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Heatmap: Cluster_162 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.48 -0.47 0.63 -0.2 0.03 0.95 -0.29 -0.32 -1.38 -0.93 0.5 -0.83
-0.05 0.15 -0.01 0.15 -0.09 -0.21 0.12 0.05 -0.47 -0.04 0.14 0.14
0.16 0.1 -0.02 -0.14 0.06 -0.39 -0.16 0.09 0.01 0.2 0.07 -0.08
0.81 0.6 -0.15 -0.59 -1.14 -0.24 -0.03 -0.13 -1.06 0.2 -0.5 0.71
0.22 -0.25 0.07 -0.05 -0.04 0.01 -0.06 -0.02 -0.03 -0.15 0.29 -0.06
0.06 0.17 0.1 0.15 -0.13 0.04 0.0 -0.05 -0.19 -0.51 0.02 0.18
0.5 0.24 -0.06 -0.02 -0.02 0.11 -0.72 0.25 -0.12 -1.09 0.15 0.12
0.24 0.41 -0.01 -0.17 -0.11 -0.4 -0.01 -0.3 -0.2 -0.2 0.45 -0.0
-0.28 0.79 0.47 0.58 0.22 0.34 -0.9 0.3 -0.89 -1.06 -0.43 -0.75
0.56 -0.11 0.35 -0.02 0.08 0.19 -0.39 -0.14 -0.35 -0.6 0.18 -0.15
-0.2 0.12 0.12 -0.02 0.03 0.13 0.01 -0.23 -0.08 -0.14 0.14 0.06
-0.24 0.21 0.17 0.11 0.0 0.71 -0.1 0.18 -0.63 -0.13 -0.51 -0.26
0.08 -0.08 0.0 0.1 0.02 0.11 -0.08 -0.06 0.02 -0.17 0.02 0.01
0.18 -0.03 -0.28 -0.45 -0.15 -0.23 -0.48 -0.19 -0.26 0.25 0.52 0.61
0.04 -0.06 0.07 0.02 0.06 -0.05 -0.03 -0.14 -0.04 -0.0 0.02 0.09
0.2 -0.18 -0.09 0.11 -0.04 -0.01 -0.1 -0.13 0.26 -0.12 0.11 -0.09
0.16 0.34 0.54 0.0 -0.07 0.47 -0.43 0.4 -0.64 -0.64 -0.37 -0.52
0.3 0.01 -0.46 1.06 0.53 -0.39 -0.92 - -1.28 -0.16 0.63 0.44
0.02 -0.11 -0.16 0.08 -0.04 -0.06 -0.09 -0.03 0.22 0.05 0.05 0.04
0.21 -0.1 0.12 0.03 0.11 -0.18 0.08 -0.22 -0.09 -0.21 -0.06 0.23
0.24 0.33 -0.04 0.32 0.02 0.72 -0.16 -0.39 -1.0 -0.33 -0.03 -0.42
-0.03 0.1 0.44 0.28 0.1 -0.21 -0.13 -0.1 -0.02 -0.24 -0.4 0.01
0.07 -0.19 -0.14 0.18 -0.08 0.08 0.12 -0.12 0.12 -0.16 0.08 -0.04
-0.09 -0.24 0.03 0.36 -0.39 0.09 -0.46 0.14 0.06 -0.14 0.13 0.27
0.33 0.38 -0.06 0.3 0.69 -1.05 -0.28 -1.2 -0.45 -0.43 0.64 -0.22
0.33 0.19 0.2 0.37 0.12 -0.16 -0.52 -0.52 -0.0 -0.75 0.21 0.05
-0.85 0.8 0.31 0.35 0.19 0.43 -0.71 0.37 -0.67 -0.85 -0.38 -0.25
-0.43 0.1 0.42 -0.95 0.12 0.44 -1.04 0.23 -0.96 -1.32 0.94 0.48
0.5 -1.77 -0.4 0.69 -2.67 1.09 -0.72 -1.34 -1.9 -0.12 1.32 -0.09
0.13 0.08 0.2 0.02 0.12 0.03 -0.1 0.07 -0.25 -0.2 0.02 -0.21
0.21 -1.27 -0.07 0.5 0.16 0.26 0.11 -0.05 -0.73 -0.2 0.5 -0.28
0.28 1.04 0.47 0.1 -0.73 -0.69 -1.72 -0.31 -2.36 -0.95 0.93 0.42
0.09 0.06 -0.87 -0.36 -0.26 -0.1 -0.76 -0.22 0.4 0.89 0.13 0.13
-0.05 0.48 0.17 -0.07 0.06 0.2 0.13 0.28 -0.54 -0.52 -0.41 -0.1
-0.12 -0.72 -0.63 0.27 1.13 - -0.73 0.06 -0.0 -2.06 1.21 0.29
1.06 0.15 0.22 0.55 - - 0.02 -0.02 -1.78 0.26 0.44 0.42
-0.26 0.27 0.19 0.15 0.39 0.04 -0.23 -0.38 -0.9 -0.04 -0.04 0.34
-1.25 0.65 0.75 0.29 0.63 -1.89 -2.22 -0.19 -0.17 -1.85 1.07 -0.12
0.46 -0.03 -0.07 -0.58 0.11 0.07 -0.1 -0.31 -0.32 -0.35 0.56 0.13
-0.02 0.61 0.39 0.54 -0.04 -0.31 -0.61 -0.8 -0.14 -0.46 -0.2 0.28
0.34 0.71 1.1 -1.12 -0.08 - -1.56 0.75 - -0.49 0.71 0.24
0.44 0.71 0.22 -0.22 -0.06 -0.88 0.13 -0.1 -0.65 -0.55 0.09 0.11
0.32 0.08 0.76 0.4 -0.23 -0.33 -0.19 0.05 -2.03 -0.11 -0.53 0.34
0.22 -0.59 0.25 -0.69 -0.41 -0.33 -0.3 -0.24 -0.14 0.17 0.94 0.25
1.18 -0.09 0.49 0.05 -1.6 0.65 -0.7 -1.8 -0.93 0.34 0.82 -
0.33 0.23 0.26 0.27 -0.59 -0.53 -0.59 -0.19 -0.33 -0.01 -0.02 0.59
-1.53 0.08 0.71 -1.19 -0.27 -0.15 0.06 0.47 -0.78 -2.16 0.95 0.71
-0.68 -0.34 0.6 0.33 -0.25 0.78 -1.49 -1.04 -0.62 0.23 0.86 -0.37
0.22 -0.13 -0.04 -0.13 0.05 0.02 -0.1 -0.02 0.01 -0.14 -0.03 0.23
0.53 -0.21 -0.18 -0.55 0.27 0.11 -0.54 -0.11 -0.42 -0.72 0.59 0.45
-0.13 -0.73 0.09 0.39 0.3 0.27 -0.17 -0.43 -0.42 -0.17 0.64 -0.25
-0.14 -0.22 0.39 0.67 0.26 -1.2 -1.43 -1.88 0.07 -0.78 0.3 1.13
0.14 0.13 0.06 0.08 0.05 0.19 -0.1 0.04 -0.27 -0.15 -0.12 -0.13
0.29 -0.09 0.13 0.02 0.15 -0.25 -0.11 -0.03 -0.1 -0.12 0.32 -0.39
0.59 -0.39 0.36 -0.12 -0.16 0.28 -0.65 -0.31 -0.49 -0.03 0.17 0.21
0.18 0.32 0.52 0.02 -0.23 -0.36 -0.36 -0.08 0.04 -1.01 0.46 -0.11
0.15 0.37 -0.3 -0.41 -0.23 0.08 -0.08 0.22 -0.22 -0.04 -0.26 0.43
0.08 0.24 0.05 0.15 -0.21 0.01 -0.36 -0.14 -0.32 -0.05 0.09 0.3
-1.52 1.21 -0.23 - 0.42 -0.16 0.05 0.95 - -1.11 0.81 0.1
0.68 -0.92 0.19 -1.22 -0.06 0.82 -2.98 0.25 -0.87 -1.16 1.35 -0.46
0.27 -0.2 0.78 0.4 -0.07 -0.39 -0.39 -0.16 -0.21 -0.29 -0.32 0.03
0.06 -0.13 0.06 0.45 -0.07 0.41 -0.25 0.08 -0.24 -0.37 -0.17 -0.09
0.33 0.18 0.51 0.61 -0.33 - 0.35 - -0.28 0.99 -0.23 -0.12
0.29 -0.3 0.65 0.09 -0.08 0.28 -0.42 -0.06 -0.34 -0.33 -0.16 -0.02
0.15 -0.64 -0.1 -0.5 0.08 0.28 -0.4 -0.63 -0.75 -0.18 0.99 0.55
0.1 0.04 0.1 -0.05 -0.01 0.1 -0.06 0.05 -0.16 -0.13 -0.03 0.0
0.14 0.19 0.12 0.12 -0.01 -0.1 -0.56 -0.17 -0.49 -0.01 0.32 0.19
0.53 -0.28 -0.03 -0.05 -0.85 -0.7 -0.11 0.18 0.16 -0.09 -0.56 0.86
-0.13 -0.54 -0.1 0.73 0.61 -0.46 -1.91 -0.15 0.19 -0.09 0.34 0.06
0.08 -0.67 -0.14 0.42 0.69 0.69 -0.01 0.05 -0.83 -0.54 -0.1 -0.67
0.68 0.53 0.55 0.84 -1.06 -2.53 -0.94 -1.43 -3.3 -0.21 1.09 0.08
0.23 0.02 0.04 -0.33 -0.5 0.18 -0.22 - 0.28 1.02 - 1.04
0.04 0.05 0.07 0.16 -0.01 0.02 -0.13 -0.01 -0.09 -0.06 -0.03 -0.01
0.13 -0.02 0.28 0.05 0.2 0.18 -0.46 -0.18 -0.44 -0.71 0.34 0.21
-0.04 0.05 -0.07 0.02 0.12 -0.16 -0.01 0.03 0.07 -0.05 -0.11 0.13
0.23 -0.23 0.17 0.7 -0.22 0.16 -1.15 0.01 0.3 -1.06 0.15 -0.04
0.16 0.07 0.56 -0.14 -0.01 -0.22 -0.77 0.44 -0.42 -1.85 0.0 0.7
-0.08 -0.18 0.64 -0.61 -0.89 -0.82 -1.01 0.18 -0.68 0.34 0.93 0.51
-2.04 0.19 1.13 -0.18 -0.6 -0.72 -0.1 -1.83 0.96 0.87 -0.79 -0.5
0.03 -0.03 0.23 0.01 -0.03 -0.27 0.02 -0.1 -0.01 -0.16 -0.05 0.26
0.17 -0.48 -0.08 -0.41 0.13 0.3 0.13 0.16 -0.57 0.01 0.56 -0.38
0.75 1.28 1.23 -0.77 -0.8 -0.05 -1.6 -0.15 -0.32 -1.54 -0.21 -2.47
-0.69 1.33 1.21 -2.14 0.28 1.37 -1.0 - -2.75 -0.34 - 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.