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Heatmap: Cluster_124 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.41 0.5 0.18 0.1 -0.28 0.11 -0.15 0.43 -0.01 0.02 -0.59 -0.32
-0.44 0.0 0.72 0.32 0.73 -0.35 -0.24 0.1 0.01 -0.27 -0.46 -1.17
0.14 0.14 0.14 0.2 -0.16 -0.15 0.45 0.65 -0.47 -0.21 -0.42 -1.01
-0.43 -0.03 0.85 1.93 0.89 -0.08 - 0.89 - - - -
0.15 -0.09 0.3 0.06 0.1 0.07 0.1 0.25 -0.35 -0.18 -0.45 -0.16
0.36 0.28 1.16 0.28 0.21 -1.32 0.64 0.0 -0.72 -0.77 -1.54 -1.38
0.13 0.14 -0.31 0.09 0.16 0.05 -0.04 0.0 -0.24 0.3 -0.21 -0.22
-0.35 0.49 0.33 -0.18 0.27 0.15 0.01 0.27 -0.43 -0.09 -0.35 -0.57
0.5 0.89 0.27 -0.06 0.11 -0.62 -0.47 -0.69 -0.56 0.15 -0.61 0.08
0.12 0.19 0.11 0.09 -0.0 0.06 -0.07 -0.04 -0.25 -0.02 -0.2 -0.06
-0.2 0.19 0.25 0.21 0.02 0.05 -0.15 0.18 0.06 -0.04 -0.46 -0.29
-1.46 0.83 0.26 -1.27 -0.04 0.32 0.18 0.68 -0.11 -0.3 -1.15 0.14
0.07 0.15 0.01 0.12 0.0 0.03 0.08 -0.1 -0.07 0.03 -0.29 -0.1
-0.16 0.24 0.3 -0.01 0.03 -0.09 0.08 0.15 -0.3 -0.11 -0.24 -0.01
-0.12 -0.24 -0.04 -0.99 -0.12 -0.27 1.18 0.44 -0.58 0.41 -0.97 -0.2
-4.09 0.66 1.21 -0.07 0.41 0.34 0.59 0.29 -0.54 -0.36 -2.6 -2.82
-0.94 0.74 1.18 0.79 0.03 0.18 0.41 -0.48 -0.94 -1.61 -1.47 -1.31
0.04 0.3 -0.14 0.16 -0.06 0.01 -0.08 -0.05 0.12 0.01 -0.35 -0.07
-0.08 0.43 0.3 -0.02 0.1 -0.27 -0.14 -0.16 0.06 -0.19 -0.27 0.05
-0.56 0.15 0.39 0.28 -0.11 0.03 0.15 0.22 -0.07 0.07 -0.32 -0.6
-0.0 0.51 0.34 -0.12 0.06 -0.09 -0.03 0.3 -0.38 -0.11 -0.32 -0.51
-0.87 1.47 1.19 -1.89 0.08 -0.57 -0.39 0.89 0.28 -0.86 - -
-0.07 0.27 0.06 0.06 -0.16 0.07 0.14 -0.17 -0.45 -0.2 -0.27 0.46
-0.19 0.29 0.19 0.37 0.12 0.15 -0.17 -0.02 0.22 -0.16 -0.3 -0.94
-0.25 0.29 0.22 0.17 0.0 -0.05 0.14 0.08 -0.04 -0.35 -0.08 -0.28
-0.14 0.31 0.65 0.53 -0.55 -0.6 -0.29 -0.01 -0.16 0.13 -0.19 -0.28
-0.18 0.14 0.61 0.37 -0.19 0.03 -0.38 0.18 -0.11 0.06 -0.34 -0.67
0.39 1.91 0.96 -1.87 -0.39 -0.14 0.22 -1.32 -0.74 -0.16 - -
0.43 0.74 0.43 -0.15 0.05 -0.37 -0.73 -0.38 -0.46 0.2 -0.18 -0.33
-0.35 0.4 0.67 0.19 -0.17 -0.2 -0.41 -0.1 0.07 0.02 -0.08 -0.5
-0.48 0.0 0.55 0.46 -0.15 0.09 -0.0 0.43 -0.13 0.07 -0.58 -1.01
-0.34 0.4 0.39 0.16 0.11 0.0 0.1 0.04 0.12 -0.29 -0.5 -0.57
0.09 0.67 -0.14 -0.04 0.07 0.14 0.27 0.23 -0.66 -0.31 -0.65 -0.21
-0.09 0.41 0.07 0.06 0.12 -0.13 -0.04 -0.2 0.21 -0.05 -0.09 -0.46
-0.12 0.31 0.38 0.54 0.43 -0.04 -0.39 -0.02 -0.39 -0.09 -0.62 -0.6
-1.0 0.71 1.19 0.92 -0.44 0.32 0.01 -0.39 -0.39 -1.86 -1.41 -0.9
-0.78 0.35 0.59 0.38 0.15 -0.12 0.23 0.25 -0.18 -0.51 -0.75 -0.39
-0.27 0.53 0.27 0.13 -0.03 -0.11 0.14 0.28 -0.22 -0.41 -0.54 -0.15
-0.76 2.33 0.76 - -1.3 -0.44 0.59 -1.55 - -1.76 - 0.49
0.15 0.04 0.03 0.02 -0.04 0.06 -0.02 0.07 -0.13 0.03 -0.27 0.02
-0.35 0.37 0.47 0.49 0.15 0.14 0.03 -0.31 -0.1 -0.55 -0.6 -0.3
-0.55 0.47 0.4 0.14 0.32 -0.58 -0.02 -0.19 0.63 -0.36 -0.31 -0.75
-0.12 -0.01 0.03 0.02 -0.12 -0.09 0.18 0.23 -0.28 0.02 -0.08 0.14
0.03 0.16 0.02 0.09 -0.01 -0.09 -0.12 0.12 -0.18 0.03 -0.12 0.02
-1.11 0.56 1.29 0.47 0.78 0.12 0.75 -0.51 -1.33 -1.96 -3.49 -1.73
-0.18 0.69 0.59 0.28 0.01 -0.33 -0.11 0.2 -0.89 -0.12 -0.71 -0.26
-0.95 0.62 0.8 0.01 -0.49 -0.44 0.22 0.79 -0.76 0.07 -1.01 -0.48
-0.03 -0.09 0.1 -0.25 -0.08 -0.18 0.38 0.44 -0.11 0.17 -0.5 -0.13
-0.39 -0.09 0.2 0.06 0.06 -0.1 0.29 0.46 0.02 0.16 -0.73 -0.32
0.28 0.14 0.12 -0.08 -0.19 0.22 0.29 0.12 -0.38 -0.32 -0.24 -0.19
-0.71 -0.11 0.63 -0.01 -0.21 -0.89 -0.08 0.6 0.53 0.28 0.03 -1.38
0.32 0.71 0.63 -1.26 -0.1 -0.2 0.82 0.17 -0.69 -1.3 -0.56 -0.41
0.52 1.13 0.05 -0.17 -0.14 -0.21 -0.24 -0.2 -0.78 -0.05 -0.97 -0.14
-0.3 0.35 0.55 0.38 0.16 0.06 -0.09 -0.12 0.11 -0.39 -0.71 -0.59
-1.81 1.36 -0.09 -0.14 0.65 -0.27 -1.66 0.07 -2.04 0.29 -0.69 0.53
0.51 0.79 -0.41 -1.14 0.08 0.41 0.13 0.58 -0.86 -0.08 -0.41 -1.21
-0.13 0.1 0.63 0.17 0.23 0.01 -0.14 0.21 -0.25 -0.15 -0.65 -0.48
-0.33 0.36 0.29 0.49 0.19 0.19 -0.22 -0.21 -0.0 -0.06 -0.63 -0.56
0.05 0.03 0.2 -0.13 -0.1 -0.01 0.08 0.28 -0.42 0.12 -0.31 0.06
-0.23 0.25 0.49 0.56 0.11 0.0 0.06 -0.06 -0.14 -0.61 -0.72 -0.27
-0.41 0.09 0.27 -0.38 -0.2 -0.18 0.29 0.31 0.04 -0.04 -0.15 0.13
-0.7 1.33 -1.45 0.12 0.38 0.31 -1.64 -1.45 - 1.33 0.27 -1.12
-0.04 0.56 0.87 -0.3 -1.59 0.54 0.45 0.9 -1.83 -0.53 -0.28 -3.3
0.18 1.03 0.75 -0.38 -0.34 -0.71 0.9 -0.36 - 0.3 -1.89 -0.29
0.1 0.23 0.39 -0.28 0.1 0.35 0.49 0.43 -0.79 -0.77 -0.3 -0.89
-0.47 0.06 0.31 0.16 0.14 -0.15 0.08 0.12 0.3 -0.13 -0.44 -0.26
0.14 0.31 -0.03 0.03 0.06 0.11 -0.19 -0.07 -0.37 0.1 -0.29 0.05
-0.29 0.4 0.26 0.2 0.01 -0.08 0.07 0.13 -0.21 -0.17 -0.38 -0.16
-0.05 0.32 -0.02 0.07 -0.01 -0.03 -0.05 0.01 0.03 0.02 -0.26 -0.1
-0.15 0.26 0.47 0.27 0.05 -0.1 0.19 -0.05 -0.2 -0.47 -0.41 -0.16
-0.56 0.29 0.55 0.33 0.83 0.34 -0.06 0.16 -0.79 -0.48 -1.13 -0.98
-0.55 0.57 0.16 0.17 -0.07 0.03 -0.09 0.25 -0.63 0.38 -0.64 -0.16
-0.09 -0.02 0.4 0.25 0.36 -0.45 -0.18 0.2 0.12 -0.27 -0.59 -0.09
-0.88 1.09 0.43 0.02 0.04 0.02 0.72 0.86 -1.19 -1.48 -1.84 -1.41
-0.08 0.17 -0.13 -0.03 0.06 0.01 -0.1 0.01 -0.17 0.09 -0.12 0.22
-0.14 0.07 0.44 0.18 -0.02 0.03 -0.07 0.04 0.22 -0.21 -0.65 -0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.