Heatmap: Cluster_129 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.12 -1.03 -0.47 -0.63 -0.25 0.11 -0.73 0.12 0.21 0.43 0.44 0.65
0.21 -0.93 -0.39 -0.3 -1.0 0.06 -0.05 0.37 0.25 -0.09 0.36 0.61
-0.72 0.1 0.69 -0.94 -0.28 1.5 -3.27 0.47 -0.42 -3.3 0.94 -1.94
0.38 -0.62 -0.23 -0.2 -0.27 0.82 -0.14 0.3 -0.17 -0.73 0.15 -0.0
-0.18 -0.71 -0.14 -0.25 -0.22 -0.3 -1.04 -0.21 0.22 0.33 1.0 0.4
0.07 -0.7 -0.1 0.43 -0.51 0.17 -0.98 -1.97 -0.43 -0.46 1.19 0.77
0.07 - -1.17 -0.67 -1.01 -2.07 -0.72 0.16 0.96 0.81 0.89 0.9
0.82 0.23 -0.45 -0.43 -0.76 0.57 -0.53 -0.7 -0.08 -0.51 0.49 0.21
-0.3 -2.14 0.63 -0.9 -0.91 0.16 -0.26 -0.37 -0.36 0.43 1.31 0.02
0.01 -0.44 0.02 -0.02 -0.16 0.03 -0.01 -0.18 0.18 -0.09 0.24 0.25
- - 0.86 0.21 - 2.39 -0.3 - -0.39 0.07 - 0.21
-1.03 0.11 -1.43 -0.65 - 1.16 -0.51 -1.03 1.43 - 1.02 0.36
0.25 -1.21 -2.16 -2.02 -0.59 0.85 -0.83 -1.23 0.45 0.37 0.59 1.2
-1.37 -0.49 -1.15 -0.35 0.24 0.66 -0.38 -1.2 0.52 -0.35 0.99 0.58
-1.77 -2.44 -1.56 - -0.44 0.8 -0.74 -1.13 0.53 -0.38 1.36 1.53
0.24 -0.22 0.3 0.04 -0.16 -0.08 -0.18 -0.36 0.19 -0.25 0.2 0.1
-0.53 -0.88 -1.1 0.29 -0.81 -0.76 -1.5 -0.52 -0.18 1.58 0.77 0.35
-1.41 -1.62 -0.65 -0.53 -0.27 -0.8 -2.21 0.56 0.13 1.0 1.24 0.5
0.19 -3.1 -0.49 0.22 -0.4 -0.21 -1.32 -1.13 0.07 0.77 0.6 1.08
0.63 -0.24 -0.24 -0.08 -0.39 0.58 -0.36 -0.31 -0.7 -0.02 0.27 0.22
-1.08 -0.89 -0.86 -0.53 -1.08 0.79 1.08 1.08 0.54 - 0.42 -0.95
-0.21 -0.06 0.21 -0.25 -0.4 0.27 0.14 0.14 0.17 -0.04 -0.33 0.15
0.02 -0.55 -0.06 0.21 -0.46 0.18 -0.06 -0.23 -0.04 -0.41 0.31 0.63
-2.35 -1.39 -0.43 -0.1 0.08 -0.16 -1.41 0.88 -0.47 0.42 0.86 0.77
0.13 -0.14 0.28 0.17 -0.37 0.01 -0.15 -0.28 0.41 -0.28 -0.06 0.06
0.08 -0.18 0.17 -0.06 -0.13 -0.19 -0.16 -0.11 -0.22 -0.08 0.43 0.28
0.15 0.31 0.3 0.59 -0.56 1.22 -2.02 -1.59 -0.23 -0.47 0.25 -0.82
-0.37 -0.7 0.37 0.63 -1.98 - -0.14 -1.22 0.21 0.32 0.94 0.89
0.16 -0.89 0.11 0.03 0.16 -0.55 -0.77 0.17 -0.13 0.15 0.72 0.08
-0.04 -0.12 -0.33 -0.33 0.1 0.22 -0.4 -0.26 -0.5 0.24 1.1 -0.61
-0.53 -0.08 -0.13 -0.41 -0.28 -0.69 -1.41 -0.06 -0.13 0.0 1.2 0.76
-0.51 -0.37 0.0 -0.22 -0.22 0.59 0.2 0.13 -0.02 0.37 -0.38 -0.01
-0.36 -1.85 -0.17 -0.5 -0.25 0.11 -0.78 -0.17 -0.07 0.83 0.74 0.64
-0.14 -0.52 -0.14 -0.26 -0.37 0.39 -0.03 -0.66 0.32 -0.38 0.46 0.64
-0.36 -0.7 0.08 -0.22 -0.69 0.03 -0.56 -0.23 0.14 -0.02 1.32 -0.1
-0.82 - -0.65 - - 1.59 0.49 -0.84 - -0.42 1.09 1.56
-0.29 -0.81 -0.26 0.65 -0.06 0.32 -1.26 -1.46 -0.57 -0.31 0.77 1.02
-0.63 -0.42 -0.48 0.13 -0.68 -0.09 -0.08 -0.26 -0.21 -0.56 1.04 0.89
0.22 -0.24 0.44 -0.13 0.17 -1.79 -1.97 -0.51 -0.43 0.53 0.66 0.66
-0.01 -0.57 0.07 0.55 -0.44 0.79 -0.56 -0.26 -0.09 -0.6 0.06 0.26
-0.15 -0.42 -0.06 0.45 -0.38 -0.76 -0.72 -0.21 -0.04 -0.4 0.64 0.94
0.08 -0.2 -0.54 -0.32 -0.27 -0.49 -0.31 0.07 0.16 0.26 0.53 0.51
0.06 -1.11 0.03 0.29 -0.64 1.49 -1.21 0.05 0.47 -1.8 -0.33 -0.22
1.07 0.16 -1.17 -0.93 -2.36 -1.04 0.14 -2.15 -1.23 0.34 1.55 0.23
-0.29 -0.46 -0.55 -0.69 0.32 -1.78 -0.67 -0.24 -0.11 0.67 0.56 1.1
0.11 -0.11 0.07 -0.13 -0.41 -0.03 -0.17 -0.04 -0.01 0.1 0.2 0.29
-0.78 -0.1 0.0 -0.49 -0.76 1.44 0.66 - -2.37 0.21 0.47 0.19
-0.61 -0.29 -0.7 -0.41 -0.7 -1.16 -0.27 0.82 0.34 0.02 -0.37 1.29
0.11 -0.68 -0.73 -0.1 -0.3 1.25 -0.32 -0.3 -0.03 0.17 -0.45 0.17
0.12 -0.85 0.13 -0.09 -0.56 0.12 -0.35 -0.42 0.4 -0.48 0.58 0.58
-0.46 -0.06 -0.19 0.04 -0.73 -0.13 -0.74 -0.16 0.28 0.17 0.38 0.82
-1.04 0.33 -0.88 -0.74 - - -1.02 - - 0.32 1.87 1.9
0.02 -0.4 -0.34 0.75 0.12 -1.32 -0.92 0.33 -0.53 -0.32 0.5 0.65
-0.45 -0.68 -0.77 0.04 -0.31 0.2 -0.84 0.21 -0.24 0.22 0.46 0.98
-1.64 -0.81 -2.42 -0.27 -0.63 0.02 -2.53 0.93 0.17 0.75 1.41 -0.19
-0.1 -0.6 0.31 0.19 -0.99 1.33 -0.66 0.33 -0.68 -0.0 -0.16 -0.76
- - - - -0.4 1.6 - - 0.78 - 2.11 1.13
-0.14 -0.41 -0.33 -0.76 -0.0 0.33 -1.01 -1.14 -0.25 0.37 1.1 0.56
-0.03 -0.29 0.18 -0.25 -0.12 -1.19 -1.12 -0.1 -0.5 0.99 0.86 -0.04
-0.08 -0.26 0.18 -0.18 -0.34 -0.1 -0.07 -0.04 0.05 0.06 0.34 0.28
-0.21 -0.7 -0.17 0.14 -1.08 -0.52 -0.36 0.12 -0.03 -0.21 0.92 0.81
-0.69 - - 0.36 - -0.25 -1.63 0.94 -0.72 - 1.65 1.7
0.34 -0.05 -0.28 -0.72 -0.48 -0.76 -1.16 -0.33 0.37 0.55 1.02 -0.01
0.44 0.18 -0.09 -0.19 -0.22 0.49 -0.4 -0.56 -0.26 0.13 -0.0 0.1
-0.46 -4.28 -0.44 -1.97 0.6 -0.25 -0.89 0.75 0.31 -0.96 1.27 0.57
-0.68 -1.03 -0.46 -1.27 0.36 0.2 -0.52 0.54 0.33 -0.73 1.09 0.22
-0.3 -1.4 0.35 -2.07 -0.87 0.15 -0.34 0.27 0.16 0.4 0.68 0.68
0.22 -0.15 -0.45 -0.14 -0.04 0.08 -0.64 -0.2 -0.11 -0.11 0.95 -0.06
0.28 -1.75 -0.61 -0.48 -0.38 0.14 0.23 -0.5 0.18 0.16 0.69 0.58
0.14 -1.19 0.02 -0.06 -0.75 0.57 0.29 0.45 0.4 -1.34 -0.11 0.23
0.03 -0.44 -0.03 -0.11 -0.16 0.14 -0.0 -0.15 0.27 -0.25 0.32 0.17
0.11 0.28 -1.4 -1.13 -1.32 -0.12 -0.66 -0.17 0.2 0.62 1.21 0.02
0.35 -0.37 -0.54 0.29 -0.5 -0.61 -0.54 0.32 -0.63 0.11 0.43 0.73
0.07 -0.3 0.29 -0.34 -0.22 -0.53 -0.33 -0.09 -0.34 0.13 0.45 0.66
0.16 -0.98 -0.53 0.03 -1.03 -0.24 -0.34 -0.17 0.41 0.26 0.44 0.82
-0.99 0.82 - -1.42 1.34 - 0.44 -1.75 -1.93 - 0.76 1.68
0.1 -1.05 -0.05 0.21 -1.24 -0.78 -0.33 -0.23 -0.59 0.56 0.83 0.8
-0.03 -0.45 -0.17 -0.8 -0.45 0.24 0.11 -0.19 0.01 0.18 0.45 0.54
0.34 -0.36 -0.07 -0.12 -0.08 -0.47 0.12 -0.17 0.1 -0.17 0.26 0.36
0.07 -0.69 -0.04 0.04 -0.0 0.05 -0.59 -0.47 -0.38 -0.05 1.07 0.1
0.5 -1.45 -0.09 -0.21 -0.48 -0.92 -0.48 -0.28 0.46 0.39 0.98 -0.05
-0.01 -1.9 -0.21 - -1.5 2.0 - - 0.42 -0.03 0.77 0.59
-1.0 -2.93 0.66 -1.68 -0.97 -0.35 0.6 -0.64 0.01 -0.38 1.4 0.68
-2.63 -0.86 0.37 -0.02 -0.27 0.37 - -2.65 -1.64 0.92 1.33 0.99
0.47 -0.86 0.02 0.38 -0.72 1.29 -1.39 -0.27 -2.26 -1.01 0.08 0.79
-1.59 0.17 -0.02 0.43 -0.15 - -0.26 -0.04 -0.55 0.68 0.91 0.42
-0.11 -0.29 -0.31 -0.07 -0.21 0.26 0.04 -0.09 0.04 0.11 0.26 0.21
0.63 0.22 -0.53 -0.69 -0.58 0.48 -0.2 -0.97 0.05 -0.26 0.27 0.54
0.49 -0.54 -0.4 -0.03 -0.72 -0.34 0.24 0.07 -0.11 -0.23 0.6 0.3
0.56 -1.1 -0.78 0.11 0.11 -0.61 -0.09 -1.63 0.57 0.15 1.05 -0.44
-0.08 -0.82 -0.01 -0.11 -0.04 -0.31 -0.64 -0.8 -0.03 0.7 1.03 -0.13
0.0 -0.07 0.05 -0.08 -0.25 0.3 -0.01 -0.13 0.06 -0.05 0.15 -0.03
0.1 -0.34 0.26 -0.85 -0.62 1.5 0.37 -0.56 -0.08 -2.87 0.68 -2.02
0.03 -0.51 -1.17 -0.49 0.6 -0.75 -0.02 -2.72 -0.13 -0.58 1.74 -0.07
-0.46 -0.12 0.3 0.14 0.1 -1.79 0.26 -0.35 -0.02 -1.65 0.63 0.87
-1.88 -0.09 1.03 -0.49 0.29 1.12 -0.09 -1.4 -0.72 1.0 -1.35 -1.75
-0.12 -0.03 -0.09 -0.12 -0.18 -0.01 -0.07 0.15 0.1 -0.23 0.35 0.14
-1.17 -0.1 0.81 0.05 0.34 0.71 -0.0 -0.15 -0.77 -0.27 -0.17 -0.45
-0.46 -1.44 0.07 -0.42 -0.66 -0.14 -0.17 -0.26 0.34 0.28 1.08 0.31
0.0 -0.21 -0.37 0.06 -0.09 0.7 -0.28 0.19 0.23 -0.45 0.0 -0.19
-0.12 -0.14 -0.04 -0.3 -0.49 0.32 -0.38 -0.15 -0.03 0.41 0.18 0.39
-0.32 -0.47 0.53 0.37 -0.23 0.94 -0.8 0.02 0.37 -1.5 0.34 -1.07
0.21 -0.47 -0.01 -0.56 -1.59 -0.33 -0.86 -0.05 0.29 0.34 1.03 0.35
-0.51 -0.29 -0.5 -0.34 -0.32 0.16 -0.33 0.17 0.02 0.13 0.71 0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.