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Heatmap: Cluster_103 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.18 0.18 0.26 0.07 0.08 -0.24 -0.14 -0.27 0.1 -0.13 0.02 -0.24
-0.12 0.03 0.13 0.01 0.22 -0.16 -0.21 -0.01 0.14 0.12 0.19 -0.52
0.56 0.03 0.01 0.06 0.4 0.25 0.28 -0.35 -0.53 -0.38 0.13 -1.34
0.02 -0.16 0.12 0.18 0.18 -0.05 -0.14 0.03 0.07 -0.04 0.09 -0.42
0.02 0.05 -0.01 -0.09 0.11 -0.01 0.02 -0.1 0.04 0.14 0.01 -0.22
0.2 0.34 -0.04 0.11 0.56 -0.52 0.23 -0.5 -0.43 0.64 -0.64 -0.91
0.15 -0.66 1.36 -2.13 1.41 -1.12 -1.16 0.65 0.16 -2.1 - -0.03
-2.11 -0.39 1.52 -0.29 1.79 - -0.08 0.71 -1.07 -2.12 -2.2 -1.57
0.15 0.1 0.07 0.18 0.34 -0.47 0.07 -0.25 -0.34 -0.19 -0.07 0.19
0.08 0.1 0.09 0.03 0.09 -0.05 -0.12 -0.01 0.01 -0.01 0.07 -0.33
0.32 -0.13 -0.06 0.46 0.02 0.06 0.09 -0.31 -0.26 -0.23 -0.17 -0.01
0.48 -1.38 -1.48 -0.1 0.83 -0.67 0.77 - 0.2 -0.56 1.36 -1.24
0.12 0.08 0.05 -0.15 0.03 0.12 -0.07 0.0 0.04 -0.02 -0.03 -0.22
-0.19 -0.53 0.27 -0.34 0.82 -0.43 -0.35 -0.58 -0.27 0.92 0.43 -1.33
-0.1 -0.16 0.26 0.04 0.25 0.21 0.1 -0.0 0.09 -0.12 0.04 -0.97
0.1 -0.24 0.24 0.26 -0.06 -0.44 0.03 -0.21 0.13 0.1 0.15 -0.26
-0.47 0.32 0.12 0.68 0.5 -0.14 -0.12 -0.11 -0.48 -0.25 -0.35 -0.27
0.43 -0.37 -0.18 -0.65 0.17 0.08 0.38 -0.06 -0.23 0.12 0.17 -0.22
0.45 0.23 -0.15 0.34 0.95 -1.31 -0.09 -0.86 -0.57 0.25 -0.1 -0.56
0.04 -0.03 0.1 0.02 0.15 -0.08 0.01 0.04 0.06 -0.04 -0.06 -0.24
-0.18 0.12 0.19 -1.13 0.81 0.38 0.05 0.18 0.02 -0.62 -0.11 -0.69
0.15 -0.56 -0.14 -0.24 0.0 -0.24 0.44 -0.06 -0.32 0.31 0.07 0.27
0.39 0.15 0.3 0.51 0.36 -0.28 -0.1 -0.38 -0.56 -0.28 -0.18 -0.43
0.1 0.02 0.01 0.32 0.07 0.03 -0.34 -0.17 -0.43 -0.5 0.49 0.08
1.05 -0.38 0.25 0.56 0.24 -1.21 0.44 -1.29 -0.51 -0.28 0.23 -1.25
-0.05 -0.03 -0.03 0.03 0.2 0.02 0.05 -0.0 0.16 -0.03 0.11 -0.56
-0.19 -0.37 0.29 0.64 0.56 -0.15 -0.15 -0.39 0.13 -0.54 -0.16 -0.22
0.19 0.27 0.08 0.62 0.45 -0.33 -0.12 0.31 -0.4 -0.46 -0.55 -0.81
0.3 -0.2 0.36 0.1 -0.08 -0.06 -0.88 -0.35 -0.12 0.13 0.36 0.01
-0.1 -0.39 -0.22 -0.21 -0.02 -0.17 0.26 0.15 0.32 0.5 0.13 -0.64
0.09 0.13 -0.0 0.06 0.36 -0.27 -0.47 -0.26 0.12 0.33 0.08 -0.46
0.27 0.23 0.36 0.07 0.15 -0.16 0.05 -0.13 -0.1 -0.24 -0.06 -0.75
-0.04 -0.52 0.67 0.64 0.54 -0.06 -0.59 -0.27 -0.08 -0.92 0.44 -1.13
0.77 -0.11 -0.17 0.16 0.35 -0.18 -0.27 -0.22 -0.51 -0.54 0.47 -0.43
0.37 -0.65 0.4 0.47 0.42 -0.21 -0.53 -0.32 -0.41 -0.39 0.16 0.06
-0.8 0.41 -0.01 0.32 0.78 -0.42 0.15 0.05 -0.18 -0.74 0.73 -3.18
0.05 -0.13 -0.08 0.38 -0.26 0.09 -0.02 0.13 -0.11 0.07 -0.08 -0.13
- - 1.22 1.36 2.27 - - - 1.18 - - -
-0.11 -0.05 -0.16 0.0 0.3 -0.16 -0.09 0.11 0.29 -0.05 0.33 -0.68
-0.13 0.31 0.32 0.14 0.25 -0.43 0.05 0.0 0.07 -0.27 -0.06 -0.54
0.39 -0.2 0.26 0.02 0.35 -0.18 -0.03 -0.29 -0.24 -0.06 0.11 -0.38
0.17 0.31 0.21 0.1 0.17 -0.1 -0.15 -0.05 -0.2 0.03 -0.21 -0.46
0.13 0.14 0.12 -0.0 0.27 -0.11 -0.04 -0.14 -0.0 0.01 -0.1 -0.37
-0.01 -0.11 0.12 -0.02 0.08 -0.11 0.08 0.06 0.37 0.06 -0.11 -0.57
0.09 -0.1 -0.47 0.78 1.25 -2.65 -0.79 -1.0 0.45 0.34 -1.42 -0.08
0.54 0.07 -0.92 0.36 0.1 -1.17 0.37 -0.05 -0.01 -0.03 0.1 -0.2
0.18 0.75 -0.21 -0.21 2.22 - -0.38 -0.93 0.12 - - -1.28
-0.78 0.82 0.44 0.8 0.4 - -0.56 -0.24 -0.32 0.64 0.18 -2.3
-0.05 0.32 0.36 0.2 0.35 -0.27 0.03 -0.2 -0.19 -0.21 -0.06 -0.61
-0.02 -0.0 0.05 0.12 0.05 -0.02 -0.15 -0.02 -0.08 -0.03 0.05 0.02
0.07 0.08 -0.0 0.11 0.34 -0.24 -0.18 0.17 -0.06 0.08 0.1 -0.72
0.1 -0.1 0.05 -0.03 0.17 -0.01 -0.04 -0.14 -0.19 -0.11 0.21 0.04
0.27 0.57 0.31 0.2 0.64 -0.76 -0.07 -0.51 -0.46 -0.15 -0.56 -0.31
0.19 0.11 -0.01 -0.06 0.1 0.15 0.1 -0.22 0.04 0.08 -0.2 -0.38
1.2 - 0.2 -0.32 0.85 0.41 0.64 - - 0.01 0.34 -0.33
0.17 0.0 -0.25 -0.29 0.43 0.2 0.04 0.06 -0.28 0.03 -0.03 -0.27
0.69 -0.03 -0.34 0.65 0.53 0.26 -0.41 -0.53 -0.8 -0.52 0.05 -0.6
-0.05 -0.1 -0.07 -0.08 -0.01 0.06 -0.03 0.11 0.2 0.12 0.06 -0.3
0.13 0.14 0.02 -0.08 0.16 -0.1 -0.06 -0.0 -0.04 0.09 -0.11 -0.21
0.13 0.07 0.02 0.18 0.34 -0.14 -0.2 -0.01 -0.02 0.01 -0.02 -0.52
-0.82 0.08 0.37 0.44 0.9 -0.1 -0.55 0.32 -1.3 -1.98 0.86 -0.98
0.63 - -0.16 -0.5 1.02 -1.44 1.09 -0.87 -0.05 0.58 -1.69 -0.0
0.41 -0.02 0.27 0.34 0.51 -0.59 -0.04 -0.26 -0.5 0.01 -0.28 -0.37
0.08 0.39 0.31 -0.03 0.22 -0.18 -0.28 -0.42 -0.12 -0.01 0.27 -0.56
0.95 - -0.33 0.45 1.14 0.48 0.29 -0.24 -1.46 -1.5 0.0 -0.95
0.07 0.11 -0.08 0.07 -0.09 0.07 -0.0 -0.02 -0.16 -0.15 0.04 0.12
0.09 -0.09 0.09 0.11 0.07 0.18 0.28 -0.37 0.17 0.13 -0.46 -0.47
0.1 0.14 0.05 -0.11 0.13 0.08 0.04 -0.12 0.11 0.04 -0.11 -0.46
0.29 -0.21 0.03 0.34 -0.09 0.09 0.09 -0.33 -0.2 -0.28 0.23 -0.17
-0.04 -0.01 0.3 0.03 0.65 0.35 -0.24 0.25 -0.26 -0.17 -0.57 -1.02
-0.66 0.12 0.43 0.42 0.52 -0.32 -0.33 -0.05 -0.13 0.11 -1.08 0.18
0.68 -0.87 -0.49 0.2 1.0 -0.32 0.43 -1.43 -0.62 -0.03 0.52 -1.28
0.1 0.09 0.43 0.26 0.23 -0.12 -0.26 -0.26 0.01 -0.04 -0.12 -0.6
- 1.32 1.2 1.53 - - 1.1 - - - - 1.12
-0.29 0.04 0.38 0.14 0.19 -0.1 0.21 -0.1 0.46 -0.19 -0.24 -1.07
0.26 -0.21 -0.11 0.16 0.35 -0.04 0.01 -0.48 -0.11 -0.01 0.08 -0.08
0.31 -2.22 0.01 -0.14 -0.15 -0.71 0.59 0.1 0.67 -0.24 -0.06 0.2
0.03 0.16 0.2 0.15 0.09 -0.13 -0.04 -0.38 0.07 -0.16 0.1 -0.21
0.7 -1.15 -0.21 0.12 0.03 -2.61 0.95 -0.57 -1.89 0.56 0.28 0.29
-0.3 -0.43 0.69 0.73 0.31 -0.25 -0.1 -0.33 -0.33 -0.67 0.49 -0.89
-0.8 0.33 0.24 0.9 0.63 -0.12 -0.37 -0.23 -0.14 -0.87 -0.64 -0.1
- - 2.46 - 2.7 - - - - - - -
0.48 0.4 0.13 -0.61 0.09 -0.49 -0.74 -0.53 0.09 0.72 0.18 -0.67
-0.0 0.14 -0.13 1.34 1.3 - 0.76 -0.91 -0.36 -1.2 -2.72 -1.32
0.07 0.07 -0.04 0.05 0.19 -0.04 -0.01 0.02 -0.03 0.01 -0.01 -0.35
0.28 0.2 0.26 0.16 0.34 -0.28 -0.25 -0.38 0.11 -0.38 0.11 -0.51
1.66 0.84 0.83 - 2.4 - - - - - - -
1.31 - - 1.86 1.77 - - - - 1.31 - -
-0.95 0.66 1.12 1.2 0.36 -1.28 -1.62 0.31 -0.84 -0.33 -0.61 -2.69
-0.4 -0.18 0.7 0.57 0.9 -0.31 -0.98 -0.54 -0.04 -0.26 0.35 -1.74
0.29 0.06 0.45 0.45 0.13 -0.09 0.09 -0.07 -0.47 -0.43 -0.31 -0.55
0.29 0.13 0.13 0.16 0.19 -0.2 -0.12 -0.14 -0.17 -0.14 0.08 -0.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.