Heatmap: Cluster_102 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
20.46 16.13 16.32 18.25 17.67 17.64 17.79 17.22 16.38 16.94 14.06 19.88
117.62 108.66 115.71 128.03 116.51 108.87 111.99 115.24 109.61 112.91 120.78 131.63
0.03 0.03 0.0 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.09
0.69 0.67 1.07 1.0 1.13 1.11 0.62 0.91 0.62 0.53 0.66 1.6
0.15 0.0 0.15 0.55 0.26 0.29 0.11 0.27 0.05 0.09 0.17 0.52
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07
0.25 0.23 0.29 0.91 0.31 0.44 0.41 0.12 0.42 0.06 0.08 0.5
1.78 1.76 1.72 2.75 1.81 1.6 1.77 1.73 1.3 1.7 1.69 1.96
0.16 0.05 0.1 0.27 0.07 0.14 0.02 0.03 0.15 0.11 0.17 0.32
5.11 4.06 4.1 4.87 4.86 4.02 6.31 3.68 5.14 4.62 4.59 5.46
0.06 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.04
0.15 0.16 0.08 0.33 0.28 0.14 0.22 0.1 0.21 0.11 0.34 0.27
1.4 1.59 1.52 1.72 1.15 1.68 1.41 1.46 1.26 1.69 1.59 1.72
0.07 0.22 0.17 0.25 0.37 0.32 0.13 0.19 0.27 0.1 0.33 0.23
1.24 0.79 0.89 0.98 0.75 0.81 0.67 0.73 1.37 0.65 0.87 0.9
0.01 0.05 0.07 0.08 0.09 0.02 0.0 0.01 0.0 0.04 0.03 0.0
0.01 0.03 0.1 0.02 0.03 0.02 0.03 0.0 0.05 0.06 0.0 0.1
7.89 7.37 7.29 8.19 6.98 7.79 6.88 6.21 7.66 6.03 7.12 9.78
0.74 0.85 0.43 0.93 0.38 0.35 0.2 0.42 0.4 0.45 0.38 1.21
0.36 0.42 0.67 0.92 0.77 0.6 0.58 0.67 0.56 0.52 0.62 0.97
4.22 4.43 3.32 4.67 3.95 4.64 5.26 4.23 3.05 4.39 5.46 6.3
0.53 0.51 0.42 0.58 0.27 0.28 0.31 0.4 0.4 0.27 0.66 0.71
0.15 0.2 0.07 0.23 0.11 0.02 0.08 0.1 0.15 0.15 0.05 0.17
3.16 2.57 4.56 3.72 4.14 3.38 3.84 3.0 3.69 3.68 2.57 5.1
2.17 2.2 3.57 4.02 2.55 2.25 2.36 1.99 2.91 2.26 3.23 2.59
10.12 8.6 9.07 9.75 7.74 8.48 8.2 9.0 7.63 9.18 9.75 10.82
0.98 0.53 0.94 0.66 1.13 0.77 0.84 1.1 0.84 0.9 1.11 1.26
0.15 0.07 0.1 0.27 0.06 0.12 0.04 0.07 0.12 0.14 0.23 0.26
1.77 1.88 1.25 1.64 1.15 1.92 1.44 2.32 1.64 1.66 1.17 2.25
0.22 0.17 0.31 0.35 0.28 0.08 0.26 0.06 0.32 0.12 0.38 0.36
1.91 1.14 1.21 1.86 1.43 1.08 1.84 0.9 1.12 1.36 1.64 2.27
0.62 0.42 0.72 0.76 0.46 0.37 0.73 0.37 0.24 0.48 0.81 1.32
0.09 0.02 0.02 0.05 0.13 0.05 0.04 0.03 0.06 0.05 0.08 0.08
0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.07 0.08
0.06 0.05 0.1 0.1 0.07 0.0 0.09 0.08 0.03 0.04 0.08 0.1
2.55 2.04 1.84 2.25 2.04 2.48 1.91 2.01 2.23 2.05 2.32 2.74
8.36 8.95 8.8 9.38 7.78 7.82 7.15 7.4 8.38 7.43 7.94 9.91
12.69 11.85 11.82 11.99 13.13 13.57 13.44 10.9 11.21 11.72 13.6 14.73
0.49 0.16 0.31 0.44 0.42 0.0 0.09 0.32 0.29 0.21 0.54 1.09
0.94 1.31 1.07 0.91 0.34 0.39 0.69 0.95 0.31 0.91 0.67 1.26
0.51 0.49 0.43 0.59 0.54 0.19 0.41 0.07 0.22 0.46 0.47 0.59
0.03 0.0 0.0 0.04 0.05 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.08
0.77 0.3 0.17 1.34 0.39 0.02 0.11 0.03 0.44 0.15 1.03 0.83
0.53 0.32 0.19 0.35 0.48 0.34 0.36 0.3 0.33 0.35 0.42 0.49
0.27 0.09 0.09 0.3 0.12 0.19 0.11 0.48 0.32 0.11 0.19 0.24
0.39 0.14 0.48 0.36 0.33 0.32 0.08 0.06 0.25 0.19 0.23 0.55
2.24 3.13 2.38 1.78 1.28 1.69 1.62 1.86 0.69 1.98 2.64 2.56
5.55 4.89 5.57 5.5 6.61 5.54 6.27 5.39 5.09 5.27 6.76 6.71
2.64 3.84 3.08 2.95 2.11 3.05 2.27 2.44 2.24 2.61 3.29 3.29
0.88 0.62 0.51 1.0 0.49 0.95 0.59 0.54 0.94 0.57 0.84 1.53
0.34 0.34 0.31 0.49 0.04 0.39 0.31 0.07 0.09 0.11 0.28 0.74
0.32 0.25 0.07 0.31 0.0 0.15 0.0 0.0 0.06 0.12 0.06 0.43
16.47 18.71 18.16 17.24 12.69 15.55 15.14 15.66 15.87 18.24 18.36 19.68
0.06 0.08 0.1 0.17 0.12 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.08 0.04
0.1 0.06 0.16 0.08 0.08 0.02 0.0 0.03 0.06 0.11 0.06 0.09
5.55 4.52 5.79 5.61 4.04 5.25 3.82 3.93 5.18 4.52 6.33 4.8
1.46 1.35 1.95 1.53 1.16 1.31 1.39 1.47 1.7 1.28 1.73 2.14
3.18 2.87 3.9 3.64 3.24 3.96 2.48 2.43 3.61 3.22 3.56 3.12
3.14 2.09 2.94 4.02 3.36 2.13 2.7 2.05 2.75 2.64 3.15 3.82
1.61 1.11 1.03 2.57 2.2 1.32 0.81 0.61 1.04 0.79 1.34 1.23
0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
3.75 3.76 3.67 4.64 4.28 3.68 2.89 2.39 3.46 2.91 3.09 4.04
1.37 1.25 0.91 1.16 1.17 0.78 0.98 0.8 0.61 0.8 0.88 1.29
0.21 0.17 0.02 0.16 0.1 0.02 0.12 0.1 0.13 0.17 0.16 0.09
6.84 8.0 7.3 9.8 8.54 9.73 8.32 7.87 8.84 7.99 8.37 9.21
0.26 0.35 0.3 0.38 0.47 0.12 0.07 0.0 0.24 0.18 0.41 0.3
0.35 0.03 0.1 0.51 0.26 0.11 0.82 0.13 0.32 0.14 0.11 0.58
0.04 0.06 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.04 0.12 0.0 0.08 0.0
0.8 0.68 0.78 1.21 0.12 0.91 0.26 0.98 1.02 0.77 1.43 0.61
0.0 0.06 0.07 0.24 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21
0.18 0.03 0.03 0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.0 0.07 0.04 0.18
0.34 0.27 0.17 0.48 0.0 0.28 0.0 0.32 0.23 0.29 0.42 0.08
0.04 0.03 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.04
0.75 1.29 1.16 0.76 0.71 0.44 0.23 0.45 0.4 0.67 0.74 1.56
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.09 0.07 0.09 0.15 0.05 0.06 0.06 0.01 0.03 0.09 0.09
0.92 0.81 0.77 0.82 1.41 0.69 0.45 0.52 0.92 0.92 0.59 1.08
1.85 0.88 0.78 1.36 1.7 1.14 1.47 0.92 0.85 1.15 1.39 2.09
4.82 6.15 6.23 4.23 3.32 3.97 3.81 5.72 4.16 4.69 5.09 6.44
0.97 1.2 1.37 1.69 1.04 1.12 1.23 1.37 1.37 1.14 1.46 1.7
0.41 0.27 0.46 0.48 0.46 0.15 0.15 0.34 0.69 0.22 0.59 0.51
0.85 0.5 0.84 0.51 0.85 0.46 0.61 0.98 0.42 0.9 0.74 1.4
0.6 0.61 0.72 1.0 0.77 0.24 0.5 0.53 0.86 0.65 0.86 1.55
3.92 3.22 3.61 3.32 3.07 2.75 2.18 2.6 2.82 3.23 3.87 4.76
0.25 0.46 0.24 0.92 0.53 0.18 0.33 0.76 0.54 0.4 0.13 1.07
0.0 0.0 0.02 0.08 0.02 0.0 0.04 0.0 0.06 0.03 0.0 0.08
0.85 1.89 2.29 1.49 1.88 1.24 0.58 2.18 0.82 2.22 1.7 2.48

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)