Heatmap: Cluster_198 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.99 0.48 0.7 0.71 0.75 0.4 0.53 -0.22 -3.18 -0.5 -1.58 -1.43
0.06 0.05 -0.02 -0.04 -0.01 0.15 0.05 0.03 -0.09 -0.02 -0.08 -0.09
-0.03 -0.12 -0.01 -0.1 0.07 0.05 -0.04 0.05 0.07 0.06 -0.06 0.03
-0.14 -0.11 -0.08 0.03 0.04 0.04 -0.07 -0.02 0.08 0.09 0.08 0.04
-0.33 0.04 0.66 1.15 0.3 0.32 0.08 -0.16 -0.71 -0.63 -1.21 -1.98
0.08 0.29 0.29 0.13 0.01 0.05 -0.15 0.08 -0.49 -0.02 -0.23 -0.23
0.07 0.03 0.17 0.05 0.04 -0.3 -0.12 -0.29 0.09 0.02 0.04 0.11
0.26 -0.12 -0.15 -0.13 -0.02 0.17 -0.03 0.21 -0.2 -0.14 -0.03 0.08
0.09 -0.01 0.08 0.13 0.03 0.1 -0.19 -0.23 0.07 -0.09 0.02 -0.03
-0.0 0.13 -0.03 -0.02 0.03 0.1 -0.07 -0.06 -0.01 -0.12 -0.14 0.15
0.11 0.08 -0.06 -0.08 0.06 0.1 -0.01 0.1 -0.1 -0.11 -0.17 0.04
0.29 0.01 0.43 0.28 0.06 -0.34 -0.29 -0.6 -0.11 -0.15 -0.08 0.18
0.01 -0.05 0.04 0.05 0.01 -0.1 0.04 -0.09 0.06 0.02 0.01 -0.01
-0.12 0.05 -0.15 -0.18 0.01 0.12 -0.02 0.13 -0.01 0.06 0.1 -0.02
-0.09 -0.08 -0.25 -0.19 -0.04 0.05 0.18 0.05 0.16 0.09 0.03 0.04
-0.09 0.06 -0.1 -0.06 0.02 0.14 0.04 -0.01 -0.17 0.08 -0.01 0.06
-0.63 0.29 0.36 0.19 0.15 -0.18 0.15 0.15 -0.31 -0.32 0.11 -0.29
0.12 0.02 -0.08 -0.02 0.06 0.09 -0.15 0.19 -0.15 -0.16 -0.15 0.16
0.07 0.07 0.13 0.05 0.12 0.07 0.05 0.07 -0.24 -0.21 -0.12 -0.13
-0.06 0.15 -0.05 -0.1 0.03 0.05 0.01 0.03 -0.03 0.09 -0.06 -0.07
-0.02 0.19 0.11 -0.05 0.12 -0.07 -0.12 -0.13 -0.09 0.11 -0.08 -0.02
-0.11 -0.03 0.26 0.06 0.09 0.15 0.04 -0.19 -0.07 -0.25 -0.25 0.18
-0.05 0.07 -0.03 -0.17 0.24 0.09 0.04 -0.07 -0.07 -0.03 -0.29 0.19
-0.21 -0.38 -0.29 0.2 0.55 0.22 -0.02 0.3 -0.47 -1.28 0.3 0.25
0.07 -0.13 0.01 -0.03 -0.01 0.05 0.13 0.01 -0.2 0.11 -0.05 0.01
0.12 -0.01 0.07 -0.04 -0.01 0.09 0.04 -0.16 0.05 -0.17 -0.14 0.12
1.81 - - - 2.23 - 1.93 - - - - -
-0.09 0.22 0.02 0.16 0.1 0.05 -0.02 -0.02 -0.3 0.0 -0.04 -0.17
-0.13 -0.04 -0.1 -0.09 0.01 0.07 -0.09 0.01 0.09 0.12 0.08 0.04
-1.12 - - 0.31 1.3 0.77 0.57 - 1.22 -0.78 - 0.78
0.08 0.1 -0.03 0.11 0.02 -0.02 -0.0 -0.17 -0.13 -0.04 0.01 0.05
-0.16 0.0 -0.06 -0.04 0.03 0.1 -0.06 0.02 0.11 0.03 -0.02 0.02
0.06 0.15 0.03 -0.09 0.03 -0.01 -0.1 -0.05 -0.08 0.06 -0.08 0.05
-0.38 -0.02 0.28 0.22 -0.09 0.21 0.02 0.08 0.02 -0.15 -0.22 -0.11
0.2 -0.06 0.38 0.25 0.14 0.17 0.1 -0.41 -0.4 -0.21 -0.48 0.03
-0.02 0.08 -0.03 0.06 -0.03 0.06 -0.05 -0.08 0.01 0.0 -0.06 0.03
-0.07 -0.18 0.31 0.11 0.15 0.05 -0.03 -0.25 0.05 -0.13 -0.12 0.03
-0.22 -0.42 0.46 0.83 0.27 -0.06 0.01 -0.82 0.05 -0.14 -0.35 -0.38
0.73 1.12 0.29 -0.05 0.04 -1.44 -0.52 -1.45 -0.37 -0.66 -0.48 0.48
-0.68 -0.17 0.06 -0.49 -0.23 0.53 0.54 0.11 0.02 0.28 -0.67 0.06
-0.25 -0.1 0.15 -0.24 -0.1 0.08 0.32 -0.07 -0.04 0.21 -0.47 0.29
0.19 0.21 0.35 -0.12 -0.17 -0.22 -0.04 -0.64 0.02 0.02 -0.18 0.31
- - - - 2.68 - 1.57 - 1.4 - - -
-0.05 0.12 0.02 0.29 -0.14 0.07 -0.03 0.09 -0.3 0.19 -0.35 -0.05
-0.41 -0.21 -0.08 0.04 -0.55 -0.07 0.24 -0.1 0.12 0.42 -0.15 0.42
0.24 0.07 -0.04 -0.08 -0.1 0.14 -0.17 0.05 -0.13 0.02 -0.2 0.13
-0.09 0.02 0.0 -0.03 -0.1 -0.03 0.12 0.06 0.05 0.06 -0.25 0.15
-0.01 -0.3 -0.37 -0.08 -0.28 0.14 -0.18 0.49 -0.31 0.48 0.19 -0.1
0.12 0.09 0.26 0.01 -0.54 -0.12 0.11 0.27 -0.32 -0.05 -0.1 0.06
0.04 -0.04 0.07 0.03 0.06 0.08 0.02 -0.07 0.01 -0.1 -0.2 0.08
-0.17 0.3 -0.31 0.34 0.19 -0.11 0.04 0.13 -0.41 0.08 0.0 -0.32
-0.09 -0.03 -0.06 -0.03 0.03 0.01 0.0 0.16 -0.09 -0.0 0.02 0.07
0.06 0.01 0.18 0.14 0.01 0.05 -0.13 -0.15 -0.03 -0.08 -0.08 -0.01
0.19 0.11 0.15 0.62 0.33 0.1 0.35 -0.08 -0.56 -0.47 -0.97 -0.58
0.0 -0.12 -0.07 0.0 0.03 0.13 0.14 -0.03 0.04 0.1 -0.42 0.1
-0.11 -0.25 0.28 -0.05 0.24 -0.03 -0.01 -0.2 -0.01 -0.23 -0.17 0.39
0.21 0.17 0.34 0.29 0.11 -0.06 -0.3 -0.51 -0.11 -0.45 -0.16 0.17
-0.22 0.03 0.08 0.24 -0.09 -0.1 -0.08 0.03 0.03 -0.08 0.13 -0.03
-0.14 0.29 -0.03 0.15 0.09 0.07 -0.11 -0.11 -0.18 0.02 -0.1 -0.01
0.06 -0.14 -0.11 -0.21 -0.02 0.14 -0.03 0.1 0.08 0.05 0.04 -0.01
0.06 -0.18 0.48 0.98 -2.3 0.54 -0.33 -0.17 0.67 -0.59 -3.38 0.02
-0.27 -0.32 0.45 0.67 -0.43 0.1 -0.04 0.07 -0.06 -0.37 -0.48 0.16
0.2 0.08 0.4 -0.01 -0.12 0.14 0.05 -0.47 -0.1 0.12 -0.43 -0.09
-0.24 0.69 -0.3 0.29 0.29 0.13 -0.25 -0.0 -0.33 -0.37 -0.49 0.1
- - - - 2.25 - 1.95 - - - 1.75 -
0.96 -0.69 0.82 -0.37 -0.23 1.21 -0.35 -2.36 -0.63 -0.53 -0.2 -0.87
0.14 0.11 0.18 -0.03 -0.03 0.03 0.02 -0.26 -0.04 -0.03 -0.22 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.