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)