Heatmap: Cluster_47 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.6 -2.4 -1.14 0.57 -0.19 -1.27 0.88 -1.4 -0.21 -0.58 0.16 1.13
0.15 -0.56 0.04 -0.14 -0.16 -0.37 0.14 -0.19 0.19 -0.04 0.1 0.52
2.46 - - - - - - - - - - 2.7
0.01 -0.48 -0.04 -0.13 -0.12 -0.33 0.13 -0.23 0.27 0.09 0.1 0.47
0.06 -1.25 0.34 -0.22 -0.64 -1.01 0.47 -0.4 0.35 0.05 0.3 0.66
-0.18 -0.34 0.05 -0.09 -0.17 -0.24 0.15 -0.41 0.17 -0.14 0.2 0.66
-0.06 -0.39 -0.02 -0.06 -0.13 -0.23 0.09 -0.09 0.23 0.05 0.09 0.37
0.05 -0.63 -0.17 -0.33 -0.24 -0.59 0.44 -0.18 0.28 0.17 0.15 0.53
-0.2 -0.6 -0.0 -0.04 0.03 -0.46 0.43 -0.0 -0.22 -0.29 0.35 0.53
0.03 -0.72 0.1 -0.32 0.06 -0.54 0.34 -0.22 0.07 0.2 0.13 0.43
-0.51 -0.33 0.93 - -0.05 - 0.8 -0.3 - -0.11 0.62 1.39
- -0.16 -0.18 - - 0.01 0.97 -0.13 -0.31 -0.01 1.3 1.06
0.09 -0.27 -0.0 -0.06 0.0 -0.34 0.1 -0.14 0.02 0.12 0.12 0.27
-0.04 -0.57 -0.01 0.03 -0.21 -0.2 0.03 -0.37 0.08 0.22 0.04 0.65
-0.1 -0.36 0.06 -0.01 0.13 -0.15 0.15 -0.16 0.17 -0.13 -0.19 0.42
0.19 -0.27 0.05 0.01 -0.2 -0.29 0.07 -0.36 0.07 -0.12 0.09 0.53
0.06 -0.33 -0.09 -0.16 -0.16 -0.37 0.05 -0.09 -0.06 0.11 0.18 0.6
-0.09 -0.84 -0.03 -0.12 -0.17 -0.54 0.38 -0.52 0.34 0.22 0.01 0.66
0.03 -0.4 0.01 -0.1 -0.21 -0.21 0.22 -0.23 0.2 -0.05 0.03 0.48
0.09 -0.41 -0.11 -0.32 -0.35 -0.3 0.08 0.02 0.29 0.1 0.01 0.56
0.05 -0.32 0.05 -0.13 -0.17 -0.18 0.09 -0.17 0.18 -0.04 0.14 0.37
0.18 -0.54 0.05 -0.14 -0.16 -0.4 0.31 -0.33 0.17 -0.09 -0.01 0.57
0.24 -0.66 -0.05 -0.06 -0.19 -0.39 0.1 -0.38 0.07 0.04 0.2 0.64
0.07 -0.97 0.06 -0.32 -0.37 -1.54 0.23 -1.23 0.05 0.14 0.48 1.23
-0.09 -0.31 -0.05 -0.12 -0.18 -0.14 0.14 -0.14 0.17 0.11 0.08 0.4
-0.04 -0.37 0.16 -0.29 -0.01 -0.13 0.52 -0.18 0.43 -0.7 -0.28 0.39
0.31 -0.72 0.01 -0.09 -0.27 -0.32 0.3 -0.41 0.15 -0.24 0.01 0.7
0.19 -0.42 0.25 -0.33 -0.28 -0.35 0.35 -0.38 0.03 0.12 0.02 0.44
0.14 -0.46 0.1 -0.33 -0.17 -0.31 0.32 -0.25 0.21 -0.05 -0.02 0.5
-0.12 -0.41 0.09 -0.12 -0.25 -0.32 0.15 -0.2 0.35 0.02 0.32 0.23
0.08 -0.61 -0.06 -0.05 -0.14 -0.38 0.26 -0.32 0.11 -0.1 0.15 0.66
-0.02 -0.53 -0.07 -0.17 -0.22 -0.33 0.16 -0.07 0.14 0.31 0.17 0.38
0.28 -0.5 -0.22 -0.38 -0.22 -0.4 0.39 0.02 -0.14 0.08 -0.05 0.65
0.57 -0.89 -0.59 -0.07 -0.97 -0.77 0.52 -0.74 -0.55 0.34 0.92 0.48
0.22 -0.83 0.14 -0.21 -0.27 -1.08 0.2 -0.34 0.25 0.16 -0.1 0.86
0.11 -0.34 0.05 -0.12 -0.08 -0.31 0.14 -0.16 0.08 -0.25 0.08 0.55
0.44 -1.35 -1.11 0.17 -0.04 -0.71 0.69 -1.13 -0.76 0.23 0.64 0.75
0.11 -0.5 0.11 -0.29 -0.14 -0.17 0.24 -0.04 -0.03 -0.08 0.08 0.47
0.19 -0.5 0.05 0.01 -0.07 -0.32 0.07 -0.3 0.17 0.04 0.05 0.37
-0.17 -1.64 -0.87 0.34 -0.4 -0.36 0.59 -0.19 0.39 -0.03 0.07 0.79
0.11 -0.49 0.1 -0.02 -0.05 -0.4 0.07 -0.13 0.12 0.14 0.03 0.33
0.01 -0.25 -0.0 -0.08 -0.0 -0.16 0.12 -0.15 -0.06 0.06 0.07 0.35
-0.06 -0.31 0.03 -0.12 -0.32 -0.48 0.15 -0.35 0.31 -0.04 0.16 0.62
0.13 -0.28 -0.12 -0.07 -0.05 -0.05 0.1 -0.22 0.05 -0.02 0.06 0.36
0.21 -1.19 -0.9 0.46 0.02 -1.46 0.48 -2.55 0.28 0.65 0.44 0.51
-0.94 0.32 0.92 -0.32 0.57 - 0.97 - -0.84 -0.53 1.04 -0.32
0.06 -0.31 -0.09 -0.1 -0.08 -0.19 0.07 -0.16 -0.02 0.16 0.2 0.33
0.08 -0.39 -0.01 -0.1 -0.16 -0.34 0.07 -0.1 0.19 -0.06 0.05 0.53
-0.1 -1.06 0.02 0.14 0.23 -0.67 -0.04 -0.25 -0.24 -0.23 0.46 0.84
0.12 -0.23 0.05 -0.11 0.05 -0.05 0.08 -0.26 0.01 -0.12 0.01 0.35
0.07 -0.56 0.02 -0.18 -0.19 -0.26 0.13 -0.27 0.22 0.15 0.13 0.46
0.02 -0.2 -0.07 -0.15 -0.16 -0.12 0.03 -0.1 0.09 0.09 0.02 0.44
0.2 -0.2 0.03 -0.01 -0.11 -0.18 0.08 -0.26 -0.01 0.05 0.06 0.26
0.12 -0.21 0.07 -0.19 -0.09 -0.22 0.01 -0.14 -0.03 0.03 0.02 0.47
0.07 -0.31 -0.12 0.07 -0.34 -0.72 0.18 -0.25 0.26 0.26 0.28 0.26
0.18 -0.31 0.23 -0.36 -0.31 -0.35 0.34 -0.43 0.01 0.12 -0.03 0.53
0.13 -0.66 0.12 -0.28 0.22 -0.75 0.45 -0.43 0.4 -0.34 -0.26 0.62
0.15 -0.33 -0.09 -0.06 -0.16 -0.16 0.07 -0.09 0.14 -0.03 0.08 0.36
0.12 -0.22 0.05 -0.23 -0.12 -0.28 0.25 -0.06 -0.04 0.08 -0.06 0.36
-0.05 -0.91 0.32 -0.48 0.07 -0.89 -0.18 0.02 0.34 0.54 0.21 0.23
0.22 -1.91 -0.47 0.44 0.2 0.44 -0.36 -1.82 0.06 -0.28 0.74 0.46
0.22 -0.62 0.09 -0.24 -0.24 -0.19 0.45 -0.03 0.2 -0.46 -0.12 0.49
3.1 - - - - - - - - - - 1.77
0.08 -0.09 -0.05 0.08 -0.15 -0.18 0.04 -0.23 -0.0 -0.08 0.06 0.4
-0.0 -0.03 0.02 -0.06 -0.12 -0.43 0.16 -0.2 -0.04 -0.08 0.2 0.42
0.15 -0.5 -0.07 -0.18 -0.25 -0.31 0.15 -0.22 0.05 0.08 0.17 0.6
-0.03 -0.15 0.14 0.02 -0.13 -0.33 0.16 -0.23 0.12 -0.11 0.08 0.32
-0.08 -1.04 -0.14 -0.2 -0.06 -1.16 0.25 -0.54 0.13 0.3 0.31 0.96
0.12 -0.42 -0.25 -0.58 -0.5 -0.62 0.35 -0.04 0.43 0.2 0.04 0.61
0.27 -0.76 -0.16 -0.22 -0.2 -0.16 0.17 -0.29 0.34 0.14 0.13 0.35
0.08 -0.58 -0.02 -0.29 -0.14 -0.33 0.31 -0.1 0.2 0.13 -0.01 0.45
-0.01 -0.75 -0.11 -0.23 -0.5 -1.15 0.2 -0.08 0.25 -0.12 0.4 0.97
-0.04 -0.53 -0.2 -0.5 -0.29 0.03 0.34 -0.15 0.23 0.03 0.34 0.38
-0.01 -0.66 -0.09 -0.26 -0.03 -0.24 0.19 -0.05 0.08 0.17 0.13 0.47
-0.15 -0.55 -0.01 -0.13 -0.03 -0.02 0.21 -0.22 0.14 0.1 0.12 0.35
0.16 -0.25 0.02 0.02 -0.2 -0.33 0.07 -0.09 0.08 0.09 0.05 0.26
0.04 -0.46 -0.23 -0.13 -0.26 -0.2 0.14 0.04 0.04 0.04 0.25 0.47
0.32 -1.03 0.29 -0.48 -0.08 -0.61 0.32 -0.34 0.16 -0.08 0.34 0.44
0.08 -0.31 0.01 -0.06 -0.15 -0.29 -0.02 -0.19 0.0 -0.03 0.11 0.6
0.2 -0.42 -0.08 -0.1 -0.23 -0.36 0.13 -0.25 0.06 0.06 0.08 0.59
0.08 -0.43 0.19 -0.13 0.01 -0.49 0.32 -0.31 0.24 0.05 -0.22 0.38
0.36 -0.16 -0.1 -0.34 -0.16 -0.41 0.12 -0.27 0.16 0.08 0.01 0.45
-0.36 -0.91 -0.02 0.17 -0.1 -0.81 0.07 -0.12 0.15 0.23 0.51 0.48
0.21 -0.28 -0.08 -0.18 -0.06 -0.22 -0.03 -0.29 0.11 0.02 0.09 0.5
0.05 -0.23 -0.06 -0.19 0.0 -0.09 0.21 -0.18 -0.06 0.01 0.04 0.38
0.1 -0.19 0.02 0.02 0.03 -0.18 0.01 -0.13 0.02 0.02 0.05 0.18
0.2 -0.71 0.09 -0.39 0.05 -0.22 0.38 -0.16 0.19 0.06 -0.3 0.41
0.28 -0.36 -0.11 -0.21 -0.22 -0.14 0.11 -0.29 0.0 0.06 0.11 0.51
-0.31 -0.69 -0.11 -0.1 -0.33 -0.52 0.54 -0.3 0.18 -0.45 0.13 1.0
0.12 -0.46 -0.07 -0.02 -0.3 -0.94 0.26 -0.4 0.08 -0.18 0.36 0.8
0.22 -0.77 0.31 -0.21 -0.6 -0.6 0.15 -0.68 -0.22 -0.08 0.29 1.05
-0.06 -1.67 -0.03 -0.13 -0.03 -0.23 0.36 -0.5 0.41 0.06 0.45 0.34
0.06 -0.64 0.14 -0.23 -0.35 -0.5 -0.04 -0.18 0.21 -0.11 -0.21 1.04
-0.04 -0.05 -0.03 -0.08 -0.01 -0.15 0.16 -0.15 0.13 -0.08 -0.06 0.3
0.17 -0.28 -0.1 -0.11 -0.05 -0.16 0.09 -0.23 0.16 -0.1 0.07 0.39
0.12 -0.31 -0.03 -0.04 0.01 -0.12 0.22 -0.19 -0.03 -0.08 -0.11 0.41
0.07 -0.29 0.07 -0.21 -0.16 -0.23 0.3 -0.17 0.16 -0.21 -0.08 0.51
0.08 -0.45 0.13 -0.11 -0.01 -0.35 0.14 -0.1 0.19 0.03 0.18 0.12
0.01 -0.49 -0.01 -0.14 -0.33 -0.37 0.34 -0.01 0.13 0.0 0.06 0.5
2.91 - - - - - - - - - - 2.16
0.06 -0.67 -0.19 0.11 -0.3 -1.37 0.16 -0.43 0.16 -0.21 0.53 0.92
-0.58 -1.08 0.38 -0.32 -0.68 -0.34 0.48 0.04 0.73 -0.4 0.11 0.51
-0.15 -0.48 0.08 0.03 -0.27 -0.69 0.22 -0.09 0.28 0.09 0.26 0.34
-0.01 -1.23 -0.21 -0.51 -0.02 -0.74 0.49 -0.29 0.33 0.26 0.21 0.68
0.26 -0.57 -0.02 -0.25 -0.16 -0.62 0.32 -0.1 0.09 0.09 -0.11 0.6
-0.04 -0.26 0.08 0.1 -0.16 -0.3 0.21 -0.26 0.15 -0.06 -0.01 0.37
0.11 -0.53 0.05 -0.09 -0.22 -0.47 0.15 -0.44 -0.02 0.14 0.22 0.66
-0.09 -0.28 0.07 0.01 -0.21 -0.15 -0.06 -0.03 0.22 0.07 0.04 0.32
0.29 -0.44 0.03 -0.32 -0.23 -0.22 0.22 -0.15 0.07 -0.08 0.05 0.5
2.37 - - 0.92 - - - - - - - 2.31
-0.26 -0.72 0.12 -0.13 0.04 -0.39 0.31 0.02 0.16 0.13 0.2 0.21
0.12 -0.25 -0.11 -0.13 -0.17 -0.21 0.17 -0.18 0.11 -0.05 0.02 0.5
0.14 -0.99 -0.79 -0.2 -0.36 -0.3 0.44 -0.49 0.58 0.26 0.13 0.58
0.34 -1.02 -0.01 -0.12 -0.13 -0.87 0.05 0.02 0.04 -0.12 0.11 0.84
0.02 -0.73 -0.22 -0.35 -0.19 -0.33 0.34 -0.02 0.05 0.1 0.22 0.62
-0.05 -0.42 0.07 -0.01 -0.17 -0.21 0.08 -0.29 -0.02 0.02 0.09 0.64
-0.16 -1.54 -0.6 0.23 -0.24 -0.86 0.46 -0.24 0.74 0.36 -0.22 0.58
-0.08 -0.15 0.07 -0.14 -0.2 -0.17 0.04 -0.14 0.06 0.02 0.28 0.31
0.25 -0.41 -0.04 -0.16 0.14 -0.21 0.12 -0.09 0.04 -0.18 -0.01 0.38
0.1 -0.23 0.12 0.03 0.09 -0.17 0.08 -0.17 0.01 -0.08 -0.06 0.2
0.18 -0.37 0.32 -0.45 -0.18 -0.59 0.46 -0.45 -0.07 -0.0 0.03 0.57
-0.19 -0.57 0.4 0.24 -0.06 -0.95 0.56 -0.87 -0.11 -0.4 0.03 0.8
0.13 -1.38 -0.4 -0.27 -0.62 -0.49 0.55 -0.17 -0.11 0.08 0.25 1.03
0.08 -0.6 -0.32 -0.13 -0.27 -0.35 0.14 -0.2 0.38 0.2 0.3 0.39
-0.04 -0.26 -0.33 -0.11 -0.08 -0.15 0.17 -0.09 0.11 0.19 0.15 0.3
-0.05 -0.32 -0.08 -0.05 -0.13 -0.27 0.13 -0.25 0.34 -0.04 0.11 0.4
-0.02 -0.71 0.33 0.26 -0.36 -0.54 0.52 -0.9 0.02 -0.29 0.03 0.73
0.12 -0.48 -0.04 -0.28 -0.21 -0.31 0.31 -0.17 0.13 0.12 0.08 0.45
0.17 -0.31 0.11 -0.22 -0.29 -0.26 -0.0 -0.29 0.0 -0.06 0.15 0.67
0.02 -0.48 -0.12 -0.14 -0.08 -0.09 0.24 -0.52 0.3 0.05 0.08 0.44
0.07 -0.76 -0.2 -0.47 -0.45 -0.28 0.42 -0.18 0.32 0.29 0.11 0.53
0.04 -0.63 -0.02 0.01 -0.49 -0.39 0.35 -0.76 0.41 0.33 0.11 0.41
0.14 -1.18 -0.2 -0.3 -0.43 -0.66 0.13 -0.73 -0.11 0.26 0.25 1.25
0.53 -1.22 -0.06 -0.04 -0.31 -2.29 0.36 -0.79 0.13 -0.31 0.25 1.17
-0.25 -0.33 0.02 -0.04 -0.09 -0.3 -0.01 -0.14 0.28 0.21 0.03 0.42
0.02 -0.13 0.11 -0.0 0.1 -0.22 0.04 -0.23 -0.13 -0.09 0.18 0.26
0.24 -0.3 -0.08 -0.18 -0.03 -0.36 0.25 -0.33 0.03 -0.22 0.01 0.63
0.04 -0.68 0.12 -0.06 -0.22 -0.44 0.34 -0.59 0.08 -0.07 0.13 0.74
0.07 -0.6 0.1 -0.26 -0.23 -0.81 0.16 -0.5 0.11 -0.06 0.2 0.97
0.3 -0.72 0.14 -0.36 -0.92 -0.72 0.61 -0.28 -0.11 -0.09 0.07 0.91
0.11 -0.4 -0.01 -0.27 -0.1 -0.2 0.05 -0.2 -0.04 0.11 0.2 0.52
0.21 -0.46 0.21 -0.32 -0.43 -0.45 0.54 -0.54 0.03 0.07 -0.08 0.6
0.12 -0.65 0.01 -0.13 0.03 -0.36 0.13 -0.05 0.29 0.1 -0.04 0.3
0.26 -0.44 0.13 -0.1 -0.33 -0.51 0.24 -0.4 -0.01 -0.09 0.19 0.62
0.21 -0.82 0.37 -0.29 -0.63 -0.52 0.25 -0.86 -0.17 -0.18 0.39 1.0
-0.06 -0.72 -0.18 -0.24 0.03 -0.05 0.16 -0.37 0.11 0.25 -0.04 0.66
-0.06 -0.41 -0.01 0.02 -0.08 -0.2 0.01 0.01 0.21 -0.07 0.2 0.25
0.23 -0.68 -0.12 -0.29 -0.48 -0.5 0.21 -0.25 0.24 0.35 0.22 0.51
0.09 -0.17 0.02 -0.02 -0.21 -0.23 0.01 -0.24 0.1 0.02 0.08 0.42
-0.01 -0.69 -0.13 -0.49 -0.48 -0.07 0.36 -0.14 0.22 0.09 0.38 0.45
0.2 -0.27 -0.09 -0.06 -0.04 -0.31 -0.04 -0.25 0.17 -0.02 0.09 0.43
0.12 -1.2 -0.18 -0.32 -0.2 -0.32 0.06 -0.1 0.04 0.29 0.27 0.76
0.92 -2.42 -0.26 -0.87 -0.76 -1.35 -0.82 -0.53 1.04 -0.41 0.47 1.07
-0.31 -0.39 0.11 -0.22 0.0 -0.28 0.18 0.1 -0.15 -0.21 0.1 0.7
0.09 -0.2 0.07 -0.06 -0.15 -0.3 0.15 -0.21 0.1 -0.02 0.01 0.38
0.07 -0.2 0.15 -0.03 -0.11 -0.27 0.18 -0.11 0.0 -0.08 0.04 0.26
0.12 -0.95 0.02 -0.52 -0.2 -0.37 0.24 0.08 0.03 0.18 0.0 0.72
0.21 -0.67 -0.0 -0.61 -0.03 -0.36 0.39 -0.33 0.29 0.21 0.16 0.25
0.19 -0.33 0.11 0.02 0.09 -0.17 0.05 -0.34 -0.05 -0.18 -0.05 0.45
2.31 - - - - - 0.43 - - 0.32 - 2.16
-0.06 -0.24 -0.07 -0.14 -0.1 -0.11 0.09 -0.14 0.08 -0.08 0.08 0.54
0.08 -0.25 0.21 0.08 -0.64 -0.73 0.14 -0.1 -0.05 -0.34 0.22 0.75
1.67 -1.12 0.11 -1.13 -0.34 -2.1 0.09 -2.17 0.28 -1.01 -0.89 1.17
0.16 -0.35 -0.05 -0.19 -0.12 -0.47 0.15 -0.38 0.31 -0.05 0.1 0.53
0.21 -0.41 0.32 -0.51 -0.33 -0.38 0.38 -0.36 -0.06 0.17 -0.03 0.52
0.15 -0.37 -0.0 -0.11 -0.18 -0.8 0.02 -0.42 -0.05 0.16 0.14 0.84
0.09 -0.19 -0.01 0.05 -0.06 -0.43 0.14 -0.08 0.06 -0.1 0.06 0.35
0.14 -0.76 0.06 -0.27 -0.34 -0.18 0.4 -0.25 0.07 0.02 -0.14 0.7
0.11 -0.39 0.01 -0.03 -0.11 -0.13 0.17 -0.08 -0.05 -0.01 0.17 0.23
-0.0 -0.39 0.03 -0.22 -0.15 -0.29 0.19 -0.36 0.23 -0.11 0.12 0.61
-0.12 -0.52 -0.22 -0.45 -0.19 -0.59 0.13 -0.17 0.36 0.27 0.1 0.77
0.1 -0.32 0.1 -0.02 -0.3 0.17 0.06 -0.41 -0.18 -0.05 0.38 0.24
0.24 -0.53 -0.12 -0.08 -0.03 -0.69 0.5 -0.49 -0.29 0.02 0.22 0.62
0.17 -0.35 0.12 -0.06 -0.15 -0.09 0.17 -0.25 0.13 -0.14 -0.05 0.34
-0.15 -0.72 0.44 -0.28 -0.27 -0.74 0.19 -0.09 0.05 0.24 0.03 0.65
-0.05 -0.69 0.08 0.08 -0.01 -0.05 0.12 -0.3 0.01 -0.07 0.07 0.52
-0.03 -0.61 0.02 -0.14 -0.18 -0.15 0.17 -0.2 0.09 -0.06 0.22 0.57
0.19 -0.29 0.16 -0.38 -0.29 -0.35 0.3 -0.3 0.08 0.1 -0.03 0.48
-0.15 -0.26 0.13 -0.06 -0.09 -0.12 -0.3 -0.17 0.12 0.1 0.16 0.46

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.