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Heatmap: Cluster_77 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.14 0.04 0.1 0.09 -0.45 -0.5 -0.02 0.06 -0.07 -0.04 0.25 0.21
0.41 -0.73 0.16 -0.24 0.69 -1.43 0.74 -0.55 -0.49 0.51 -0.8 0.07
0.6 -0.58 -0.34 -0.34 0.28 -1.0 0.46 -0.36 0.15 0.36 0.12 -0.19
0.23 0.2 -0.11 -0.28 0.15 -0.69 0.14 0.1 0.1 -0.12 0.09 -0.05
0.74 0.24 -0.13 0.65 -0.27 - -0.55 -0.65 -0.55 0.81 -0.09 0.19
-0.53 0.09 -0.01 0.13 0.48 -0.87 -0.31 1.26 -0.22 -0.02 -1.29 -0.39
0.0 0.05 0.03 0.05 -0.03 -0.06 -0.14 0.04 0.03 0.0 -0.02 0.05
-0.54 -0.88 -0.11 -0.75 -0.22 -0.76 -0.25 0.28 0.73 0.21 1.06 -0.25
-0.02 -0.03 0.01 0.05 -0.16 0.09 -0.05 0.06 -0.07 -0.01 -0.1 0.21
0.17 -0.04 -0.05 0.15 -0.09 0.2 -0.06 0.11 -0.23 0.01 -0.38 0.1
0.18 -1.57 -0.07 0.57 -0.7 -0.19 -0.16 0.67 -0.29 -0.61 0.92 -0.42
0.1 -0.16 0.24 0.12 -0.03 -0.23 -0.28 0.13 0.03 -0.11 -0.09 0.16
-2.08 1.01 0.32 0.01 -2.16 0.09 -0.79 0.01 -0.98 -1.06 1.43 -0.09
0.1 -0.07 0.27 0.14 -0.45 -0.61 -0.17 -0.16 0.23 0.25 -0.11 0.27
-0.2 0.47 0.72 0.18 -0.33 -1.48 -1.66 -1.79 0.3 0.51 -1.86 1.19
-0.45 -0.18 -0.03 0.11 -0.04 -0.06 -0.22 0.06 0.21 -0.12 -0.02 0.52
0.07 0.17 -0.1 0.02 -0.07 -0.14 0.01 0.19 -0.24 -0.05 -0.03 0.1
0.14 -0.26 -0.06 0.08 -0.97 -0.03 0.07 0.29 0.21 -0.08 0.14 0.12
0.08 0.07 0.19 0.18 -0.07 -0.09 -0.21 0.05 -0.1 -0.02 -0.13 0.0
-0.1 0.11 0.03 -0.03 -0.1 -0.14 0.04 0.01 0.08 -0.15 0.18 0.03
0.02 -0.48 -0.2 -0.02 0.08 -0.53 0.28 0.08 0.06 -0.07 0.28 0.24
-0.06 -0.05 0.12 0.05 -0.31 0.08 -0.0 -0.17 0.06 0.0 0.03 0.19
-0.76 0.15 0.84 -0.15 -0.48 -0.34 -0.13 -0.89 0.27 -0.47 0.07 0.74
0.07 -0.58 0.18 -0.31 0.13 0.07 0.45 -0.31 -0.1 -0.57 -0.28 0.66
-0.57 -0.42 -1.41 -2.38 0.69 0.55 0.44 1.0 0.09 -2.24 1.21 -
-0.03 0.09 -0.11 -0.17 0.02 0.22 0.1 -0.16 -0.0 -0.11 0.02 0.08
0.29 -0.29 0.49 0.27 -0.12 -0.51 -0.47 -0.12 0.22 0.1 -0.2 -0.02
0.07 0.03 -0.02 -0.03 -0.34 -0.15 -0.01 0.21 -0.18 0.16 -0.05 0.23
0.16 -0.0 -0.29 0.15 -0.49 0.11 0.15 -0.02 0.14 -0.06 0.06 -0.06
-0.28 -0.3 0.04 0.34 0.22 -0.29 -0.41 -0.21 0.11 -0.01 0.53 -0.06
-1.21 1.0 -2.04 0.08 -1.8 - 0.44 1.38 - 0.84 -0.3 0.5
0.34 0.16 -0.01 -0.11 -0.54 0.0 -0.28 -0.05 -0.11 0.37 -0.28 0.23
0.14 -2.81 -0.44 0.68 0.04 -1.7 0.13 -0.42 0.46 0.74 -0.01 0.26
0.14 0.4 0.87 -1.18 -1.68 -0.37 -0.52 0.05 -0.13 -0.71 0.44 0.69
0.02 -0.17 0.09 -0.11 -0.16 0.05 0.0 0.02 0.05 0.01 0.05 0.1
-0.04 -0.06 0.04 0.02 0.06 -0.03 -0.01 -0.06 0.01 -0.05 0.07 0.04
0.35 0.26 -0.58 0.21 -0.08 0.12 -0.31 0.48 0.18 -0.36 -0.24 -0.53
0.88 -0.74 -0.05 -0.76 -0.48 0.26 -0.85 -0.29 -0.67 -0.17 0.83 0.5
0.93 0.11 -0.91 0.31 0.39 - -0.58 0.41 -1.04 0.74 0.84 -
0.04 -0.03 -0.31 -0.34 0.07 -0.1 0.21 0.2 -0.08 -0.07 0.12 0.17
0.18 0.11 -0.11 -0.29 -0.09 -0.39 0.03 0.32 -0.09 -0.05 -0.04 0.25
0.2 -0.23 0.07 0.22 -0.64 0.26 0.06 -0.36 0.05 0.06 -0.06 0.13
0.31 -0.0 -0.07 -0.49 -0.28 -0.86 -0.66 -0.48 -0.22 -0.35 0.56 1.17
0.35 -0.21 -0.3 -0.11 0.21 -0.12 0.48 -0.31 -0.15 0.26 -0.04 -0.39
0.49 -0.24 0.44 -0.18 -0.56 -0.55 0.05 0.09 0.0 -0.18 -0.04 0.25
-0.65 -0.5 0.06 0.52 -0.6 -0.45 0.31 0.15 0.39 0.06 -0.1 0.23
-0.27 -0.75 -0.16 0.03 0.19 -0.04 0.11 -0.15 0.04 0.19 0.36 0.16
-0.13 -1.01 -0.95 -0.0 0.27 -0.93 0.29 -0.06 -0.09 -0.2 1.32 -0.2
0.12 0.1 -0.13 -0.18 -0.24 -0.31 -0.01 0.32 -0.2 0.15 0.08 0.16
0.26 -1.24 -0.05 -0.32 0.06 0.0 0.49 -0.5 -0.15 0.02 0.31 0.38
0.33 0.33 0.34 0.09 0.26 -0.44 0.28 -0.79 -0.88 -0.35 0.12 0.03
-0.18 -0.43 -0.31 -0.02 0.07 -0.45 0.43 0.11 0.12 0.17 -0.04 0.24
-0.03 0.34 0.39 0.24 -0.24 -0.48 -0.62 -0.68 0.14 0.18 0.02 0.24
-0.37 0.03 -0.88 -0.03 -0.83 -0.49 0.69 0.9 -1.33 0.03 0.43 0.21
0.2 -0.04 0.16 -0.08 -0.33 -0.0 -0.24 0.16 -0.2 -0.11 0.22 0.13
-0.01 -1.08 -1.84 -0.16 0.02 -1.03 0.11 0.24 0.32 -0.73 1.28 0.39
0.94 - 0.4 -1.18 0.52 - -1.36 0.09 1.24 0.7 0.53 -
0.31 0.31 -0.56 -0.2 -0.12 -0.31 -0.1 0.96 0.24 -0.72 0.04 -0.91
-0.31 -0.05 0.41 0.51 -1.57 -0.31 -0.1 -0.03 -0.28 0.07 0.03 0.61
0.18 -0.03 -0.68 0.3 -0.52 -1.32 -0.24 0.49 0.3 -0.08 0.76 -0.3
-0.07 0.03 0.24 0.05 0.07 -0.18 -0.12 -0.1 -0.01 -0.13 0.07 0.09
-0.88 -1.19 -0.7 1.74 - 0.04 0.0 0.66 -0.03 -0.9 0.51 -0.97
- - 0.04 - 1.78 0.16 0.37 -0.15 - 0.21 1.61 -
0.18 0.01 0.0 -0.36 -0.92 -0.21 -0.02 0.01 -0.32 0.04 0.67 0.35
1.28 - - 1.67 - - 0.31 0.76 0.22 - 1.2 -
0.12 0.07 -0.06 -0.31 -0.01 -0.49 0.16 -0.37 0.27 -0.37 0.2 0.45
-0.96 0.11 -0.13 -0.05 0.34 -0.23 0.05 -0.4 0.39 -0.32 0.23 0.4
0.62 0.17 -0.32 0.32 -0.18 -0.34 -1.14 0.55 0.11 -0.36 0.18 -0.48
-0.32 -0.69 -0.3 -0.44 0.21 -0.23 -0.39 -0.22 0.3 0.27 0.87 0.19
- 0.14 0.76 -0.5 0.99 -0.68 -0.55 -0.56 0.04 - - 1.81
-0.58 0.14 -0.15 -0.11 0.23 -0.09 0.05 0.17 0.07 -0.39 -0.19 0.52
0.02 -0.23 -0.07 -0.31 -0.46 -0.02 0.35 0.21 -0.37 0.2 0.25 0.17
0.25 -0.6 -0.22 0.04 0.31 -0.26 0.52 -0.49 -0.03 -0.11 -0.09 0.25
0.14 0.91 -1.55 -0.23 0.73 -0.57 0.14 1.28 -0.16 -2.04 -1.9 -0.87

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.