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Heatmap: Cluster_207 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.01 0.06 -0.37 -0.12 -0.25 -0.19 -0.05 -0.09 0.1 0.12 0.3 0.32
0.94 -0.69 -0.52 -0.49 - -0.38 0.64 -0.67 1.41 -1.02 -1.96 0.76
-0.48 0.34 -0.85 1.11 -0.02 -0.71 -0.75 -0.17 -0.1 -0.69 0.86 -0.2
-0.18 -0.83 -1.82 -0.72 -0.31 0.19 0.82 -0.63 0.6 -0.86 0.63 0.76
0.96 -2.5 -0.37 -0.43 -3.7 -0.03 0.25 -0.31 1.16 -1.61 0.48 0.43
0.1 -0.09 -0.1 0.06 -0.44 -0.63 0.25 -0.53 0.48 0.03 -0.17 0.53
0.13 -0.06 -0.04 -0.1 -0.08 0.23 0.01 0.04 0.02 -0.35 -0.05 0.16
0.07 -0.28 0.23 -0.14 0.23 -0.21 0.22 -0.26 -0.1 -0.41 0.04 0.36
0.03 -0.04 -0.45 0.4 0.17 -0.52 0.27 -0.1 0.37 -0.62 0.18 -0.14
0.19 -0.25 -0.0 -0.03 0.08 -0.37 0.29 -0.08 0.08 -0.06 0.06 -0.03
0.13 -0.12 0.12 -0.11 -0.15 -0.12 0.05 -0.05 0.08 -0.06 0.08 0.09
0.56 -1.62 -1.15 0.09 -0.28 0.6 0.27 -0.02 0.16 -0.67 0.33 0.2
0.9 0.67 0.25 -2.19 - - -0.42 0.97 0.69 -2.1 -1.0 1.07
0.16 -0.16 -0.01 -0.18 -0.08 -0.26 0.25 0.2 -0.12 -0.09 -0.07 0.26
1.29 - - 0.56 - - 0.85 0.57 0.49 - 0.89 0.61
0.24 -0.35 0.15 -0.15 0.02 0.09 0.15 -0.07 -0.08 -0.57 -0.15 0.45
0.15 -0.31 -0.49 -0.08 0.63 0.36 -0.21 -0.4 0.03 -0.39 -1.13 0.78
0.08 0.04 0.08 0.04 -0.22 -0.19 0.14 -0.14 0.01 -0.09 -0.02 0.2
0.38 -1.06 -0.67 0.53 -0.23 0.29 0.37 -0.02 -0.18 -0.55 0.15 0.16
0.71 - - 1.42 0.89 -0.88 -0.74 -0.76 -0.3 - -0.33 1.31
-0.06 -0.19 0.07 0.09 0.08 -0.32 0.25 -0.52 -0.2 0.23 0.21 0.15
0.06 0.14 -0.03 0.11 -0.05 -0.21 0.01 -0.11 0.04 0.11 -0.06 -0.06
0.04 -0.07 0.13 0.08 0.07 -0.16 0.11 -0.18 -0.34 0.04 -0.02 0.19
0.23 -0.1 0.09 -0.04 -0.13 -0.12 0.4 0.03 -0.16 -0.06 -0.4 0.09
-0.01 -0.14 0.02 -0.12 -0.13 0.01 0.05 -0.07 0.01 0.03 0.16 0.16
0.44 - 0.02 -0.52 -0.47 0.46 0.82 0.12 0.69 -0.09 -0.41 -0.56
0.24 0.02 -0.96 0.16 -1.03 0.63 0.5 0.4 0.19 -0.46 -0.54 -0.21
-0.0 -0.15 -0.24 0.38 0.01 -0.36 0.27 0.04 0.07 -0.19 0.02 0.0
0.13 -0.04 -0.05 0.05 -0.08 0.04 0.14 -0.1 -0.08 -0.08 -0.09 0.13
-0.25 -0.15 0.29 -0.05 -0.08 -0.06 0.12 -0.12 0.09 -0.1 -0.14 0.33
-0.35 -0.28 -0.28 0.54 -0.17 -0.17 -0.68 0.04 -0.07 -0.36 0.42 0.69
1.02 -0.36 -0.3 0.35 0.74 - 0.33 -1.0 -0.8 0.0 -0.06 0.18
0.14 -0.26 0.17 0.11 0.07 -0.32 0.01 -0.17 -0.12 -0.01 0.14 0.13
0.33 0.23 0.25 -0.05 0.19 -0.31 0.34 -0.01 -0.4 0.03 -1.18 -0.03
-0.84 1.04 -0.64 1.08 0.61 0.54 -0.16 - -0.18 -1.81 -0.07 -0.67
0.16 -1.45 -0.59 0.73 -0.72 0.6 -0.5 0.42 0.45 -1.0 -1.26 0.8
0.14 -0.52 -0.13 0.12 0.1 -0.51 -0.02 -0.01 0.37 -0.06 -0.25 0.44
0.28 0.44 -1.24 -1.44 0.26 -0.31 -0.17 0.15 -0.04 -0.38 -0.49 1.13
0.74 - - - 1.81 - 1.3 - - 1.21 - 1.05
0.24 -0.31 -0.32 -0.33 0.18 -0.45 0.34 -0.68 0.2 -0.05 0.19 0.5
0.19 -0.28 0.6 1.5 -1.76 -0.81 0.57 -0.14 -1.05 -0.55 -2.24 0.07
-0.29 -0.91 -0.21 0.19 -0.29 -0.86 0.64 0.29 0.19 0.37 -0.34 0.34
0.48 -0.89 -0.5 -1.1 -0.21 -1.59 0.78 -0.7 -0.3 0.57 -0.12 1.09
0.85 -1.06 -0.01 -1.54 - 0.13 0.94 0.76 -0.23 -2.45 0.14 0.62
0.21 0.17 -0.12 0.22 0.3 -0.05 0.2 -0.45 -1.08 0.14 0.06 -0.09
0.13 -0.53 -0.16 0.16 -0.06 -0.4 0.05 0.22 -0.08 0.33 -0.05 0.16
0.65 -1.68 - -1.56 0.25 0.49 2.0 - -0.34 -0.29 0.37 -1.74
-0.05 -1.12 -2.08 0.6 0.65 - 1.15 -1.82 -0.78 0.09 -0.81 1.34
0.95 -0.38 0.56 -0.46 -1.08 - 0.83 -0.35 -0.89 0.29 -0.98 0.85
0.12 -0.14 -0.03 -0.02 0.03 0.07 0.21 0.15 -0.05 -0.08 -0.73 0.26
0.03 -0.07 0.07 -0.07 -0.35 -0.07 0.34 0.14 0.15 -0.14 -0.11 -0.03
0.14 -0.22 -0.2 0.04 0.08 -0.33 0.03 -0.05 -0.06 0.2 0.12 0.14
0.12 -0.15 -0.22 0.04 -0.15 -0.06 -0.15 0.12 0.15 -0.0 -0.14 0.34
0.49 0.35 0.24 0.17 0.62 -0.13 -0.25 -1.15 -0.28 -1.15 0.04 -0.04
0.07 -0.57 0.12 0.16 -0.1 -0.13 0.17 -0.02 0.11 -0.01 0.02 0.03
0.02 -0.31 0.27 0.19 -0.32 -0.34 -0.06 0.1 -0.02 -0.02 0.02 0.3
0.03 -0.01 -0.05 0.01 0.03 -0.08 0.11 -0.04 -0.01 -0.03 0.1 -0.07
-0.09 -0.19 0.28 0.21 -0.17 -1.11 0.41 0.22 -0.01 0.16 -0.17 -0.02
-0.09 - -0.6 2.25 -0.76 -0.01 0.52 0.64 - -2.35 -2.44 -0.52
0.7 -0.64 -1.54 -1.21 0.13 -1.48 0.99 0.28 -0.6 0.64 0.35 -0.29
-0.11 -0.39 0.01 0.06 -0.19 0.11 0.25 0.01 -0.05 -0.34 0.21 0.26
0.14 -0.59 -0.09 -0.21 -0.27 -0.03 0.24 -0.06 0.36 0.16 -0.04 0.15
1.43 - - - - - 1.61 - 1.53 - - 1.75

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.