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Heatmap: Cluster_235 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.08 - - -0.53 0.79 - -0.97 0.13 - 0.84 1.3 1.47
0.64 0.12 -0.64 -0.14 0.39 -1.08 -0.97 0.46 -1.16 0.55 0.2 0.11
0.6 0.04 -0.15 -0.41 -0.41 -0.33 -0.58 0.18 -0.18 0.47 0.53 -0.42
0.35 -0.3 0.04 -0.85 -0.01 -0.0 -0.1 -0.51 0.78 0.11 -0.02 -0.13
0.34 -0.03 -0.02 -0.39 -0.39 -0.14 -0.01 0.21 -0.2 0.1 0.44 -0.18
0.3 -1.72 0.25 -0.55 -0.08 -0.28 0.0 0.38 -0.53 0.66 0.58 -0.41
0.01 0.12 -0.23 -0.15 -0.05 0.21 -0.12 -0.13 -0.0 0.09 0.07 0.13
- - 1.55 - 0.76 - - 0.57 - 1.72 0.26 0.48
0.09 0.93 0.3 0.35 -0.13 -0.93 -0.24 0.37 -0.79 0.25 -0.95 -0.59
0.07 -0.35 -0.02 -0.11 -0.31 0.03 0.25 0.16 -0.08 -0.17 0.24 0.15
0.73 -0.25 0.63 -0.18 -0.59 0.46 -0.51 -0.6 -0.07 -0.07 0.31 -0.93
-0.08 -2.76 0.38 -0.56 -0.71 -0.21 -0.5 0.58 0.73 0.49 0.51 -0.41
0.96 -0.85 0.71 -0.21 -0.04 0.35 -0.76 -1.06 0.28 -0.07 0.6 -
-0.02 0.1 0.38 -0.05 0.23 -0.51 0.12 0.07 -0.35 -0.07 0.02 -0.14
- - -1.14 - -0.84 -1.02 - - -1.27 2.06 2.15 0.57
0.21 -0.81 0.38 -0.29 -0.15 0.51 -0.08 -1.33 0.18 0.04 0.46 -0.08
-0.82 - -0.59 - 1.58 -0.47 1.65 - -0.62 -0.42 1.34 -
-0.03 -0.26 -0.05 -0.22 0.12 -0.09 0.04 -0.1 0.07 0.19 0.1 0.16
0.26 0.45 - - 0.67 - 0.76 - 1.85 - 1.35 -
-0.83 -0.15 0.8 -0.84 0.86 -0.28 -0.01 0.22 0.06 -0.36 -1.71 0.38
0.03 0.28 0.2 0.11 0.13 -1.53 0.15 0.33 -0.18 0.3 -0.04 -0.64
-0.65 0.61 0.7 -0.62 -0.1 -0.06 0.25 -0.13 0.07 -0.03 -0.58 -0.2
0.15 0.05 0.61 -1.97 0.33 -0.36 0.7 -0.16 -0.36 0.54 - 0.37
-0.24 -0.2 0.07 0.05 0.01 -0.2 0.42 0.08 -0.1 -0.03 0.07 -0.06
0.53 0.4 -0.46 0.28 -0.35 -0.36 -0.56 -0.46 -0.41 0.23 0.23 0.3
- 0.76 1.4 -0.16 1.02 -1.27 - -0.08 -0.68 0.67 -0.07 -2.14
-0.79 -0.24 0.07 -0.44 0.92 -0.14 -0.55 0.3 -0.19 -0.08 -0.33 0.55
-1.52 -0.75 0.42 -0.29 0.88 0.73 -1.07 -0.12 0.42 -0.53 -0.47 0.33
-0.57 -1.43 0.43 -0.6 1.37 -1.23 -1.72 -0.12 0.56 0.39 -0.39 0.2
- - - - 1.69 - 1.39 - - - 1.81 1.41
0.03 -0.62 -0.56 -0.05 -0.07 0.23 -0.35 0.31 -0.19 0.65 -0.1 0.2
- - - - 2.53 - - - - - 2.64 -
-0.15 0.14 -0.19 0.0 0.18 -0.15 0.05 0.21 -0.47 0.03 0.14 0.06
- - - - 1.43 - - - - 1.36 2.75 -
-0.03 -0.09 0.56 -0.5 0.51 -0.41 -0.43 -0.37 -0.11 0.12 0.11 0.14
-0.56 -0.42 -0.1 -0.3 0.65 -0.32 0.03 -0.16 -0.32 0.13 0.4 0.42
-1.38 0.78 1.21 -0.76 0.1 -0.03 0.65 0.44 -1.28 0.68 - -
1.32 - 0.92 - 0.17 0.04 - -0.03 - 0.09 0.66 0.88
-0.7 -0.11 0.24 -0.19 0.66 -0.42 -2.21 0.43 0.06 0.69 0.55 -1.34
-0.09 0.16 -0.4 0.43 0.52 -0.94 0.8 -0.78 0.85 - -0.65 0.17
0.53 -0.58 -0.42 0.17 0.3 -0.26 -1.13 0.06 0.18 0.3 0.4 -0.41
0.22 -0.43 0.13 -1.11 -0.03 -0.01 0.66 0.17 -0.28 -0.15 0.37 -0.23
0.51 -0.61 -0.7 -0.75 -0.24 0.25 0.15 0.14 0.27 -0.11 0.61 -0.32
-0.29 0.54 0.3 -1.39 -0.37 0.08 -0.47 -0.55 -0.74 0.65 0.23 0.62
0.96 - 0.13 -0.84 1.7 - -1.01 - -0.1 - 1.59 -0.49
1.35 -0.55 -1.14 -0.78 -0.57 -1.04 -0.03 0.72 -0.64 -0.18 0.49 0.02
-0.75 0.52 0.42 - 0.67 - -0.25 -0.26 -0.71 -0.75 0.99 1.12
0.38 -0.45 -0.38 -0.27 -0.27 0.32 0.39 -0.31 0.19 -1.2 0.07 0.64
- - 0.76 - 1.01 - 0.7 - - - 2.33 0.72
-0.01 -0.07 0.22 0.02 0.25 0.05 0.07 0.06 0.0 -0.08 -0.61 -0.07
0.06 0.17 0.42 -0.09 -0.12 -0.02 -0.14 0.02 -0.05 0.02 -0.14 -0.25
0.06 0.26 -1.56 -0.21 0.69 -0.45 -1.42 0.48 -1.79 1.04 0.43 -0.4
0.06 -0.61 0.28 -0.07 0.07 0.05 -1.05 -0.49 0.16 0.36 0.41 0.18
0.01 0.05 0.2 -0.05 0.09 0.06 -0.14 -0.12 -0.05 0.07 -0.1 -0.06
0.16 0.03 0.05 -0.03 -0.08 -0.08 0.02 -0.06 0.05 -0.03 0.01 -0.07
0.35 0.22 -0.31 -0.05 0.02 -0.36 -0.11 -0.47 -0.15 -0.1 0.49 0.15
-0.66 1.24 - -0.4 - - -0.49 -0.62 - 2.03 0.31 0.65
-0.03 -0.22 -0.44 -0.06 -0.18 0.42 0.26 0.16 0.02 -0.05 -0.13 0.06
1.79 -0.95 0.44 - -0.54 - - -1.02 -0.97 0.56 1.48 -0.46
0.1 -0.36 0.09 -0.03 -0.16 -0.05 0.21 -0.08 -0.06 -0.03 0.17 0.1
-1.21 0.68 0.64 - 1.36 - 0.35 -0.93 0.51 -0.74 -1.24 0.69
0.28 -0.15 0.6 -0.96 0.57 -0.03 -0.2 -0.15 -0.71 0.27 0.04 -0.35
0.09 0.01 0.21 -0.16 0.14 -0.28 -0.17 -0.07 -0.01 0.26 0.1 -0.25
0.33 -0.3 0.02 -0.35 0.35 -0.36 0.05 0.13 0.01 0.13 -0.01 -0.23
-0.11 0.06 -1.1 0.03 0.18 -0.17 0.18 -0.85 -0.89 0.55 1.01 -0.28
0.15 -0.29 -0.11 0.13 -0.14 -0.14 -0.05 0.18 -0.19 0.11 0.21 0.05
0.44 -1.66 0.17 -0.22 0.33 0.32 -0.83 -0.66 0.17 0.3 0.34 0.04
-0.09 0.57 -0.12 0.42 0.27 -1.06 -0.23 0.51 -0.36 0.36 -0.21 -1.24
0.06 -0.13 -0.17 -0.01 0.0 -0.68 0.14 -0.39 0.03 0.27 0.27 0.3
-0.01 0.22 0.44 0.05 0.02 -0.26 -0.01 0.15 -0.68 0.22 -0.35 -0.11
-0.06 -0.15 -1.03 0.07 0.29 0.43 -0.45 -0.1 -0.0 0.31 0.32 -0.19
0.03 -0.24 -0.14 -0.09 -0.04 -0.28 -0.24 -0.02 0.43 0.33 0.15 -0.09
0.26 0.21 -0.38 -0.66 -0.28 0.25 0.37 -0.25 -0.05 0.22 -0.12 0.06
-0.34 -2.03 -2.15 -0.77 -1.14 -0.01 -0.05 0.52 -2.1 1.52 0.38 0.94
0.77 - - - 1.7 -0.48 0.96 -1.55 0.32 -0.59 1.08 -
0.47 0.31 -0.48 -0.82 -0.45 0.35 -0.54 -1.94 -0.22 0.41 0.63 0.48
-0.52 -0.52 0.24 0.42 -0.06 -0.59 0.54 -1.05 -0.73 -0.86 1.13 0.23
0.77 -0.06 -0.5 0.13 -0.32 -0.74 -0.25 0.16 0.34 0.03 0.42 -0.85
-0.05 0.13 -0.25 0.01 -0.02 0.09 0.11 -0.67 0.07 -0.36 0.62 -0.05
0.17 -0.07 0.31 -0.15 -0.41 0.12 -0.29 -0.23 -0.06 0.05 0.21 0.17
0.46 0.1 -2.06 -0.4 -1.36 0.81 0.29 -0.72 0.17 0.49 -0.43 0.39
-0.26 0.22 0.04 -0.6 0.36 -0.51 -0.19 0.29 -0.19 0.39 0.09 -0.03
0.1 -0.05 0.22 -0.0 -0.06 0.02 0.02 0.09 -0.22 -0.04 -0.15 0.03
0.28 0.72 1.06 0.84 -1.82 -0.41 1.38 -1.03 -2.14 -1.1 -2.37 -2.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.