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Heatmap: Cluster_185 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.37 0.37 0.26 -0.05 -0.13 -0.17 -0.3 -0.22 0.03 0.0 -0.16 -0.22
-1.94 1.22 0.09 0.09 -0.76 -1.05 -0.2 -0.13 0.82 -0.81 -0.62 0.54
-0.24 0.39 0.11 -0.13 -0.01 0.01 0.37 -0.18 -0.3 -0.14 -0.16 0.1
0.96 - 0.67 -0.05 - -0.43 -1.02 0.25 0.35 -0.72 -1.05 1.44
-0.04 -0.02 -0.47 0.21 -0.4 0.64 0.22 -0.41 0.39 -0.16 -0.38 -0.05
0.12 0.01 -0.06 0.23 0.02 0.01 0.02 -0.01 -0.1 -0.02 -0.13 -0.14
0.24 0.35 -0.02 0.31 0.06 -0.12 -0.37 0.64 0.03 -0.29 -0.88 -0.64
-1.63 0.43 0.37 1.15 -0.36 -0.24 -0.1 -0.35 0.62 -2.6 -0.51 0.1
-0.19 0.07 0.45 0.03 -0.17 -0.3 0.06 0.01 0.41 -0.47 -0.07 -0.1
-2.29 0.74 1.05 0.7 -2.87 - 0.37 0.34 0.02 0.14 -0.04 -0.65
-0.19 -0.33 0.13 0.1 -0.16 0.1 0.26 0.1 -0.02 0.06 -0.37 0.16
-0.17 -0.1 0.05 0.07 -0.24 0.1 0.08 0.04 0.21 0.03 -0.16 0.03
-0.13 -0.17 0.05 0.13 -0.12 0.11 0.13 0.02 0.19 -0.09 -0.27 0.08
0.31 -0.11 0.82 0.48 0.36 -0.15 0.44 0.29 -1.88 - 0.36 -1.47
0.03 0.17 0.05 0.05 0.01 0.16 -0.07 0.25 -0.05 -0.13 -0.19 -0.4
-0.02 -0.09 0.18 -0.6 -0.3 0.13 -0.14 0.14 0.14 0.05 -0.13 0.39
-0.39 0.54 0.31 0.65 -0.45 -0.55 0.38 -0.92 -0.32 -0.24 0.08 0.04
0.0 0.16 0.47 -0.09 -0.35 -0.15 -0.16 -0.1 -0.17 -0.25 0.05 0.35
-0.11 0.93 0.09 0.46 -0.05 -1.01 -0.01 -0.47 -0.42 0.05 0.18 -0.67
- 2.09 - 1.57 - 1.26 - - - - 1.25 -
0.01 0.03 0.26 0.09 -0.14 -0.08 -0.0 -0.09 0.11 -0.27 0.12 -0.12
-0.29 0.69 0.55 -0.07 -0.4 -0.11 0.4 0.4 0.1 -1.42 -0.94 -0.22
-0.01 0.09 -0.08 0.24 0.01 0.0 -0.12 -0.01 0.02 -0.11 0.04 -0.11
0.1 0.21 0.44 0.14 -0.02 -0.03 -0.12 -0.2 -0.02 -0.26 -0.13 -0.28
-0.33 0.82 0.81 0.89 0.7 -0.29 -1.29 -0.37 -1.14 -0.45 -0.71 -1.31
-0.28 0.88 0.26 -0.12 -0.01 0.52 -0.11 -0.09 -0.36 -0.1 -0.22 -1.47
-0.38 -0.24 -0.01 0.37 -1.39 0.61 -0.12 0.45 0.35 0.35 -0.53 -0.59
0.2 -0.06 0.38 -0.14 -0.66 -0.15 -0.04 -1.29 0.18 -1.07 0.96 0.27
0.3 0.17 0.37 0.54 -0.72 -1.86 -0.31 0.04 0.29 -1.05 0.6 -0.06
-0.48 1.55 -1.25 1.57 - 0.0 - 0.69 0.89 -1.0 - -
0.23 0.27 0.44 0.19 -0.02 0.06 -0.03 -0.05 -0.12 -0.53 -0.26 -0.51
-0.01 0.77 0.99 0.64 -0.26 0.93 -0.68 -0.52 -1.96 -0.82 -0.75 -1.87
- -0.64 -0.31 0.9 -0.22 -0.53 0.94 0.57 0.17 -1.1 -0.22 0.34
0.49 1.79 1.77 1.04 - - - - - - - 0.74
0.17 -0.0 0.07 -0.07 -0.25 -0.34 -0.04 -0.11 -0.0 -0.1 0.25 0.3
0.15 0.34 0.27 -0.07 -0.27 -0.13 -0.13 -0.22 0.03 -0.12 -0.02 0.05
0.17 0.05 0.19 0.22 -0.18 -0.01 -0.19 -0.17 -0.17 -0.05 0.07 -0.01
-0.2 -0.14 0.08 -0.55 -0.47 -0.23 -0.07 0.13 0.21 0.07 0.13 0.64
-2.11 1.28 0.46 1.46 0.07 -0.69 -0.73 -1.83 0.26 -0.18 - -0.8
- 2.59 2.58 - - - - - - - - -
0.03 0.23 -0.01 0.76 -0.33 0.09 -0.15 0.98 -1.02 -0.42 -1.95 -0.17
0.18 0.34 0.34 0.15 -0.03 -0.11 0.12 0.21 -0.26 -0.97 -0.4 -0.05
- 1.99 0.98 - - - - - 1.94 1.15 - -
-0.11 -0.08 0.02 -0.08 -0.5 -0.45 -0.04 0.07 0.58 -0.46 0.24 0.38
0.01 0.2 0.02 -0.14 0.01 -0.04 0.07 0.17 -0.18 -0.01 -0.12 -0.03
0.88 0.91 0.74 0.75 -0.34 -1.14 -0.2 -3.03 -0.13 -0.82 -0.29 -1.3
0.12 0.09 0.21 0.2 -0.29 -0.4 -0.09 -0.13 -0.03 -0.06 -0.09 0.31
-1.96 -1.12 0.1 1.13 0.57 0.46 0.44 0.54 -0.28 - 0.29 -1.76
-0.18 -0.2 0.08 -0.07 -0.36 -0.04 0.1 0.02 0.07 0.06 -0.04 0.41
0.04 0.62 0.18 0.81 -0.86 -0.55 0.18 -0.11 -0.26 -0.67 0.22 -0.68
0.11 0.16 0.04 0.35 -0.12 0.06 -0.12 -0.04 0.13 -0.05 -0.36 -0.31
-0.16 0.46 -0.42 0.53 -0.07 0.31 -0.07 -0.01 0.08 -0.52 -0.07 -0.55
- 1.99 - 1.11 - 1.16 - 0.78 0.94 - - -
- 1.33 - 1.46 - - - 1.13 1.09 - - 1.28
0.58 0.27 -0.06 -0.11 0.12 -0.53 -0.06 -0.65 0.54 -0.57 -0.1 -0.03
-0.27 -0.28 0.06 -0.04 -0.38 0.15 0.09 0.2 0.05 0.02 0.04 0.22
- 2.52 - 2.64 - - - - - - - -
0.07 0.03 0.06 -0.01 -0.13 0.01 -0.17 -0.14 0.32 -0.06 -0.01 -0.03
-0.47 -1.38 -0.26 -1.23 0.01 0.46 -0.15 -0.08 0.65 -0.06 -0.9 1.22
-0.34 -0.21 0.07 0.17 0.37 0.15 -0.27 0.21 0.38 -1.13 0.32 -0.38
- -0.23 2.69 - 0.18 - - - 1.83 - - -
-0.17 0.32 -0.16 0.15 -0.11 -0.12 0.16 0.24 0.31 -0.24 -0.23 -0.36
-0.96 0.78 -1.38 0.96 -1.55 -0.61 0.11 -0.2 -1.03 -0.17 0.56 0.72
-0.2 0.71 1.02 0.01 0.21 0.38 -1.49 -3.77 -2.14 -1.23 -0.37 1.11
0.08 0.03 0.06 -0.08 0.04 0.0 0.04 0.05 -0.03 -0.13 -0.08 -0.0
0.14 0.23 0.48 0.31 -0.57 -0.4 -0.49 0.0 -0.05 -0.02 -0.07 0.07
0.35 0.15 0.14 0.3 -0.16 0.02 -0.5 -0.18 -0.14 -0.35 0.01 0.11
0.51 0.42 0.08 -0.27 -0.29 -0.13 -0.32 -0.3 0.22 -0.26 -0.02 0.03
0.2 -0.16 0.16 -1.32 -0.74 -1.53 0.49 -0.13 -0.18 -0.05 0.52 0.92
-0.21 0.31 0.28 0.64 0.02 0.04 -0.28 0.06 0.23 -0.48 -0.22 -1.12
-0.22 -0.17 -0.24 0.7 0.35 0.21 0.13 0.77 -0.15 -0.96 -0.92 -0.73
-0.61 0.39 -0.24 0.44 0.09 0.3 -0.22 0.67 0.11 -0.93 -0.53 -0.36
0.09 0.14 -0.08 -0.05 -0.03 -0.09 0.28 0.14 0.03 -0.05 -0.29 -0.18
0.59 0.41 0.35 0.72 -0.4 -0.38 -0.45 -0.08 -0.1 -0.27 -0.66 -0.62
-0.12 -0.28 -0.16 0.75 0.18 0.23 0.21 0.14 0.07 -0.36 -0.5 -0.79
0.91 -0.57 -0.58 -0.12 -1.89 -0.24 -0.06 -0.39 0.1 0.12 -0.46 1.09
0.05 0.39 -0.19 0.27 -0.02 -0.44 -0.07 0.63 -0.47 0.16 -0.76 -0.11
-0.05 0.13 -0.11 0.41 -0.01 0.02 0.01 0.33 0.18 -0.19 -0.7 -0.34
0.35 0.54 0.38 0.65 0.08 -0.49 -0.49 -0.52 -0.76 -0.49 -0.14 0.02
-0.15 -0.31 -0.13 0.01 -0.15 0.33 -0.11 0.24 -0.06 0.09 -0.15 0.23
-0.98 1.56 1.25 -0.72 - -0.63 - - -0.98 0.42 -1.01 1.36
0.28 0.85 -0.11 1.31 -0.84 0.02 0.01 -0.05 -0.27 0.28 - -
0.09 0.37 -0.05 0.41 0.49 0.09 -0.16 0.01 -0.42 -1.19 0.13 -0.52

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.