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Heatmap: Cluster_61 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.13 -0.41 0.33 -0.71 0.15 0.26 -0.06 -0.44 0.45 0.05 0.18 -0.44
0.28 -0.28 0.32 0.15 -0.35 0.11 -0.07 -0.32 0.25 0.16 -0.66 0.06
0.06 -0.02 0.13 0.1 0.08 -0.21 -0.1 -0.17 -0.08 0.01 0.16 -0.02
0.17 -0.03 0.38 -1.32 -0.86 0.76 -0.41 -2.27 0.38 -0.44 0.83 0.23
0.24 0.39 -0.03 -0.0 0.03 -1.04 -0.18 -1.15 0.32 0.44 -0.14 0.24
-0.02 -0.19 0.16 -0.12 0.1 -0.06 -0.04 -0.09 0.04 0.08 -0.01 0.11
0.54 0.28 -0.02 0.04 -0.21 0.18 -1.63 -0.53 0.23 0.04 0.07 0.08
-0.69 0.46 0.06 0.3 -0.36 -0.47 -0.8 -0.67 0.26 0.76 -1.05 0.72
0.13 0.48 0.02 -0.08 -0.38 -1.45 0.14 -0.2 0.09 0.12 -1.23 0.91
-0.07 0.09 0.07 -0.21 -0.41 0.18 0.15 -0.07 -0.08 0.07 -0.08 0.24
-0.37 0.31 0.51 0.04 -0.41 0.2 -0.27 -0.3 0.01 0.27 -0.44 0.05
0.14 -0.05 -0.01 -0.27 0.12 0.2 -0.05 0.31 -0.11 -0.25 0.01 -0.17
0.02 0.17 0.03 0.02 -0.02 -0.13 -0.1 -0.07 -0.06 0.01 -0.0 0.11
-0.13 0.09 0.09 -0.0 0.05 -0.01 -0.23 -0.06 0.26 -0.12 0.01 -0.02
0.25 0.02 0.12 0.05 0.09 -0.09 0.01 -0.43 -0.28 0.33 -0.17 -0.07
0.39 -0.69 0.37 -0.45 -0.22 -0.08 0.2 -0.14 -0.07 -0.45 0.15 0.46
0.02 -0.31 0.15 -0.25 -0.05 0.07 0.07 -0.02 0.16 -0.12 0.2 -0.01
0.01 0.11 -0.49 -0.49 0.08 -0.06 -0.78 0.3 -0.27 -0.18 0.72 0.39
1.0 -0.13 -0.65 -0.08 0.16 - -0.06 0.45 -1.0 -1.4 1.5 -1.43
-0.41 0.24 0.16 0.52 -0.44 0.01 -0.01 0.03 0.24 -0.06 -0.53 -0.13
-0.11 -0.13 0.26 -0.06 -0.05 -0.39 -0.06 -0.1 0.23 0.18 0.02 0.08
0.28 0.28 -0.02 -0.7 -0.01 0.26 -0.26 -0.08 -0.05 -0.07 -0.38 0.4
0.06 -0.2 0.08 -0.11 0.03 -0.03 -0.12 -0.05 -0.1 -0.08 0.06 0.37
0.08 0.09 0.06 -0.08 0.12 0.02 -0.22 -0.05 0.04 -0.13 0.09 -0.05
0.26 -0.02 -0.04 -0.26 -0.32 0.17 0.23 0.07 -0.31 0.18 -0.29 0.15
0.14 0.21 -0.14 -0.24 0.36 -0.64 -0.36 0.35 0.28 -0.39 0.23 -0.22
0.26 0.11 -0.48 -0.57 -0.31 0.03 -0.3 0.11 -0.13 -0.06 0.84 -0.08
0.19 0.16 -0.2 -0.28 0.11 -0.1 -0.18 0.11 -0.03 -0.12 0.37 -0.18
0.25 0.28 0.19 0.18 -0.12 -0.43 -1.64 -0.49 0.55 -0.24 -0.32 0.6
-2.27 1.14 0.11 -0.96 -1.01 0.42 -2.17 -1.44 0.23 -0.05 -0.07 1.31
0.05 -0.19 0.13 -0.16 0.03 -0.04 -0.22 -0.0 0.24 0.08 0.0 0.02
-0.04 -0.06 0.16 0.02 -0.11 -0.44 -0.0 -0.41 0.25 0.24 0.01 0.18
0.25 0.08 0.49 0.59 -0.45 0.21 0.22 -2.81 0.34 -1.03 -0.18 0.0
0.12 0.13 -0.41 -0.24 -0.4 0.04 -0.23 0.19 0.15 -0.45 0.36 0.4
-0.08 -0.18 0.01 0.05 0.28 -0.14 0.27 -0.37 -0.04 -0.01 -0.05 0.12
0.24 -0.55 0.44 0.01 0.14 0.6 -0.14 -1.2 0.42 -0.34 -0.48 -0.03
-0.47 -1.1 0.01 0.45 -0.37 -0.31 0.06 -0.12 0.29 0.11 0.28 0.47
0.04 -0.05 -0.06 -0.06 -0.07 -0.28 -0.11 -0.15 0.34 0.16 -0.08 0.2
0.04 0.15 0.61 0.88 -0.12 -0.49 -0.99 -1.13 -0.69 -0.69 -0.64 1.01
-0.07 0.31 -0.29 -0.16 -0.37 -1.24 0.44 -0.09 -0.23 0.68 -0.49 0.52
0.15 0.09 -0.09 -0.02 0.19 0.03 -0.1 0.14 -0.06 -0.24 0.01 -0.16
0.02 0.11 0.03 0.04 -0.07 -0.27 -0.39 -0.22 0.17 0.22 0.15 0.07
0.24 0.53 0.01 -0.05 -1.28 0.26 -1.45 -0.16 -0.07 0.23 0.59 -0.14
-0.08 -0.08 0.16 -0.22 -0.08 0.18 -0.08 -0.01 0.14 -0.12 0.08 0.06
0.31 0.51 -0.23 -0.11 -0.09 -0.56 -0.09 0.24 0.28 -0.23 -0.28 -0.11
0.26 0.12 0.26 -0.16 -0.06 -0.03 -0.41 -0.32 0.25 0.1 -0.1 -0.09
0.1 -0.29 -0.11 -0.45 -0.61 0.06 -0.3 -0.2 0.06 0.27 0.4 0.59
0.2 -0.1 0.04 -0.18 -0.5 0.3 -0.13 -0.07 0.2 -0.29 0.09 0.21
0.05 -0.05 -0.08 -0.16 -0.34 -0.27 -0.04 0.05 0.16 0.21 -0.01 0.34
0.32 0.21 -0.67 -0.08 -0.09 -0.9 -0.03 -0.47 0.16 0.31 0.26 0.36
0.24 0.2 -0.02 0.12 -0.29 -0.75 -0.04 -0.27 -0.19 -0.0 0.18 0.48
0.14 -0.0 -0.24 -0.39 -0.18 0.16 0.08 0.03 -0.08 0.15 -0.31 0.44
0.12 -0.24 -0.04 0.43 -0.08 0.16 0.09 -0.48 -0.41 0.13 -0.39 0.38
-0.44 0.61 0.43 -0.58 -0.85 -2.59 0.41 0.32 -0.38 0.35 -0.4 0.71
0.29 0.19 0.07 -0.04 -0.21 -0.38 0.01 -0.09 -0.07 0.01 0.09 0.02
0.32 -0.44 0.15 0.12 -0.16 -0.01 -0.09 -0.35 0.38 0.15 -0.35 0.02
0.45 -0.26 -0.27 0.17 -0.35 -1.22 -1.39 -0.5 0.64 0.16 -0.14 0.97
-0.09 -0.22 0.11 -0.06 -0.2 0.01 -0.17 0.16 0.22 -0.2 0.21 0.13
-0.05 -0.27 0.08 0.05 0.02 0.05 -0.06 -0.2 0.52 -0.18 -0.13 0.01
-0.07 0.03 -1.15 0.15 -1.21 0.41 -0.35 -0.05 0.75 0.61 -0.28 -0.13
0.06 0.1 0.06 0.1 -0.07 0.06 -0.18 -0.36 0.01 0.13 -0.19 0.18
0.09 -0.53 0.11 0.14 -0.01 0.12 -0.04 -0.19 0.43 -0.09 -0.26 0.02
-0.02 0.31 -0.28 -0.35 -1.0 -0.65 -0.66 -0.84 0.68 0.61 -0.66 1.05
-0.15 -0.27 0.7 -1.29 0.33 0.1 -0.15 -0.63 0.48 0.29 -0.38 -0.03
0.67 0.01 - -0.44 0.58 -0.18 -0.57 0.41 0.14 -0.48 0.82 -0.52
-0.06 0.23 0.33 -0.1 -0.44 -0.62 0.15 -0.55 0.13 0.28 0.05 0.2
-0.11 -0.24 0.1 0.15 0.05 -0.3 0.07 -0.3 0.09 0.16 -0.02 0.24
0.17 -0.13 -0.23 -0.27 0.09 0.16 -0.1 0.09 -0.05 -0.14 0.08 0.22
-0.02 -0.5 -0.41 -2.42 0.01 0.65 0.05 -0.23 0.17 -0.33 0.6 0.55
0.62 -0.7 -0.14 -0.57 -1.91 -1.12 -1.43 -0.81 0.83 0.95 -0.76 1.2
0.39 -0.22 0.29 -0.1 0.57 0.28 -0.5 -5.13 0.34 -0.09 -0.72 0.52
0.34 0.15 -0.05 -0.14 0.05 -0.43 -0.22 -0.43 0.1 0.26 -0.12 0.25
-0.5 0.46 -0.88 0.53 1.11 -0.76 -0.65 -0.18 -0.62 -1.0 0.82 -0.4
0.89 0.57 -1.71 0.1 0.64 - -0.42 0.74 -0.57 -2.79 0.89 -0.69
0.12 -0.78 -0.97 0.34 -0.52 0.2 0.04 0.05 0.57 -0.22 -0.05 0.43
0.04 -0.38 -0.5 0.46 0.69 0.23 0.08 -0.16 0.03 -1.18 -0.27 0.14
0.15 -0.28 -0.31 0.24 -0.26 -0.1 0.1 -0.31 0.26 -0.13 0.24 0.17
0.26 0.06 0.25 0.2 -0.2 0.24 -0.06 -0.49 -0.01 -0.83 0.01 0.19
0.18 0.11 0.01 -0.08 0.16 0.05 -0.24 -0.04 0.13 -0.09 -0.14 -0.12
-0.13 0.07 -0.51 -0.16 0.49 -0.17 -0.23 0.52 -0.22 0.02 0.34 -0.48
0.56 -0.2 0.05 -0.04 0.23 0.09 -0.18 -0.04 0.1 -0.92 -0.17 0.08
0.38 0.14 0.02 -0.18 -0.17 0.35 -0.09 -0.33 -0.21 0.06 -0.47 0.22
0.09 0.03 0.11 0.05 -0.2 -0.21 -0.03 -0.37 0.11 0.08 0.03 0.21
-0.25 0.17 0.45 0.15 -0.12 -0.6 -0.36 -0.35 0.12 -0.24 0.4 0.22
0.24 -0.28 0.21 0.08 -0.16 0.07 -0.1 -0.33 0.2 0.1 -0.25 0.07
0.11 -0.24 -0.25 0.4 0.48 -0.03 -0.14 -2.0 0.57 0.14 -0.11 -0.2
-1.33 0.91 -0.19 0.0 -0.34 -0.32 -0.66 0.24 0.17 -0.63 0.3 0.52
-0.41 0.73 0.52 0.53 -1.06 -0.1 -1.23 -0.09 0.28 -0.35 -0.03 -0.07
0.29 -0.06 -0.23 -0.88 0.4 -0.63 -0.99 0.01 0.02 0.19 1.01 -0.38
0.04 0.12 0.2 0.1 -0.1 -2.14 0.03 -0.32 0.85 -0.14 -0.75 0.47
0.24 0.18 0.1 -0.3 -0.16 0.11 0.13 -0.13 -0.3 0.18 -0.54 0.25
0.22 0.34 -0.62 - - -0.5 -0.29 0.57 1.02 1.15 0.72 -
0.47 0.06 0.22 0.35 -0.28 -0.19 -1.21 -0.19 -0.56 0.02 -0.1 0.59
0.5 - 0.68 1.3 -0.61 0.34 -1.04 -0.59 -0.94 0.92 - 0.06
0.53 -1.28 0.41 -0.08 -0.42 0.08 0.16 -0.54 0.14 0.04 -0.52 0.52
-0.5 0.34 0.51 0.39 -0.76 0.37 -0.69 -0.66 0.57 0.13 -0.76 -0.02
1.77 0.55 0.37 - - - - 0.19 0.24 0.21 0.12 0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.