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Heatmap: Cluster_260 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.01 0.54 0.41 -0.11 -0.82 -0.44 -0.5 0.04 -0.28 -0.7 0.72 0.24
0.52 -0.89 0.2 -0.04 -0.1 -0.52 -0.39 -0.51 -0.33 0.49 0.36 0.41
0.54 0.03 0.7 0.04 -0.48 -0.08 -0.21 -0.11 -0.02 -0.59 -0.33 -0.03
-0.55 0.28 -0.0 -0.14 0.44 0.16 -0.3 -0.08 0.33 -0.29 0.21 -0.46
0.18 0.11 0.04 -0.08 -0.07 -0.32 -0.35 -0.14 -0.11 0.05 0.41 0.1
-0.73 0.49 -0.16 -0.55 0.35 0.49 -0.87 0.17 0.07 -1.58 0.12 0.67
-0.06 0.36 -0.07 -1.45 -0.82 0.08 -1.34 0.96 0.77 -1.84 -0.33 0.76
-0.32 -0.55 0.06 0.1 0.26 0.01 -0.31 -0.09 0.03 -0.16 0.37 0.3
0.19 0.35 0.15 -0.52 -0.33 -0.14 -0.8 -0.11 0.06 -0.22 0.6 0.21
-0.84 -0.64 1.35 -0.21 -1.84 - -1.81 -1.63 1.03 0.07 0.08 1.24
2.58 - - - - - - - 2.59 - - -
-0.11 -0.36 0.38 0.02 0.06 -0.16 -0.48 -0.29 0.57 -0.2 -0.05 0.24
-0.15 -0.5 -0.1 -0.07 0.08 -0.01 -0.05 -0.19 0.03 -0.07 0.45 0.34
0.12 -0.41 -0.07 0.23 -0.37 0.42 0.33 -0.16 -0.4 -0.33 -0.24 0.46
-0.02 -0.01 0.07 -0.02 -0.2 0.02 -0.14 0.09 0.15 -0.12 0.01 0.13
-0.33 0.07 0.08 -0.03 -0.24 -0.33 -0.67 -0.29 0.36 0.18 0.31 0.45
-0.33 -0.14 0.09 -0.36 0.5 -0.93 -0.46 -0.54 0.08 0.16 0.43 0.66
0.17 -0.41 -0.35 0.0 0.1 0.19 0.17 -0.11 0.17 -0.09 -0.08 0.09
-0.35 -1.17 0.35 -0.03 -0.12 -0.62 0.02 -0.83 0.57 0.15 0.61 0.33
0.18 -0.22 0.12 0.12 -0.09 -0.3 -0.14 -0.07 0.23 -0.2 0.08 0.18
0.15 0.74 -1.22 -1.08 - -0.1 -0.89 0.77 1.03 - 1.63 -
0.01 -0.04 0.01 0.05 -0.01 -0.22 -0.39 -0.18 -0.02 0.1 0.29 0.28
-0.1 -0.28 0.24 -0.59 -0.28 0.25 0.09 0.04 -0.02 -0.01 -0.0 0.4
-0.04 -0.06 -0.04 0.05 0.01 -0.01 0.14 0.11 -0.02 -0.03 -0.21 0.07
1.27 -0.92 0.62 -0.71 -0.31 -1.33 -0.25 -1.83 0.78 -0.58 -0.42 0.55
0.36 - 1.87 0.66 0.77 - - - -0.51 -0.31 - 1.18
-0.32 -0.6 0.18 -0.04 0.43 -1.0 0.74 -0.17 0.28 -0.95 0.84 -0.97
0.24 0.09 0.05 -0.03 0.02 0.14 -0.35 -0.27 0.1 -0.36 0.22 0.01
-1.26 -0.06 -0.1 -0.96 -0.05 1.07 0.54 -1.29 -0.23 0.7 -0.36 -0.02
0.68 0.17 - 0.5 -1.86 0.4 -2.24 -1.02 1.51 - 0.3 0.57
0.01 0.08 0.21 0.0 0.13 0.25 0.01 0.24 -0.35 -0.56 -0.27 0.03
-0.01 -0.01 -0.0 -0.04 0.01 0.06 0.05 -0.0 -0.09 -0.06 -0.02 0.11
-0.33 0.4 -0.22 -0.14 0.5 0.22 -0.5 -0.39 0.42 -0.25 -0.34 0.14
0.01 0.21 0.2 -0.02 -0.11 -0.22 0.0 -0.31 -0.03 -0.2 0.26 0.08
- -2.91 -0.19 0.79 0.11 0.32 -2.85 -1.61 0.42 -0.04 1.35 0.68
-0.19 - - - -0.7 - 1.12 -0.95 2.03 - 1.69 -1.03
0.07 - 1.29 0.38 - - 0.56 0.28 - 0.06 -0.02 1.31
0.13 -0.72 0.35 - 0.2 -1.12 0.63 -1.16 -0.11 -0.04 0.76 0.87
-0.4 0.79 1.35 - 0.47 -1.12 - 1.26 0.19 -1.07 - 0.14
-0.05 0.05 0.09 0.05 -0.08 -0.09 -0.14 -0.02 -0.0 0.03 -0.03 0.17
- 1.72 -0.54 - - - -0.21 -0.23 0.38 0.29 1.91 -
-0.89 -0.23 -0.02 -0.99 0.55 1.41 -0.92 0.32 0.08 -1.08 -0.1 -0.38
-0.07 -0.75 -0.22 0.67 -4.37 -1.9 -0.42 0.07 0.62 -0.8 -0.24 1.55
-0.82 0.54 0.11 -0.29 0.26 0.5 -0.69 -0.07 0.17 -0.92 0.22 0.12
0.42 -0.38 -0.61 0.16 0.16 -0.68 -0.13 0.06 0.48 -0.1 -0.06 0.2
-0.93 - 0.9 0.42 -1.86 0.08 -1.84 0.11 0.94 -1.53 0.63 0.83
-0.21 -0.07 0.36 -0.07 -0.22 0.08 -0.26 -0.47 -0.03 -0.63 0.69 0.31
0.14 -0.28 0.27 0.1 -0.24 0.29 -0.07 0.15 0.31 -1.24 0.15 -0.18
0.01 -0.2 0.82 -0.23 0.07 -0.5 0.01 -0.21 0.15 -0.76 0.71 -0.84
1.29 -0.6 -0.88 -0.28 0.26 -2.11 -1.31 -0.33 0.98 -0.39 -0.27 0.43
-0.24 -2.48 0.55 -0.06 0.24 -1.13 -0.26 -2.33 0.99 -0.37 -0.04 1.1
-0.39 -0.09 -0.05 0.1 0.07 -0.27 0.0 -0.11 -0.05 -0.21 0.5 0.27
0.25 -0.2 -0.48 -0.14 0.07 -0.08 -0.0 -0.63 0.17 -0.82 0.6 0.55
0.52 0.23 0.02 -0.36 -0.53 -0.24 -0.8 -0.17 -0.65 0.38 0.7 0.05
-0.02 0.27 0.19 0.02 -0.03 0.0 -0.29 -0.17 -0.1 -0.34 0.14 0.19
-2.15 - 1.03 0.77 -1.14 0.16 -0.33 -1.17 0.92 -0.15 0.35 0.21
0.97 -2.13 0.44 -0.88 -1.09 -2.03 -2.2 -0.49 1.55 - 0.7 0.77
-1.67 -1.62 -0.51 -1.37 0.22 -1.39 0.27 0.54 0.31 -1.27 1.49 0.68
0.23 -0.03 0.03 -0.05 -0.04 -0.09 -0.17 0.03 -0.13 0.08 0.1 -0.0
0.54 -1.33 0.38 -0.63 -0.85 -0.58 -1.07 -0.79 0.03 0.62 0.71 0.79
-0.27 -0.26 0.29 -0.08 -0.36 -0.09 -0.29 -0.51 0.31 0.43 0.36 0.08
0.05 -0.0 0.03 -0.18 0.06 -0.29 -0.05 -0.04 0.21 -0.15 0.28 -0.01
-0.47 - 1.78 0.14 - -0.05 -0.38 - -0.47 -0.07 -0.5 1.39
-0.09 -0.2 -0.1 0.37 -0.37 0.64 -0.69 0.46 0.13 -0.73 0.15 -0.28
-0.08 0.94 0.44 0.42 0.02 -1.58 -0.32 -1.29 -1.16 -0.47 1.03 -0.58
-0.0 -0.3 0.98 -0.28 -0.51 -0.22 -0.81 -0.13 0.39 -0.85 0.62 -0.09
0.2 0.21 0.11 0.32 -1.1 -0.93 -0.84 -0.39 1.03 -0.97 -1.73 1.13
0.05 0.18 0.08 -0.09 -0.16 -0.17 -0.15 -0.05 0.01 -0.07 0.2 0.11
-0.08 0.24 0.2 -0.04 0.12 0.14 -0.22 0.27 -0.21 -0.39 0.06 -0.28
-0.42 0.03 0.08 -1.02 -0.24 0.66 -0.66 -0.27 0.28 -0.16 0.21 0.62
1.14 -0.01 0.97 -0.09 -1.52 0.09 -1.49 -0.22 0.69 -1.18 -0.29 -1.27
-1.8 -0.81 0.29 0.03 0.5 0.08 -0.59 -0.18 0.72 -2.03 1.1 -0.25
0.04 0.11 0.06 0.03 -0.1 0.15 -0.15 0.01 -0.09 -0.18 -0.02 0.1
-0.0 -0.17 0.08 -0.09 0.07 -0.19 -0.05 -0.3 0.08 0.18 0.29 0.02
-0.2 -0.69 -0.11 0.04 -0.25 -0.24 0.38 0.51 0.36 -0.72 -0.59 0.67
-1.81 0.19 -1.58 0.13 -2.31 0.38 0.32 0.37 1.06 -2.44 0.85 0.06
0.4 0.15 -0.35 -0.23 -0.25 -0.57 -0.78 -0.17 0.57 -0.13 0.47 0.23
0.06 0.01 -0.02 0.23 -0.35 0.17 0.03 0.23 -0.08 -0.34 -0.36 0.23
-0.11 -0.71 0.75 0.77 -1.05 -0.69 -1.02 - 0.89 -0.71 0.2 0.89
-0.14 -0.28 -0.13 0.06 -0.18 0.27 -0.07 -0.0 -0.25 -0.27 0.38 0.39
0.19 -0.13 0.05 -0.09 -0.21 -0.04 -0.43 -0.14 -0.0 0.03 0.37 0.24
0.36 -1.21 0.3 0.39 -0.47 -1.2 -0.54 0.22 -0.5 0.59 0.63 -0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.