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Heatmap: Cluster_171 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.12 0.12 -0.05 -0.16 -0.01 0.01 -0.04 0.18 -0.28 0.0 -0.07 0.11
- -0.01 - 0.48 0.4 - 0.05 1.24 - 0.34 1.86 -
-1.46 -0.86 -2.23 -2.0 1.29 -3.14 -2.32 0.68 1.16 -0.31 1.46 -1.07
0.28 0.2 -0.12 -0.96 -1.32 0.2 0.54 0.16 -0.25 0.42 -0.46 0.23
-1.03 0.56 -0.8 0.07 0.01 0.44 -0.18 0.12 -0.69 -0.79 0.87 0.07
-0.14 0.13 0.02 0.09 0.05 -0.08 -0.09 0.14 0.03 -0.04 -0.05 -0.09
- - - - 1.3 - - 0.82 0.97 2.05 0.75 -
-0.11 0.09 0.16 0.2 0.59 0.0 -0.5 0.15 -0.56 0.04 -0.04 -0.45
-0.1 0.13 -0.07 -0.08 -0.06 0.23 -0.05 0.07 -0.04 -0.2 0.06 0.05
0.56 0.19 -0.84 0.33 1.02 -2.61 0.27 0.39 -1.44 -0.91 -0.07 0.0
0.07 0.28 -0.08 -0.06 0.2 -0.2 -0.19 0.07 0.08 -0.06 -0.1 -0.09
0.08 0.18 -0.04 -0.12 -0.25 -0.1 0.03 0.04 0.09 -0.09 -0.13 0.24
- - - - - 0.44 - 2.19 - - 1.65 1.56
-1.16 0.6 - - 0.08 - - 1.23 -0.23 -1.17 1.45 1.38
0.04 0.12 -0.14 0.17 0.1 -0.19 -0.2 0.25 0.08 0.01 -0.08 -0.26
-0.24 0.58 -0.13 -0.5 -0.07 0.32 -0.77 0.57 0.41 -0.23 0.13 -0.97
0.14 0.28 0.03 0.09 0.33 0.14 -0.3 0.05 -0.54 -0.07 -0.29 -0.09
-0.02 0.13 0.01 0.09 0.06 0.0 -0.14 0.01 -0.11 0.02 -0.08 0.02
-0.06 0.14 -0.05 0.14 0.12 0.06 -0.22 0.03 0.11 0.01 -0.1 -0.23
0.02 0.16 0.0 -0.06 0.01 -0.08 -0.02 0.11 -0.14 0.04 -0.11 0.05
0.14 0.41 -0.45 0.48 0.22 0.78 -0.68 -0.05 -0.81 -0.96 -1.55 0.63
0.05 0.02 -0.01 0.07 -0.08 0.1 -0.03 0.07 -0.22 -0.05 -0.03 0.08
-0.05 0.11 -0.01 0.05 0.02 0.1 -0.01 0.02 -0.04 0.04 -0.07 -0.18
0.1 0.14 0.02 0.1 0.01 0.03 -0.11 -0.03 -0.07 -0.09 -0.17 0.04
0.15 0.19 0.03 0.09 -0.01 -0.02 -0.18 0.1 -0.2 -0.01 -0.12 -0.1
0.06 0.09 -0.05 0.15 -0.13 0.24 -0.09 0.05 -0.1 -0.17 -0.09 -0.0
-0.0 0.13 0.06 0.07 0.04 0.0 -0.13 0.02 -0.12 -0.05 0.03 -0.06
-0.05 0.1 -0.1 -0.1 0.03 0.21 -0.11 -0.01 -0.1 -0.01 -0.19 0.26
-0.05 -0.01 -0.04 -0.06 -0.09 -0.07 0.06 0.05 -0.02 0.21 -0.05 0.04
0.06 0.17 -0.14 0.02 -0.05 0.11 -0.13 0.04 -0.12 0.05 -0.12 0.08
0.1 0.18 -0.02 0.01 0.04 -0.12 -0.1 0.05 -0.13 -0.02 -0.2 0.14
-0.22 -0.66 0.19 -0.36 -0.47 -0.35 0.77 0.35 0.06 0.27 -0.38 0.12
-0.04 0.13 -0.03 0.08 -0.01 0.03 -0.05 -0.01 0.01 -0.02 -0.1 -0.02
0.26 0.41 0.06 0.19 0.11 -0.05 -0.51 0.24 -0.14 -0.33 -0.45 -0.1
-0.02 0.15 0.01 0.1 -0.09 0.03 -0.02 0.12 -0.18 -0.07 -0.11 0.03
0.14 0.58 -0.1 0.2 0.3 0.31 -0.56 0.6 -0.63 -0.68 -0.93 -0.22
0.06 0.07 -0.06 0.07 0.02 0.08 -0.0 0.06 -0.14 0.03 -0.16 -0.05
-0.01 0.23 0.03 0.05 0.06 -0.08 -0.28 0.11 -0.04 0.07 -0.12 -0.09
- - - - - - - 2.62 - - 2.55 -
0.08 0.14 0.05 0.03 0.1 -0.01 -0.07 -0.02 -0.06 -0.01 -0.08 -0.18
0.29 0.79 0.58 -0.02 -0.05 0.34 -0.08 -0.14 -2.63 -0.13 -1.06 -0.1
0.11 0.16 -0.35 0.44 0.41 -0.07 -0.35 0.32 -0.27 -0.15 -0.1 -0.54
0.13 -0.02 0.01 -0.02 0.22 0.06 -0.11 0.12 -0.26 -0.05 -0.01 -0.13
0.02 0.2 -0.01 0.02 0.08 0.0 -0.06 -0.07 0.07 -0.05 -0.05 -0.19
-0.15 0.21 0.02 0.14 0.16 -0.04 -0.28 0.07 0.1 0.01 -0.05 -0.26
-0.01 0.28 -0.03 0.15 0.07 0.01 -0.2 -0.03 0.02 -0.03 -0.09 -0.21
-0.02 0.03 -0.01 0.12 0.03 0.1 -0.09 0.02 -0.15 -0.03 -0.09 0.06
-0.14 0.24 -0.18 -0.11 -0.25 0.12 -0.08 0.11 0.03 -0.08 -0.07 0.29
0.05 0.08 -0.02 0.06 -0.16 0.17 -0.03 0.12 -0.28 -0.05 -0.15 0.12
0.1 0.25 -0.06 0.13 0.07 -0.08 -0.09 -0.03 -0.23 0.16 -0.15 -0.13
0.08 0.1 -0.17 0.08 0.21 -0.35 -0.01 0.24 -0.28 -0.36 0.09 0.19
0.03 0.03 0.1 0.04 -0.02 0.03 -0.14 0.13 -0.13 -0.03 -0.08 0.03
-0.71 -0.67 -0.3 -0.1 0.05 0.69 -0.09 0.19 0.6 0.07 -0.02 -0.46
0.07 0.23 -0.1 0.03 0.09 -0.16 -0.17 0.01 0.06 0.08 0.04 -0.25
-0.21 -0.05 -0.07 0.03 0.1 -0.12 -0.02 0.19 0.1 0.1 0.03 -0.14
0.25 0.35 -0.18 0.08 0.33 -0.24 -0.61 0.27 -0.45 0.13 -0.01 -0.3
-0.19 0.27 -0.1 0.08 0.03 -0.07 -0.2 0.15 0.04 -0.15 -0.06 0.1
- - - - - - - 2.62 - - 2.55 -
0.35 0.42 0.1 0.11 0.08 0.38 -0.08 -0.36 -0.38 -0.26 -0.36 -0.38
- - 0.99 - 0.82 - 2.1 0.8 - 1.16 - -
-0.49 0.58 -0.68 -0.27 0.18 0.07 0.27 0.8 -0.9 -0.2 0.02 -0.33
0.66 - - - 0.53 -0.65 0.38 0.63 0.15 -0.94 1.69 -0.68
0.02 0.29 -0.02 0.19 -0.03 -0.0 -0.18 0.02 -0.12 -0.11 -0.09 -0.02
0.4 0.31 -0.1 0.1 0.2 0.18 -0.52 0.28 -0.35 -0.34 -0.21 -0.3
-0.05 0.48 -0.12 0.19 0.54 -0.18 -0.55 0.08 -0.13 0.16 -0.0 -1.08
-0.48 -0.58 0.02 0.15 -0.03 0.42 0.46 0.31 0.28 0.44 -1.45 -0.69
0.23 1.02 0.2 0.17 0.5 -0.41 -0.64 0.05 -1.11 -0.7 -0.64 -0.04
- 1.07 0.03 1.07 - 1.23 - 1.08 - 1.21 - -
-0.23 0.23 0.03 0.07 0.01 0.05 -0.07 0.13 0.1 0.02 -0.28 -0.13
-0.06 0.17 -0.07 0.07 -0.32 -0.03 -0.14 -0.08 0.27 -0.18 -0.5 0.57
0.09 0.34 -0.02 0.03 0.1 -0.02 -0.18 0.11 -0.11 -0.08 -0.23 -0.12
-0.05 0.12 -0.02 0.04 0.08 0.07 -0.06 0.02 -0.07 -0.01 -0.07 -0.06
-0.0 0.23 0.0 0.08 0.09 -0.06 -0.12 0.17 -0.15 -0.01 -0.13 -0.15
0.1 0.55 0.26 -0.07 0.47 0.0 -2.26 0.34 -0.04 -0.41 -0.73 0.18
-0.01 0.15 -0.01 0.12 -0.0 0.09 -0.05 0.12 -0.2 0.02 -0.1 -0.18
0.06 0.11 -0.1 0.08 0.03 0.09 0.16 0.3 -0.56 -0.16 -0.18 -0.01
-0.08 0.19 0.0 0.33 0.13 0.07 -0.16 0.12 -0.15 0.15 -0.19 -0.62
-0.01 -0.16 0.3 -0.04 0.18 -0.06 -0.07 -0.01 -0.19 0.06 -0.22 0.13
0.06 0.14 -0.13 0.12 0.12 -0.01 -0.28 -0.13 0.14 0.11 0.02 -0.26
-0.19 0.24 -0.41 -0.51 -0.35 -0.16 -0.31 0.37 -0.11 0.05 -0.11 0.86
0.2 -0.57 0.03 -1.02 1.1 0.58 -2.34 0.49 0.28 0.0 -1.13 -0.4
0.07 0.28 -0.02 0.06 0.14 0.02 -0.11 0.05 -0.05 -0.07 -0.1 -0.39
0.12 0.09 0.91 0.37 0.5 0.17 -1.17 -0.19 -0.62 -1.5 -0.04 -0.26
-0.03 0.0 0.13 0.01 -0.03 0.04 -0.16 0.15 -0.02 -0.01 -0.11 -0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.