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Heatmap: Cluster_201 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.25 -0.12 -0.07 0.07 0.12 0.02 0.04 -0.07 0.12 0.07 -0.02 0.04
-0.32 -0.26 0.03 0.02 -0.38 -0.67 0.38 -1.2 0.74 -0.31 0.37 0.5
-0.3 -0.55 0.12 0.28 0.14 0.02 0.11 -0.12 0.26 -0.09 0.02 -0.1
-0.46 -0.33 -0.09 0.47 -0.21 -0.08 0.56 -1.05 0.32 0.1 -0.13 0.2
-0.04 -0.24 0.11 0.07 -0.48 -0.15 0.15 -0.53 0.4 0.07 0.15 0.2
-0.29 -0.22 -0.04 0.02 0.01 -0.01 0.12 -0.15 0.33 -0.05 0.03 0.15
-0.26 -0.22 0.05 0.21 -0.07 -0.06 -0.05 -0.14 0.22 -0.02 0.11 0.14
-0.32 -0.31 -0.21 0.18 -0.0 0.1 0.05 -0.05 0.38 0.05 0.04 -0.06
-0.26 -0.2 -0.02 0.19 -0.0 -0.08 -0.02 -0.27 0.16 0.12 0.41 -0.2
-0.13 -0.01 -0.11 0.2 0.02 0.02 -0.04 -0.01 -0.0 -0.01 0.03 0.01
-0.43 -0.25 -0.02 0.26 0.05 0.02 -0.09 -0.2 0.29 -0.02 0.18 0.04
-0.12 -0.24 -0.03 0.06 -0.16 -0.12 0.12 -0.26 0.29 0.11 0.14 0.11
-0.28 -0.08 0.12 0.05 -0.07 -0.04 0.01 -0.1 0.24 0.06 -0.09 0.11
-0.23 -0.38 -0.02 0.02 -0.19 0.03 0.13 -0.07 0.21 0.16 0.04 0.18
-0.18 -0.25 -0.09 -0.02 -0.11 -0.05 0.09 -0.12 0.31 0.0 0.36 -0.06
-0.21 -0.18 -0.15 0.06 -0.04 0.04 0.03 -0.02 0.32 0.06 0.12 -0.1
-0.19 -0.33 -0.15 0.14 -0.03 0.08 -0.1 0.04 0.22 0.01 0.2 0.0
-0.15 -0.24 -0.04 0.14 0.03 -0.05 0.03 -0.17 0.29 0.03 0.0 0.04
-0.2 -0.23 0.01 0.21 0.06 -0.05 0.02 -0.09 0.18 -0.08 0.16 -0.07
-0.23 -0.2 -0.02 0.09 -0.11 0.19 -0.09 -0.16 0.34 0.03 0.1 -0.05
-0.01 0.08 -0.09 -0.07 -0.08 0.01 0.01 -0.15 0.12 0.01 0.05 0.1
-0.22 -0.2 0.01 -0.01 0.0 0.04 0.06 -0.14 0.13 -0.0 0.21 0.06
-0.19 -0.13 -0.15 0.12 -0.13 0.11 0.12 -0.28 0.23 0.06 -0.1 0.22
-0.45 -0.24 -0.11 0.13 0.03 -0.04 -0.06 -0.16 0.5 0.08 0.26 -0.18
-0.53 -0.47 0.01 -0.17 0.04 0.42 -0.54 -0.49 0.69 0.02 0.61 -0.36
-0.23 -0.28 0.06 0.24 -0.05 0.03 0.02 -0.25 0.4 -0.04 0.07 -0.11
-0.04 -0.19 -0.11 -0.08 -0.17 0.1 -0.1 0.05 0.29 -0.01 0.16 0.03
-0.35 -0.25 -0.06 0.12 -0.04 -0.05 0.19 -0.29 0.28 0.23 -0.05 0.12
-0.04 -0.19 -0.13 0.06 -0.12 0.09 -0.03 -0.08 0.22 -0.13 0.18 0.11
-0.46 -0.35 -0.03 0.19 0.06 0.19 -0.05 -0.12 0.23 0.08 0.18 -0.1
-0.43 -0.15 0.01 0.23 0.16 -0.27 -0.15 -0.11 0.17 0.06 0.22 0.08
-0.18 -0.17 -0.08 0.01 -0.05 -0.15 0.08 -0.08 0.16 0.13 0.06 0.2
-0.41 -0.44 0.09 0.34 -0.01 -0.04 0.03 -0.23 0.32 -0.07 0.01 0.17
-0.13 -0.06 0.01 0.09 -0.18 -0.24 -0.02 -0.31 0.2 0.12 0.12 0.29
-0.21 -0.14 -0.11 0.07 -0.02 0.06 0.05 0.03 0.3 -0.03 0.04 -0.1
-0.08 -0.01 -0.26 0.05 0.09 -0.08 -0.02 -0.08 0.13 0.03 0.08 0.12
-0.3 -0.31 -0.04 0.24 0.0 -0.03 -0.02 -0.15 0.26 0.02 0.2 -0.01
-0.18 -0.22 0.09 0.08 -0.08 -0.09 0.09 -0.1 0.24 -0.0 0.02 0.09
-0.25 -0.3 -0.03 -0.01 -0.2 0.03 0.02 -0.06 0.46 0.11 0.19 -0.14
-0.3 -0.13 -0.03 0.16 0.03 -0.41 0.2 -0.29 0.41 0.11 0.13 -0.11
-0.37 -0.19 0.0 0.11 0.0 0.12 0.03 0.02 0.05 0.01 0.11 0.05
-0.12 -0.13 0.24 0.16 0.17 -0.37 0.29 -0.46 0.06 -0.16 -0.12 0.22
-0.34 -0.11 -0.13 0.0 0.04 -0.17 0.09 -0.11 0.5 -0.27 0.35 -0.07
-0.36 -0.15 0.01 0.31 -0.17 -0.02 0.04 -0.12 0.19 -0.04 -0.03 0.2
-0.13 -0.19 -0.1 0.19 0.0 -0.12 -0.02 -0.21 0.31 -0.0 0.11 0.07
-0.75 0.01 -0.37 0.33 -0.19 -0.2 0.16 -0.0 0.02 0.4 0.44 -0.3
-0.55 -0.34 -0.09 -0.01 0.16 -0.34 0.14 0.11 -0.11 0.22 0.46 0.05
-0.11 -0.47 -0.06 0.01 -0.11 -0.21 0.12 -0.14 0.27 0.06 0.21 0.27
-0.66 -0.14 -0.19 0.27 0.1 0.07 0.12 -0.13 0.15 0.09 0.27 -0.19
-0.12 -0.1 -0.11 0.06 0.03 0.06 -0.01 -0.03 0.06 0.07 0.13 -0.06
-0.22 -0.05 -0.08 0.06 -0.04 -0.11 0.1 -0.14 0.27 0.05 0.01 0.08
-0.12 -0.17 0.06 0.19 -0.0 0.03 -0.03 -0.15 0.18 -0.17 0.09 0.01
-0.04 -0.18 -0.03 0.08 -0.01 -0.03 -0.03 -0.17 0.13 -0.0 0.08 0.15
-0.38 -0.36 -0.06 0.27 0.16 0.0 0.05 -0.08 0.19 0.11 0.05 -0.1
-0.12 -0.12 -0.01 0.06 -0.11 -0.06 -0.03 -0.05 0.18 0.01 0.18 0.02
-0.27 -0.22 -0.01 -0.0 0.05 -0.1 0.05 -0.27 0.3 0.12 0.12 0.11
-0.69 -0.86 -0.05 0.16 -0.27 0.11 -0.0 -0.11 0.49 0.19 0.42 0.04
-0.05 -1.46 0.02 0.35 -0.38 -0.05 -0.22 -0.77 1.07 0.29 -0.07 -0.1
-0.02 -0.1 0.01 0.12 -0.11 -0.21 -0.08 -0.14 0.14 0.0 0.09 0.23
-0.14 -0.26 0.07 0.16 -0.07 -0.06 0.01 -0.22 0.2 0.0 0.09 0.13
-0.3 -0.14 0.06 0.21 0.04 -0.05 0.07 -0.04 0.2 -0.05 -0.09 0.02
-0.08 0.0 0.04 0.09 -0.06 0.02 0.01 -0.12 0.03 -0.05 0.01 0.09
-0.2 -0.35 0.05 0.15 -0.16 0.03 0.07 -0.2 0.32 -0.27 0.19 0.19
-0.15 -0.46 0.06 0.23 -0.24 -0.28 0.13 -0.25 0.23 -0.15 0.26 0.36
-0.51 -0.45 -0.08 0.35 -0.04 0.08 0.06 -0.15 0.5 0.04 0.02 -0.11
-0.05 -0.05 -0.09 -0.03 -0.19 -0.16 -0.08 -0.12 0.22 0.14 0.11 0.22
-0.18 -0.35 0.04 0.06 -0.17 0.07 0.26 -0.12 0.13 -0.07 0.12 0.08
-0.21 -0.44 -0.32 0.0 0.59 -0.22 0.69 -0.53 -0.52 0.14 0.25 -0.09
-0.17 0.05 -0.13 0.18 0.04 -0.14 0.03 -0.19 0.08 0.16 0.16 -0.15
0.06 -0.78 -1.02 0.18 -0.24 0.49 1.17 -0.97 0.42 -0.25 -0.77 -0.05
-0.39 -0.39 -0.63 -0.17 -0.2 -0.22 0.19 -0.36 0.77 0.2 0.55 -0.05
-0.37 -0.3 0.1 0.18 -0.14 -0.03 -0.07 -0.6 0.48 0.18 0.24 0.01
-0.59 -0.17 -0.14 0.27 0.13 0.06 0.02 -0.16 0.27 0.05 0.31 -0.31
-0.1 -0.21 -0.07 0.19 0.0 -0.12 -0.01 -0.21 0.26 -0.04 0.13 0.07
-0.38 -0.35 -0.1 0.28 0.13 0.07 0.01 -0.18 0.35 -0.01 -0.03 0.04
-0.13 -1.22 -0.17 0.19 0.01 0.21 -0.33 -0.07 0.45 0.02 0.36 0.07
-0.25 -0.32 -0.18 0.21 0.16 -0.07 0.11 -0.09 0.45 0.05 0.04 -0.32
-0.6 -0.64 -0.06 0.45 0.26 -0.08 -0.03 -0.41 0.47 -0.07 0.27 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.