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Heatmap: Cluster_251 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.23 -0.34 0.43 0.48 0.67 - 0.63 0.06 -2.03 - - 1.52
0.05 -0.02 0.11 0.13 -0.11 0.03 -0.01 -0.06 -0.16 0.04 -0.2 0.15
0.45 -0.04 0.37 -0.18 -0.36 -0.05 0.23 -0.13 -0.45 -0.16 -0.14 0.15
0.8 0.51 0.47 0.09 -0.13 -1.53 -1.12 -0.85 -0.59 -0.57 1.28 -1.52
-0.24 -0.99 0.45 0.45 -0.6 0.11 1.29 -1.09 -0.13 -2.19 -1.27 0.78
0.04 0.06 0.06 0.04 -0.23 0.25 0.05 -0.03 -0.38 -0.05 -0.12 0.2
0.02 -0.09 0.3 0.56 -0.18 -0.35 -0.11 0.01 -0.36 0.22 -0.67 0.23
-0.07 -0.05 0.13 0.24 0.22 -0.61 -0.66 -0.4 -0.78 -0.48 0.58 0.85
0.13 -0.02 0.03 0.12 -0.04 -0.04 -0.04 0.0 -0.03 -0.05 -0.04 -0.03
0.13 0.02 0.02 -0.0 -0.08 0.1 0.03 -0.04 -0.15 0.04 -0.11 0.02
0.11 0.05 0.26 0.08 -0.14 0.12 0.16 -0.2 -0.38 -0.17 -0.22 0.19
0.0 0.16 0.21 0.06 0.14 -0.65 -0.02 -0.22 -0.08 -0.12 0.11 0.21
0.21 -0.25 0.12 0.19 -0.26 -3.25 0.71 -0.52 0.11 -1.09 -0.14 1.03
0.36 0.22 0.39 -0.21 -0.05 -0.66 -0.06 -0.73 0.04 -0.42 -0.14 0.61
-0.11 0.5 0.13 -0.06 0.24 -0.18 -0.04 -0.37 0.07 -0.1 -0.23 -0.05
-0.0 -0.98 -0.22 -0.46 0.24 0.42 0.77 -0.76 -0.46 -0.47 0.65 0.11
0.08 -0.64 0.13 0.27 0.05 -0.6 0.36 -0.4 -0.05 0.22 -0.16 0.32
0.02 0.11 -0.19 -0.1 -0.14 -0.09 0.11 -0.04 0.09 0.13 -0.35 0.33
0.03 -0.01 0.13 0.12 0.14 -0.31 0.13 -0.16 -0.1 -0.07 0.11 -0.09
-0.32 -0.14 -0.02 -0.15 0.52 0.28 -0.35 0.1 -0.37 -0.12 0.09 0.19
0.13 -0.25 -0.09 0.04 0.5 0.09 0.01 -0.52 0.33 -0.02 -0.58 -0.01
0.03 0.04 0.04 0.08 -0.07 0.09 -0.06 -0.01 -0.13 0.0 -0.08 0.06
0.08 -0.05 -0.02 0.21 0.03 -0.13 0.42 -0.21 -0.22 -0.18 -0.48 0.31
0.68 0.8 0.35 -0.26 0.36 -1.36 -0.21 - -0.19 -0.33 -1.11 0.9
0.81 -0.77 0.06 -0.62 0.88 -0.85 0.21 -0.62 -0.06 -1.35 0.01 0.49
0.05 -0.11 0.04 0.11 -0.08 0.07 0.02 -0.04 -0.22 -0.05 0.01 0.16
-0.13 -0.45 0.18 -0.19 0.21 0.19 0.14 -0.17 0.03 -0.13 0.03 0.14
0.07 0.09 0.27 -0.2 -0.3 0.05 0.11 -0.37 -0.09 -0.39 0.18 0.35
-0.08 -0.01 -0.07 -0.05 0.04 0.18 -0.14 -0.07 -0.07 -0.12 0.2 0.13
0.3 0.01 -0.91 0.25 0.62 -0.07 0.32 0.39 - -0.03 -0.77 0.51
0.55 -0.93 0.87 -0.55 0.11 -1.12 -0.26 -1.11 -0.27 -0.79 0.4 0.95
1.07 -0.43 0.4 0.62 -0.04 - -0.71 -1.25 -0.05 -1.36 0.14 0.88
0.08 -0.09 0.44 0.17 0.02 -0.25 -0.25 -0.14 -0.08 0.0 -0.2 0.13
-1.24 - - -0.63 0.68 - 1.7 - - 0.04 0.08 2.0
0.14 0.01 0.24 0.09 -0.34 -0.3 0.1 -0.31 0.18 -0.13 0.16 0.01
0.24 0.0 0.23 0.08 -0.01 -0.08 0.0 -0.21 -0.18 -0.2 -0.04 0.07
0.38 -1.33 0.02 -0.78 -0.21 0.23 -0.01 0.05 -0.58 -3.16 0.53 1.27
0.04 -0.05 -0.04 0.02 -0.13 0.04 -0.02 -0.1 -0.07 0.02 0.18 0.09
0.16 0.21 0.46 0.03 -0.35 -0.08 0.09 -0.86 -0.22 -0.48 0.08 0.44
-0.39 -1.41 -0.03 0.88 0.35 -0.07 0.73 -0.53 -0.21 -1.25 0.31 -0.11
-0.64 -0.39 2.11 - - 1.01 -0.46 - - - 0.34 1.19
-0.02 0.05 0.25 0.26 -0.14 -0.1 -0.0 -0.36 -0.01 -0.26 -0.05 0.23
0.03 -0.35 -0.08 -0.06 0.34 -0.15 0.18 -0.0 0.01 -0.33 -0.1 0.33
-0.13 0.12 0.33 0.41 0.28 0.11 -0.12 -0.75 -0.0 -0.63 -0.62 0.4
0.1 0.15 0.3 0.04 -0.18 -0.34 -0.02 -0.24 0.13 -0.3 0.01 0.19
0.06 0.0 -0.08 0.12 -0.03 0.18 -0.31 -0.04 0.06 -0.04 -0.23 0.22
0.15 0.11 0.42 0.18 -0.04 -0.37 -0.24 -0.27 -0.07 -0.19 0.22 -0.09
0.01 -0.01 0.15 0.02 -0.07 0.04 0.08 -0.12 -0.07 -0.17 0.0 0.12
-0.17 0.52 0.71 -0.33 -0.8 -0.09 -0.08 -0.01 -0.63 -1.61 -0.47 1.07
-0.14 -0.46 0.31 0.13 -0.19 -0.09 -0.3 -0.03 0.2 -0.88 0.56 0.33
-0.16 0.0 0.12 0.15 -0.13 -0.02 -0.03 -0.17 0.18 -0.06 -0.08 0.15
-0.11 -0.04 -0.01 -0.04 0.01 0.1 0.08 -0.2 0.09 0.07 -0.13 0.15
-0.16 -0.19 0.3 0.06 0.24 0.11 0.15 -0.13 -0.15 -0.3 -0.28 0.18
-0.7 -0.29 0.23 -0.1 1.17 0.52 0.75 -1.09 -1.27 -0.14 - 0.39
-0.2 0.25 0.53 -0.03 -0.91 0.15 0.26 -0.49 -0.45 -0.18 0.07 0.38
-0.26 -0.04 0.37 -0.15 -0.55 -1.0 -0.63 0.21 0.52 0.6 -1.43 0.76
-0.01 0.15 0.22 0.09 -0.32 -0.18 0.22 0.04 -0.17 0.01 -0.51 0.26
0.09 -0.04 0.06 -0.02 -0.06 0.12 0.02 0.04 -0.11 -0.05 -0.11 0.05
-0.22 0.02 0.27 0.21 -0.02 0.13 0.03 -0.24 -0.18 -0.23 -0.19 0.26
-0.78 -1.29 0.44 -0.39 0.84 0.33 0.84 -0.54 -0.42 -0.95 -0.69 0.57
-0.05 -1.98 0.17 0.7 -1.57 0.29 0.05 -0.24 0.93 -1.63 -2.12 1.1
-0.06 0.17 -0.09 -0.24 -0.06 -0.03 0.1 -0.06 -0.06 0.07 -0.04 0.24
-0.1 0.82 0.26 -0.31 -0.43 0.61 0.25 -1.64 0.35 -1.17 -1.46 0.52
0.2 0.06 0.12 0.16 0.0 -0.52 -0.16 -0.22 -0.19 0.15 0.31 -0.11
-0.29 -0.57 -0.6 -0.29 -0.17 0.09 -0.01 0.28 0.06 -0.01 -0.02 0.89
0.65 -1.04 -1.66 -0.08 0.28 -1.49 0.74 0.58 0.51 -1.02 -0.19 0.21
0.31 -1.95 -0.97 0.24 0.74 0.23 1.22 -0.31 -2.1 -1.8 - 1.2
-0.27 -0.25 -0.05 -0.16 0.25 0.72 -0.01 -0.09 -0.04 -0.7 0.15 0.01
0.45 0.29 -0.2 0.01 -0.12 0.58 -0.64 -0.27 -0.1 -0.23 -0.47 0.18
0.75 -0.54 -1.71 0.81 0.67 -1.59 0.7 -0.19 - 0.59 - 0.72
0.02 0.02 0.03 0.05 -0.21 0.09 0.05 -0.05 -0.13 0.03 -0.06 0.14
-0.6 -1.0 -0.1 0.35 0.76 -0.5 0.33 -0.94 0.21 0.16 -0.96 0.74
0.48 -1.07 0.15 -1.6 -0.72 0.03 1.23 -0.8 -0.57 -0.16 0.37 0.36
-0.16 0.3 0.05 -0.14 -0.11 0.14 0.12 -0.08 -0.32 -0.2 -0.17 0.39
0.1 0.12 0.93 -0.48 -0.84 0.25 0.11 -0.99 -0.35 -0.49 -0.83 0.87
0.11 0.04 0.06 -0.47 -0.04 0.43 -0.23 -0.19 -0.22 -0.35 -0.11 0.59
-0.28 -0.35 -0.08 0.31 0.16 -1.46 0.33 0.02 0.33 -0.23 -0.22 0.57
-0.11 -0.17 0.01 0.11 -0.1 -0.07 0.11 0.0 -0.04 -0.14 0.05 0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.