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Heatmap: Cluster_168 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.08 -0.08 -0.64 -0.96 -1.43 -0.03 0.56 -2.0 0.65 0.95 -0.74 0.83
- - 1.79 - 0.0 - 1.28 0.48 - 0.41 1.25 -
-0.02 -0.6 -0.14 -0.84 -0.15 -0.08 0.09 -0.53 0.53 0.15 0.4 0.49
-0.14 -0.25 0.47 0.17 -0.18 0.14 -0.01 -0.63 -1.16 0.29 0.64 -0.17
-0.71 -0.04 0.03 -0.02 -0.33 -0.83 -0.29 -0.05 0.39 0.63 0.56 -0.08
-0.5 0.18 0.5 -0.04 0.67 - 0.48 -0.39 -0.8 0.19 0.25 0.16
-1.1 0.23 -0.32 -1.91 - -0.82 0.0 -0.21 0.95 1.11 -0.85 1.15
0.13 0.1 -0.06 -0.33 0.26 -0.45 -0.59 -0.9 0.31 0.49 0.23 0.19
-0.12 -0.03 0.02 -0.07 -0.1 -0.02 -0.01 -0.25 0.23 0.04 0.17 0.08
-0.03 -0.07 -0.24 -0.33 -0.45 -0.2 0.03 -0.11 -0.12 0.55 0.44 0.19
-0.06 -0.25 0.4 0.41 0.38 0.03 -0.42 -0.19 -0.18 0.53 -0.5 -0.81
-0.11 0.02 0.4 -0.17 -0.89 - 1.08 0.26 -0.03 -0.71 -0.62 0.82
-0.58 -1.53 0.74 0.32 0.43 -0.82 -0.71 -0.12 0.51 0.82 0.09 -1.41
-0.1 0.06 -0.26 0.15 -0.03 0.08 0.94 0.26 -0.72 -0.12 -1.2 -0.04
-0.44 -0.32 1.69 0.45 -0.96 -1.09 0.59 - 0.28 0.84 -1.46 -
0.08 0.04 0.03 -0.03 0.36 -0.14 -0.19 0.16 -0.15 0.12 -0.23 -0.17
0.17 0.07 0.41 0.27 -0.33 -0.42 0.19 -0.18 -0.65 0.29 -0.19 -0.02
-0.47 -0.17 -0.01 0.03 -0.29 0.02 -0.07 -0.14 0.47 0.23 0.02 0.16
0.41 0.33 0.27 -0.37 -0.77 -0.05 -0.24 -0.14 0.1 0.02 0.13 -0.05
0.06 -0.06 0.18 -0.15 -0.53 0.19 -0.12 -0.33 0.15 0.07 -0.02 0.36
0.48 0.75 0.74 -1.17 0.42 - 1.04 0.09 - 0.52 - -0.12
0.11 0.12 -0.11 0.07 0.07 -0.27 -0.12 -0.15 0.02 0.1 0.06 0.03
1.17 -1.75 -0.61 -0.6 -0.37 0.9 -1.69 - -0.82 1.23 0.6 -0.4
-0.02 -0.02 -0.08 -0.02 -0.17 -0.16 -0.08 -0.11 0.27 0.05 0.19 0.06
-0.26 -0.04 0.13 0.31 0.5 0.04 -0.24 0.21 -0.21 0.47 -0.75 -0.82
0.07 -0.34 -0.37 -0.42 -0.74 -0.08 -0.45 0.13 0.18 0.52 0.3 0.57
-0.77 - 1.28 -0.5 0.67 0.03 0.58 0.84 -1.89 -1.52 0.83 -
-0.05 -0.06 0.01 0.0 0.09 -0.02 0.13 -0.22 -0.23 -0.18 -0.03 0.43
- - 1.78 -1.43 0.15 0.22 -1.24 0.06 0.66 1.53 - -
-1.08 -0.41 0.55 0.13 0.5 -2.29 -0.36 -0.73 0.44 -0.45 1.1 -0.01
-0.03 -0.1 -0.0 -0.14 0.16 -0.02 -0.22 0.01 0.23 0.1 -0.09 0.04
- - 1.55 - 1.06 - - -0.98 1.1 0.91 1.3 -
0.63 -0.04 0.7 -1.91 0.19 -2.82 -0.7 -1.19 0.72 0.39 0.63 -0.43
-0.01 -0.01 -0.18 -0.11 -0.53 -0.2 -0.19 0.02 0.3 0.19 0.2 0.31
-0.86 -1.45 0.19 0.31 0.56 -0.28 -0.53 0.37 -0.11 0.05 -0.4 0.77
-0.15 -0.74 0.41 0.24 0.27 -0.49 0.48 -1.19 0.06 -0.76 0.96 -0.62
-1.16 -0.36 0.79 -0.4 -0.51 0.0 0.73 -0.69 -0.42 -1.24 0.55 0.73
-0.14 -0.09 0.04 -0.08 0.02 -0.23 0.06 -0.05 0.09 0.01 0.13 0.18
0.14 -0.07 0.12 -0.05 0.07 -0.3 0.02 -0.11 -0.09 0.02 0.01 0.18
-0.11 -0.7 0.56 0.2 -0.3 -0.26 0.7 -0.36 -0.19 0.07 -0.43 0.16
0.15 -0.96 0.24 -0.1 0.25 -0.56 -0.14 0.07 0.06 0.2 -0.05 0.37
0.13 0.09 0.16 -0.22 -0.52 -0.03 -0.05 -0.11 -0.05 0.15 -0.02 0.31
-0.05 -0.8 0.25 -0.37 0.25 -0.08 -0.13 -3.44 -0.99 0.55 0.96 0.53
-0.0 0.03 -0.01 0.13 0.0 -0.03 -0.02 -0.25 -0.1 0.15 -0.04 0.1
-0.03 -0.11 0.1 0.0 -0.03 -0.06 0.09 -0.09 0.03 0.08 0.02 -0.01
0.83 0.74 -0.89 0.65 0.05 -1.44 0.48 -0.67 -0.55 -0.98 -0.77 0.31
0.94 -2.55 0.94 -0.01 -0.13 -1.53 0.66 -1.16 -1.27 0.57 -0.05 -0.23
-0.68 -0.14 0.07 0.45 -0.0 0.02 0.99 0.0 -0.67 0.19 -0.87 -0.43
0.34 0.49 -0.38 -0.12 -1.03 0.44 -0.21 -1.99 0.23 0.47 0.58 -0.68
0.08 -1.0 0.47 0.27 -2.2 -0.6 0.83 1.26 - 0.76 0.16 -
-0.03 0.1 -0.02 -0.1 0.02 0.23 0.19 0.18 -0.25 -0.31 -0.18 0.07
-0.72 -0.6 1.13 -0.45 -0.65 -0.3 1.31 -0.67 0.38 - 0.26 -0.41
-0.1 -0.05 -0.04 -0.1 -0.09 -0.2 -0.01 -0.25 0.09 0.27 0.24 0.14
-0.15 -0.46 -0.1 0.12 -0.09 -0.03 -0.28 -0.05 0.27 0.01 -0.01 0.52
0.14 - 0.33 0.41 0.89 -0.73 0.78 -0.58 -0.66 0.65 -0.92 -0.4
-1.22 0.53 0.38 0.18 -0.88 -0.82 -2.01 -0.6 0.88 0.35 0.55 0.13
-0.02 0.06 0.53 0.24 -0.19 -0.44 -0.02 -0.2 -0.49 -0.12 -0.07 0.37
-0.19 -0.12 0.14 -0.23 -0.12 -0.08 0.36 -0.09 -0.0 0.03 -0.05 0.24
-0.02 0.11 0.32 -0.19 -0.2 -0.14 0.06 0.16 -0.3 0.02 -0.05 0.1
-0.13 -0.08 -0.05 -0.13 -0.08 0.12 -0.07 0.09 -0.06 0.13 0.19 0.02
-0.17 0.14 0.1 0.85 0.72 -0.14 0.19 -0.62 -1.98 0.9 -2.05 -1.2
-0.47 0.1 -2.1 -0.15 -0.46 0.56 1.1 0.53 -1.23 0.46 -1.35 0.13
0.17 0.7 0.97 0.44 -0.59 -0.49 -0.32 -1.83 -0.77 0.6 -0.08 -1.27
0.13 -0.84 0.0 0.2 0.31 -0.59 -0.49 0.25 -0.25 0.02 0.53 0.12
-0.02 -0.29 -0.4 -0.23 -0.31 -0.14 0.1 0.16 0.11 0.43 0.17 0.18
-0.57 0.55 -0.23 -0.18 0.01 -0.02 -0.67 0.06 0.0 0.35 0.31 -0.09
-0.16 0.02 0.23 0.08 -0.31 -0.5 0.35 -0.57 -0.04 0.06 0.6 -0.2
-1.78 -0.66 -0.03 0.77 0.72 - 1.45 - -0.75 -1.78 0.48 0.79
-0.06 0.03 -0.01 -0.17 -0.07 0.15 0.29 0.19 -0.26 -0.08 -0.23 0.09
0.06 0.04 0.13 -0.0 -0.07 -0.23 -0.0 -0.05 0.03 -0.07 0.02 0.12
-0.05 -0.18 -0.12 -0.48 -0.09 0.11 0.74 0.3 -0.36 -0.33 0.16 -0.15
0.24 0.38 -0.64 0.43 0.06 -1.2 -1.11 -1.49 -0.43 0.3 0.95 0.4
0.7 -2.42 0.53 -0.65 - -0.52 0.92 -2.49 0.38 - 1.41 0.47
-1.34 -1.24 0.79 0.4 -0.16 0.36 0.67 -0.31 -0.44 -0.4 0.12 -0.03
0.16 0.15 0.19 0.33 -0.94 -0.45 0.08 -0.31 -0.23 0.4 -0.32 0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.