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Heatmap: Cluster_259 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.4 0.08 -0.0 -0.14 -0.17 -0.44 -0.17 -0.22 0.37 -0.12 0.2 -0.05
-1.74 1.3 1.46 - 1.34 -0.45 - - -0.21 -0.74 0.5 -1.49
1.11 0.71 -0.66 1.49 - -0.34 0.26 -0.06 -0.81 -1.85 -1.94 -0.5
1.3 0.07 1.49 0.04 - - -0.24 - 0.77 1.07 - -
0.76 1.17 -0.68 0.34 -1.18 0.04 -0.18 -0.23 -0.23 -1.85 -3.27 0.79
0.93 1.01 0.42 -0.22 -2.14 -0.69 -0.47 0.12 -0.33 -1.46 -0.94 0.63
-0.0 -0.29 -0.52 0.47 -0.01 -0.18 0.55 0.16 -0.59 -0.46 -0.83 0.76
-0.08 -0.05 0.36 -0.22 -0.09 -0.31 -0.09 0.12 -0.2 0.11 0.27 0.03
0.23 1.03 0.03 0.61 0.22 0.53 -1.67 -0.52 -0.64 -0.56 -0.04 -1.53
-0.46 0.2 0.78 -0.15 0.65 -0.58 -1.73 -2.68 -0.72 0.79 0.7 -0.23
0.09 -0.01 0.36 -0.42 -0.11 0.42 -0.28 0.13 -0.38 -0.29 0.36 -0.21
0.09 -0.08 0.23 0.02 -0.03 -0.57 -0.11 0.04 0.12 0.03 0.24 -0.13
-0.04 0.13 0.05 0.09 0.05 -0.1 -0.0 -0.11 0.15 -0.17 -0.01 -0.07
1.19 0.79 -1.04 0.11 1.21 -0.19 0.22 -1.88 -1.68 -0.55 -0.51 -3.1
-0.2 0.16 0.16 0.04 -0.14 -0.19 -0.26 -0.09 0.14 0.19 0.07 0.04
-0.47 1.4 -0.11 0.71 -0.66 0.34 -0.1 -0.8 -0.71 -0.48 -0.41 -0.75
0.01 0.06 1.17 1.29 -0.85 - -1.29 -0.01 0.04 - 1.18 -
0.22 -0.15 -0.09 -0.1 -0.05 0.18 -0.19 -0.06 -0.27 -0.01 0.25 0.18
-0.21 0.14 0.2 0.35 0.42 -0.15 -0.02 -0.35 -0.13 0.13 -0.14 -0.53
-0.16 0.24 0.14 -0.1 0.07 -0.12 -0.19 -0.22 0.01 0.1 0.17 -0.04
0.16 0.1 -0.06 0.07 -0.05 0.03 0.01 0.08 -0.14 -0.09 0.01 -0.17
0.12 0.36 0.75 -0.28 -0.28 0.53 -0.15 -1.01 0.66 -0.03 -1.63 -0.78
0.78 0.44 0.98 -0.26 -0.77 -0.1 -1.88 0.58 -1.7 0.36 -0.29 -1.19
0.08 0.82 0.05 0.84 0.17 -0.07 0.24 -0.57 -0.28 -0.99 -0.88 -0.86
-0.3 -0.03 -0.43 0.51 0.43 -0.11 0.28 -0.18 -0.35 -0.09 0.07 -0.17
1.5 -0.67 0.26 -1.95 0.45 -0.6 -0.47 -1.28 -0.36 -1.13 1.12 -0.95
0.52 0.01 0.25 -0.38 0.05 -0.47 -0.35 -0.89 -0.43 0.18 0.58 0.2
0.57 -0.62 0.68 -0.69 0.46 -0.81 0.21 -0.31 -0.49 -0.56 0.66 -0.39
-0.59 1.02 0.47 -0.12 -0.15 0.21 -1.07 0.06 -0.14 -0.26 -1.12 0.29
-1.76 1.06 -1.6 0.81 -0.35 0.16 -0.15 - 0.27 -0.18 1.15 -1.22
-0.05 0.08 -0.12 -0.03 -0.06 -0.09 -0.02 0.1 0.04 0.14 0.01 -0.02
-0.03 0.28 -0.25 0.04 -0.11 -0.43 0.07 0.05 0.21 0.17 -0.07 -0.07
1.51 1.06 0.77 -2.31 -0.81 0.46 -0.77 -0.43 - -0.59 -0.23 -1.45
-1.91 1.05 -1.68 1.75 1.13 -1.49 0.24 -0.05 - -1.44 - -0.13
1.13 -0.37 0.9 -0.19 -0.32 -0.31 0.4 -0.09 -0.91 -1.15 0.2 -1.82
0.11 0.71 0.8 -0.8 0.15 -0.77 -2.07 -0.2 -1.05 0.36 0.65 -0.28
-0.36 0.32 0.07 0.6 0.62 0.04 -0.16 0.2 -0.61 -2.58 -0.3 0.23
0.02 0.1 0.28 0.38 0.04 0.09 0.04 0.26 -0.25 -0.79 -0.3 -0.24
0.34 -0.06 -0.04 0.22 0.15 -0.33 0.02 0.02 0.01 0.16 -0.12 -0.62
-0.86 -0.28 -0.39 0.47 0.67 -0.12 0.13 -0.25 0.0 -1.08 0.13 0.54
0.0 0.39 0.5 0.23 -0.7 -0.66 -0.29 0.85 0.09 -0.36 -0.57 -0.5
0.12 0.32 -0.27 0.29 -0.24 -0.04 -0.34 0.32 0.07 -0.12 -0.16 -0.17
0.61 0.8 -0.01 0.41 -0.58 -0.16 0.35 -0.67 -0.07 -0.07 -0.8 -1.14
-0.3 0.21 0.24 -0.12 -0.21 -0.07 -0.45 0.07 -0.02 -0.1 0.55 -0.09
0.08 0.27 0.13 -0.06 -0.08 -0.02 -0.21 0.01 -0.2 -0.08 0.06 0.02
0.25 0.11 0.06 -0.09 -0.19 -0.14 -0.77 -0.04 0.11 0.1 0.15 0.2
-0.45 0.97 0.44 -0.27 -1.52 0.59 0.26 -1.98 1.01 -0.38 -0.96 -0.91
2.4 1.77 - 1.74 - - - - - - - -
0.24 1.15 -0.72 0.22 -0.45 - -0.51 0.2 0.58 0.14 -0.08 -0.52
-0.51 0.48 -0.65 -0.15 0.03 0.43 -1.37 0.02 0.18 0.12 0.45 0.02
-1.39 0.71 0.6 0.02 -0.65 0.63 0.08 -2.14 -0.38 -0.48 0.88 -0.6
0.67 1.04 0.94 -0.15 -0.23 -0.45 - -0.26 -1.51 0.73 -0.37 -1.58
-0.05 0.17 0.14 -0.93 -0.39 -0.22 -0.89 0.24 -0.56 0.41 0.57 0.53
0.25 0.27 -0.0 0.12 -0.02 -0.22 -0.14 0.08 -0.39 0.2 -0.11 -0.2
-0.84 0.76 0.35 0.08 0.86 - 0.66 0.23 -0.73 - -1.9 0.98
1.59 0.92 -0.52 0.57 0.04 -1.43 -0.22 - - -1.38 0.66 -0.52
0.09 0.51 -0.33 0.3 -2.1 0.45 -0.33 0.02 -0.09 0.67 -1.65 0.29
0.2 0.36 0.01 -0.34 0.62 0.51 -2.03 -0.28 -1.14 0.35 0.53 -0.81
-0.23 0.27 -0.35 -0.28 0.02 -0.36 -0.1 0.11 0.27 0.19 0.21 0.03
-0.14 -0.52 0.38 -0.05 0.19 -0.5 -0.96 0.9 0.12 -0.04 0.07 -0.33
-0.44 0.04 0.59 0.7 0.33 0.0 -0.51 0.55 -0.53 -1.65 0.05 -0.67
-0.2 0.13 0.3 -0.09 -0.3 -0.23 -0.32 0.12 0.34 0.3 -0.2 -0.08
0.14 0.08 -0.17 0.15 0.17 0.34 -0.71 0.51 0.28 -0.27 -0.49 -0.62
- 1.37 - -1.05 0.18 - 0.38 - - -0.26 1.98 0.78
1.99 1.25 - 1.3 - - - - 0.02 - - 1.12
0.05 -0.5 -0.25 -0.24 0.19 -0.41 -0.78 -0.05 0.09 0.39 0.44 0.49
1.88 -1.52 0.85 -2.44 -0.23 -2.36 0.61 - - 0.35 1.09 -
-0.21 -1.1 -0.2 -0.24 0.44 -0.52 0.25 0.14 0.46 -0.06 -0.35 0.57
-0.16 -0.04 -0.07 -0.19 0.18 0.81 -0.9 -0.85 -1.92 0.42 1.14 -0.97
0.78 2.04 0.94 1.08 - - - - - 1.11 - -
0.29 0.46 0.18 -0.9 0.5 -0.03 -0.21 -0.21 -0.73 0.52 -0.22 -0.51
0.41 2.99 - - - - - - 0.54 - 0.32 -
- 1.78 0.36 -0.61 - - -0.78 - -0.68 -0.4 1.57 0.76
0.03 0.3 -0.1 -0.01 -0.21 -0.06 0.08 0.24 -0.65 0.25 0.18 -0.33
1.69 -0.95 -1.12 0.83 0.97 - -0.21 -0.03 - -0.07 -0.37 -1.04
-0.44 0.26 -0.06 -0.07 -0.24 -0.17 -0.34 0.29 0.31 0.27 -0.01 -0.06
-0.8 -0.17 -0.08 0.32 0.14 -0.65 -0.05 -0.24 0.56 -0.33 0.38 0.28
1.43 -0.17 -1.19 -0.04 0.06 - 0.68 -0.37 0.71 0.47 - -0.81
- 2.35 1.26 - - - - - 2.17 - - -
0.19 0.1 0.28 -0.21 -0.11 -0.16 0.25 0.16 -0.39 0.16 -0.56 0.02
0.69 0.36 0.99 -0.74 0.59 -0.69 0.2 - -1.02 0.51 - 0.42
0.37 -0.09 0.05 0.12 -0.24 0.21 0.1 -0.26 -0.02 -0.78 0.12 0.1
-0.02 0.01 -0.16 -0.25 0.11 0.05 -0.06 -0.0 0.04 0.09 0.08 0.07
0.03 -0.31 -0.71 0.7 0.35 0.04 -0.01 -0.65 -0.12 -0.43 0.04 0.39
0.6 0.16 0.57 -0.29 -1.06 -1.11 -0.31 -0.9 0.26 -0.34 0.68 0.25
1.57 0.73 0.3 0.18 - -0.46 0.52 -0.66 -0.74 -0.66 -1.35 -0.74
- 2.12 - 1.17 - - - - 0.99 - 1.77 -
-0.09 -0.3 -0.92 0.57 -1.08 -3.05 0.94 0.3 0.31 -1.15 -0.57 1.09
-0.15 0.14 0.22 -0.16 0.32 0.11 0.07 -0.13 -0.25 -0.22 -0.29 0.17
0.07 0.13 -0.06 0.08 0.15 0.13 -0.62 -0.0 0.17 -0.1 -0.07 -0.03
0.85 0.52 0.1 0.12 -0.26 0.13 -1.51 -0.53 -0.7 -0.48 0.11 0.29
1.32 0.45 -1.25 -0.27 -0.06 -1.11 1.28 -1.26 -0.53 -0.13 0.02 -
-0.07 0.06 -0.01 -0.08 0.15 0.09 -0.13 -0.14 0.06 0.07 0.04 -0.08
0.22 0.27 0.35 -0.57 0.28 -0.05 -0.44 -0.26 -0.3 0.33 -0.14 -0.06
0.15 0.64 -0.52 0.4 -0.59 0.24 0.52 -0.96 0.02 -0.42 0.3 -0.93
0.12 0.2 0.68 0.82 -0.26 -1.34 -0.63 0.16 -0.07 -0.48 0.8 -
0.08 0.02 -0.11 -0.07 0.02 0.05 0.06 0.04 -0.08 0.06 -0.03 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.