Heatmap: Cluster_199 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.13 0.3 0.01 -0.18 0.11 -0.11 -0.16 0.18 -0.14 0.0 -0.07 -0.17
-0.22 0.79 -0.16 -0.9 0.14 0.14 -0.13 1.02 -0.97 -0.61 -0.45 -0.09
-0.03 0.22 -0.06 -0.02 0.23 0.05 -0.11 0.11 0.04 0.03 -0.15 -0.42
0.08 0.1 0.07 0.02 0.06 0.07 -0.13 -0.14 0.1 -0.09 -0.01 -0.16
-0.11 0.09 0.06 0.1 -0.11 -0.3 0.03 0.11 0.03 0.21 -0.17 -0.01
0.03 0.04 -0.0 -0.07 0.04 0.13 0.11 0.04 -0.05 -0.13 -0.21 0.04
-0.09 0.15 0.18 0.43 -0.16 -0.32 0.14 -0.02 -0.2 -0.08 -0.31 0.1
0.08 0.13 0.03 0.0 -0.05 -0.08 -0.07 0.15 0.11 -0.07 -0.14 -0.14
0.06 0.47 0.32 0.15 0.24 -0.12 -0.12 -0.13 -0.09 -0.12 -0.48 -0.51
-0.07 0.11 -0.03 0.01 0.12 0.03 -0.01 0.05 0.07 0.05 -0.1 -0.27
0.01 -0.25 0.06 0.02 0.13 0.2 -0.15 0.09 -0.13 0.12 -0.03 -0.14
-1.82 0.78 - 0.94 0.7 -1.53 - 0.76 0.55 1.2 -0.58 -
0.15 0.1 0.07 -0.02 0.05 0.0 -0.21 0.06 0.04 0.02 -0.31 -0.02
-0.04 0.1 -0.08 -0.02 0.05 -0.15 -0.18 0.05 0.03 0.12 -0.0 0.08
-0.03 0.24 0.18 0.2 -0.03 -0.29 -0.04 -0.16 0.2 0.06 -0.11 -0.37
-0.02 0.11 -0.05 -0.11 0.06 -0.02 -0.07 0.09 -0.07 0.19 0.09 -0.24
0.07 0.05 0.07 0.04 0.09 -0.1 0.06 -0.05 -0.01 -0.04 -0.15 -0.05
0.16 0.04 -0.09 0.11 0.04 0.07 -0.04 0.13 -0.04 -0.08 -0.22 -0.12
0.03 0.05 0.2 0.13 0.11 -0.03 -0.09 -0.08 0.04 -0.1 -0.14 -0.17
-0.04 -0.12 -0.01 -0.01 0.07 0.06 0.09 0.02 0.03 0.04 -0.11 -0.06
-0.45 0.51 0.6 0.64 0.4 -0.29 0.11 -1.18 0.16 -0.67 -0.43 -0.68
0.09 -0.15 -0.01 -0.17 -0.01 0.14 0.11 0.04 0.01 0.17 -0.04 -0.25
0.1 0.04 -0.02 -0.11 0.02 -0.02 -0.04 0.1 -0.12 0.08 -0.11 0.06
0.01 0.12 0.12 -0.09 0.02 0.0 0.0 0.06 0.05 0.03 -0.08 -0.29
-0.02 0.3 -0.07 -0.18 0.22 -0.06 -0.03 0.31 0.2 -0.17 -0.15 -0.6
0.02 -0.39 -0.35 0.21 0.32 0.15 0.05 -0.02 -0.03 0.1 -0.19 -0.05
0.03 -0.57 -0.39 0.1 0.32 0.23 0.1 -0.07 0.13 0.14 -0.01 -0.24
-0.51 0.25 -0.18 0.37 0.35 -0.06 -0.1 0.34 -0.12 -0.11 -0.26 -0.29
0.07 -0.03 -0.0 0.04 0.21 0.06 -0.03 0.08 -0.17 -0.07 -0.01 -0.18
-0.07 -0.25 -0.24 -0.27 -0.11 0.17 0.19 0.05 -0.01 0.16 0.21 0.04
1.24 - 0.51 -0.86 -0.31 - -0.07 0.88 0.47 0.75 -0.34 -2.37
0.05 0.19 0.07 0.13 0.29 -0.22 -0.15 0.0 -0.01 -0.04 -0.09 -0.36
0.12 0.29 -0.14 -0.07 0.15 -0.04 -0.21 0.2 -0.38 0.49 -0.1 -0.66
0.16 0.32 -0.28 -0.2 0.2 -0.19 -0.02 0.32 -0.09 0.21 -0.29 -0.38
-0.04 0.31 0.34 0.18 0.19 -0.54 -0.29 -0.11 0.05 0.12 -0.42 -0.09
1.01 1.57 -0.1 -0.44 -1.83 -0.94 0.37 -1.08 0.37 -0.21 -1.39 -2.16
0.01 0.27 -0.2 0.06 -0.01 0.0 -0.12 0.11 0.06 0.16 -0.06 -0.38
-0.1 0.45 -0.02 0.24 -0.04 0.11 -0.16 0.64 -0.24 -0.42 -0.29 -0.66
0.08 -0.33 -0.61 0.29 0.45 -1.12 -0.55 0.73 -0.11 1.05 0.01 -3.55
0.14 0.12 -0.1 -0.16 0.06 -0.03 0.03 0.15 -0.1 0.02 -0.13 -0.04
0.12 0.07 -0.04 0.07 0.12 0.05 -0.1 0.09 -0.07 -0.06 -0.2 -0.08
0.42 0.71 -0.23 -0.72 0.63 -0.54 -0.24 0.91 -0.4 -0.3 -1.48 -0.54
-0.21 0.43 0.18 0.32 0.28 -0.22 -0.07 0.35 -0.23 -0.2 -0.44 -0.63
0.36 0.13 -0.25 -0.49 -0.43 -0.32 -0.13 0.92 0.08 0.38 -0.58 -0.54
-0.17 -0.25 -0.11 0.02 0.18 0.09 0.15 0.12 0.04 0.03 -0.04 -0.14
0.31 -0.29 -0.77 -0.13 -0.41 -0.82 0.05 0.3 0.23 0.39 0.45 0.01
-0.39 0.42 0.07 0.44 0.22 -0.09 -0.12 0.4 -0.27 -0.3 -0.24 -0.61
-0.08 0.41 -0.1 -0.02 0.06 0.19 -0.42 0.55 -0.29 0.1 -0.58 -0.23
0.05 0.31 0.01 -0.28 -0.09 0.19 -0.22 0.51 -0.24 -0.16 -0.5 0.11
0.01 -0.16 -0.18 -0.06 0.18 0.15 0.08 0.1 0.17 0.18 -0.15 -0.46
0.04 -0.1 0.33 -0.64 0.75 0.47 0.9 -0.92 -0.49 0.43 -1.13 -2.62
0.18 0.08 0.15 -0.04 -0.06 0.03 -0.01 0.15 -0.16 -0.04 -0.42 0.05
-0.2 -0.16 -0.12 -0.13 0.17 0.08 0.05 0.1 -0.03 0.21 -0.13 0.09
0.48 -0.43 - -0.18 - -0.2 - 1.5 -0.55 1.71 0.42 -
-0.13 -0.42 0.02 0.42 0.13 -0.07 0.09 -0.04 -0.02 0.16 -0.14 -0.17
-0.18 0.1 0.23 0.21 0.15 -0.06 0.04 0.13 -0.06 -0.07 -0.18 -0.43
0.71 -0.51 -1.24 0.57 -1.18 -1.11 1.06 1.06 -0.35 -0.47 -0.05 -2.3
1.14 - - 0.9 - - - 0.08 -0.37 1.33 1.85 -
-0.06 0.03 0.03 0.0 0.19 -0.06 -0.01 0.17 0.02 -0.01 -0.08 -0.31
0.04 0.11 -0.18 0.01 0.18 -0.15 -0.24 0.54 -0.05 -0.02 -0.13 -0.32
-0.16 -0.18 -0.05 -0.26 -0.04 0.0 0.27 0.3 -0.06 0.12 0.07 -0.13
0.41 -0.69 -0.56 -0.38 -0.04 -0.75 0.13 0.25 0.32 0.25 0.33 0.07
-0.04 -0.06 0.1 0.05 0.08 -0.24 0.13 0.09 0.13 -0.1 -0.13 -0.07
0.62 - -0.78 1.41 -0.53 -0.58 0.17 -0.73 0.68 0.27 - 0.41
0.15 0.22 -0.01 0.18 0.22 -0.36 -0.09 0.16 -0.11 0.16 -0.26 -0.45
-0.09 0.41 0.03 0.07 0.24 -0.13 -0.15 0.04 -0.0 -0.05 -0.16 -0.35
-0.66 0.86 -0.29 -0.19 0.62 -1.13 -0.31 0.17 0.66 -0.04 -0.37 -0.72
-0.36 -0.48 -0.58 0.94 0.96 0.73 0.53 -2.69 -1.13 -0.39 -0.07 -0.88
-0.11 1.07 0.53 -2.16 -0.11 0.32 -1.06 0.86 0.23 -0.86 -1.22 -0.55
-0.27 1.18 -0.67 -0.23 0.37 0.41 -0.61 1.21 -0.6 -1.81 -1.34 -0.98
-0.03 -0.04 0.01 -0.2 0.1 -0.03 0.18 0.07 0.11 0.02 -0.02 -0.21
-0.31 0.16 0.12 0.22 0.39 0.04 -0.14 0.2 -0.05 -0.18 -0.33 -0.32
0.08 -0.01 -0.14 -0.15 -0.08 -0.03 0.03 -0.1 0.14 0.28 0.07 -0.15
-0.41 -0.27 0.01 -0.42 0.14 0.33 0.17 0.29 0.18 -0.01 -0.0 -0.25
-0.12 0.05 0.08 0.24 0.23 0.12 -0.27 0.44 -0.35 -0.06 -0.24 -0.38
0.2 0.17 0.27 0.39 0.12 -0.23 0.34 -0.29 0.17 -0.45 -0.42 -0.79
-0.08 -0.2 -0.17 0.08 0.18 -0.51 0.12 0.12 0.07 0.37 0.14 -0.35
-0.57 -0.51 -0.13 0.66 0.27 -0.8 0.46 -0.02 0.43 -0.11 -0.63 0.09
0.05 1.44 -0.36 -0.28 0.34 -0.57 0.46 0.04 -1.0 0.2 -2.34 -1.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.