Heatmap: Cluster_96 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.01 -0.0 -0.04 -0.08 -0.11 -0.07 0.0 -0.09 0.13 0.04 -0.01 0.22
-0.08 0.0 -0.12 -0.16 -0.24 0.15 0.14 0.16 -0.03 -0.02 -0.14 0.26
0.19 -0.4 0.04 -0.09 0.09 0.11 -0.26 -0.25 0.16 -0.13 -0.07 0.42
-0.18 -0.12 -0.2 -0.2 -0.18 0.14 -0.06 -0.05 0.1 0.25 0.1 0.28
-0.24 -0.17 -0.13 -0.03 -0.18 -0.03 -0.1 -0.13 0.02 0.03 0.14 0.61
-0.28 -0.3 -0.24 -0.1 -0.12 -0.2 0.1 0.06 0.12 0.22 0.12 0.42
-0.23 0.22 -0.29 -0.11 -0.59 0.28 -0.03 -0.1 0.25 -0.06 -0.02 0.4
-0.15 -0.09 0.02 -0.08 -0.17 0.02 0.01 -0.02 0.15 0.12 0.03 0.12
-0.01 -0.12 -0.1 0.06 -0.36 -0.23 0.1 0.17 0.06 -0.05 0.12 0.25
-0.12 -0.13 0.01 -0.22 -0.03 -0.07 0.05 -0.03 0.17 0.0 -0.11 0.39
-0.12 -0.04 0.01 -0.05 -0.15 0.13 0.06 0.12 -0.02 -0.13 -0.09 0.22
-0.13 0.04 -0.11 -0.19 -0.1 -0.06 0.14 -0.06 0.3 0.05 -0.08 0.13
0.92 0.47 -0.03 -0.73 -0.49 -0.74 -0.62 -0.68 -0.85 0.36 0.29 0.58
-0.08 0.03 -0.05 -0.06 -0.05 0.04 -0.1 0.02 -0.01 0.11 -0.05 0.16
0.25 -0.17 -0.04 -0.1 -0.26 -0.51 -0.1 -0.01 -0.02 -0.19 0.14 0.68
-0.06 -0.24 0.26 0.21 -0.05 -0.07 0.1 -0.35 -0.03 -0.2 0.14 0.14
-0.14 -0.34 0.01 -0.05 -0.03 -0.07 0.08 0.02 0.07 0.05 0.1 0.21
0.05 -0.03 -0.15 -0.07 -0.05 -0.06 0.07 0.04 0.12 0.12 -0.04 -0.03
-0.1 -0.07 0.0 -0.11 -0.18 -0.01 0.02 0.04 -0.01 0.06 -0.12 0.39
-0.09 -0.25 0.06 -0.12 -0.18 -0.09 -0.03 -0.09 0.11 0.08 0.0 0.46
-0.31 -0.13 -0.08 -0.11 -0.17 -0.19 0.14 0.04 0.18 0.09 -0.04 0.41
-0.34 0.42 -0.87 0.09 -0.98 0.03 0.24 -0.48 0.52 0.04 -0.39 0.68
-0.02 -0.21 -0.07 0.09 -0.16 -0.12 0.07 -0.13 0.08 0.18 0.05 0.17
0.01 0.06 -0.07 -0.21 -0.26 0.05 0.06 -0.06 0.14 0.1 -0.11 0.2
-0.14 -0.12 -0.05 0.04 -0.22 -0.05 0.03 -0.1 0.16 0.16 0.06 0.15
-0.21 -0.06 -0.21 0.09 -0.04 -0.07 -0.06 -0.05 0.19 0.11 0.04 0.2
-0.11 0.07 0.09 -0.09 -0.14 -0.13 -0.17 -0.11 0.07 0.15 0.05 0.26
0.07 0.03 0.15 -0.13 -0.26 0.14 0.01 -0.08 0.11 -0.08 -0.14 0.11
-0.02 -0.24 0.2 -0.31 -0.43 -0.2 0.2 -0.29 -0.07 0.16 0.1 0.57
0.05 0.05 -0.04 -0.09 -0.07 0.07 0.11 -0.15 -0.05 -0.1 -0.08 0.24
0.07 0.11 -0.13 -0.06 -0.01 0.19 0.02 0.33 -0.29 -0.17 -0.71 0.36
0.54 -0.01 -0.9 -0.57 -0.53 -0.52 0.35 -1.41 -0.14 -0.24 0.28 1.22
0.1 0.06 -0.04 -0.18 -0.13 0.02 0.02 -0.17 0.1 -0.01 -0.02 0.21
-0.17 -0.3 0.1 -0.06 0.1 0.13 0.02 -0.12 0.14 -0.18 -0.03 0.25
-0.28 -0.07 -0.13 -0.14 -0.14 -0.01 0.12 0.06 0.03 0.07 0.09 0.29
0.01 -0.25 0.13 -0.06 -0.21 -0.39 -0.14 -0.29 -0.18 0.05 0.18 0.76
0.04 -0.19 -0.01 -0.2 -0.1 0.1 0.08 -0.02 -0.2 -0.26 -0.07 0.62
-0.16 -0.08 -0.11 -0.14 -0.21 -0.05 -0.12 0.05 0.09 0.25 0.03 0.35
0.13 -0.0 -0.12 -0.3 -0.22 -0.06 0.23 0.0 -0.24 0.01 0.03 0.39
-0.15 -0.17 0.06 0.12 -0.29 -0.21 -0.01 -0.27 -0.05 0.05 0.25 0.47
-0.06 -0.07 -0.02 -0.14 -0.15 0.03 0.02 0.01 0.02 -0.0 0.05 0.26
0.19 -0.25 -0.17 -0.26 -0.66 -0.01 0.18 -0.38 0.16 -0.16 0.14 0.73
0.46 0.46 0.08 -0.13 -0.36 -0.51 -0.77 -1.2 -0.11 -0.06 0.13 0.84
0.27 0.21 -0.14 -0.0 -0.45 -0.51 -1.03 -1.27 0.05 0.14 0.27 1.03
0.1 -0.06 0.01 -0.06 -0.28 -0.07 0.07 -0.07 0.09 -0.03 0.04 0.21
0.51 1.15 -1.27 0.34 - 0.7 0.23 -0.48 0.87 -1.09 - -0.22
-0.16 0.28 0.05 -1.04 -1.47 -0.04 -0.49 0.06 -0.05 0.15 0.18 1.04
0.19 -0.56 0.08 -0.13 -0.52 -0.13 -0.16 -0.47 0.11 0.04 0.36 0.66
0.39 0.3 -0.38 -1.1 -0.99 -0.3 0.08 -0.69 -0.13 0.18 0.3 0.97
0.16 0.06 -0.52 -0.16 -0.44 -0.63 0.14 -0.66 -0.17 0.31 0.21 0.88
-0.01 -0.07 -0.03 -0.02 -0.07 0.07 -0.07 0.04 -0.05 -0.03 0.02 0.2
-0.1 -0.07 0.09 -0.04 -0.16 -0.11 -0.08 -0.06 0.09 -0.04 0.14 0.27
-0.08 -0.07 -0.07 -0.04 -0.1 -0.1 0.09 0.03 0.04 0.04 0.02 0.23
0.33 0.23 -0.15 -0.14 -0.38 -0.46 -0.38 -0.52 -0.06 -0.22 0.14 0.91
-0.15 -0.09 -0.07 -0.11 -0.19 0.07 0.02 -0.04 0.18 0.01 0.06 0.24
-0.0 0.06 -0.15 -0.08 -0.12 -0.02 0.11 0.02 0.08 0.11 -0.18 0.13
0.03 -0.29 0.13 -0.2 -0.77 -0.86 0.05 -0.39 0.07 0.21 0.32 0.86
0.08 -0.07 0.02 -0.2 -0.44 0.11 0.02 -0.17 0.26 -0.21 -0.12 0.5
-0.07 -0.45 0.19 -0.3 -0.1 0.07 0.04 -0.05 0.05 -0.03 0.06 0.41
-0.01 -0.16 -0.05 -0.72 -0.94 -0.26 0.49 -0.72 -0.66 0.36 0.2 1.08
-0.22 -0.08 -0.11 -0.17 -0.05 -0.16 0.01 -0.06 0.14 0.24 0.0 0.35
0.08 0.68 -0.5 -0.33 -0.28 -0.41 -0.13 -0.19 0.23 0.08 -0.18 0.45
-0.08 0.05 -0.11 -0.21 -0.38 -0.0 0.05 -0.02 -0.02 0.21 0.03 0.37
-0.12 -0.06 -0.14 -0.09 -0.15 0.02 -0.01 0.01 0.11 0.07 0.04 0.27
0.33 0.27 -0.44 -0.29 -0.65 -1.19 -0.3 -0.99 -0.04 0.25 0.52 1.0
-0.12 0.02 -0.09 -0.05 -0.09 0.12 -0.0 -0.01 0.09 -0.02 0.05 0.08
0.02 -0.12 0.14 -0.06 -0.3 0.17 0.08 -0.17 0.15 -0.1 -0.08 0.18
-0.08 -0.14 0.02 -0.03 -0.08 0.02 -0.01 -0.06 0.14 -0.03 -0.01 0.22
-0.07 -0.05 -0.0 -0.06 -0.1 -0.07 -0.12 -0.07 0.03 0.09 0.02 0.33
0.78 0.38 0.07 0.1 -0.83 -0.63 -1.27 -1.26 -0.06 -0.22 0.25 0.86
-0.02 -0.14 0.03 -0.23 -0.28 -0.19 -0.1 0.11 0.16 0.03 0.07 0.41
0.25 -0.09 -0.14 0.08 -0.63 -0.66 -0.55 -0.86 0.19 0.07 0.44 0.88
-0.16 -0.03 0.04 -0.05 -0.17 -0.1 0.0 0.11 0.06 0.01 -0.14 0.35
0.09 0.15 0.06 0.24 -0.27 -0.0 0.08 -0.18 0.14 -0.17 -0.3 0.05
-0.2 -0.05 -0.14 -0.15 -0.15 -0.06 0.09 0.04 0.07 0.2 0.04 0.23
-0.03 -0.03 -0.02 -0.17 -0.07 -0.07 -0.08 -0.14 0.02 0.03 -0.0 0.45
-0.11 0.07 -0.08 -0.33 -0.31 -0.13 0.21 -0.04 0.0 0.29 0.03 0.25
-0.12 -0.03 -0.11 -0.17 -0.27 -0.07 -0.03 -0.03 0.21 0.06 0.01 0.41
-0.07 -0.08 -0.03 -0.09 -0.22 0.13 0.01 -0.01 0.1 0.03 -0.03 0.21
0.4 -0.06 -0.17 -0.37 -0.62 -0.52 -0.05 -0.2 -0.03 -0.34 0.41 0.83
-0.19 -0.01 -0.03 0.07 -0.11 -0.01 -0.03 -0.02 0.16 0.02 0.02 0.11
0.14 -0.14 0.07 -0.24 -0.21 0.18 0.12 -0.03 0.02 -0.24 -0.03 0.24
-0.11 0.11 -0.03 -0.12 -0.24 -0.05 -0.08 0.1 0.04 0.1 -0.16 0.35
0.05 -0.07 -0.03 0.01 -0.22 -0.15 0.11 0.03 0.05 -0.08 0.02 0.21
-0.09 -0.13 0.07 -0.01 -0.22 -0.16 -0.02 -0.11 -0.05 0.12 0.12 0.38
-0.01 0.03 -0.01 -0.01 -0.16 0.05 0.0 -0.06 0.14 -0.03 -0.13 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.