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Heatmap: Cluster_23 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.22 0.18 0.13 -0.15 -0.06 -0.04 0.14 0.12 -0.54 -0.01 -0.49 0.24
0.2 0.32 0.06 -0.08 0.12 0.1 0.07 0.26 -0.49 -0.12 -0.48 -0.23
0.13 0.36 0.05 -0.21 0.2 0.26 -0.17 0.36 -0.57 0.2 -0.52 -0.55
0.12 0.39 0.07 -0.03 0.11 0.16 -0.04 0.15 -0.45 0.04 -0.43 -0.34
0.32 0.42 0.15 -0.21 0.06 0.24 -0.09 0.73 -1.39 -0.28 -0.91 -0.18
0.05 0.29 0.04 -0.0 0.14 0.03 0.04 -0.04 -0.21 0.0 -0.04 -0.41
0.16 0.05 0.14 -0.15 0.01 -0.01 0.12 0.28 -0.41 0.0 -0.33 -0.01
0.04 0.37 0.0 -0.07 0.02 0.12 -0.02 0.38 -0.56 -0.11 -0.51 0.04
0.03 0.5 0.15 -0.05 0.24 -0.15 0.08 0.92 -1.49 -0.08 -1.18 -0.47
0.03 0.3 0.0 0.02 0.05 0.08 -0.07 0.1 -0.34 0.01 -0.11 -0.16
-0.03 0.15 -0.07 -0.08 0.09 0.13 -0.02 0.15 -0.22 0.11 -0.22 -0.06
0.21 0.16 -0.05 -0.08 0.12 -0.01 -0.02 0.32 -0.33 -0.04 -0.3 -0.13
0.13 0.24 -0.01 0.02 0.11 -0.12 -0.1 0.22 -0.28 -0.0 -0.29 -0.02
0.14 0.32 0.08 -0.05 0.1 0.13 -0.06 0.13 -0.37 0.05 -0.41 -0.24
0.1 0.21 0.01 -0.1 0.03 0.03 -0.05 0.01 -0.15 0.08 -0.18 -0.02
0.06 0.2 -0.01 -0.16 0.08 0.17 -0.04 0.13 -0.19 0.04 -0.2 -0.16
0.45 0.43 -0.13 -0.38 0.03 0.33 -0.16 0.46 -0.7 -0.06 -0.72 -0.2
0.23 0.35 -0.31 0.18 0.33 0.07 -0.1 0.37 -0.67 0.05 -0.61 -0.39
0.07 0.28 0.02 -0.0 0.18 0.07 0.02 0.03 -0.27 -0.02 -0.26 -0.23
0.09 0.2 0.13 -0.0 0.06 0.05 0.0 0.09 -0.34 -0.07 -0.29 -0.02
0.05 0.22 0.05 0.02 -0.05 -0.03 -0.01 0.16 -0.12 -0.14 -0.16 -0.03
0.09 0.27 0.19 -0.04 0.21 0.09 0.14 0.17 -0.71 0.04 -0.72 -0.11
0.3 0.4 -0.03 -0.07 0.03 0.23 0.11 0.17 -0.37 -0.08 -0.5 -0.52
0.15 0.19 0.1 0.02 0.06 0.15 0.01 0.19 -0.33 -0.21 -0.53 0.01
0.21 0.21 0.14 0.04 0.03 -0.12 0.09 0.18 -0.33 -0.16 -0.56 0.07
0.55 0.77 0.22 -0.03 0.05 0.39 -0.09 0.27 -0.98 -0.56 -1.48 -0.61
0.15 0.17 0.03 -0.1 -0.09 0.12 0.17 0.22 -0.4 -0.09 -0.44 0.09
0.11 0.11 0.01 -0.1 0.06 0.07 0.08 0.15 -0.24 -0.01 -0.29 -0.03
0.21 0.23 0.03 -0.02 0.09 0.06 0.04 0.23 -0.48 -0.15 -0.45 0.01
0.17 0.22 0.05 -0.04 0.1 0.1 0.13 0.2 -0.46 -0.11 -0.44 -0.13
0.12 0.14 0.03 0.11 -0.02 0.05 0.01 0.11 -0.28 -0.1 -0.33 0.07
-0.03 0.41 0.09 -0.13 0.29 0.15 -0.29 0.39 -0.29 0.15 -0.57 -0.64
0.13 0.28 0.03 -0.08 0.19 0.07 -0.03 0.18 -0.4 0.05 -0.42 -0.18
0.13 0.27 0.07 -0.07 0.11 0.06 0.12 0.13 -0.43 -0.0 -0.3 -0.24
0.09 0.14 0.03 -0.04 0.1 0.04 -0.02 0.09 -0.18 -0.03 -0.26 -0.01
0.08 0.38 0.01 -0.05 0.05 0.16 -0.01 0.1 -0.31 0.0 -0.39 -0.19
0.18 0.31 0.04 -0.02 0.15 0.1 -0.01 0.25 -0.44 -0.04 -0.54 -0.22
0.11 0.28 -0.01 -0.02 0.12 -0.01 -0.07 0.17 -0.28 0.09 -0.3 -0.23
0.06 0.26 0.0 -0.08 0.05 0.25 -0.01 0.22 -0.37 -0.1 -0.43 -0.03
0.4 0.33 -0.1 -0.38 -0.09 0.11 -0.14 0.52 -0.41 0.19 -0.45 -0.46
0.14 0.14 -0.02 -0.18 -0.04 0.24 -0.02 0.39 -0.59 0.18 -0.39 -0.14
0.24 0.47 -0.09 -0.15 0.12 0.2 -0.12 0.37 -0.33 0.01 -0.67 -0.51
0.15 0.24 0.07 -0.03 0.03 0.1 -0.02 0.13 -0.26 -0.09 -0.42 -0.03
0.18 0.17 -0.02 -0.04 0.14 0.05 0.13 0.27 -0.59 -0.05 -0.42 -0.04
0.12 0.31 0.12 -0.05 -0.01 0.11 0.1 0.25 -0.45 -0.06 -0.66 -0.06
0.08 0.26 0.02 0.09 0.03 0.13 0.04 -0.05 -0.22 -0.12 -0.36 0.01
0.22 0.16 0.06 -0.07 -0.06 -0.08 -0.02 0.17 -0.24 -0.12 -0.31 0.19
0.08 0.2 0.13 0.06 0.05 0.16 -0.06 0.04 -0.29 -0.09 -0.36 -0.03
0.11 0.21 -0.06 -0.02 0.14 0.1 -0.02 0.14 -0.15 -0.03 -0.23 -0.27
0.03 0.18 0.06 0.04 0.07 0.09 -0.01 0.24 -0.32 -0.02 -0.49 -0.01
0.12 0.2 0.05 -0.04 -0.01 0.09 -0.04 0.09 -0.19 -0.06 -0.14 -0.13
0.06 0.18 -0.07 0.01 0.2 0.07 -0.09 0.22 -0.27 0.14 -0.21 -0.39
0.19 0.19 0.03 -0.06 -0.05 0.02 0.01 0.03 -0.19 -0.02 -0.24 0.02
0.14 0.3 0.12 0.04 0.01 -0.21 -0.09 0.14 -0.31 -0.12 -0.01 -0.12
0.26 0.26 0.14 0.04 0.01 0.01 -0.07 0.06 -0.63 -0.02 -0.06 -0.18
0.03 0.2 -0.05 -0.05 0.13 0.05 0.0 0.13 -0.17 0.11 -0.24 -0.23
-0.02 0.21 -0.13 0.01 0.14 -0.02 -0.08 0.24 -0.17 0.11 -0.2 -0.2
0.16 0.2 -0.0 0.03 0.05 0.13 -0.07 -0.03 -0.15 -0.01 -0.16 -0.2
0.19 0.4 0.04 -0.04 0.22 0.0 -0.02 0.3 -0.76 0.05 -0.63 -0.18
0.13 0.2 0.02 0.04 0.02 0.02 0.06 0.02 -0.18 -0.01 -0.24 -0.13
0.19 0.19 0.06 -0.04 0.03 -0.09 0.08 0.22 -0.26 0.01 -0.41 -0.1
0.06 0.31 0.12 -0.08 0.2 0.11 0.13 0.25 -0.58 -0.03 -0.56 -0.23
0.23 0.18 0.06 0.05 0.39 0.18 -0.07 0.48 -0.52 -0.12 -0.47 -1.03
0.08 0.3 -0.17 -0.29 0.21 0.28 -0.18 0.6 -0.38 0.14 -0.58 -0.51
0.09 0.03 -0.07 -0.26 0.07 0.1 0.02 0.23 -0.1 0.13 -0.11 -0.2
0.24 0.26 -0.14 -0.27 0.32 0.39 -0.0 0.48 -0.3 -0.05 -0.87 -0.72
0.04 0.05 0.01 -0.25 0.05 0.2 0.15 0.13 -0.28 -0.07 -0.28 0.14
0.24 0.38 0.05 -0.1 0.29 0.24 -0.09 0.31 -0.65 -0.12 -0.37 -0.64
0.2 0.39 -0.01 -0.19 0.14 -0.01 -0.01 0.37 -0.59 0.03 -0.5 -0.17
0.06 0.33 0.01 -0.06 0.12 -0.06 0.09 0.38 -0.49 0.14 -0.49 -0.33
0.13 0.27 0.02 -0.06 -0.01 0.09 -0.0 0.21 -0.44 -0.0 -0.35 -0.01
0.02 0.27 0.08 0.01 0.14 0.03 -0.0 0.27 -0.42 0.0 -0.41 -0.19
0.21 0.33 0.06 -0.13 0.08 0.07 0.09 0.23 -0.41 -0.06 -0.47 -0.23
0.05 0.21 0.01 0.03 0.09 -0.03 0.05 0.15 -0.23 -0.03 -0.23 -0.15
0.07 0.4 0.04 0.03 0.18 0.12 0.15 0.15 -0.48 -0.1 -0.55 -0.32
-0.06 0.49 0.32 -0.3 -0.22 0.29 -0.85 0.67 0.09 0.15 -0.61 -0.93
0.11 0.29 0.1 -0.18 0.07 -0.04 -0.09 0.28 -0.3 -0.01 -0.31 -0.07
-0.03 0.11 0.01 0.07 0.07 -0.04 -0.16 0.3 -0.09 0.06 -0.25 -0.15
0.11 0.58 0.13 0.0 0.2 -0.05 -0.22 0.43 -0.31 -0.18 -0.32 -0.93
0.37 0.47 -0.03 -0.13 0.16 0.24 -0.02 0.35 -0.66 -0.06 -0.8 -0.5
0.08 0.32 0.08 -0.04 -0.06 0.15 0.09 0.23 -0.47 -0.14 -0.43 -0.02
0.1 0.12 -0.04 -0.06 0.13 0.03 0.01 0.2 -0.18 0.04 -0.22 -0.2
0.13 0.19 0.11 0.07 -0.09 -0.04 -0.1 0.09 -0.22 -0.09 -0.27 0.14
0.06 0.3 -0.05 -0.05 0.05 0.04 -0.02 0.26 -0.16 0.03 -0.28 -0.3
0.24 0.37 0.08 -0.01 0.07 0.12 -0.04 0.3 -0.66 -0.05 -0.58 -0.19
0.31 0.21 0.23 -0.1 0.01 -0.08 0.14 0.18 -0.66 -0.16 -0.64 0.2
0.14 0.24 0.17 0.01 0.04 0.1 -0.01 0.21 -0.43 -0.11 -0.5 -0.08
0.15 0.14 0.08 -0.24 0.02 0.12 0.2 0.29 -0.52 -0.09 -0.44 0.06
0.01 0.15 -0.03 0.02 0.01 0.01 -0.04 0.14 -0.16 0.09 -0.2 -0.05
0.12 0.25 0.17 -0.02 0.1 0.09 -0.04 0.2 -0.4 -0.03 -0.42 -0.2
0.09 0.16 0.3 0.02 -0.18 0.05 -0.24 0.15 -0.5 -0.02 -0.35 0.29
-0.14 0.12 -0.08 0.02 0.17 0.26 -0.01 0.29 -0.08 0.06 -0.34 -0.45
0.19 0.43 0.09 -0.09 0.2 0.24 0.02 0.39 -0.93 -0.06 -0.73 -0.37
0.13 0.13 0.05 -0.11 0.04 0.11 0.21 0.21 -0.38 -0.03 -0.3 -0.21
0.12 0.3 0.04 -0.23 0.03 0.09 -0.16 0.3 -0.22 -0.01 -0.28 -0.13
0.06 0.25 -0.08 -0.03 0.29 0.34 -0.07 0.32 -0.33 0.15 -0.46 -0.93
0.16 0.24 0.08 0.02 0.18 0.04 0.01 0.16 -0.37 -0.01 -0.3 -0.39
0.16 0.31 0.07 0.06 0.15 -0.02 0.03 0.14 -0.35 -0.09 -0.43 -0.18
0.19 0.2 0.09 -0.03 0.05 0.08 0.08 0.17 -0.42 -0.01 -0.4 -0.17
0.13 0.16 0.07 -0.05 0.02 0.18 0.1 0.15 -0.31 -0.09 -0.39 -0.09
0.04 0.1 -0.13 -0.03 0.1 0.07 -0.0 0.08 -0.13 0.16 -0.2 -0.12
0.17 0.19 0.15 -0.11 -0.02 0.08 0.18 0.31 -0.6 -0.14 -0.38 -0.09
0.1 0.39 0.12 -0.05 0.01 -0.03 0.1 0.43 -0.62 -0.23 -0.46 -0.12
0.09 0.14 0.11 -0.03 0.09 0.08 -0.03 0.14 -0.39 0.01 -0.38 0.04
0.05 0.47 0.08 0.16 0.08 0.1 -0.01 0.45 -0.61 -0.28 -0.7 -0.27
0.23 0.4 -0.14 -0.1 0.11 0.2 -0.3 0.56 -0.32 0.06 -0.37 -0.9
0.26 0.21 0.07 -0.09 0.03 0.06 0.07 0.28 -0.56 -0.05 -0.53 -0.0
-0.2 -0.03 -0.03 -0.08 0.33 0.3 -0.1 0.53 -0.16 0.14 -0.53 -0.6
0.27 0.67 0.12 -0.04 0.01 -0.38 0.23 0.98 -1.95 -0.2 -0.93 -0.8
0.01 0.17 -0.03 -0.05 -0.03 0.2 0.06 0.17 -0.29 0.04 -0.25 -0.08
0.14 0.22 0.15 -0.1 0.02 0.12 0.05 0.31 -0.62 -0.04 -0.39 -0.12
0.06 0.3 0.06 -0.04 0.06 0.08 -0.06 0.13 -0.23 0.03 -0.31 -0.18
0.15 0.29 0.04 -0.22 0.13 0.03 -0.04 0.58 -0.75 0.07 -0.21 -0.53
0.15 0.28 -0.03 -0.15 0.09 0.22 -0.03 0.24 -0.42 -0.1 -0.69 0.13
0.44 0.22 -0.39 -0.44 -0.01 0.29 -0.11 0.42 -0.58 0.28 -0.41 -0.2
0.1 0.29 0.07 0.05 -0.01 0.15 -0.08 0.17 -0.27 -0.03 -0.34 -0.24
0.04 0.14 0.06 -0.11 0.23 0.23 0.03 0.25 -0.52 0.09 -0.58 -0.12
0.03 0.22 -0.07 -0.07 0.07 0.1 -0.06 -0.02 -0.04 -0.01 -0.18 -0.0
0.04 0.18 0.28 -0.02 0.23 0.09 0.06 0.27 -0.28 -0.15 -0.61 -0.35
0.18 0.28 0.14 -0.08 0.17 0.05 0.09 0.03 -0.37 -0.04 -0.34 -0.28
0.04 0.41 0.04 0.04 0.25 -0.02 0.05 0.41 -0.53 -0.29 -0.52 -0.26
-0.01 0.26 -0.05 -0.09 0.06 0.13 -0.12 0.13 -0.16 0.01 -0.17 -0.06
0.16 0.24 0.03 -0.1 0.04 -0.02 0.21 0.32 -0.5 -0.03 -0.41 -0.15
0.15 0.22 -0.05 -0.17 0.23 0.14 0.05 0.22 -0.41 0.08 -0.34 -0.31
0.27 0.22 0.1 -0.01 0.09 0.06 0.05 0.23 -0.59 -0.13 -0.47 -0.07
0.17 0.29 -0.05 -0.04 0.12 -0.15 -0.02 0.46 -0.76 0.06 -0.43 -0.0
0.06 0.67 0.05 0.12 0.33 -0.22 -0.11 0.27 -0.53 -0.03 -0.51 -0.67
0.26 0.22 0.03 -0.26 0.04 0.06 0.16 0.27 -0.68 -0.13 -0.49 0.19
0.12 0.16 -0.02 -0.08 0.11 0.08 0.13 0.15 -0.34 0.03 -0.31 -0.12
0.23 0.32 0.15 -0.02 0.21 0.01 0.09 0.31 -0.71 -0.1 -0.51 -0.37
0.18 0.16 0.07 -0.04 -0.06 -0.15 0.1 0.22 -0.33 0.02 -0.42 0.11
0.12 0.18 -0.05 -0.08 -0.03 -0.01 0.05 0.16 -0.07 0.06 -0.14 -0.24
0.07 0.15 0.02 -0.01 0.07 -0.03 -0.07 0.05 0.02 -0.02 -0.14 -0.14
0.29 0.34 -0.14 -0.46 0.12 0.43 0.02 0.39 -0.64 0.09 -0.91 -0.19
0.1 0.11 0.03 -0.09 0.11 0.07 0.05 0.15 -0.27 0.04 -0.29 -0.11
0.11 0.18 0.06 -0.03 0.16 0.03 0.1 0.17 -0.35 0.02 -0.45 -0.15
0.13 0.26 0.03 -0.14 0.01 0.17 0.07 0.33 -0.53 -0.05 -0.36 -0.13
0.25 0.18 0.06 -0.11 0.11 0.15 0.07 0.41 -0.63 -0.05 -0.46 -0.33
0.3 0.24 0.3 -0.16 -0.06 -0.08 0.01 0.29 -0.61 0.1 -0.76 0.02
0.17 0.24 0.05 -0.12 0.16 0.05 -0.02 0.21 -0.3 -0.03 -0.46 -0.12
0.08 0.32 -0.02 0.02 0.03 0.18 0.1 0.23 -0.5 -0.09 -0.56 -0.06
0.11 0.39 0.08 0.09 0.05 0.06 -0.02 0.25 -0.42 -0.14 -0.47 -0.21
0.0 0.12 -0.02 0.08 0.13 0.23 0.09 0.1 -0.45 0.08 -0.41 -0.11
0.3 0.26 0.08 -0.11 0.04 0.01 0.04 0.41 -0.65 -0.33 -0.64 0.16
0.2 0.3 0.04 -0.07 0.08 0.02 -0.05 0.23 -0.45 0.05 -0.35 -0.17
0.32 0.45 0.0 -0.2 0.18 0.36 -0.26 0.43 -0.64 -0.19 -0.58 -0.48
0.17 0.22 0.01 -0.12 -0.04 0.08 0.02 0.23 -0.38 -0.1 -0.35 0.11
0.2 0.3 -0.04 0.05 0.15 0.05 -0.01 0.24 -0.51 0.09 -0.57 -0.23
0.13 0.37 0.05 -0.02 0.17 -0.0 -0.07 0.16 -0.16 -0.04 -0.32 -0.43
-0.03 0.19 -0.07 -0.03 0.06 0.11 0.15 0.3 -0.43 -0.04 -0.38 -0.0
0.21 0.48 0.0 -0.13 0.13 0.29 -0.08 0.3 -0.46 -0.02 -0.8 -0.43
0.03 0.12 0.02 0.01 -0.01 0.07 0.0 0.11 -0.17 0.0 -0.22 -0.01
0.15 0.19 0.1 -0.05 0.15 -0.03 0.05 0.4 -0.34 -0.03 -0.47 -0.37
0.07 0.21 -0.03 -0.06 0.15 0.02 -0.06 0.16 -0.07 0.06 -0.21 -0.32
0.31 0.38 -0.01 -0.1 0.6 -0.07 -0.31 0.31 -0.81 -0.08 -0.48 -0.32
0.07 0.2 0.05 -0.1 0.19 0.11 0.02 0.09 -0.29 0.02 -0.29 -0.17
0.24 0.42 0.04 -0.29 0.2 0.26 -0.34 0.51 -0.67 0.08 -0.73 -0.35
-0.04 0.15 -0.19 0.01 0.15 0.18 -0.06 0.18 -0.17 0.08 -0.18 -0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.