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Heatmap: Cluster_82 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.12 0.03 0.48 0.85 -1.29 -1.29 -0.72 -0.17 0.01 0.12 -0.56 0.69
- 0.14 1.76 - - 1.24 - - 2.09 - -0.14 -
0.24 1.7 0.9 -1.41 -1.92 -1.55 0.04 -1.01 -1.24 -1.89 -0.68 0.91
0.06 0.05 0.04 0.01 -0.06 0.02 -0.02 0.0 -0.09 0.02 -0.11 0.05
0.12 0.16 0.02 -0.11 -0.17 -0.28 -0.22 0.15 -0.12 -0.12 0.18 0.27
-0.1 0.25 0.26 0.27 -0.06 -0.34 0.19 -0.11 0.13 -0.4 -0.19 -0.11
0.27 0.32 0.22 -0.14 -0.24 -0.3 -0.06 -0.02 -0.38 -0.06 -0.18 0.32
-0.75 1.2 1.43 -0.07 -0.77 -0.27 0.05 -0.61 -3.05 -0.79 -1.56 0.39
0.33 0.06 0.51 -0.06 -0.42 -0.18 -0.23 -0.17 -0.05 -0.41 0.15 0.18
-0.08 -0.58 1.03 0.36 -0.71 -2.78 -0.27 -0.65 0.01 -0.41 0.71 0.52
0.21 0.02 -0.05 -0.0 0.03 -0.09 -0.1 0.04 -0.44 -0.12 0.07 0.31
0.39 0.1 0.01 -0.17 -0.52 -0.37 -0.18 0.34 -0.58 0.19 0.01 0.36
-0.16 -0.18 0.23 0.07 -0.25 -0.13 0.38 0.41 -0.07 -0.06 -0.69 0.11
0.04 0.02 0.1 -0.47 0.09 0.26 -0.02 0.15 -0.16 0.14 -0.16 -0.13
-0.07 0.14 0.01 0.1 -0.08 -0.4 0.32 -0.03 0.08 -0.07 -0.44 0.26
0.06 0.08 0.01 0.08 -0.09 -0.02 0.03 0.11 -0.22 -0.1 -0.15 0.15
0.2 0.31 0.04 0.14 -0.2 -0.32 -0.08 0.06 -0.58 -0.22 -0.01 0.38
0.01 0.1 0.16 -0.34 -0.08 0.01 0.11 0.24 -0.06 -0.06 -0.16 -0.02
0.3 -0.23 0.26 0.54 -0.33 -0.04 0.14 -0.23 -0.54 -0.36 -0.16 0.24
-1.13 0.85 0.88 -1.13 -0.29 -0.32 0.55 0.04 -0.72 -1.47 -0.96 0.89
-0.72 0.63 0.75 -0.5 -0.01 0.18 0.41 -0.74 0.15 -0.16 -0.52 -0.49
0.16 0.24 0.21 -0.27 0.13 0.07 -0.24 0.15 -0.06 -0.31 -0.27 0.04
-0.08 0.51 0.41 -0.41 0.09 -1.04 -0.95 -0.09 -0.89 0.48 0.1 0.61
0.2 0.11 0.17 -0.11 -0.19 -0.18 0.07 0.13 -0.34 -0.08 -0.24 0.3
0.3 0.19 0.07 -0.29 -0.12 -0.2 -0.04 0.15 -0.44 -0.02 0.02 0.21
- 0.98 1.58 - - - 0.8 -0.25 1.46 0.77 - -
-0.02 0.18 0.05 0.04 -0.11 -0.07 0.05 -0.05 -0.09 0.11 -0.17 0.04
1.17 -0.63 0.98 -0.51 0.43 0.5 - 0.43 0.22 - -0.91 -0.69
-1.15 -0.5 1.22 -0.72 0.1 -0.04 1.05 -0.9 1.08 -1.82 -0.92 -1.61
0.16 0.84 -0.12 -0.48 -1.23 -0.15 0.16 -0.22 -0.11 -0.06 -0.22 0.5
0.53 0.78 0.04 -0.33 -0.55 0.24 -0.58 0.04 -0.86 0.06 -1.23 0.52
-0.04 -0.02 0.29 -0.02 -0.01 0.15 -0.06 0.15 -0.49 -0.07 -0.49 0.37
0.51 0.65 0.36 -0.15 -0.09 -0.23 -0.59 -0.41 -0.26 -0.59 -0.33 0.38
0.04 0.03 0.17 0.11 -0.14 0.2 0.02 -0.09 -0.24 -0.24 -0.21 0.23
0.32 0.21 1.0 -1.35 -1.85 -0.87 0.4 0.49 -0.25 -1.11 0.19 0.28
- 1.24 0.8 -2.07 0.46 -0.04 -0.55 0.79 0.44 -1.88 0.25 -3.95
0.19 0.35 0.15 0.04 -0.02 -0.22 0.0 -0.07 -0.31 -0.1 -0.38 0.18
0.25 0.17 0.13 -0.17 -0.25 -0.32 0.06 0.17 -0.18 -0.01 -0.18 0.18
0.18 1.08 0.49 -0.89 -0.68 -2.06 -0.03 -0.09 -0.34 -1.22 -0.33 1.0
0.17 0.29 0.22 -0.13 -0.09 -0.06 0.07 -0.03 -0.32 -0.08 -0.45 0.22
-0.29 0.55 0.21 0.18 -0.26 -0.42 -0.46 -1.76 -0.1 0.51 0.11 0.48
0.04 0.04 0.12 -0.14 0.09 -0.21 0.18 -0.1 0.06 -0.11 -0.14 0.11
0.43 0.4 -0.07 0.15 -0.23 -0.23 0.11 -0.33 -0.72 -0.38 -0.1 0.47
0.41 0.27 0.09 -0.09 -0.53 -0.46 -0.28 -0.23 -0.22 -0.2 0.12 0.63
0.36 0.27 -0.03 -0.07 -0.21 -0.09 0.08 0.07 -0.54 -0.16 -0.21 0.29
-0.01 -0.01 0.31 -0.02 -0.4 -0.02 -0.11 -0.03 -0.05 -0.22 0.05 0.35
- 0.14 1.18 0.51 - - 0.99 - 1.68 -0.05 - 0.09
0.21 -0.51 0.43 -0.4 -1.21 -2.15 -0.15 0.12 -0.22 -0.13 0.66 1.03
0.13 0.06 -0.02 -0.28 -0.0 -0.39 0.07 0.18 -0.28 0.18 -0.14 0.31
0.46 -0.27 0.47 -0.0 -1.77 -1.05 -0.8 -0.71 0.4 0.02 0.83 0.42
-0.16 0.5 0.63 0.51 -0.4 -0.67 -0.81 -1.09 -0.69 -0.19 0.47 0.5
0.03 0.52 0.62 -0.74 -0.35 -0.9 0.46 -0.1 -0.61 -0.35 -0.41 0.68
-0.01 -0.79 1.24 0.32 -0.51 1.1 -0.51 0.75 -1.04 -0.08 -2.65 -
0.42 1.78 -0.0 1.5 - - - - - -1.17 - 1.57
1.3 0.9 1.52 - - 0.0 - -0.31 - - - 1.58
0.14 0.03 -0.08 -0.17 -0.07 0.07 0.03 0.15 -0.14 0.06 -0.04 -0.01
- - 1.63 - - - - 1.62 2.54 - - -
0.05 -0.11 0.53 0.5 -0.74 0.12 -1.22 -0.06 -0.03 -0.96 -0.18 0.79
0.13 0.2 0.28 0.44 -0.26 -0.42 -0.08 -0.33 -0.19 -0.39 -0.01 0.29
0.1 1.26 0.43 -0.23 -0.59 -1.09 -0.2 0.36 -1.53 -1.83 0.02 0.5
0.07 0.13 0.09 -0.12 -0.15 -0.18 -0.05 -0.02 -0.0 0.02 -0.09 0.24
-0.58 0.61 0.23 -0.44 -1.52 -0.19 0.13 -0.35 -1.26 -0.41 0.18 1.32
0.18 0.23 0.37 -0.1 -0.24 -0.55 -0.06 -0.21 -0.15 -0.52 -0.34 0.78
0.06 0.02 0.18 0.12 -0.03 -0.06 0.05 -0.09 -0.25 -0.18 -0.02 0.12
0.13 0.16 0.24 -0.35 -0.18 0.03 -0.19 0.1 -0.23 0.03 -0.05 0.18
0.38 -0.15 0.02 -0.03 -0.59 -0.02 -0.42 0.12 -0.17 -0.21 0.35 0.37
- 1.69 1.72 - - - 0.41 - 1.05 - - 1.05
0.29 -0.09 0.24 0.38 0.05 -0.14 0.1 -0.37 -0.25 -0.45 -0.29 0.24
0.49 0.91 0.28 -1.23 -0.61 0.39 -2.37 -2.0 -1.35 -0.29 0.62 0.94
- - 2.63 - - - - - 2.54 - - -
-0.18 0.22 0.98 -0.47 0.05 -0.97 -0.01 0.02 -0.69 -0.48 -0.27 0.61
0.46 0.17 -0.07 -0.07 0.16 -0.58 -0.19 0.2 -0.55 -0.06 0.07 0.13
0.02 -0.2 0.21 0.22 -0.11 0.09 0.06 -0.09 -0.27 -0.22 -0.0 0.19
0.41 0.47 0.06 0.14 -0.92 -0.26 -0.42 -0.54 -0.89 -0.59 0.46 0.82
- - 1.91 - - - - - 3.04 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.