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Heatmap: Cluster_242 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.1 -0.3 0.06 0.03 -0.14 -0.33 -0.19 -0.32 0.25 0.16 0.14 0.34
-0.08 -0.3 -0.07 -0.12 -0.09 -0.03 0.1 -0.08 -0.05 0.26 0.09 0.28
-0.11 -0.3 -0.16 -0.17 -0.28 -0.18 0.21 0.0 0.02 0.16 0.07 0.52
0.21 -0.11 0.14 -0.16 -0.53 -0.07 -0.09 -0.15 0.17 -0.09 -0.03 0.48
-0.08 -0.34 -0.15 -0.3 -0.2 -0.18 0.41 -0.11 -0.31 -0.06 0.13 0.75
0.21 -0.33 -0.25 -0.51 -0.44 -0.33 0.25 -0.14 -0.11 -0.05 0.37 0.76
-0.17 -0.19 0.06 -0.05 -0.49 -0.38 0.32 0.08 -0.15 -0.31 0.02 0.78
0.0 -0.17 -0.08 -0.09 -0.15 -0.09 0.14 -0.19 0.22 0.03 0.11 0.18
0.03 -0.32 0.14 -0.11 -0.22 -0.03 0.23 -0.09 -0.23 -0.08 -0.08 0.55
0.15 -0.16 0.14 -0.34 -0.24 -0.16 0.04 0.08 0.07 0.02 -0.07 0.34
0.16 -0.16 0.1 0.06 -0.35 -0.3 0.03 -0.12 -0.33 -0.15 0.14 0.62
0.08 -0.08 0.03 -0.18 -0.31 -0.31 0.11 -0.21 0.17 -0.13 0.06 0.55
0.24 -0.58 -0.28 -0.11 -0.38 -0.09 0.13 -0.25 0.19 0.09 0.05 0.6
-0.06 -0.43 -0.07 -0.13 -0.27 -0.03 0.08 0.05 -0.03 0.21 0.04 0.46
-0.03 -0.24 -0.13 -0.12 -0.22 -0.03 0.15 -0.06 -0.02 0.11 0.13 0.35
0.07 -0.21 0.09 -0.07 -0.15 -0.07 -0.05 0.05 0.07 0.07 -0.09 0.22
0.01 -0.56 0.17 0.17 -0.11 -0.25 -0.03 -0.2 0.13 -0.08 0.11 0.4
-0.01 -0.15 0.05 -0.08 -0.03 -0.06 0.0 -0.11 0.07 -0.01 0.07 0.22
0.03 -0.24 0.04 -0.12 -0.22 -0.22 0.22 -0.37 0.16 0.07 -0.0 0.46
0.58 -0.11 0.17 0.01 -0.14 -1.61 0.0 -0.48 0.03 -0.31 0.01 0.73
-0.08 -0.09 -0.03 -0.32 -0.29 -0.2 0.26 -0.33 0.25 -0.02 0.06 0.52
0.11 -0.22 0.02 -0.08 -0.12 -0.1 0.15 -0.08 -0.05 -0.02 -0.04 0.33
-0.05 -0.28 0.14 -0.02 -0.12 -0.04 0.17 -0.19 0.06 0.09 -0.09 0.24
-0.12 -0.29 0.01 -0.15 -0.32 -0.03 0.11 -0.04 -0.0 0.04 0.16 0.46
0.05 -0.41 0.06 -0.3 -0.35 0.07 -0.06 -0.45 0.35 -0.13 0.2 0.57
-0.11 -0.28 -0.14 -0.05 -0.31 -0.26 0.16 -0.01 0.24 0.03 0.15 0.38
0.07 -0.22 0.01 -0.1 -0.18 -0.09 0.1 0.04 -0.03 0.02 -0.09 0.37
0.03 -0.15 -0.1 -0.28 -0.11 -0.05 0.15 -0.06 -0.08 0.05 0.17 0.33
0.05 -0.22 0.0 -0.1 -0.08 -0.11 0.01 -0.12 0.07 0.07 0.07 0.29
-0.01 -0.24 -0.02 -0.07 -0.14 -0.03 0.03 -0.07 0.11 -0.04 0.15 0.26
0.04 -0.18 0.02 -0.06 -0.17 -0.05 -0.0 -0.08 0.07 -0.02 -0.03 0.37
-0.01 -0.03 -0.0 -0.19 -0.18 -0.14 0.11 -0.1 0.03 0.06 0.01 0.35
-0.23 -0.28 -0.03 -0.05 -0.16 -0.16 0.15 -0.24 0.08 0.21 0.11 0.42
0.41 -0.23 0.04 -0.14 -0.45 -0.24 0.04 -0.57 0.23 -0.29 0.22 0.54
0.08 -0.21 0.14 -0.38 -0.08 -0.09 0.06 -0.07 -0.16 -0.08 0.09 0.5
-0.03 -0.19 -0.05 -0.03 -0.13 -0.16 0.05 -0.1 0.16 0.01 0.1 0.28
0.14 -0.26 0.03 -0.04 -0.11 -0.21 0.11 -0.2 0.08 -0.02 0.03 0.34
0.02 -0.22 -0.03 -0.08 -0.05 -0.16 0.11 -0.08 -0.05 -0.05 0.11 0.39
0.29 -0.42 -0.44 -0.46 -0.32 -0.38 0.36 0.02 0.08 0.04 0.08 0.64
-0.3 -0.64 0.26 -0.15 -0.29 -0.35 0.27 0.19 -0.12 0.53 -0.23 0.35
-0.0 -0.05 0.09 -0.19 -0.24 -0.26 0.11 -0.19 0.02 0.27 0.05 0.26
-0.0 -0.18 0.1 -0.04 -0.05 -0.15 -0.03 -0.12 0.15 -0.05 0.02 0.29
0.23 -0.67 -0.09 -0.21 -0.15 -0.74 0.15 -0.4 0.03 0.08 0.42 0.68
0.03 -0.48 0.11 -0.19 -0.18 -0.19 0.17 -0.07 -0.05 0.07 -0.01 0.55
-0.08 -0.11 -0.01 -0.07 -0.0 -0.13 0.07 -0.12 0.04 -0.01 0.06 0.3
0.06 -0.17 -0.09 -0.05 -0.17 0.02 0.0 -0.01 -0.09 0.03 0.01 0.37
0.07 -0.25 0.01 -0.05 -0.05 -0.01 0.12 -0.04 -0.14 -0.03 0.08 0.24
-0.11 -0.42 -0.12 -0.43 -0.24 -0.02 0.13 -0.07 0.22 0.21 0.03 0.52
0.03 -0.06 0.13 0.08 -0.16 -0.36 0.12 -0.36 0.01 0.08 -0.01 0.36
0.12 -0.14 0.25 0.05 -0.13 -0.4 0.12 -0.22 -0.11 -0.33 0.08 0.47
0.13 -0.22 0.03 -0.1 -0.1 -0.15 -0.01 -0.14 -0.05 -0.04 0.22 0.33
0.15 -0.1 0.03 -0.08 -0.22 -0.08 0.06 -0.05 -0.17 0.07 -0.07 0.35
0.21 -0.41 0.01 -0.07 -0.1 -0.32 -0.03 -0.32 0.11 0.06 0.09 0.51
-0.04 -0.32 0.16 -0.22 -0.35 -0.24 0.2 -0.21 -0.09 0.11 0.23 0.5
-0.06 -0.18 -0.01 0.06 -0.08 -0.09 -0.01 -0.11 0.2 -0.03 0.02 0.23
-0.21 -0.74 0.27 -0.33 -0.3 -0.05 0.32 -0.56 0.28 -0.1 0.33 0.51
-0.21 -0.81 -0.38 -0.19 -0.33 -0.62 0.35 -0.61 0.14 0.1 0.59 0.91
0.04 -0.23 -0.04 0.06 -0.2 0.01 0.12 -0.04 0.09 -0.02 -0.13 0.26
0.13 -0.26 -0.06 -0.11 -0.16 -0.2 0.05 -0.24 0.17 -0.02 0.24 0.31
0.16 -0.15 -0.05 -0.18 -0.2 -0.09 -0.02 -0.27 0.23 -0.16 0.11 0.44
-0.11 -0.19 -0.05 -0.12 -0.13 -0.14 0.17 -0.02 -0.01 0.15 0.04 0.33
0.01 -0.33 0.01 -0.32 -0.16 -0.07 0.12 -0.02 0.02 0.13 0.09 0.37
-0.07 -0.33 0.19 0.09 0.03 -0.3 -0.08 -0.26 -0.01 -0.01 0.15 0.41
0.16 -0.77 -0.04 -0.13 -0.04 -0.16 0.04 -0.54 0.25 0.01 0.31 0.47
-0.12 -0.07 -0.03 -0.3 -0.14 -0.1 -0.03 -0.06 0.16 0.13 0.06 0.37
0.04 -0.3 -0.15 -0.23 -0.18 -0.25 0.04 -0.04 -0.23 0.13 0.45 0.45
0.0 -0.18 0.01 -0.1 -0.09 -0.05 0.09 -0.08 0.05 0.09 0.03 0.18
0.08 -0.21 0.06 -0.3 -0.22 -0.07 0.16 -0.08 -0.01 -0.02 -0.07 0.51
0.02 -0.47 0.04 0.04 -0.23 -0.14 0.16 -0.27 0.21 -0.06 0.22 0.28
0.1 -0.33 0.07 -0.08 -0.12 -0.12 -0.19 -0.11 0.22 -0.05 0.16 0.32
-0.01 -0.21 0.01 -0.22 -0.12 0.01 0.1 -0.06 -0.13 -0.04 0.18 0.38
0.24 -0.8 -0.21 -0.21 -0.25 -0.45 0.23 -0.23 -0.2 -0.02 0.34 0.84
0.04 -0.33 -0.03 -0.25 -0.38 0.11 0.16 -0.03 -0.12 -0.04 -0.0 0.61
0.01 -0.13 -0.03 -0.11 -0.16 -0.15 0.19 -0.25 -0.01 0.04 0.07 0.41
0.05 -0.58 -0.01 -0.26 -0.26 -0.53 0.34 -0.08 -0.25 0.03 0.29 0.71
-0.02 -0.44 -0.05 -0.15 -0.09 -0.07 0.11 -0.04 -0.1 -0.06 0.16 0.55
0.11 -0.12 0.04 -0.27 -0.19 -0.11 0.08 -0.13 -0.14 0.02 -0.06 0.58
-0.17 -0.37 0.07 0.04 -0.4 -0.15 0.21 -0.29 0.01 0.08 0.06 0.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.