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Heatmap: Cluster_224 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.01 -0.09 -0.55 0.11 -0.21 -0.14 -0.08 -0.44 0.16 0.15 0.08 0.64
-0.08 -0.12 0.03 0.09 -0.19 -0.33 -0.09 -0.6 0.49 0.23 -0.4 0.52
-0.13 -0.13 -0.22 0.01 -0.32 -0.33 -0.05 0.01 0.23 0.0 0.34 0.38
-0.19 -0.06 0.06 -0.22 -0.37 -0.2 0.09 0.05 0.27 -0.28 0.01 0.56
0.41 0.05 -0.6 -0.36 -0.51 0.05 -0.43 -1.31 -0.27 0.39 0.25 0.99
-0.05 0.01 -0.01 -0.01 -0.12 0.03 0.02 -0.04 0.05 -0.0 -0.03 0.15
-0.13 -0.14 0.16 0.12 -0.03 -0.31 -0.01 -0.27 0.14 -0.02 0.09 0.28
-0.01 -0.03 -0.05 -0.03 -0.21 -0.06 0.06 -0.02 0.03 -0.02 -0.02 0.31
-0.05 -0.03 0.03 -0.08 -0.06 -0.19 -0.2 -0.37 0.37 0.07 0.0 0.34
-0.08 0.01 -0.06 -0.06 -0.16 -0.06 -0.05 0.0 0.06 0.04 0.01 0.3
0.04 0.01 -0.18 0.09 -0.05 0.02 -0.11 -0.04 -0.09 -0.19 -0.14 0.49
-0.16 -0.07 -0.06 -0.0 0.01 0.09 0.08 0.01 -0.0 0.04 -0.1 0.14
-0.19 -0.65 0.04 -0.11 0.08 -0.35 0.12 -0.35 0.4 0.27 -0.34 0.59
-0.17 -0.25 0.14 -0.06 -0.01 0.07 0.02 -0.08 0.13 0.03 -0.29 0.35
-0.15 0.03 -0.1 -0.0 -0.02 0.11 -0.01 0.01 -0.01 -0.0 0.05 0.07
0.04 -0.13 -0.1 -0.2 -0.25 -0.48 -0.29 -0.09 0.31 0.11 -0.03 0.71
-0.1 -0.03 0.1 -0.09 -0.22 -0.06 0.1 -0.05 0.03 -0.03 -0.01 0.28
-0.21 -0.32 -0.02 0.04 -0.15 -0.09 0.07 0.02 0.28 -0.03 -0.08 0.35
-0.09 -0.32 -0.14 0.14 -0.23 0.13 0.15 -0.16 0.07 0.05 -0.07 0.34
0.51 -0.24 -0.07 0.18 -0.29 -0.18 -0.26 -0.45 0.15 -0.23 0.15 0.38
-0.26 -0.29 -0.07 -0.18 -0.29 -0.42 -0.3 0.03 0.42 0.38 0.18 0.4
0.16 -0.14 -0.39 -0.24 -0.62 -0.18 0.33 0.41 -0.16 -0.34 0.04 0.62
-0.17 -0.11 0.05 -0.03 0.13 -0.18 0.01 -0.07 0.03 0.05 -0.1 0.31
-0.01 0.03 -0.1 0.01 -0.18 -0.1 -0.03 0.01 0.04 0.06 0.01 0.21
-0.03 0.04 0.02 -0.08 -0.13 0.03 -0.1 -0.1 0.02 0.01 0.07 0.2
0.11 -0.09 -0.14 0.07 -0.11 -0.01 0.1 -0.29 0.18 0.09 -0.03 0.06
0.09 -0.11 -0.02 -0.01 -0.16 -0.17 0.08 0.05 -0.08 -0.08 0.02 0.32
0.14 0.01 0.07 0.02 0.14 0.02 -0.06 -0.35 0.11 -0.03 -0.21 0.07
-0.12 0.12 0.04 0.01 -0.19 -0.01 -0.09 0.02 0.06 -0.02 -0.0 0.16
-0.08 -0.0 -0.02 0.02 -0.19 0.01 -0.01 -0.17 0.17 0.05 0.01 0.16
0.01 0.06 -0.05 -0.04 -0.23 -0.02 -0.16 -0.06 0.17 0.03 0.07 0.16
0.04 -0.3 -0.12 -0.42 -0.14 0.5 0.03 -0.15 -0.32 0.19 -0.68 0.75
-0.04 -0.08 -0.15 -0.27 -0.26 -0.02 0.1 0.04 0.1 0.12 0.01 0.35
-1.08 -0.95 -2.86 0.39 -0.01 0.05 0.42 -2.6 0.96 0.02 - 1.62
-0.1 -0.23 -0.05 0.07 -0.12 0.14 0.02 -0.05 0.03 0.05 -0.14 0.3
-0.11 0.03 -0.11 -0.08 -0.13 -0.08 0.04 0.02 0.18 -0.02 -0.03 0.24
-0.34 -0.23 -0.01 0.15 -0.51 -0.01 -0.03 -0.09 0.27 0.13 -0.19 0.55
-0.09 -0.22 -0.14 0.14 0.01 0.03 -0.02 -0.11 0.13 0.0 -0.12 0.3
0.06 -0.12 -0.05 -0.17 -0.53 -0.54 0.1 -0.22 0.06 0.29 -0.41 0.89
0.06 -0.01 0.08 0.1 -0.21 -0.23 -0.05 -0.24 0.22 0.2 -0.35 0.28
-0.07 -0.14 -0.09 0.01 -0.11 0.0 0.06 -0.11 0.16 -0.01 0.01 0.23
-0.01 -0.12 -0.05 0.08 -0.13 -0.04 0.01 -0.26 0.18 0.09 -0.25 0.37
-0.12 -0.09 -0.13 -0.09 -0.18 0.08 0.05 0.2 0.12 -0.01 -0.14 0.22
0.01 -0.2 -0.08 0.03 -0.15 -0.12 0.06 -0.1 0.18 0.08 0.04 0.17
0.04 -0.0 -0.19 0.03 -0.06 -0.02 -0.05 -0.21 0.09 0.09 0.01 0.21
0.01 -0.15 0.06 -0.1 -0.12 -0.08 -0.01 -0.05 -0.1 0.07 -0.01 0.4
-0.93 -0.02 -0.66 -0.09 -1.56 0.05 0.61 -0.02 -0.01 -0.34 0.15 1.09
0.02 -0.23 -0.04 -0.03 -0.25 -0.11 0.11 0.01 0.03 -0.07 0.15 0.32
-0.05 -0.01 -0.04 -0.02 -0.07 -0.02 -0.14 -0.01 -0.07 0.13 -0.04 0.28
-0.35 -0.52 -0.23 -0.17 -0.69 -0.85 -0.05 -0.19 0.6 0.26 0.44 0.76
-0.22 0.05 -0.15 -0.22 -0.25 0.07 -0.01 0.06 0.24 0.06 0.09 0.18
-0.03 -0.21 0.12 -0.19 -0.12 -0.12 -0.03 -0.04 0.34 -0.08 -0.06 0.29
-0.14 -0.03 -0.1 0.02 -0.01 0.07 0.04 0.16 0.11 -0.02 -0.13 0.0
-0.03 -0.06 0.04 0.1 0.06 -0.02 -0.03 -0.34 0.26 -0.09 -0.04 0.07
-0.14 -0.24 -0.09 -0.08 0.12 -0.26 -0.07 -0.05 0.26 0.06 -0.1 0.43
-0.09 -0.31 0.0 0.11 0.1 -0.09 -0.01 -0.19 -0.01 -0.09 0.23 0.25
-0.17 -0.06 -0.06 0.08 -0.07 0.04 -0.06 -0.15 0.22 -0.05 -0.24 0.41
-0.14 -0.02 -0.06 -0.1 -0.36 -0.04 0.04 0.05 0.14 -0.01 0.03 0.36
-0.04 -0.07 0.04 -0.0 -0.09 0.01 -0.22 -0.06 -0.03 0.11 -0.06 0.34
- -1.51 -1.39 - 0.66 1.33 -1.07 - 1.5 -0.23 -0.65 1.25
0.28 -1.1 0.3 0.34 -0.62 -0.17 -1.2 -0.2 0.26 0.1 -0.04 0.8
-0.2 -0.42 0.08 0.02 -0.23 -0.13 0.28 -0.12 0.01 -0.01 -0.31 0.69
-0.03 -0.27 0.01 0.07 -0.24 -0.05 0.24 0.05 -0.09 0.08 -0.34 0.4
-0.14 -0.13 -0.4 -0.53 -0.55 -0.3 0.12 0.11 0.46 -0.1 0.24 0.67
0.05 0.05 0.08 -0.01 -0.21 -0.19 -0.3 -0.02 0.22 0.21 0.01 0.02
-0.2 -0.05 -0.03 0.07 -0.17 -0.05 -0.02 -0.05 0.11 0.1 -0.02 0.25
-0.1 -0.52 -0.18 -0.09 0.08 0.03 0.14 -0.28 0.14 -0.19 0.35 0.37
0.11 -0.17 -0.26 0.23 -0.34 -0.08 -0.08 -0.35 0.03 0.13 0.26 0.3
-0.16 -0.24 -0.13 0.06 -0.19 0.09 0.17 0.03 0.04 0.06 -0.02 0.22
-0.16 -0.08 -0.13 0.0 -0.13 0.09 -0.03 -0.03 0.1 0.04 0.08 0.2
-0.18 -0.12 -0.05 0.09 -0.06 0.14 -0.02 -0.09 0.02 -0.05 -0.05 0.3
-0.26 -0.31 -0.13 -0.04 0.01 0.04 0.12 -0.11 -0.01 -0.14 0.31 0.36
-0.12 0.08 0.02 -0.0 -0.14 0.06 -0.05 -0.04 0.04 -0.04 0.04 0.12
-0.05 -0.17 -0.03 0.15 -0.09 -0.14 0.06 -0.12 0.05 -0.01 -0.0 0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.