Heatmap: Cluster_238 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.15 -0.04 0.03 0.03 -0.03 0.18 -0.04 -0.2 0.1 -0.01 -0.13 -0.08
0.3 -0.97 -0.84 -0.16 -0.02 -1.88 0.19 0.53 1.38 1.03 -1.64 -
0.19 0.15 -1.73 -2.04 -0.74 0.66 0.66 0.66 0.29 -0.86 0.2 -0.08
0.04 0.05 -0.27 -0.09 0.06 0.22 -0.22 0.11 0.01 0.15 -0.01 -0.12
-0.03 -0.06 0.02 0.08 0.03 -0.06 0.03 0.09 -0.02 0.12 0.06 -0.31
-0.03 -0.04 -0.11 0.03 0.0 0.08 0.02 0.11 -0.09 0.19 0.13 -0.38
-0.22 0.24 -0.41 -0.28 0.3 0.43 -0.33 0.4 -0.24 0.35 -0.49 -0.21
0.04 0.0 -0.1 -0.12 -0.1 0.22 0.04 0.19 0.16 0.02 -0.3 -0.16
0.04 -0.1 -0.17 -0.12 0.11 0.0 0.15 0.09 0.0 0.1 -0.04 -0.12
-0.06 0.01 0.04 -0.14 -0.01 -0.03 -0.08 0.07 0.12 0.28 -0.08 -0.17
-0.01 0.19 -0.22 0.02 0.06 0.26 0.03 -0.23 0.13 -0.02 -0.18 -0.13
0.2 0.1 -0.21 -0.13 0.02 0.28 -0.23 -0.33 0.39 0.19 -0.35 -0.17
-0.05 -0.17 -0.28 0.01 0.01 0.15 0.0 0.08 0.1 -0.15 0.02 0.2
-0.02 -0.17 -0.04 0.06 0.03 0.17 0.09 0.04 0.06 -0.03 -0.14 -0.08
- 0.57 0.34 -0.21 -0.71 0.67 -0.78 - 0.34 0.2 0.85 0.47
-0.09 -0.01 -0.05 -0.08 0.03 0.09 0.07 0.08 0.01 -0.04 0.1 -0.12
-0.09 0.04 -0.06 -0.08 0.08 0.03 -0.03 0.05 0.01 0.1 -0.05 -0.02
-0.17 0.17 0.36 -1.93 0.1 -0.81 0.34 1.05 0.47 0.43 -2.22 -0.94
-0.09 -0.95 -0.21 -0.25 -0.12 -0.3 0.63 0.09 0.42 0.28 -0.18 0.08
0.09 0.07 -0.02 -0.11 -0.19 0.24 -0.1 0.07 0.03 -0.24 -0.03 0.12
-0.18 -0.49 -0.47 -0.01 0.54 -0.33 0.42 0.19 0.43 0.58 -0.74 -0.93
-0.08 0.17 -0.06 0.07 0.02 0.24 0.03 -0.58 0.1 0.29 -0.34 -0.07
-0.3 -0.38 -0.22 0.1 -0.83 0.58 -0.07 -0.08 0.71 0.23 -0.08 -0.36
0.03 -0.02 0.06 -0.07 0.14 0.08 -0.22 -0.09 0.15 0.01 -0.21 0.09
-0.06 -0.04 -0.3 -0.19 -0.08 0.25 -0.01 0.21 0.01 0.19 -0.04 -0.04
-0.08 -0.0 -0.05 -0.2 -0.05 0.12 -0.05 0.15 0.09 0.05 -0.07 0.06
0.08 0.05 -0.13 -0.01 -0.01 0.05 -0.04 -0.03 0.08 0.04 -0.08 -0.03
0.42 -0.4 -3.52 1.02 -0.13 -0.52 -0.96 0.65 -1.14 0.71 -0.07 0.08
-0.16 0.29 0.07 0.29 -0.16 0.13 0.09 -0.4 -0.23 0.14 0.15 -0.44
-0.04 0.06 0.01 -0.06 0.02 0.05 -0.18 -0.04 0.1 0.03 0.07 -0.04
-0.16 -0.27 -0.35 -0.45 0.11 0.45 0.01 0.34 0.23 0.21 -0.58 0.06
0.14 -0.12 0.09 0.03 0.21 0.35 0.01 -0.14 -0.05 -0.14 -0.28 -0.24
-0.94 -0.6 - - 1.21 0.42 0.87 -0.96 -1.0 1.62 0.31 -
0.08 -0.09 -0.15 -0.1 0.05 0.06 0.05 -0.01 -0.0 0.09 0.07 -0.07
0.2 -0.45 -0.42 -0.04 0.01 -0.18 -0.27 -0.76 0.14 0.37 0.66 0.17
-0.12 0.13 -0.48 0.03 -2.68 1.03 0.09 0.38 -0.07 -0.62 -0.29 0.33
-0.02 -0.02 -0.03 -0.06 0.12 0.01 -0.05 0.1 0.01 0.17 0.04 -0.31
-0.09 -0.1 -0.06 -0.21 0.1 -0.04 0.14 0.12 0.1 0.2 -0.13 -0.09
-0.17 -0.14 -0.07 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.08 0.19 -0.01 -0.07
-0.01 -0.31 0.93 -1.26 -0.13 -0.21 - - 0.81 1.51 0.16 -1.32
-0.16 -0.1 -0.27 -0.19 0.15 0.09 0.12 0.18 0.13 0.05 -0.09 0.02
-0.14 0.09 -0.63 0.3 -0.62 -0.3 -0.08 -0.17 -0.3 0.16 0.7 0.37
0.06 -0.12 0.17 -0.11 0.37 -0.41 0.02 0.01 0.43 0.27 -0.14 -1.1
-0.15 0.37 -0.85 0.2 0.11 -0.13 -0.88 - 0.68 0.68 -1.2 0.95
-0.13 0.16 -0.01 0.19 0.36 0.23 -0.23 0.02 -0.57 0.1 0.22 -0.71
0.43 -0.24 -0.03 -0.2 0.02 0.47 -0.1 -0.28 -0.11 -0.0 -0.22 0.02
-0.09 0.02 -0.03 -0.15 -0.08 0.04 0.08 0.08 0.03 0.29 -0.02 -0.23
-0.01 0.05 0.17 0.12 0.1 -0.11 -0.09 -0.07 0.05 -0.14 -0.3 0.15
-0.18 -0.34 0.46 0.07 0.05 -0.06 -0.2 0.04 0.21 -0.05 -0.15 -0.03
0.01 -0.07 -0.15 -0.01 -0.1 0.05 -0.03 -0.13 0.23 0.19 -0.07 0.02
0.09 -0.07 0.09 0.14 0.08 0.1 -0.03 0.06 0.12 -0.23 -0.19 -0.24
-0.77 -0.13 -0.08 -1.55 -0.93 0.46 -0.67 0.65 0.41 0.7 0.46 -0.36
-0.04 -0.28 -0.31 0.01 0.24 0.19 -0.21 0.39 -0.59 0.46 0.15 -0.42
0.52 -0.98 -0.65 -0.22 0.3 -0.03 -0.55 -0.21 -0.25 0.2 0.98 -0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.