Heatmap: Cluster_248 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.19 0.52 0.19 0.25 0.4 0.12 0.56 0.27 0.35 0.18 0.41 0.36
0.3 0.1 0.39 0.26 0.34 0.11 0.12 0.18 0.21 0.27 0.17 0.32
0.03 0.0 0.02 0.0 0.03 0.1 0.02 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0
0.1 0.13 0.14 0.09 0.15 0.06 0.1 0.09 0.06 0.06 0.03 0.04
0.18 0.12 0.29 0.04 0.13 0.14 0.11 0.05 0.09 0.03 0.11 0.11
15.85 17.67 16.94 15.8 12.56 17.07 12.38 14.79 14.1 11.84 15.28 14.62
0.29 0.14 0.15 0.17 0.38 0.39 0.2 0.0 0.25 0.18 0.31 0.03
1.05 2.61 1.7 1.53 1.4 1.32 1.17 0.63 1.02 1.23 1.58 1.32
4.4 4.74 4.11 4.2 4.8 5.09 4.02 3.87 5.06 4.26 4.97 5.32
5.8 4.82 6.12 5.93 5.86 6.7 4.8 5.82 5.83 5.39 4.88 6.83
9.72 9.65 9.63 9.3 10.47 9.27 10.02 9.26 9.75 10.12 9.4 8.81
0.18 0.1 0.07 0.2 0.05 0.32 0.21 0.26 0.06 0.22 0.15 0.07
0.63 0.76 0.53 1.32 1.0 1.76 0.66 0.55 0.77 1.05 0.99 1.25
0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
17.74 15.7 18.53 18.57 19.86 17.33 16.87 17.8 18.44 18.97 21.1 18.82
0.25 0.17 0.34 0.36 0.26 0.28 0.19 0.37 0.34 0.22 0.18 0.21
22.71 26.87 22.34 22.95 20.33 20.6 18.64 17.76 19.21 19.29 21.69 21.23
0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.06 0.03 0.06 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
9.66 8.79 8.4 9.83 10.39 9.66 9.97 9.26 11.66 8.71 10.58 9.38
0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.87 4.54 3.94 4.08 5.45 3.47 5.05 4.18 5.61 3.93 5.54 4.46
3.17 3.56 3.95 2.56 3.51 3.38 2.1 2.56 1.73 3.7 3.15 2.93
5.61 3.68 5.28 6.5 4.93 5.01 4.49 3.93 4.52 4.88 6.33 5.75
0.22 0.15 0.17 0.13 0.16 0.09 0.09 0.15 0.15 0.15 0.09 0.15
0.1 0.07 0.19 0.09 0.04 0.04 0.03 0.04 0.03 0.05 0.04 0.02
0.53 0.64 0.83 0.45 0.64 0.47 0.61 0.34 0.7 0.35 0.57 0.5
1.06 1.19 0.99 0.69 0.9 1.18 0.76 0.91 0.7 0.67 1.08 0.73
9.67 10.94 10.44 10.92 10.19 10.3 9.09 9.0 9.77 9.57 10.2 8.77
8.54 7.07 7.73 8.63 6.68 8.19 7.33 7.63 6.8 7.98 8.48 7.99
0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
14.28 11.94 13.46 14.03 14.67 12.78 13.33 13.03 15.11 13.51 15.75 14.12
1.68 1.15 1.35 1.25 1.15 1.19 0.98 1.04 1.12 1.15 0.69 1.08
12.89 14.91 15.59 15.6 17.51 14.74 13.94 14.39 15.48 13.26 13.47 11.25
6.45 5.33 6.78 6.02 5.94 5.33 5.34 5.68 6.13 5.8 6.12 4.84
9.32 6.67 10.25 9.02 10.51 6.88 7.02 6.85 8.47 10.0 10.84 5.78
0.41 0.32 0.44 0.26 0.45 0.25 0.57 0.38 0.25 0.58 0.46 0.41
17.22 22.35 22.18 14.68 21.87 21.54 20.44 17.75 14.29 14.9 17.66 9.68
1.53 1.72 0.89 0.97 0.95 1.75 1.32 1.12 1.33 1.37 0.98 1.09
0.01 0.0 0.02 0.06 0.06 0.05 0.0 0.05 0.03 0.05 0.06 0.02
0.31 0.23 0.65 0.48 0.51 0.46 0.29 0.29 0.25 0.42 0.5 0.32
0.06 0.26 0.2 0.23 0.32 0.08 0.0 0.0 0.12 0.23 0.0 0.07
0.15 0.17 0.21 0.17 0.1 0.0 0.05 0.28 0.12 0.11 0.24 0.08
0.71 0.63 1.25 0.71 1.91 1.37 0.94 0.39 0.42 0.79 0.48 0.82
0.21 0.13 0.39 0.18 0.15 0.04 0.19 0.2 0.26 0.07 0.31 0.14
1.45 1.69 1.87 1.46 1.75 1.51 1.19 1.22 1.49 1.54 0.97 1.17
0.24 0.14 0.17 0.1 0.24 0.08 0.07 0.05 0.11 0.09 0.17 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.18 0.17 0.22 0.21 0.12 0.06 0.07 0.17 0.12 0.16 0.2 0.11
0.03 0.03 0.05 0.02 0.04 0.04 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.04
0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.06 0.06 0.05 0.08 0.1 0.04 0.02 0.0 0.04 0.08 0.03 0.05
4.85 4.89 5.25 4.97 4.41 5.91 4.7 5.07 4.93 5.14 5.51 4.05
0.12 0.03 0.14 0.07 0.0 0.04 0.0 0.03 0.06 0.06 0.0 0.0
0.29 0.23 0.37 0.22 0.22 0.24 0.11 0.04 0.08 0.02 0.2 0.19
0.18 0.11 0.35 0.22 0.08 0.04 0.07 0.04 0.21 0.11 0.21 0.2
0.12 0.03 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03
0.02 0.05 0.07 0.04 0.0 0.0 0.06 0.01 0.02 0.0 0.06 0.02
2.37 1.64 2.43 2.54 2.68 2.46 2.66 1.87 2.54 2.3 2.42 2.47
20.52 15.61 24.32 22.03 23.3 25.47 26.89 20.07 22.96 17.56 19.86 17.03
7.47 6.63 7.58 7.01 6.14 7.21 6.52 7.35 7.58 6.04 6.14 7.25
4.17 0.34 1.71 0.91 2.59 1.28 1.87 1.04 0.49 3.75 0.55 0.89
0.06 0.09 0.02 0.06 0.17 0.15 0.04 0.0 0.03 0.06 0.06 0.07
0.06 0.05 0.08 0.04 0.04 0.0 0.05 0.0 0.03 0.01 0.04 0.05
0.06 0.11 0.12 0.13 0.04 0.08 0.06 0.08 0.02 0.02 0.11 0.06
1.68 0.61 2.36 1.71 1.69 0.77 1.39 1.12 1.05 1.58 1.83 1.32
5.12 4.22 5.56 4.0 2.69 4.52 3.08 3.18 3.45 3.21 3.08 3.92
20.39 17.88 21.36 15.47 16.26 19.59 16.66 16.05 12.29 16.0 18.21 13.45

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)