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Heatmap: Cluster_127 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.05 -0.02 -0.06 -0.11 -0.05 0.1 -0.03 -0.02 -0.02 -0.05 0.11 0.07
-0.25 -1.15 -0.66 -0.28 -0.01 0.21 0.01 -0.55 0.77 -0.02 0.56 0.31
-0.09 -0.09 -0.19 0.4 0.07 -0.02 0.08 -0.17 0.01 -0.09 -0.16 0.14
-0.1 0.55 0.02 -0.04 -2.06 0.02 -2.94 -1.11 0.93 -0.15 0.31 0.79
-0.26 -0.09 -0.09 0.29 -0.1 0.12 -0.1 -0.83 0.38 0.13 0.06 0.14
-1.48 -0.57 0.17 -0.44 -0.94 -1.3 -0.18 0.26 0.58 0.33 0.91 0.55
0.28 -0.21 -0.03 0.15 -0.07 -0.34 0.07 -0.73 -0.23 0.08 0.59 0.03
-0.14 -0.11 -1.07 0.77 -0.47 -0.61 -1.0 0.18 0.29 -0.5 0.91 0.2
-0.44 0.02 -0.14 0.08 -0.07 0.37 -0.08 0.0 0.15 -0.18 0.12 0.02
-1.03 -0.13 0.18 0.23 -2.01 -2.05 0.05 0.64 -0.21 1.03 -0.14 0.48
-0.94 -0.55 0.09 -0.29 -0.64 -1.58 -0.29 0.68 0.42 1.02 -0.02 0.21
-0.18 -1.05 -0.22 -1.1 0.11 -0.8 -0.26 -0.29 0.66 0.83 0.55 0.24
-0.24 -0.18 -0.32 0.07 -0.32 0.18 -0.29 0.2 0.22 0.11 0.23 0.14
-0.09 -0.09 0.03 -0.08 -0.11 -0.05 -0.04 0.13 0.15 0.06 0.02 0.03
-0.18 -0.07 0.01 -0.04 -0.07 0.19 0.06 0.0 0.06 -0.12 0.01 0.12
-0.03 -0.01 -0.25 0.02 -0.07 0.12 -0.04 -0.0 -0.33 0.25 0.17 0.07
-0.35 -0.08 0.27 0.2 0.13 -0.27 -0.33 -0.32 -0.15 -0.06 0.39 0.3
0.21 0.3 0.15 -0.25 -0.08 -0.76 -0.24 0.15 0.24 -0.16 -0.02 0.17
-0.03 0.08 0.06 0.09 -0.07 -0.21 -0.15 -0.11 -0.03 0.02 0.27 0.01
-0.63 -0.05 -0.26 -0.29 0.03 0.27 0.04 0.53 0.01 -0.15 0.06 0.12
-1.17 0.14 -0.37 0.52 -0.52 0.13 -3.53 -0.37 0.49 0.25 0.61 0.56
-1.0 0.61 0.94 0.71 -2.56 -2.28 -2.54 -1.59 0.31 0.64 0.15 0.71
0.04 0.05 -0.02 0.25 -0.16 0.04 -0.15 -0.17 -0.5 0.07 0.28 0.1
0.18 -0.0 0.05 0.12 -0.09 -0.13 -0.08 -0.45 0.03 -0.02 0.23 0.05
-0.06 -0.03 -0.12 0.1 -0.02 0.06 0.05 0.01 -0.08 0.02 0.03 0.01
-0.03 0.08 -0.01 0.15 -0.1 -0.24 -0.34 0.19 0.05 -0.07 0.08 0.16
0.46 -1.79 -0.36 -0.74 0.12 -0.81 -2.02 0.12 0.57 1.01 0.71 -0.3
-0.02 -0.01 -0.07 -0.26 0.12 -0.41 -0.28 0.22 -0.08 0.15 0.32 0.13
-0.17 -0.23 0.05 -0.13 -0.1 0.06 -0.1 -0.12 0.16 0.15 0.12 0.23
-1.72 -0.73 -0.73 0.16 0.27 -1.12 -0.35 0.07 0.83 1.01 -0.42 0.41
-0.01 0.12 0.25 0.27 -0.33 -0.35 -0.28 0.06 0.33 -0.05 -0.23 -0.01
-0.75 0.01 -0.07 -0.36 -0.01 -0.99 -0.03 0.16 0.21 0.04 0.64 0.41
0.76 0.35 0.33 -1.17 -0.47 0.46 -1.02 -1.26 -1.02 -1.02 0.99 0.44
-0.31 -0.2 0.29 -0.08 0.02 -0.33 -0.0 -0.16 -0.18 0.04 0.23 0.45
-0.45 - - - - 1.5 - 0.52 0.67 0.88 1.48 -0.33
0.53 0.82 -0.47 -0.09 -0.84 -0.95 -0.54 0.15 0.7 -0.09 -0.6 0.05
0.16 0.42 -1.19 0.5 0.03 - -0.91 0.24 -0.28 1.38 -0.49 -0.28
-0.21 -0.59 -0.76 -0.47 -0.27 0.42 0.4 0.01 0.41 -0.1 0.13 0.41
-1.23 - 1.27 -0.68 0.79 - 0.47 -1.01 -1.29 0.74 0.69 0.32
0.16 -0.39 -0.15 -0.42 -0.12 -0.07 0.04 0.13 0.24 0.22 0.24 -0.08
0.34 0.01 0.48 0.19 -0.47 -0.29 0.03 -0.38 -0.18 -0.95 -0.05 0.57
-0.35 0.14 -0.3 0.04 0.18 0.03 0.07 0.32 -0.01 0.06 0.03 -0.39
-0.02 0.02 0.05 0.11 -0.07 -0.04 -0.1 -0.06 0.0 -0.01 0.09 0.02
-0.31 0.54 -0.06 0.4 -0.2 -0.62 -0.98 -0.17 0.47 0.12 -0.11 0.2
-0.67 0.21 0.65 0.8 0.23 0.11 0.38 -1.27 -0.54 0.07 -1.5 -0.24
-0.17 -0.44 -0.91 -0.6 -0.21 0.42 -0.31 0.29 0.39 0.26 0.45 0.11
-1.41 -0.19 -0.47 0.54 0.43 -0.93 0.2 -0.06 0.78 -0.28 0.23 -0.18
-0.73 -0.01 -0.88 0.98 -2.16 0.57 -2.56 -0.2 0.68 -0.33 0.32 0.58
-0.12 -0.77 0.12 -0.03 0.14 -0.25 -0.15 0.14 0.28 0.17 -0.19 0.34
-0.57 0.24 0.02 -0.55 -0.52 0.46 0.27 0.3 0.09 0.02 0.33 -0.73
0.06 0.04 0.06 -0.23 -0.45 -0.12 -0.29 -0.04 0.24 -0.0 0.35 0.18
-0.99 -0.02 0.36 -0.46 -0.37 0.36 -0.36 0.07 0.17 0.19 0.45 -0.03
-0.45 -0.23 0.44 0.19 -0.14 -0.13 -0.28 -0.18 -0.07 0.71 -0.58 0.17
-0.07 -0.47 -0.66 0.66 -1.57 -0.08 -0.52 -0.8 0.62 0.33 0.74 0.13
0.25 -0.05 0.1 0.37 -0.2 0.06 -0.45 0.07 -0.13 -0.12 -0.22 0.13
0.12 0.01 0.13 0.42 -0.14 -0.42 -0.41 -0.14 -0.06 -0.04 0.18 0.14
-0.15 -0.45 0.19 -0.12 -0.78 0.12 -0.08 0.01 0.33 0.36 -0.19 0.33
0.48 0.1 0.53 0.44 -0.25 -0.98 -0.68 -2.08 -1.58 -0.21 0.55 0.89
0.03 -0.09 -0.31 0.3 -0.72 0.03 0.15 0.33 0.09 -0.3 0.16 0.03
-0.23 -0.95 0.21 0.31 0.05 -0.31 -0.82 0.33 0.3 0.04 0.13 0.27
-0.03 0.45 -0.75 0.1 -0.24 0.1 -0.09 0.0 -0.12 -0.29 0.43 0.05
-0.34 -0.07 -0.35 -0.29 -0.38 0.38 0.1 0.35 0.39 -0.4 0.06 0.18
-0.07 -0.14 -0.28 0.03 -0.16 0.12 0.21 0.09 0.07 -0.32 0.31 0.0
-0.2 -0.05 -0.02 -0.02 -0.06 -0.0 0.01 0.15 0.03 0.06 0.03 0.03
-0.11 0.03 -0.14 -1.16 -0.15 0.15 0.06 0.51 -0.08 0.29 0.15 -0.08
-0.05 0.08 -0.41 -0.22 0.37 -0.64 -0.08 0.21 -0.4 0.39 0.29 0.04
-0.1 -0.12 0.12 0.33 -0.13 -0.15 -0.29 0.07 0.05 0.12 -0.09 0.09
-0.02 0.32 1.77 1.53 - - 1.26 - 0.11 - - -
0.01 0.07 0.03 0.2 0.09 0.01 -0.27 -0.25 -0.14 -0.04 0.15 0.06
-1.33 -0.44 -0.13 0.31 0.38 -0.05 0.13 -0.15 0.39 -0.94 0.49 0.26
-0.11 -0.03 -0.09 0.14 0.26 -0.38 -0.02 -0.07 0.06 0.26 0.03 -0.19
0.04 -0.97 -1.07 -0.58 -0.36 -0.16 -0.17 -0.77 0.72 1.07 0.51 -0.01
0.05 -0.17 -0.01 0.13 -0.09 -0.05 0.07 -0.06 0.06 0.12 0.04 -0.13
-0.61 -0.17 0.01 -0.29 -0.17 0.43 -0.23 0.38 0.39 -0.27 0.27 -0.17
0.55 -0.27 0.63 0.49 -0.61 0.16 0.45 -0.87 -0.0 -2.06 -0.53 0.19
0.0 -0.0 -0.4 0.2 -0.01 -0.18 -0.58 0.03 0.51 -0.12 0.35 -0.13
-0.16 -0.21 -0.22 -0.46 -0.15 -0.21 -0.7 0.21 0.51 0.25 0.38 0.27
0.37 - 1.04 0.76 -0.21 -0.59 0.33 -0.69 0.16 - -2.04 1.12
-0.12 -1.54 -0.33 0.07 -0.18 -0.67 -0.39 -0.2 0.46 0.12 0.54 0.86

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.