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Heatmap: Cluster_197 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-2.03 0.77 1.76 -0.12 0.76 - -0.96 -1.81 0.06 -1.62 0.61 -1.48
- 1.55 - 0.59 - - 1.6 2.18 - - - -
-0.43 -0.71 0.67 0.33 0.11 -0.01 1.13 -0.24 0.62 -0.36 -2.45 -2.43
-1.27 0.03 0.58 0.59 -0.24 0.31 0.18 -0.33 -0.46 -0.57 0.25 -0.05
0.73 1.58 0.33 - -0.02 0.46 - -1.22 -0.45 0.43 - 0.28
0.1 0.2 -0.14 0.29 0.17 0.23 0.15 0.02 -0.25 -0.07 -0.36 -0.63
-0.02 -0.04 0.02 -0.11 0.07 0.37 -0.04 -1.06 0.39 -0.4 -0.34 0.54
0.17 0.07 0.24 0.09 -0.21 -0.11 0.15 -0.02 -0.19 -0.15 -0.23 0.08
-0.05 0.04 0.09 0.16 -0.08 0.04 0.04 0.04 -0.12 0.16 -0.16 -0.22
-0.18 -0.1 -0.07 0.05 -0.05 0.09 0.17 -0.04 -0.03 -0.21 0.06 0.24
-0.1 0.26 0.08 -0.04 0.02 0.09 0.02 -0.23 -0.12 -0.05 -0.13 0.12
0.49 -1.81 -0.19 0.15 -0.18 -0.19 -0.62 0.37 -0.46 1.19 0.28 -1.3
0.05 0.14 0.06 -0.0 0.15 0.0 0.02 -0.07 -0.09 -0.09 -0.21 0.0
1.22 0.09 0.29 0.16 -1.11 -1.73 0.95 - 1.38 -0.86 -1.82 -2.81
-0.92 0.25 0.45 0.42 0.01 -0.11 -0.16 0.1 0.21 -0.63 0.33 -0.71
-0.26 -0.82 0.16 0.03 0.19 0.1 -0.31 -0.41 0.53 0.15 -1.04 0.72
0.97 -0.41 1.21 1.99 - - - -0.38 0.34 - - -0.05
0.81 0.99 -0.05 -0.11 -2.82 0.22 0.02 -0.25 -2.69 0.16 -0.36 0.22
0.07 0.01 0.0 0.18 -0.05 -0.0 0.3 0.26 -0.22 -0.14 -0.24 -0.31
-0.69 -0.16 0.56 0.18 0.31 0.58 -1.44 0.05 -0.0 -0.82 0.11 0.14
0.24 0.3 -0.08 0.02 0.21 -0.11 0.38 0.22 -0.44 -0.01 -0.67 -0.52
0.24 1.22 -0.02 -0.33 -1.76 1.17 0.05 0.41 -1.63 0.2 - -1.63
0.18 0.04 0.02 0.33 -0.18 0.09 0.13 0.14 0.05 -0.19 -0.56 -0.26
0.31 0.44 - 0.62 0.32 -0.33 0.93 -0.71 -0.65 - 0.81 -0.14
1.14 0.08 0.62 0.71 -0.18 0.17 -0.07 -0.97 -1.25 -1.19 0.31 -
- - - 2.62 1.19 - 1.84 - - - - -
0.38 0.88 -0.96 0.13 -0.72 0.14 0.44 -1.2 -0.19 0.19 0.32 -1.05
-0.45 -0.12 -0.03 0.07 0.07 -0.04 0.17 -0.22 0.59 -0.18 -0.49 0.28
-0.01 -0.41 0.36 0.16 0.14 -0.06 0.28 0.3 0.09 -0.41 -0.73 -0.09
-0.33 0.02 0.22 0.53 -0.06 -1.1 0.64 -0.31 -0.38 -0.54 0.59 -0.26
0.38 0.12 0.58 -0.23 -0.14 -1.17 0.0 -0.2 -2.07 0.56 0.27 0.16
-0.68 0.48 1.09 -1.38 -1.27 0.21 0.91 -0.43 -1.55 -0.11 0.41 -0.55
0.16 -0.24 0.08 0.08 0.23 -0.03 -0.0 -0.02 0.1 -0.2 -0.37 0.1
0.0 0.07 0.04 -0.07 0.14 0.17 -0.07 0.3 -0.15 -0.09 -0.25 -0.19
- - 2.0 2.09 - - 1.9 - - - - -
-0.86 0.32 0.33 1.48 -0.45 0.54 - -0.39 -0.93 -0.53 -0.34 0.26
0.24 -0.31 0.23 0.63 -0.08 0.14 0.06 0.23 -0.39 -0.43 -0.52 -0.29
-0.28 1.08 1.22 0.04 -1.44 -0.49 0.11 -0.6 - 0.09 0.26 -0.72
0.5 -0.1 0.31 0.48 -0.92 -0.49 -0.03 -0.55 -0.1 -0.19 0.21 0.18
0.4 - 1.2 -0.3 1.29 - - 0.5 0.33 - - 1.3
0.39 -0.14 -0.01 0.22 0.33 0.06 0.1 -0.1 -0.56 0.38 -0.7 -0.49
0.33 -1.05 0.56 0.83 0.18 - 0.26 - 0.29 -1.24 0.71 0.49
0.19 0.01 0.29 0.09 -0.41 -0.01 -0.06 -0.18 -0.35 0.32 -0.25 0.13
-0.02 0.07 -0.26 -0.29 0.37 0.14 0.27 -0.3 -0.22 -0.14 -0.05 0.24
-0.27 0.33 0.95 -0.24 -0.39 -0.95 0.11 -0.09 -0.95 -0.16 0.39 0.14
-0.03 0.16 0.49 0.56 0.21 -0.08 0.91 0.09 -0.38 0.27 - -
- 0.86 1.02 - - 1.16 0.84 - 0.94 1.14 - -
-0.6 -0.54 1.19 -0.39 -0.14 -0.24 0.51 0.66 -0.46 -0.19 0.32 -
- 0.84 2.29 0.81 - - 0.61 - - - 1.03 -
-0.77 0.07 0.41 0.68 -0.05 -0.03 0.53 -0.58 -1.42 -0.89 0.22 0.38
-1.01 -0.25 0.22 0.98 -0.76 -0.08 - -1.0 0.36 0.38 0.42 0.65
0.05 -1.07 0.44 0.99 -0.04 0.43 -1.07 0.13 -1.24 -0.27 -0.83 0.52
0.14 0.17 -0.05 -0.13 -0.46 0.07 0.07 -0.02 -0.1 0.13 -0.01 0.09
-0.0 0.98 0.05 -0.06 0.55 0.51 0.26 0.54 -0.65 -1.29 -1.16 -
0.07 0.95 0.28 -1.84 0.27 -0.49 -1.78 -2.88 0.21 0.73 -2.18 1.09
0.19 0.25 -0.59 -0.5 0.65 0.51 -0.7 -0.33 1.25 - - 0.59
0.69 0.16 0.67 -0.09 -0.23 -1.23 -0.26 -0.46 -0.48 0.21 -0.48 0.38
-0.54 -0.14 0.22 0.15 0.41 0.51 -0.78 -0.54 0.74 -0.28 -1.49 0.33
0.34 -0.01 0.5 0.16 -0.51 -0.64 0.72 -0.04 -0.17 -0.34 -0.52 -0.22
-0.09 -0.15 0.15 0.74 0.03 -0.29 -0.38 -0.29 0.1 -1.19 0.08 0.47
0.41 -1.22 0.44 -0.05 0.47 0.79 -0.91 0.06 -0.41 0.18 -0.49 -0.64
-0.16 -0.08 0.04 0.48 -0.07 0.03 -0.15 -0.52 -0.18 -0.49 0.39 0.33
-0.71 0.07 0.63 -2.15 -0.78 0.52 -0.21 0.16 1.22 -0.96 0.4 -1.34
-0.07 -0.14 0.22 0.22 -0.16 -0.01 0.1 -0.35 -0.15 -0.28 0.05 0.38
0.35 -0.74 -0.3 0.32 -0.38 0.31 0.13 -0.36 -0.08 0.4 -0.24 0.11
-0.34 0.58 0.64 0.08 0.06 -0.88 -0.82 -0.16 0.05 -0.2 -0.25 0.39
0.13 -0.24 0.13 -0.44 -0.29 0.26 0.36 0.18 -0.03 -0.53 0.09 0.09
-0.18 0.02 -0.21 -0.01 0.43 -0.16 0.21 -0.86 0.14 -0.51 0.13 0.48
0.14 0.16 0.04 0.53 -0.07 -0.6 -0.18 0.5 -0.52 0.03 0.07 -0.69
0.15 0.07 -0.01 0.16 0.26 -0.07 -0.15 -0.19 0.02 -0.07 -0.4 0.11
-0.06 0.04 0.05 0.22 -0.13 -0.02 0.02 0.01 -0.05 -0.38 0.03 0.19
0.11 -0.06 0.17 0.09 -0.18 -0.22 0.23 -0.03 -0.23 0.08 -0.17 0.11
0.09 0.78 0.34 -0.62 0.64 0.38 -0.19 -1.87 -0.54 0.4 -0.38 -0.94
-0.05 0.46 0.52 -0.1 -0.16 -0.62 -0.36 0.16 0.31 -0.81 -0.35 0.34
0.0 -0.07 0.28 0.14 -0.04 -0.02 0.41 -0.59 0.13 0.06 -0.05 -0.57
0.05 -0.04 0.07 -0.0 0.04 0.02 0.05 -0.13 0.01 0.08 -0.18 0.02
-0.06 -0.19 0.13 -0.02 0.05 0.05 0.15 0.1 0.07 0.04 -0.21 -0.17
0.29 0.01 0.14 0.08 -0.04 -0.07 0.03 -0.21 0.08 0.04 -0.2 -0.24
-0.42 0.68 0.06 0.54 0.05 -0.85 -0.48 0.82 -0.84 -0.07 -0.87 0.04
-0.75 -0.21 -0.24 0.39 -0.62 0.92 0.88 0.56 0.04 -0.7 -1.53 -0.87
-0.18 0.04 -0.48 0.2 0.15 0.19 -0.14 -1.06 0.02 0.4 -0.24 0.49

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.