Heatmap: Cluster_146 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.33 0.14 -0.05 0.18 -0.24 0.03 -0.37 0.11 -0.31 -0.2 0.31 -0.14
0.21 0.06 0.22 0.08 -0.29 0.01 -0.13 -0.18 0.13 -0.42 0.4 -0.32
0.65 -0.03 0.35 -0.1 -0.75 -0.18 0.03 -0.25 -0.57 -0.08 0.08 0.3
0.29 0.31 -1.57 -0.69 -1.12 0.72 -0.88 0.72 -0.87 -0.01 0.48 0.44
0.06 -0.05 0.04 0.02 -0.04 0.11 0.0 -0.06 -0.2 -0.17 -0.05 0.28
0.09 -0.37 -0.11 0.01 -0.95 -0.19 0.17 -0.35 0.2 0.36 0.32 0.31
0.37 -1.89 -0.75 0.2 0.26 0.41 -0.38 - 1.15 -1.82 0.35 0.7
-0.34 -0.75 -0.53 0.39 -0.35 0.38 0.35 -1.4 0.64 -1.55 0.33 0.78
0.14 -0.06 -0.17 -0.09 -0.01 0.03 0.03 -0.09 -0.01 -0.16 0.15 0.19
0.12 0.41 -0.07 -0.4 0.34 -0.05 0.17 -0.42 -0.36 -0.6 -0.14 0.52
0.06 0.04 0.03 0.06 -0.21 -0.14 -0.01 0.02 -0.11 0.02 0.06 0.14
-0.11 0.4 -0.56 0.03 -0.08 0.48 -0.13 0.12 0.2 -0.0 -0.57 -0.14
0.4 0.03 -0.12 -0.43 -0.29 0.48 0.02 -0.22 -0.62 -0.71 0.05 0.69
0.43 0.11 0.27 0.26 0.06 0.36 -0.27 -2.39 -1.15 -0.32 -0.01 0.67
0.03 0.02 0.08 -0.04 0.0 -0.02 -0.01 0.05 -0.11 -0.12 -0.07 0.17
0.14 -0.47 -0.45 0.04 -0.2 0.2 0.15 -0.03 0.2 -0.08 -0.16 0.4
-0.2 0.2 0.37 0.39 0.05 0.32 -0.43 0.08 -0.35 -0.31 -0.07 -0.43
0.25 0.12 0.27 0.2 -0.23 0.08 -0.21 0.96 -2.7 -1.2 0.21 -0.15
0.91 -0.94 0.71 -0.24 -0.14 0.18 -0.34 0.27 -1.64 -0.22 -0.93 0.47
-0.09 -0.3 -0.03 -0.29 -0.13 0.26 0.26 0.2 -0.25 0.14 -0.1 0.16
0.02 0.06 -0.0 0.02 -0.2 0.4 -0.15 -0.09 -0.48 -0.44 0.03 0.52
0.05 -0.09 0.04 -0.04 -0.16 0.11 0.0 -0.0 -0.01 -0.13 -0.01 0.2
-0.1 -0.13 0.22 -0.09 -0.16 -0.21 -0.08 -0.04 0.05 -0.32 0.21 0.46
-0.06 -0.01 -0.02 -0.04 -0.22 -0.04 0.07 0.08 -0.08 0.08 0.03 0.16
0.13 -0.2 0.1 0.37 -0.42 0.58 -0.1 -0.07 -0.48 -0.84 -0.08 0.4
0.0 0.29 -0.16 0.2 -0.08 0.26 -0.09 -0.05 0.03 -0.21 -0.24 -0.07
0.13 0.05 0.13 -0.07 0.07 0.05 0.04 0.07 -0.32 -0.25 -0.02 0.07
0.08 0.15 0.05 -0.13 0.08 0.17 0.16 0.04 0.03 -0.28 -0.29 -0.17
0.19 -0.04 -0.01 0.17 -0.21 0.05 -0.07 -0.06 -0.01 -0.31 0.18 0.01
-0.22 -3.31 0.51 -1.16 0.11 0.82 -0.17 -0.18 -0.35 -0.4 0.93 0.15
0.23 0.1 0.08 -0.03 -0.09 0.17 -0.15 -0.31 -0.21 -0.33 0.15 0.23
0.03 0.01 0.22 -0.16 1.3 1.12 -1.0 -0.8 - -1.09 0.49 -1.58
0.3 -0.08 -0.18 -0.24 -0.18 0.09 0.02 -0.52 -0.1 -0.05 0.3 0.38
-0.02 -0.07 -0.03 -0.09 -0.14 0.39 -0.28 0.14 -0.33 -0.47 0.06 0.52
0.22 -0.13 0.42 -0.3 -0.89 0.5 -0.03 -0.32 0.14 -0.82 0.3 0.18
0.33 -0.11 0.22 0.32 0.39 0.46 0.07 -0.52 -0.54 -1.12 0.0 -0.28
-0.37 -0.12 -0.04 -0.14 0.14 0.56 -0.2 -0.14 0.0 -0.19 0.28 -0.03
0.15 0.08 0.04 0.27 -0.01 0.06 -0.59 -0.04 -0.19 -0.16 0.18 0.04
0.34 -0.05 -0.44 -0.07 0.0 0.36 0.01 -0.18 -0.3 -0.12 0.01 0.22
0.41 0.16 -0.04 -0.25 -0.18 0.2 -0.15 -0.3 -0.31 -0.05 0.06 0.24
0.46 -0.34 0.3 0.54 -1.97 0.23 -3.19 0.74 -2.14 -0.96 0.17 1.06
0.43 -0.07 0.17 0.28 -0.03 0.04 -0.16 -0.13 -0.15 -0.36 0.04 -0.25
0.21 -0.04 0.16 0.13 -0.08 0.32 -0.2 -0.04 -0.38 -0.08 -0.01 -0.12
0.02 0.02 -0.31 0.79 0.15 0.15 0.07 -0.49 0.44 -0.28 -0.41 -0.93
-0.12 -0.09 0.05 -0.19 -0.09 0.07 0.02 0.35 -0.25 -0.23 -0.08 0.39
0.74 -0.94 0.52 -0.62 -0.7 0.15 -0.4 0.08 0.14 -0.87 0.12 0.53
0.77 0.69 -0.11 -0.75 -0.76 0.55 -0.11 -0.69 -0.68 -0.45 0.39 -0.16
0.3 -0.01 -0.57 -0.5 0.85 -1.46 -0.35 1.44 -0.95 -1.29 0.28 -0.78
0.22 -0.34 0.29 0.17 -0.29 0.44 -0.0 -0.19 -0.36 -0.65 -0.39 0.56
0.11 0.08 0.14 0.25 -0.17 0.17 -0.21 0.05 -0.02 -0.49 -0.08 0.03
0.41 -0.15 0.2 0.04 -0.35 0.3 -0.02 -0.06 -0.43 -0.7 0.17 0.2
-1.02 -1.1 0.27 0.1 1.02 0.3 -0.21 0.45 -0.15 -0.13 -0.31 -0.61
0.62 -0.39 0.51 0.38 -0.61 0.18 -0.56 -0.22 -0.09 -0.96 0.13 0.15
0.9 -0.24 0.11 0.28 -0.47 -0.07 -0.88 -0.07 0.99 - 0.27 -0.65
0.36 0.06 0.13 0.2 -0.02 0.02 -0.32 -0.13 -0.15 -0.29 0.13 -0.14
0.09 0.07 -0.06 -0.93 -1.4 0.14 -0.23 -0.32 0.68 -1.41 0.35 1.01
0.05 0.48 -0.14 -0.15 0.03 0.11 -0.53 0.01 -0.44 -0.13 0.47 -0.1
-0.01 -0.01 0.04 0.05 0.03 0.07 0.01 -0.05 -0.05 -0.01 0.02 -0.09
0.1 0.3 0.08 0.05 -0.11 0.23 0.06 -0.38 0.15 -0.33 -0.07 -0.23
0.46 0.1 -0.09 0.24 -0.33 0.67 -0.25 -0.76 0.03 -0.92 -0.4 0.39
0.44 0.01 0.26 -0.08 -0.13 0.29 0.12 -0.31 -0.6 -0.11 0.1 -0.3
0.1 -0.03 -0.05 -0.08 -0.19 -0.09 -0.06 0.01 -0.03 -0.05 0.18 0.23
0.32 0.18 -0.12 0.03 -0.42 -0.06 -0.09 -0.15 -0.17 -0.05 0.03 0.33
1.17 0.37 0.97 -0.52 -0.83 -0.47 - -0.85 0.85 - -0.92 0.71
1.04 - 1.2 0.23 0.44 - - - - - 1.97 0.28
-0.28 -0.32 0.29 0.07 -0.0 0.16 -0.04 -0.03 -0.3 -0.39 0.2 0.39
0.48 0.18 -0.26 -0.03 -0.14 0.22 0.1 -0.8 -0.5 -0.13 -0.13 0.49
0.54 -0.6 -0.46 0.13 -0.62 0.75 0.06 -0.15 -0.08 -0.29 0.1 -0.07
0.06 -0.17 0.11 -0.02 -0.01 0.22 0.14 0.02 -0.25 -0.18 -0.24 0.22
0.4 0.0 0.23 0.17 0.36 0.42 -0.37 -0.12 -0.37 -0.96 -0.33 -0.02
0.92 - 0.38 - 0.08 -1.1 -1.36 1.34 0.3 -1.39 0.71 0.16
0.41 -0.32 0.22 0.6 0.15 0.21 -0.26 -0.38 0.0 -0.3 -0.4 -0.42
-0.02 0.35 0.03 0.06 0.2 0.2 -0.16 0.4 -0.57 -0.22 -0.63 -0.01
0.82 -0.33 -0.4 0.45 -1.07 0.28 -0.5 0.02 0.01 -1.34 0.09 0.52
0.15 -0.02 0.12 0.16 0.04 0.2 -0.11 0.12 -0.44 -0.11 -0.27 0.02
0.17 0.1 -0.04 0.29 -0.1 0.06 -0.32 -0.0 -0.1 -0.36 0.0 0.16
0.06 -2.45 0.45 0.32 -1.42 1.21 -0.44 0.31 0.08 -1.27 0.67 -1.23
0.62 -0.02 -0.04 0.25 0.07 0.38 0.27 -0.82 -0.23 0.09 -0.46 -0.89
0.03 -0.02 0.02 0.08 -0.01 0.05 -0.04 -0.02 -0.18 -0.05 -0.01 0.14
0.5 -0.53 -0.52 0.33 0.13 0.1 0.27 -0.79 -0.32 -0.37 0.33 0.2
0.4 -0.05 0.21 0.27 -0.12 0.02 -0.19 -0.2 -0.13 -0.34 -0.04 -0.02
0.1 -0.02 -0.08 -0.15 0.11 0.11 -0.01 0.49 -0.43 -0.0 -0.39 0.06
0.3 0.33 -0.33 0.49 -0.08 -0.37 0.03 -0.53 0.42 -0.28 -0.19 -0.26
0.14 -0.28 -0.03 0.31 -1.11 -0.36 -0.1 -0.16 0.35 -0.11 0.39 0.35
0.01 0.03 0.17 0.27 -0.16 -0.14 -0.24 0.2 0.08 -0.28 -0.1 0.06
- - 1.36 - 2.62 - - - - - 1.72 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.