Heatmap: Cluster_5 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.92 1.86 2.54 2.14 1.12 2.44 2.31 1.36 2.78 1.76 3.29 1.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.06 0.0 0.0 0.08 0.0
8.75 7.35 11.01 10.71 6.71 11.07 14.51 6.95 12.64 11.43 12.61 12.99
0.4 0.0 0.39 0.15 0.11 0.43 0.0 0.45 0.16 0.26 0.65 0.41
1.07 1.45 1.33 1.28 0.78 1.13 0.46 0.64 0.85 0.55 0.92 0.69
0.27 0.11 0.17 0.28 0.12 0.24 0.13 0.11 0.38 0.34 0.45 0.21
0.36 0.46 0.47 1.19 0.2 0.53 0.53 0.34 0.31 0.56 0.48 0.2
0.27 0.6 0.65 0.59 0.31 0.61 0.34 0.28 0.42 0.48 0.49 0.11
3.81 4.4 4.38 4.54 3.51 4.08 3.93 3.73 4.6 4.74 4.72 3.96
0.23 0.12 0.17 0.08 0.2 0.26 0.08 0.3 0.15 0.2 0.43 0.47
4.37 4.93 5.41 5.63 4.35 6.39 5.76 5.44 6.65 5.89 7.38 5.47
41.45 39.6 45.07 49.75 44.68 53.39 49.11 40.65 51.99 46.79 50.8 46.01
3.76 2.95 3.3 4.12 3.13 3.92 3.55 3.41 3.57 3.46 4.05 3.08
5.69 6.07 8.11 7.28 4.86 7.65 9.04 4.85 10.51 7.23 9.36 9.21
1.22 1.77 2.6 2.57 1.77 3.35 2.66 1.22 2.4 2.52 2.04 1.95
14.25 12.34 14.95 15.54 11.06 16.03 15.22 13.95 14.87 13.9 16.39 17.91
15.94 18.06 22.35 23.42 16.37 36.07 25.6 22.27 19.27 19.9 24.27 10.82
25.36 27.03 26.93 23.95 25.47 24.63 24.04 26.23 22.22 27.86 24.92 20.5
4.24 6.62 7.21 9.52 6.99 8.63 9.74 5.19 14.35 7.75 11.39 6.17
0.09 0.02 0.08 0.1 0.03 0.05 0.05 0.14 0.05 0.07 0.21 0.09
32.41 32.93 32.7 33.1 31.54 34.48 31.17 32.18 32.35 33.8 31.31 28.4
0.03 0.0 0.02 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0
0.06 0.15 0.21 0.35 0.08 0.7 0.0 0.07 0.0 0.15 0.0 0.14
0.69 0.3 0.61 0.86 0.48 0.49 0.41 0.77 0.31 1.05 1.02 0.73
1.75 2.9 3.43 3.3 1.71 1.79 2.89 2.25 2.88 2.77 3.59 2.12
3.23 2.87 3.15 3.16 2.36 5.3 2.36 3.16 2.5 2.84 2.37 2.05
1.61 1.99 2.58 3.13 2.13 1.66 1.36 4.81 1.43 1.95 6.46 0.5
0.51 0.81 0.65 0.72 0.35 0.55 0.52 0.62 0.96 0.13 1.14 0.65
0.17 0.09 0.12 0.39 0.13 0.39 0.19 0.0 0.11 0.31 0.3 0.0
0.21 0.06 0.12 0.19 0.13 0.18 0.16 0.09 0.17 0.13 0.2 0.24
0.32 0.21 0.15 0.16 0.14 0.21 0.23 0.26 0.18 0.18 0.28 0.28
1.98 2.43 2.42 2.24 2.0 3.01 1.78 1.75 1.24 2.05 2.93 1.57
48.58 50.81 57.82 58.48 47.23 66.07 62.9 53.71 59.57 53.19 61.15 49.86
0.12 0.07 0.1 0.08 0.14 0.46 0.09 0.4 0.02 0.24 0.36 0.0
1.71 1.31 1.15 0.93 1.16 2.18 1.54 2.4 0.81 1.04 1.15 1.0
1.18 1.27 0.81 0.69 0.81 1.75 0.62 0.68 0.53 0.72 0.96 0.51
0.48 0.37 0.2 0.72 0.21 0.45 0.35 0.34 0.73 0.73 0.78 0.6
7.29 10.87 17.28 12.17 8.88 12.02 13.36 10.8 21.09 14.37 17.02 17.06
0.49 0.63 0.49 0.54 0.39 0.4 0.36 0.35 0.61 0.53 0.63 0.55
10.05 9.83 11.41 13.17 12.37 11.24 13.26 9.16 15.64 11.21 11.91 13.34
0.19 0.19 0.29 0.12 0.29 0.21 0.08 0.09 0.43 0.18 0.46 0.35
0.1 0.31 0.26 0.22 0.16 0.35 0.13 0.06 0.17 0.39 0.25 0.29
0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02
15.78 17.98 23.26 27.5 20.22 38.74 30.28 25.35 19.22 22.92 28.43 12.13
1.44 1.6 1.91 1.22 0.8 1.53 2.46 1.59 3.8 2.4 1.73 3.5
0.07 0.23 0.19 0.07 0.18 0.31 0.18 0.04 0.06 0.24 0.26 0.07
0.07 0.02 0.03 0.05 0.12 0.19 0.02 0.22 0.1 0.29 0.33 0.05
2.61 2.18 4.53 4.31 1.67 4.25 4.63 4.09 5.15 3.3 6.29 2.5
18.88 16.93 19.9 18.89 19.51 20.51 20.03 16.96 23.23 20.67 25.09 24.35
20.82 26.79 27.47 25.5 27.21 26.18 28.75 22.98 32.85 28.54 34.4 26.74
1.94 1.9 1.8 1.69 1.49 2.56 2.09 1.94 1.64 2.6 1.87 1.77
6.78 7.08 8.48 7.7 6.93 6.74 8.77 6.9 10.25 7.82 9.95 9.54
3.08 2.98 2.9 2.81 2.28 2.93 2.87 3.11 2.45 3.44 2.89 1.91
8.57 7.23 7.55 7.98 7.77 7.4 8.15 7.71 9.69 8.6 7.37 7.9
3.67 3.35 3.64 4.52 3.59 3.33 3.63 3.03 4.02 3.43 5.47 3.13
2.36 2.05 2.25 2.18 1.9 2.18 1.75 1.76 2.64 2.53 2.34 2.37
0.09 0.06 0.15 0.04 0.08 0.07 0.0 0.25 0.03 0.0 0.38 0.04
1.37 1.38 1.78 1.29 1.26 1.47 2.13 1.22 2.42 1.61 1.3 1.98
0.07 0.09 0.0 0.18 0.0 0.29 0.0 0.23 0.08 0.1 0.38 0.0
1.35 0.98 1.66 1.24 0.86 1.56 0.61 0.88 1.32 0.41 1.93 0.5
1.19 1.57 1.17 1.92 1.38 1.23 2.07 1.19 3.22 1.19 2.07 0.72
0.12 0.21 0.17 0.18 0.08 0.2 0.2 0.29 0.19 0.25 0.45 0.07
2.37 4.25 5.52 4.59 5.3 5.69 6.7 2.91 6.89 6.04 6.99 3.3
0.12 0.09 0.12 0.07 0.05 0.09 0.06 0.15 0.07 0.15 0.28 0.07
0.13 0.07 0.37 0.2 0.13 0.09 0.19 0.15 0.28 0.29 0.3 0.43
18.12 21.59 36.59 36.88 34.42 46.13 46.65 15.71 48.72 33.64 47.89 32.82
0.28 0.06 0.12 0.32 0.07 0.13 0.17 0.22 0.11 0.18 0.31 0.12
3.66 4.26 4.05 3.5 4.25 4.64 4.02 3.4 3.47 3.71 3.7 3.21
0.37 0.31 0.34 0.33 0.33 0.22 0.22 0.23 0.31 0.32 0.22 0.27
0.01 0.07 0.03 0.04 0.06 0.05 0.07 0.14 0.08 0.05 0.14 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)