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Heatmap: Cluster_184 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.69 1.15 -0.52 - -0.69 - 1.42 0.52 0.34 0.65 -0.16 -
-0.49 0.06 0.23 0.13 -0.56 0.08 0.17 -0.39 0.54 -0.26 -0.25 0.28
- - - -0.32 0.47 -0.2 0.59 1.23 0.49 0.47 0.39 0.02
-0.27 0.44 0.08 0.16 -0.2 -0.1 0.09 -0.06 0.11 -0.22 -0.17 -0.03
- 1.7 - - -0.22 - - 2.15 1.4 - -0.31 -
-0.17 0.07 0.06 0.27 -0.17 -0.1 -0.01 0.03 -0.04 -0.03 0.09 -0.06
- 2.51 - - - - - 2.66 - - - -
-3.32 0.48 0.63 -0.11 -0.19 -0.29 -0.28 1.22 0.12 -0.23 -0.88 -0.54
-0.24 -0.02 0.06 0.04 0.17 -0.08 0.16 0.15 0.24 -0.11 -0.19 -0.28
- -0.35 -5.27 -0.07 0.77 0.31 0.44 1.19 0.14 -0.14 0.25 -1.14
-0.44 -0.0 0.17 0.16 -0.04 -0.17 0.07 0.19 0.14 -0.12 -0.11 0.03
0.06 0.48 0.28 0.22 0.1 -0.11 -0.23 -0.39 -0.16 -0.34 0.0 -0.17
-2.47 0.09 0.81 -0.08 0.18 -1.0 -0.3 0.61 0.59 0.17 -0.38 -0.55
-0.37 0.25 0.02 -0.05 0.45 -0.36 -0.05 0.26 0.03 -0.06 -0.0 -0.39
0.07 -0.73 0.74 -0.04 -0.57 -0.97 0.29 -0.21 0.46 -0.92 -0.38 0.81
-0.18 0.09 0.12 0.26 -0.38 -0.03 -0.03 0.05 -0.04 -0.16 0.15 0.04
-0.88 0.07 -0.07 -0.02 0.09 0.21 -0.24 0.7 0.35 -0.3 -0.06 -0.48
0.06 -0.04 0.0 -0.09 0.12 0.2 -0.12 -0.06 -0.23 -0.05 -0.05 0.2
-0.16 -1.33 -0.44 0.25 0.08 0.46 -0.04 0.77 -0.38 0.16 -0.35 0.01
-0.23 -0.04 0.08 -0.08 -0.02 0.02 0.11 0.13 0.08 -0.06 -0.11 0.07
-0.44 0.0 -0.01 0.11 0.23 -0.07 0.1 0.16 0.24 -0.04 -0.09 -0.37
-0.15 0.0 -0.07 -0.14 -0.01 0.15 -0.13 0.1 0.14 -0.02 -0.07 0.16
-0.49 0.18 -0.23 -0.88 0.83 -0.21 -0.02 0.34 0.15 0.39 -0.58 -0.39
-0.18 0.17 -0.23 -0.22 -0.06 -0.07 0.09 0.22 0.13 0.15 0.12 -0.25
-0.15 0.01 0.06 -0.09 0.07 0.05 -0.05 -0.13 0.12 0.07 0.01 -0.0
-0.36 -1.01 -0.18 0.06 0.22 0.55 -0.28 0.5 0.11 0.07 -0.02 -0.3
-0.36 0.02 -0.16 -0.17 0.54 -0.03 0.04 0.42 -0.05 0.17 -0.46 -0.28
- 2.59 0.93 - - - - 1.24 - 0.76 - -
-0.1 -0.1 0.04 -0.12 0.08 0.15 -0.03 0.08 -0.13 -0.02 0.01 0.1
-0.4 -0.24 -0.19 0.04 0.26 -0.08 0.09 0.23 0.03 0.05 0.02 0.05
-0.51 0.73 -0.01 -0.38 -0.52 -0.25 -0.33 0.38 -0.08 -0.11 0.05 0.43
0.18 -0.11 0.07 -0.5 0.3 0.25 0.26 0.04 -0.97 0.28 -0.42 0.09
-0.15 -0.04 0.09 0.03 -0.09 -0.01 0.13 -0.01 0.04 -0.06 -0.04 0.09
-0.15 -0.25 -0.07 -0.01 0.07 0.08 0.24 0.2 0.01 -0.08 0.04 -0.17
-1.02 -0.55 -0.95 0.06 0.63 -0.17 0.29 0.63 1.39 -1.87 -0.33 -1.42
-0.65 0.06 -0.33 0.3 0.17 0.78 -0.14 -0.01 -0.57 0.06 -0.77 0.31
-1.72 0.44 0.64 -0.34 0.65 -1.07 0.06 -0.35 -0.13 -1.31 -0.53 1.07
0.17 -0.2 -0.23 -0.47 0.24 0.75 -0.29 -0.08 -1.05 -0.11 -0.04 0.5
0.08 -0.44 -0.04 0.09 0.09 0.25 -0.21 0.14 -0.28 0.21 -0.27 0.18
0.13 0.02 0.06 0.03 0.1 -0.0 -0.12 -0.01 -0.19 0.05 -0.17 0.08
- - - -0.26 -0.11 0.84 -0.07 0.78 2.1 -0.23 -0.66 -
2.47 1.84 - - - - - - 1.53 - - -
-0.16 0.26 0.09 0.02 0.1 -0.05 -0.23 0.18 -0.18 0.13 -0.11 -0.16
0.11 -0.12 0.23 0.2 -0.22 -0.14 -0.01 -0.05 0.03 -0.25 0.0 0.13
-0.18 -0.16 0.21 0.23 -0.13 -0.03 -0.06 0.0 0.09 -0.06 0.13 -0.12
-0.54 0.16 0.02 0.18 0.45 -0.45 -0.22 0.35 0.5 -0.22 -0.0 -0.86
- 2.44 - - - - - - 2.72 - - -
-0.85 0.4 -2.21 0.51 -0.08 -0.06 -1.4 0.51 1.49 -2.44 -0.94 0.34
- 1.47 -0.47 -0.09 - - -0.53 1.58 1.7 -0.64 - -
-3.07 -0.15 -4.07 -0.67 0.74 0.29 0.41 1.0 0.02 -0.23 0.47 -0.29
-3.93 0.18 0.6 -0.09 0.44 -0.02 -0.27 0.7 0.1 -0.01 0.23 -1.68
-0.57 -0.04 -1.6 0.01 0.06 0.57 0.07 0.44 -0.2 0.05 0.05 0.2
-0.12 -0.06 -0.12 -0.09 0.12 0.01 0.04 0.03 0.04 0.08 -0.13 0.17
-0.31 -0.52 -0.82 -0.02 0.82 -0.17 0.5 0.47 -0.72 -0.03 -0.54 0.27
0.39 0.69 0.16 -0.89 -0.34 -0.38 -0.72 -0.51 0.06 0.42 0.09 0.16
-0.23 -0.11 -0.28 -0.19 0.22 0.16 0.0 0.4 0.28 0.07 -0.4 -0.17
-0.2 0.31 0.59 0.13 0.2 -0.31 -0.83 -0.21 0.01 0.34 -0.46 -0.13
- 0.87 1.73 - - - - 2.01 0.56 - 0.44 -
-0.67 -0.19 0.15 -0.17 -0.21 -0.18 0.13 0.82 0.46 -0.06 0.06 -0.93
-0.03 -0.0 0.02 -0.03 -0.05 -0.07 0.0 0.09 0.0 -0.07 0.06 0.07
-0.5 0.72 -1.22 -0.89 0.47 -0.02 -1.33 -0.46 0.57 -0.1 0.96 -0.3
-1.67 -0.34 -0.08 0.03 -0.36 0.56 0.3 0.54 -0.7 0.4 -0.02 0.09
-0.21 -0.12 0.1 0.13 0.18 -0.0 0.05 -0.02 0.07 -0.02 -0.01 -0.21
-0.27 -0.23 0.03 0.13 -0.1 0.0 0.15 0.01 0.1 -0.05 0.09 0.06
-0.17 -0.18 0.1 0.17 -0.08 -0.02 0.13 -0.07 0.05 -0.05 0.06 -0.0
-0.38 0.38 -0.05 0.68 0.18 -1.76 -0.54 -1.03 0.2 -0.33 0.05 0.83
1.09 1.78 -1.31 0.8 - - - 0.82 0.71 -0.15 - -
-0.8 -0.41 0.21 -0.33 -0.19 0.62 0.19 0.19 0.13 0.35 -0.05 -0.54
-2.38 1.35 -0.37 0.63 -0.15 -0.36 -0.03 0.18 0.16 -0.2 -0.27 -1.61
-0.26 0.18 0.25 0.05 0.05 -0.19 0.07 -0.09 0.22 -0.16 -0.34 0.08
-0.88 -1.46 0.76 0.41 1.1 -0.66 0.58 0.6 0.37 -1.0 -1.26 -4.03
-0.21 -0.01 0.12 -0.2 0.2 -0.03 0.2 0.11 0.04 -0.03 -0.34 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.