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Heatmap: Cluster_52 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.01 -0.27 -0.01 0.12 -0.52 0.14 0.2 -0.12 -0.2 0.19 -0.04 0.31
-0.09 -0.13 -0.06 0.09 -0.11 -0.31 -0.12 -0.09 0.24 -0.06 0.27 0.26
- - 1.12 1.15 - - - 1.88 - 0.3 1.43 -
-0.03 -0.48 0.15 -0.22 -0.07 -0.36 -0.2 -0.24 0.24 0.12 0.23 0.53
-0.38 -0.48 -0.22 0.36 0.02 -1.17 -0.08 -1.52 0.62 0.16 0.8 0.29
- - 0.09 - - - 0.36 1.62 -0.1 0.21 1.8 -0.0
- -1.33 0.29 0.62 -1.05 - -0.23 1.81 -1.48 0.84 0.88 -
-0.06 -0.3 -0.42 -0.03 -0.02 -0.19 -0.08 -0.26 0.31 0.29 0.38 0.12
-0.61 -0.36 0.19 0.12 -0.2 -1.24 1.15 -1.24 0.17 -0.96 0.52 0.42
-0.68 -0.15 -0.37 0.5 -0.59 -0.59 0.05 0.26 -0.08 -0.53 0.96 0.2
0.1 -0.3 0.23 -0.12 -0.22 -0.02 0.17 -0.14 -0.45 -0.01 0.18 0.37
-0.2 -0.47 -0.56 -0.44 0.5 -0.83 0.51 -1.06 0.89 -0.13 0.76 -0.62
0.03 -0.33 -0.28 0.11 0.16 -0.33 0.13 -0.8 0.67 0.03 0.28 -0.2
-0.27 - -0.06 - 0.94 - 1.68 -0.06 - -0.28 0.25 1.07
0.02 -0.11 0.1 0.12 0.13 -0.12 0.08 0.08 -0.32 0.07 -0.19 0.05
0.03 -0.25 0.02 -0.26 -0.1 -0.35 0.32 -0.14 -0.2 0.01 0.21 0.46
0.31 -0.75 -0.54 -0.21 -0.61 -0.56 -0.29 0.08 -0.16 -0.48 1.2 0.57
-0.28 0.18 -0.38 0.13 -0.51 -1.71 0.29 -0.66 0.64 -0.55 1.15 -0.22
0.04 -0.17 -0.18 -0.17 -0.1 -0.14 0.02 -0.32 0.19 0.22 0.14 0.33
0.4 -1.18 -0.69 -0.52 -0.18 -0.12 0.26 -0.45 0.07 0.26 0.46 0.66
-0.3 -0.25 -0.15 -0.4 -0.7 -0.26 -0.02 0.04 -0.06 0.19 0.54 0.73
0.03 -0.27 -0.25 0.04 0.02 -0.1 0.11 0.18 -0.2 -0.01 0.4 -0.09
0.15 -0.15 -0.23 -0.08 -0.19 0.11 0.1 -0.2 0.02 0.02 -0.0 0.33
-0.09 -0.32 -0.06 0.01 -0.28 -0.21 0.15 0.03 0.08 -0.02 0.3 0.25
-0.04 -0.16 0.12 -0.05 -0.13 -0.06 0.03 0.01 -0.05 -0.05 0.22 0.11
-0.47 -0.65 -0.31 -0.73 0.95 -1.69 0.98 -0.76 -0.35 0.64 0.26 -0.16
-0.08 -0.45 0.06 -0.45 -0.09 -0.48 0.14 -0.1 0.1 0.16 0.46 0.37
-0.03 -0.25 -0.1 -0.24 0.01 -0.52 0.41 -0.01 0.24 0.0 0.01 0.25
-0.07 -0.13 -0.02 -0.13 0.13 -0.25 0.39 0.01 -0.07 -0.09 0.03 0.1
-0.08 -0.1 0.16 -0.2 0.35 -0.23 0.35 -0.0 0.2 -0.37 0.07 -0.38
-1.25 -0.44 -0.09 -0.08 -0.47 -0.63 0.41 0.14 -0.41 -0.22 0.98 0.66
-0.6 -1.14 -0.66 0.1 -0.45 0.13 0.25 0.22 0.21 -0.07 0.95 -0.05
-0.18 - - - - - 0.32 - -0.15 - 2.75 1.17
-0.03 -0.01 0.21 -0.07 -0.02 -0.08 0.04 -0.05 -0.08 -0.11 0.07 0.1
0.58 - - 0.25 0.44 - 1.08 0.21 -1.06 -1.01 1.25 0.4
-0.71 -1.62 -2.83 -1.13 -0.57 -0.71 0.45 0.67 -0.02 -0.89 1.83 0.18
-0.12 - 1.07 - - - 0.37 0.36 -0.19 0.21 2.13 -
0.34 -3.36 -0.56 0.32 -2.29 -1.19 0.24 -0.79 -0.11 -3.55 1.76 0.94
-2.17 -0.57 -0.4 -0.04 -0.35 -0.06 -0.01 0.83 -0.66 -0.23 0.95 0.52
0.93 -1.03 -1.21 -0.82 -0.91 - - - 0.76 - 1.87 1.44
-0.51 0.12 -0.62 -1.55 -0.07 -1.39 0.49 -0.45 0.25 -0.09 1.44 -0.15
-0.22 -0.13 -0.28 -0.04 0.47 -0.21 0.03 -0.47 0.44 -0.15 0.26 -0.02
0.01 -0.91 0.11 0.45 -0.29 0.64 0.31 -1.2 -0.79 -1.84 0.77 0.48
-0.66 -0.98 0.39 0.4 -0.33 0.66 0.52 -0.55 -1.09 -1.91 1.41 -1.49
0.11 -0.08 -0.5 -0.44 -0.42 -0.11 0.1 0.22 -0.04 -0.13 0.5 0.41
-0.17 -0.6 0.12 0.22 -0.68 -0.14 -0.21 0.21 -0.22 -0.18 0.59 0.49
-2.37 -1.25 0.15 0.37 -0.89 -0.21 0.3 0.32 -1.81 0.03 1.42 0.17
-0.83 -0.02 0.16 0.05 -1.49 -0.47 -0.37 -0.42 0.44 0.09 0.54 0.87
0.06 -0.3 -0.11 -0.55 -0.43 -0.11 -1.18 -0.61 0.55 -3.25 0.99 1.15
-0.6 -0.39 0.11 0.18 0.04 -0.34 0.03 0.41 -0.02 -0.12 0.58 -0.33
-0.12 -0.26 0.05 0.05 -0.02 0.17 -0.12 -0.17 -0.41 -0.03 0.57 0.06
0.14 -0.27 -0.03 -0.07 -0.47 -0.13 0.14 -0.03 0.13 -0.06 0.22 0.27
-0.21 -0.12 -0.02 0.42 -0.07 -0.87 -0.26 -0.36 0.19 0.06 0.82 -0.28
-0.52 -0.27 -0.19 0.2 -0.36 -0.49 -0.03 0.19 0.04 0.18 0.75 -0.0
-0.69 -0.02 0.13 -0.22 0.14 -0.08 0.12 -0.03 0.29 0.18 0.26 -0.37
-0.02 -1.98 -0.03 -0.19 -0.36 -0.24 0.65 -0.03 -0.31 -1.01 1.09 0.38
-0.23 -0.18 -0.01 -0.08 -0.05 -0.14 -0.08 -0.08 0.13 -0.04 0.28 0.35
- - - 0.58 - - 1.87 - - - 2.31 0.92
-0.56 -1.34 -0.36 -0.6 0.06 -1.22 1.05 -0.82 0.03 0.43 0.64 0.53
-0.31 -0.93 -0.02 -0.74 -2.28 -0.12 0.73 0.35 -0.06 0.16 0.64 0.47
-0.33 -0.32 0.28 0.05 0.41 -0.38 -0.27 -0.03 -0.15 -0.19 0.51 0.06
-3.22 -0.72 -0.81 0.12 -0.05 0.12 0.68 -0.17 -0.05 0.13 0.67 0.52
-0.35 0.01 0.23 0.39 -0.24 -0.14 0.12 0.07 -0.05 -0.03 0.14 -0.35
-0.39 -0.59 -0.25 -0.46 -0.41 -0.36 0.47 0.12 -0.04 0.35 0.71 0.17
-0.49 -0.95 0.19 0.38 -0.25 -0.98 0.17 0.36 -0.29 0.06 0.74 0.04
-0.08 -0.15 -0.04 0.14 -0.1 -0.1 0.08 0.1 -0.05 0.04 0.07 0.05
-0.35 -0.1 -0.01 0.01 -0.08 -0.06 0.09 0.08 0.15 0.13 -0.04 0.1
-0.74 -0.25 -0.78 -1.1 0.23 0.39 -0.55 1.53 -0.9 0.2 0.83 -
-0.98 -0.71 -0.09 -0.25 -0.16 -0.65 0.5 0.21 0.48 0.05 0.88 -0.45
0.26 -0.11 -0.53 -0.17 -0.27 0.2 0.28 -0.12 -0.29 -0.01 0.13 0.35
-1.18 -0.59 0.16 0.45 -0.45 0.34 0.32 0.03 -0.94 0.24 0.86 -0.67

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.