Heatmap: Cluster_231 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.03 -0.05 0.35 -0.06 -0.42 -0.36 -0.05 -0.39 -0.13 0.02 0.26 0.49
0.04 -0.18 -0.17 0.07 -0.31 -0.36 -0.09 -0.23 0.12 0.17 0.41 0.29
-0.24 -0.07 -0.05 0.31 -2.35 - 0.5 -2.6 0.56 - 1.06 1.41
0.8 -0.8 -0.12 0.28 -0.39 -1.13 -0.88 -3.2 0.02 -0.03 0.14 1.37
-0.04 -0.15 -0.07 -0.37 -0.57 -0.5 -0.12 -0.47 0.0 0.13 0.46 0.93
0.05 -0.46 -0.18 -0.05 -0.5 -0.34 -0.06 -0.12 0.26 -0.07 0.17 0.81
0.2 -0.41 0.16 -0.02 -0.14 -0.26 -0.12 -0.39 -0.01 -0.3 0.35 0.58
0.11 -0.17 -0.09 0.0 -0.01 -0.29 -0.09 -0.1 0.12 0.07 0.25 0.11
0.48 -0.1 -0.33 -0.19 -0.55 -0.38 0.03 -0.35 -0.15 -0.18 0.14 0.89
-0.1 -0.11 0.17 0.07 -0.14 -0.42 -0.07 -0.02 0.01 -0.16 0.14 0.44
0.31 -0.27 -0.16 -0.16 -0.8 -0.26 -0.53 -0.03 0.36 0.11 0.05 0.74
-0.11 -0.02 0.06 -0.01 -0.24 -0.51 0.01 -0.39 0.04 -0.16 0.23 0.72
-0.51 -0.03 -0.24 -0.28 0.01 -0.55 -0.13 -0.28 -0.22 -0.45 0.62 1.06
0.1 -0.16 -0.08 -0.09 -0.13 -0.1 -0.03 -0.19 0.1 0.02 0.14 0.33
-0.17 -0.48 0.57 0.12 -0.14 -0.08 -0.28 -0.87 0.32 -0.38 0.08 0.61
0.41 -0.43 -0.04 -0.27 -0.27 -0.25 -0.31 -0.36 -0.24 -0.12 0.42 0.82
0.28 -0.15 -0.06 -0.28 -0.36 -0.03 -0.23 -0.15 -0.12 -0.21 0.32 0.65
0.07 -0.23 -0.06 -0.06 -0.09 -0.16 -0.12 0.09 0.03 0.07 0.0 0.36
0.04 -0.06 -0.0 -0.4 -0.58 -0.26 -0.07 -0.48 0.08 0.23 0.3 0.71
-0.08 -0.11 -0.12 0.04 -0.53 -0.42 -0.57 -0.26 -0.1 -0.4 0.66 0.97
0.07 0.06 0.22 -0.03 -0.28 -0.41 0.12 -0.39 -0.07 -0.01 0.08 0.42
0.09 0.03 -0.05 -0.15 -0.14 -0.14 -0.14 -0.28 0.08 0.05 0.14 0.38
0.05 0.2 0.28 -0.02 -0.47 -0.52 -0.21 -0.17 -0.12 -0.03 0.15 0.52
-0.22 -0.1 0.15 0.04 0.03 -1.08 0.02 -0.03 -0.08 -0.45 0.21 0.81
-0.05 0.32 0.2 -0.31 -0.54 -0.36 0.01 -0.11 -0.14 -0.01 0.14 0.51
0.17 -0.11 -0.19 -0.12 -0.16 -0.21 -0.03 0.01 -0.09 -0.06 0.14 0.48
0.02 0.08 0.21 0.01 -0.24 -0.31 -0.03 -0.31 -0.0 -0.06 0.09 0.37
0.39 -0.27 -0.38 -0.29 -0.2 -0.6 -0.41 -0.66 0.18 -0.22 0.4 1.04
0.14 0.03 0.15 -0.23 -0.13 -0.23 -0.22 -0.09 -0.1 0.05 0.1 0.38
0.31 -0.26 0.21 0.24 -0.46 -0.59 -0.45 -0.35 -0.02 0.01 0.35 0.5
-0.23 -0.07 0.13 0.24 0.05 -0.22 -0.11 -0.06 -0.16 -0.08 0.09 0.31
0.16 -0.17 -0.1 -0.06 -0.18 -0.14 -0.37 -0.4 0.28 -0.14 0.28 0.53
0.52 -0.72 -0.86 -0.35 -0.86 -0.58 -0.33 -2.87 -0.01 0.49 0.29 1.51
0.04 -0.4 -0.04 -0.05 -0.38 -0.21 0.0 -0.22 0.06 0.12 0.34 0.47
0.05 -0.38 -0.09 0.01 -0.22 -0.02 -0.1 -0.11 -0.02 0.06 0.21 0.45
0.05 -0.01 0.07 -0.0 -0.22 -0.13 -0.01 -0.09 -0.06 -0.04 0.11 0.27
-0.0 -0.07 -0.02 -0.03 -0.04 -0.14 0.04 0.06 0.03 -0.04 -0.02 0.21
0.1 -0.16 -0.12 -0.21 -0.27 -0.18 -0.04 -0.01 -0.0 0.14 0.21 0.4
0.2 -0.09 0.04 -0.0 -0.09 -0.36 -0.36 -0.15 0.04 0.02 0.31 0.26
-0.29 0.14 0.15 -0.24 -0.3 -0.57 0.01 -0.41 -0.24 -0.01 0.48 0.72
0.06 -0.02 0.12 0.09 -0.12 -0.12 0.01 -0.08 -0.08 -0.04 0.03 0.13
-0.23 -0.06 -0.6 0.38 0.23 -0.31 0.1 -0.93 -0.29 0.27 -0.0 0.7
0.44 -1.15 -0.2 -0.13 -0.77 -0.4 0.09 -0.95 0.7 0.04 -0.07 0.91
0.03 0.24 0.3 0.18 -0.41 -0.44 -0.3 -0.39 0.06 0.08 0.06 0.29
0.01 -0.23 0.08 0.0 -0.5 -0.13 -0.05 0.01 0.34 -0.3 0.08 0.43
0.13 -0.04 -0.02 0.01 -0.2 -0.25 -0.23 -0.45 0.25 -0.08 0.12 0.52
-0.08 -0.11 0.25 -0.15 -0.09 -0.2 0.12 -0.15 0.05 -0.07 0.04 0.29
-0.05 0.17 0.11 0.06 -0.14 -0.2 0.05 -0.11 -0.14 -0.15 0.03 0.29
-0.15 -0.25 -0.12 -0.0 -0.3 -0.68 -0.12 -0.4 0.18 0.17 0.45 0.67
0.07 -0.07 -0.03 0.0 -0.11 -0.12 -0.07 -0.16 0.06 -0.11 0.19 0.28
0.1 -0.24 0.1 -0.01 -0.14 -0.33 -0.08 -0.26 -0.11 0.1 0.24 0.43
0.16 -0.36 -0.1 -0.16 -0.24 -0.47 -0.12 -0.27 0.08 0.17 0.38 0.56
0.47 -0.33 0.27 -0.2 -0.5 -0.64 -0.28 -0.76 -0.08 -0.26 0.46 0.87
0.03 -0.18 0.05 -0.19 -0.25 -0.29 -0.06 -0.41 0.05 0.23 0.18 0.55

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.